Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
YRYTGKLRPHYPLMPTRPVPSYIQRPDYADHPLGMSESEQALKGTSQIKLLSSEDIEGMRLVCRLAREVLDVAAGMIKPG
VTTEEIDHAVHLACIARNCYPSPLNYYNFPKSCCTSVNEVICHGIPDRRPLQEGDIVNVDITLYRNGYHGDLNETFFVGE
VDDGARKLVQTTYECLMQAIDAVKPGVRYRELGNIIQKHAQANGFSVVRSYCGHGIHKLMHTAPNVPHYAKNKAVGVMKS
GHVFTIEPMICEGGWQDETWPDGWTAVTRDGKRSAQFEHTLLVTDTGCEILTRRLDSARPHFMS

The query sequence (length=304) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8p2k:MA 315 304 0.9934 0.9587 0.9934 0.0 2b3h:A, 2b3k:A, 9f1d:EA, 4fli:A, 4flj:A, 4flk:A, 4fll:A, 2g6p:A, 2gz5:A, 4hxx:A, 4ikr:A, 4iks:A, 4ikt:A, 4iku:A, 4iu6:A, 6lzb:A, 6lzc:A, 2nq6:A, 2nq7:A, 4u1b:A, 4u69:A, 4u6c:A, 4u6e:A, 4u6j:A, 4u6w:A, 4u6z:A, 4u70:A, 4u71:A, 4u73:A, 4u75:A, 4u76:A, 5ykp:A, 5yr4:A, 5yr5:A, 5yr6:A, 5yr7:A
2 8bqd:x 367 295 0.5493 0.4550 0.5661 1.50e-120 8bqx:x
3 3s6b:A 345 303 0.5362 0.4725 0.5380 1.92e-118
4 4fuk:A 329 303 0.5428 0.5015 0.5446 9.14e-116 4fuk:B
5 4fo8:C 266 254 0.4309 0.4925 0.5157 9.81e-90 4fo7:A, 4fo7:B, 4fo7:C, 4fo7:D, 4fo8:A, 4fo8:B, 4fo8:D, 4juq:A, 4juq:B, 4juq:C, 4juq:D
6 3iu7:A 284 280 0.4474 0.4789 0.4857 3.99e-87 4iec:A, 4if7:A, 3iu8:A, 3iu9:A, 4ook:A, 3pka:A, 3pkb:A, 3pkc:A, 3pkd:A, 3pke:A, 3ror:A, 1yj3:A, 5yoh:A, 5yoi:A, 5ypd:A, 5ypj:A, 5yxf:A
7 8khn:A 287 277 0.4145 0.4390 0.4549 9.11e-83 8kho:A
8 4a6v:A 264 259 0.3947 0.4545 0.4633 2.32e-77 4a6v:B, 4a6w:A, 2bb7:A, 1c21:A, 1c22:A, 1c23:A, 1c24:A, 1c27:A, 3d27:A, 2evc:A, 2evm:A, 2evo:A, 2evo:B, 2gg0:A, 2gg2:A, 2gg3:A, 2gg5:A, 2gg7:A, 2gg8:A, 2gg9:A, 2ggb:A, 2ggc:A, 2gtx:A, 2gtx:B, 2gu4:A, 2gu4:B, 2gu5:A, 2gu5:B, 2gu6:A, 2gu6:B, 2gu7:A, 2gu7:B, 1mat:A, 2mat:A, 3mat:A, 2p98:A, 2p99:A, 2p9a:A, 4pnc:A, 2q92:A, 2q93:A, 2q94:A, 2q95:A, 2q96:A, 1xnz:A, 1yvm:A, 4z7m:A, 4z7m:B
9 3mx6:B 260 255 0.3586 0.4192 0.4275 8.68e-75 3mr1:A, 3mr1:B, 3mr1:C, 3mr1:D, 3mx6:A
10 1qxw:A 249 246 0.2599 0.3173 0.3211 3.45e-42 1qxy:A, 1qxz:A
11 3tav:A 264 224 0.2697 0.3106 0.3661 2.25e-41 3tav:B
12 2dfi:A 301 206 0.1842 0.1860 0.2718 1.04e-17 2dfi:B, 6m00:A, 1wkm:A, 1wkm:B, 1xgm:A, 1xgm:B, 1xgn:A, 1xgn:B, 1xgs:A, 1xgs:B
