BioLiP

>protein
YSKDEIMEMYLNRSYFGNGEWGVENASLKYFGKSAADLNIPEAATIAGLLQAPSAYDPYQHIDKATNRRNMVLNAMVETG
TISKAEGDKYKATKIVLNDQSKDPLANKYPWYVDAVINEAVNEADITQDEIMQKGYKIYTELDQNYQTSLENVYNNDGLF
PSNANDGTLVQSGAVLMDPATGGIRALVGGRGEHVFRGFNRATQMKAQPGSTMKPLAVYTPALQSGYDVDSMLKDEKITY
KGNYTPTNVGGVYSGEVPMYKAVANSINAPAVWLLDQIGIDKGVKSVEKFGITVPEKDRTLGLALGGMSKGASPVEMATA
YATFANNGAKPESHIITKIVDPSGNTVYENVPKTKQIISETVSNEMTSMLLDVINTGTGQSAAVSGHEMAGKTGSTQVPF
DDTSGTKDQWFVGYTPNLVGAVWMGYDKTDKEHYLTTTSSAGVSSLAHYVMNSGLQYQ

The query sequence (length=458) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3zg8:B	458	458	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3zg9:B, 3zga:B
2	2olv:B	618	454	0.3035	0.2249	0.3062	2.36e-48	2olv:A
3	3ue1:A	604	301	0.2249	0.1705	0.3422	1.32e-40	3udi:A, 3udi:B, 3udx:A, 3udx:B, 3ue0:A, 3ue0:B, 3ue1:B
4	3ue1:A	604	158	0.1223	0.0927	0.3544	8.40e-20	3udi:A, 3udi:B, 3udx:A, 3udx:B, 3ue0:A, 3ue0:B, 3ue1:B
5	4oon:A	502	282	0.2140	0.1952	0.3475	1.62e-40
6	7u4h:A	576	318	0.2314	0.1840	0.3333	1.28e-37	7u4h:B
7	3vma:A	708	443	0.2642	0.1709	0.2731	1.26e-33	5fgz:A, 3fwl:A, 5hl9:A, 5hla:A, 6yn0:A
8	5hlb:A	733	443	0.2642	0.1651	0.2731	5.14e-33
9	5hld:A	649	443	0.2489	0.1757	0.2573	4.85e-28
10	2c5w:B	385	339	0.2227	0.2649	0.3009	2.24e-27	2c6w:B, 2zc5:B, 2zc5:D, 2zc6:B, 2zc6:D
11	2v2f:F	366	326	0.2271	0.2842	0.3190	3.97e-27
12	2y2l:B	476	335	0.2249	0.2164	0.3075	1.44e-23	2fff:B, 2jch:A, 2je5:A, 2je5:B, 2xd1:A, 2xd1:B, 2xd5:A, 2xd5:B, 2y2g:A, 2y2g:B, 2y2h:A, 2y2h:B, 2y2i:A, 2y2j:A, 2y2k:A, 2y2l:A, 2y2m:A, 2y2n:A, 2y2o:A, 2y2p:A, 2y2q:A, 2y2q:B, 7zui:AAA, 7zuj:AAA, 7zuk:AAA, 7zul:AAA
13	5cxw:A	376	345	0.2140	0.2606	0.2841	6.93e-20
14	3d3h:A	174	83	0.0852	0.2241	0.4699	4.96e-15
15	7rcz:A	511	253	0.1572	0.1409	0.2846	7.28e-11	7rcz:B
16	4r1g:B	419	282	0.1616	0.1766	0.2624	1.84e-08	4n1x:A, 4n1x:B, 4qjg:A, 4qjg:B, 4r0q:A, 4r0q:B, 4r1g:A, 4r23:A, 4r23:B, 4r3j:A, 4r3j:B, 4ra7:A, 4ra7:B
17	7zg8:AAA	525	249	0.1354	0.1181	0.2490	2.74e-08	7zg8:BBB
18	7ok9:B	525	365	0.1943	0.1695	0.2438	2.33e-07	7o4a:AAA, 7ok9:A, 7ok9:E, 7ok9:C, 7ok9:G, 7ok9:H, 7ok9:I, 7ok9:D, 7ok9:F, 7ok9:J
19	8vbu:A	505	365	0.1943	0.1762	0.2438	2.66e-07	7o4a:BBB, 7o4b:A, 7o4b:C, 8vbu:B, 8vbv:A, 8vbv:B, 8vbw:A, 8vbw:B
20	6kgw:A	452	162	0.0961	0.0973	0.2716	7.86e-07	6kgs:A, 6kgt:A, 6kgu:A, 6kgv:A
21	3vmr:A	227	93	0.0568	0.1145	0.2796	6.95e-06	6ftb:A, 3hzs:A, 3vmq:A, 3vmt:A
22	3upp:A	445	279	0.1310	0.1348	0.2151	8.35e-06	3upn:A, 3upn:B, 3upo:A, 3upo:B, 3upp:B
23	6pl6:B	577	123	0.0742	0.0589	0.2764	9.79e-05