13 1pv9:A 337 244 0.1974 0.1780 0.2459 4.58e-15
14 3q6d:A 355 261 0.1875 0.1606 0.2184 3.68e-14 3q6d:B, 3q6d:C, 3q6d:D
15 1wy2:A 351 243 0.1809 0.1567 0.2263 1.06e-12 1wy2:B
16 5cdl:A 349 255 0.2105 0.1834 0.2510 6.48e-11 5cdv:A, 5giq:A
17 7k3u:A 362 280 0.2138 0.1796 0.2321 2.20e-10 7k3u:B, 7k3u:C, 7k3u:D, 7k3u:E, 7k3u:F, 7k3u:G, 7k3u:H, 7k3u:I, 7k3u:J, 7n02:A, 7n02:B, 6xmr:A, 6xmr:B, 4zng:C, 4zng:B, 4zng:A
18 1pv9:B 318 242 0.1875 0.1792 0.2355 1.77e-09
19 2zsg:A 356 248 0.1711 0.1461 0.2097 2.61e-08
20 1wn1:A 356 233 0.1678 0.1433 0.2189 6.19e-08 1wn1:B
21 5cnx:A 360 251 0.1875 0.1583 0.2271 1.12e-07 5cnx:B, 5cnx:C
22 4ege:A 371 174 0.1612 0.1321 0.2816 3.30e-07
23 5cde:A 398 249 0.1875 0.1432 0.2289 5.35e-07 5cde:B, 5fcf:A, 5fcf:B, 5fch:A, 5fch:B, 4r60:A, 4r60:B
24 7bhp:A 322 78 0.0855 0.0807 0.3333 1.27e-05
25 4fkc:A 370 179 0.1513 0.1243 0.2570 4.07e-05 4rgz:A, 4rgz:N, 4rgz:1, 4rgz:e
26 8onz:A 385 222 0.1743 0.1377 0.2387 1.13e-04 8onx:A, 8oo0:D
27 8onz:A 385 30 0.0428 0.0338 0.4333 3.9 8onx:A, 8oo0:D
28 1chm:A 401 149 0.1283 0.0973 0.2617 6.08e-04 1chm:B
29 6sxo:A 375 87 0.0855 0.0693 0.2989 0.001 8k2c:CA, 6swa:t, 8xsx:CA, 8xsy:CA, 8xsz:CA, 6z6l:CA, 6z6m:CA, 6z6n:CA, 6zm7:CA, 6zme:CA, 6zmi:CA, 6zmo:CA
30 4pv4:A 436 192 0.1480 0.1032 0.2344 0.002 4pv4:B
31 3ig4:A 419 158 0.1151 0.0835 0.2215 0.002 3ig4:B, 3ig4:C, 3ig4:D, 3ig4:E, 3ig4:F
32 2bh3:A 440 208 0.1513 0.1045 0.2212 0.002 1a16:A, 2bha:A, 2bhb:A, 2bhd:A, 2bn7:A, 2bws:A, 2bwt:A, 2bwv:A, 2bww:A, 2bwx:A, 2bwy:A, 1jaw:A, 1m35:A, 1m35:B, 1m35:C, 1m35:D, 1m35:E, 1m35:F, 1n51:A, 2v3x:A, 2v3y:A, 2v3z:A, 1w2m:A, 1w2m:B, 1w2m:C, 1w2m:D, 1w2m:E, 1w2m:F, 1w7v:A, 1w7v:B, 1w7v:C, 1w7v:D, 1wbq:A, 1wbq:B, 1wbq:C, 1wbq:D, 1wl6:A, 1wl9:A
33 5wze:B 449 197 0.1480 0.1002 0.2284 0.004 5wze:A, 5wze:C, 5wze:D
34 6yo9:A 398 254 0.1480 0.1131 0.1772 0.006 6twk:A, 6twk:B, 6yo9:B
35 5x49:A 441 258 0.1743 0.1202 0.2054 0.031 5x49:B
36 4cxv:A 258 118 0.0888 0.1047 0.2288 0.82 4cwm:A, 4cwm:B, 4cxo:A, 4cxp:A, 4cxv:B, 3w52:A
37 3fm3:A 356 24 0.0428 0.0365 0.5417 0.89 3fm3:B, 3fmq:A, 3fmq:B, 3fmr:A, 3fmr:B
38 8jxr:C 341 56 0.0559 0.0499 0.3036 1.3
39 6z1h:A 382 182 0.1349 0.1073 0.2253 1.6
40 4c25:A 212 61 0.0493 0.0708 0.2459 1.7 4c24:A
41 3rva:A 445 56 0.0526 0.0360 0.2857 1.7
42 7rxc:B 439 56 0.0559 0.0387 0.3036 1.8 7rxd:B
43 3bxo:A 236 47 0.0526 0.0678 0.3404 1.9 3bxo:B
44 6ekj:A 206 93 0.0757 0.1117 0.2473 2.0 3abd:B, 3abe:C, 6bc8:A, 6bcd:A, 6bi7:A, 6bi7:C, 6ekl:A, 6ekm:A, 4ext:C, 4gk0:A, 4gk0:B, 4gk5:A, 4gk5:B, 6k07:A, 6k08:A, 5o8k:A, 6ve5:A, 3vu7:C, 6ws0:CCC, 6ws5:CCC, 6ww9:A, 6ww9:B, 5xpt:A
45 8hki:Q 262 53 0.0592 0.0687 0.3396 3.4
46 2nvu:B 789 92 0.0757 0.0292 0.2500 3.5 3dbh:B, 3dbh:D, 3dbh:F, 3dbh:H, 3dbl:B, 3dbl:D, 3dbl:F, 3dbl:H, 3dbr:B, 3dbr:D, 3dbr:F, 3dbr:H, 3gzn:B, 3gzn:D, 1r4m:F, 1r4m:H, 1r4n:B, 1r4n:D, 1r4n:F, 1r4n:H, 1tt5:B, 1tt5:D, 1yov:B, 1yov:D
47 6sjv:A 529 89 0.0724 0.0416 0.2472 3.7 6sqc:A
48 7uaj:B 512 89 0.0724 0.0430 0.2472 3.8 2fk4:A, 8gcr:A, 4giz:C, 4giz:D, 8jrn:D, 8jrn:B, 8jro:D, 8jro:B, 8jrp:B, 8jrp:D, 8jrq:B, 8jrq:D, 8jrr:B, 8jrr:D, 8r1f:B, 8r1g:B, 8r1g:E, 6siv:B, 6sja:B, 7uaj:A, 7uaj:C, 7uaj:D, 4xr8:F
49 4my2:A 474 89 0.0724 0.0464 0.2472 4.5 5bpu:A, 5bpu:D, 5bpu:C, 5bpu:E, 5bqc:A
50 4nuf:A 549 92 0.0757 0.0419 0.2500 4.7
51 3ob4:A 474 89 0.0724 0.0464 0.2472 4.8
52 5hzv:A 598 92 0.0757 0.0385 0.2500 5.0
53 4qsz:A 686 92 0.0757 0.0335 0.2500 5.0 8j25:A, 8j2p:E, 8j2p:A, 4kyc:A, 4qsz:B, 4qu2:A, 4qu2:B
54 7wr3:A 794 49 0.0493 0.0189 0.3061 5.1 7wr3:B, 7wr5:A
55 4wrn:B 663 92 0.0757 0.0347 0.2500 5.1
56 3py7:A 500 92 0.0757 0.0460 0.2500 5.2
57 4wrn:A 693 89 0.0724 0.0317 0.2472 5.3 7pfp:B
58 3d4g:E 472 92 0.0757 0.0487 0.2500 5.4 3d4c:A, 3d4g:A, 3d4g:B, 3d4g:C, 3d4g:D, 3d4g:F, 3d4g:G, 3d4g:H, 3ef7:A, 3ef7:B, 5osq:A, 5osq:B
59 4keg:A 535 92 0.0757 0.0430 0.2500 5.5 4n4x:A
60 4xai:A 565 92 0.0757 0.0407 0.2500 5.5 4xai:B