24	4cjn:A	642	297	0.1463	0.1044	0.2256	1.04e-04	4bl3:A, 4bl3:B, 4cjn:B, 4cpk:A, 4cpk:B, 4dki:A, 4dki:B, 6h5o:B, 5m18:A, 5m18:B, 5m19:A, 5m19:B, 5m1a:A, 5m1a:B, 1mwt:A, 1mwt:B, 1mwu:A, 1mwu:B, 6q9n:A, 3zfz:A, 3zfz:B, 3zg0:A, 3zg0:B, 3zg5:A, 3zg5:B
25	4kqq:A	520	297	0.1812	0.1596	0.2795	2.30e-04	7ato:A, 7atw:A, 7atx:A, 7au0:A, 7au1:A, 7au8:A, 7au9:A, 7aub:A, 7auh:A, 5df7:A, 5df7:B, 5df8:A, 5df8:B, 5df9:A, 4fsf:A, 6hr6:A, 6hr9:A, 6i1e:A, 7jwl:A, 7kit:A, 4kqo:A, 4kqo:B, 4kqq:B, 4kqr:A, 4kqr:B, 4l0l:A, 3ocl:A, 3ocn:A, 7onk:A, 7onk:B, 4ool:A, 4oom:A, 3pbq:A, 3pbr:A, 3pbs:A, 3pbt:A, 6r3x:A, 6r42:A, 6un1:A, 6un3:A, 6vje:A, 6vot:A, 4wej:A, 4wek:A, 4wel:A, 6y6u:A, 6y6z:A
26	7rd0:A	482	314	0.1572	0.1494	0.2293	2.53e-04
27	4ovd:A	422	215	0.1245	0.1351	0.2651	3.18e-04
28	7onw:A	485	297	0.1703	0.1608	0.2626	3.63e-04	8gpw:A, 8gpw:B, 6i1i:A, 7onn:A, 8rtz:AAA
29	7atm:A	478	222	0.1441	0.1381	0.2973	0.002	7kiv:A, 7kiw:A, 7lc4:A, 7ly1:A, 3pbo:A
30	6syn:A	471	286	0.1616	0.1571	0.2587	0.003
31	6p55:B	327	276	0.1528	0.2141	0.2536	0.011	6p52:A, 6p53:B, 6p54:A, 6p54:B, 6p55:A, 6xqv:A, 6xqv:B
32	6h5o:A	598	131	0.0721	0.0552	0.2519	0.014
33	8f3i:A	641	108	0.0568	0.0406	0.2407	0.033	8f3g:A, 8f3l:A, 8f3n:A, 8f3p:A, 8f3s:A, 8f3u:A, 8f3w:A, 8f3y:A, 6g88:A, 6mkf:A, 6mkg:A
34	5oj1:A	675	158	0.0917	0.0622	0.2658	0.039	5oiz:A, 2z2m:B, 2z2m:E, 2zc3:B, 2zc3:E, 2zc4:B, 2zc4:E
35	1pyy:A	607	193	0.1004	0.0758	0.2383	0.039
36	7kis:A	458	256	0.1223	0.1223	0.2188	0.092	7kis:B
37	3pm9:A	465	42	0.0262	0.0258	0.2857	0.19	3pm9:B, 3pm9:C, 3pm9:D, 3pm9:E, 3pm9:F
38	5fjv:B	207	75	0.0459	0.1014	0.2800	0.26	5fjv:A, 5fjv:E, 5fjv:C, 5fjv:D
39	6g88:C	597	88	0.0502	0.0385	0.2614	0.44	6g88:B
40	8veq:A	325	100	0.0786	0.1108	0.3600	0.58	6vbd:A, 8ven:A, 8vep:A
41	8veq:A	325	47	0.0284	0.0400	0.2766	8.1	6vbd:A, 8ven:A, 8vep:A
42	6tix:BBB	533	253	0.1245	0.1069	0.2253	0.59	6tix:AAA
43	5oj0:A	658	132	0.0764	0.0532	0.2652	0.65	1qmf:A
44	3vsl:A	631	164	0.1004	0.0729	0.2805	2.0	3vsl:B
45	8ro0:W	496	134	0.0721	0.0665	0.2463	3.7	8ro1:W
46	8g64:A	169	125	0.0633	0.1716	0.2320	4.1
47	7rcy:A	828	293	0.1572	0.0870	0.2457	5.0	7rcw:A
48	7zgh:A	413	25	0.0240	0.0266	0.4400	5.1	7zgh:B
49	6n1x:A	377	140	0.0677	0.0822	0.2214	7.0	6d9t:A
50	6g9f:A	539	114	0.0699	0.0594	0.2807	7.2	6g9s:A
51	6ef8:A	407	33	0.0306	0.0344	0.4242	8.4	6ef8:B, 6ef8:C, 6ef8:D, 6ef8:E, 6ef8:F, 6ef8:G, 6nef:A
52	6pth:A	369	37	0.0328	0.0407	0.4054	8.8	4tsz:A, 4tsz:B, 4tsz:C, 4tsz:D, 4tsz:E, 4tsz:F, 4tsz:G, 4tsz:H, 4tsz:I, 4tsz:J, 4tsz:K, 4tsz:L, 4tsz:M, 4tsz:N, 4tsz:O, 4tsz:P
53	2ejt:A	371	54	0.0415	0.0512	0.3519	9.4	2eju:A, 2ytz:A, 2ytz:B
54	7txj:a	199	87	0.0480	0.1106	0.2529	9.4
55	2wad:C	607	29	0.0262	0.0198	0.4138	10.0	2wad:A, 2wae:A

[Back]