61 7nvm:Q 538 141 0.1151 0.0651 0.2482 5.6 8i1u:H, 8i1u:P, 8i9u:H, 8i9u:P, 7nvl:Q, 7nvl:q, 7nvm:q, 7nvn:Q, 7nvn:q, 6qb8:q, 6qb8:Q, 8sfe:q, 8sfe:Q, 8sff:Q, 8sff:q, 8sg8:Q, 8sg8:q, 8sg9:Q, 8sg9:q, 8sgc:Q, 8sgc:q, 8sgl:Q, 8sgl:q, 8sgq:q, 8sgq:Q, 8sh9:Q, 8sh9:q, 8sha:Q, 8sha:q, 8shd:Q, 8shd:q, 8she:Q, 8she:q, 8shf:Q, 8shf:q, 8shg:Q, 8shg:q, 8shl:Q, 8shl:q, 8shn:Q, 8shn:q, 8sho:Q, 8sho:q, 8shp:Q, 8shp:q, 8shq:Q, 8shq:q, 8sht:Q, 8sht:q, 7trg:B, 7ttn:B, 7ttt:B, 7tub:B, 7wu7:H, 7wu7:P, 7wz3:q, 7x0s:J, 7x0s:P, 7x0v:J, 7x0v:P, 7x3j:Q, 7x3j:q, 7x3u:Q, 7x3u:q
62 5jon:A 509 89 0.0724 0.0432 0.2472 5.8 5jon:B
63 8c5l:B 557 89 0.0724 0.0395 0.2472 5.9 8c5l:A
64 5dfm:A 509 92 0.0757 0.0452 0.2500 6.0 5dfm:B
65 6slm:A 539 89 0.0724 0.0408 0.2472 6.1
66 1r6z:Z 499 89 0.0724 0.0441 0.2472 6.1 3mj0:A, 1r6z:P, 1r6z:A, 1t2r:A, 1t2s:A
67 5tj4:E 556 89 0.0724 0.0396 0.2472 6.3 5tib:A, 5tib:B, 5tj2:A, 5tj2:B, 5tj2:C, 5tj2:D, 5tj4:A, 5tj4:B, 5tj4:C, 5tj4:D, 5tj4:F, 5tj4:G, 5tj4:H, 5tj4:I, 5tj4:J
68 2vgq:A 461 89 0.0724 0.0477 0.2472 6.5
69 4xaj:B 570 89 0.0724 0.0386 0.2472 6.6 4xaj:C, 4xaj:D, 4xaj:A
70 2xz3:A 459 92 0.0757 0.0501 0.2500 6.7
71 5fsg:A 661 89 0.0724 0.0333 0.2472 6.8
72 7mk7:A 369 92 0.0757 0.0623 0.2500 6.9 7mk7:B
73 4h1g:A 670 53 0.0526 0.0239 0.3019 6.9
74 5aza:A 836 92 0.0757 0.0275 0.2500 6.9 5b3z:A, 5b3z:B, 5b3z:C, 5b3z:D, 2zag:A, 2zag:B, 2zag:C, 2zag:D, 2zai:A, 2zai:B, 2zai:C, 2zai:D
75 4b3n:A 557 92 0.0757 0.0413 0.2500 7.0 4b3n:B
76 8tlx:A 439 92 0.0757 0.0524 0.2500 7.2 2mv7:A, 2n4q:B, 8tlv:A, 8tlw:A
77 8sbu:A 585 92 0.0757 0.0393 0.2500 7.3 8sbu:B
78 5t05:B 677 89 0.0724 0.0325 0.2472 7.3 5t03:A, 5t03:B, 5t05:A, 5t0a:A, 5t0a:B
79 3f5f:A 656 89 0.0724 0.0335 0.2472 7.3 4ndz:A, 4ndz:B, 4ndz:C, 4ndz:D, 4ndz:E, 4ndz:F
80 6smv:A 525 92 0.0757 0.0438 0.2500 7.4
81 4pqk:B 479 89 0.0724 0.0459 0.2472 7.4 4pqk:A, 4pqk:C, 4pqk:D
82 1ttx:A 109 37 0.0395 0.1101 0.3243 7.5
83 5hzw:A 668 92 0.0757 0.0344 0.2500 7.6 5i04:A
84 4ozq:B 687 89 0.0724 0.0320 0.2472 7.7 4ozq:A
85 6wbj:A 432 92 0.0757 0.0532 0.2500 7.9 6wbh:A
86 3mp8:A 513 89 0.0724 0.0429 0.2472 8.0 3mp1:A, 3mp6:A
87 8g8w:B 398 85 0.0724 0.0553 0.2588 8.1
88 1hsj:A 487 89 0.0724 0.0452 0.2472 8.4 1hsj:B
89 5edu:B 723 49 0.0493 0.0207 0.3061 8.4 5edu:A, 5iqz:A
90 4bl8:B 734 92 0.0757 0.0313 0.2500 8.4 4bl8:A, 4bl9:A, 4bl9:B, 4bl9:C, 4bl9:D, 4blb:A, 4blb:B, 4blb:C, 4blb:D, 4bld:A, 4bld:B, 4bld:C, 4bld:D, 4kmd:A
91 5ttd:A 491 88 0.0724 0.0448 0.2500 8.5
92 5w0r:A 548 89 0.0724 0.0401 0.2472 8.6 5jj4:C, 5jj4:A, 5jj4:B, 5w0r:B, 5w0u:B, 5w0u:A, 5w0z:B, 5w0z:A, 5w1c:B, 5w1c:A
93 3h4z:A 568 92 0.0757 0.0405 0.2500 8.6 3h4z:B, 3h4z:C
94 3abd:A 180 89 0.0757 0.1278 0.2584 8.7 6bi7:E, 5xpu:A
95 7e29:A 496 92 0.0757 0.0464 0.2500 8.8
96 6gfj:A 457 89 0.0724 0.0481 0.2472 8.8 6gfj:B, 6gfj:C, 6gfj:D
97 6x91:H 558 89 0.0724 0.0394 0.2472 8.8 6x91:D
98 4qvh:A 596 89 0.0724 0.0369 0.2472 8.8 6ct5:A, 6ct5:B, 7ed0:A, 8gkf:A, 8gkf:B, 8gkf:C, 8gkf:D, 8gkf:E, 8gkf:H, 8gkf:I, 7n8e:A, 7n8e:B, 7n8l:A, 7n8l:B, 7n8m:A, 7n8m:B, 4qjk:A, 4qvh:B, 8qzi:A, 8qzi:B, 8qzi:C, 8qzi:D, 8qzj:A, 8qzj:B, 8qzj:C, 8qzj:D, 4u89:A
99 5gpq:A 460 92 0.0757 0.0500 0.2500 8.9
100 3l2j:A 484 89 0.0724 0.0455 0.2472 8.9 3c4m:A, 3c4m:B, 3h3g:A, 3l2j:B
101 8h68:A 624 89 0.0724 0.0353 0.2472 8.9 8hb2:A, 8hb2:B, 8hb2:C, 8hb2:D, 8hbb:A, 8hbb:B, 8hbb:C, 8hbb:D
102 6xds:A 485 87 0.0724 0.0454 0.2529 8.9 6b8o:B, 6b8o:E, 6b8o:C, 6b8o:F, 6b8o:A, 6b8o:D
103 5gpp:B 462 89 0.0724 0.0476 0.2472 9.1 5gpp:A
104 3osq:A 607 92 0.0757 0.0379 0.2500 9.2
105 6dd5:A 652 89 0.0724 0.0337 0.2472 9.3 6dd5:B, 3rum:A, 3vfj:A
106 8e0p:B 789 50 0.0493 0.0190 0.3000 9.3 8e0p:A, 8e0p:C, 8e0p:D
107 4kv3:A 456 92 0.0757 0.0504 0.2500 9.3 4kv3:B
108 8iiy:A 506 91 0.0757 0.0455 0.2527 9.4 8dkb:A, 8dkb:B, 8dkb:C, 8dkb:D, 8dkb:E, 8dkb:F, 8dkb:G, 8dkb:H, 8i60:C, 8i60:D, 8iiz:A, 8ij0:A, 8ij0:B, 7jfy:B, 7jfy:A, 7jfy:C, 7jfy:D, 5r68:B, 5r68:A, 5r69:B, 5r69:A, 5vnb:A, 5vnb:B, 5vnb:D, 5xtz:A, 5y8v:D
109 6xrx:A 551 92 0.0757 0.0417 0.2500 9.4
110 6k7f:A 499 89 0.0724 0.0441 0.2472 9.5
111 6x91:A 592 89 0.0724 0.0372 0.2472 9.5 6x91:B, 6x91:C, 6x91:E, 6x91:F, 6x91:G
112 6xdj:A 441 89 0.0724 0.0499 0.2472 9.6 6xaw:A, 6xdj:B
113 5h7q:A 469 92 0.0757 0.0490 0.2500 10.0 5wpz:A, 5wpz:B, 5wpz:C, 5wpz:D, 5wpz:E, 5wpz:F, 5wq6:A, 5wq6:B, 5wq6:C, 5wq6:D
114 4dxb:A 637 89 0.0724 0.0345 0.2472 10.0 4dxb:B, 4dxc:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218