Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
YFQSVAILQKRDHEGFGFVLRGAKAETPIEEFTPTPAFPALQYLESVDVEGVAWKAGLRTGDFLIEVNGVNVVKVGHKQV
VGLIRQGGNRLVMKVVSVT

The query sequence (length=99) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5izu:A 124 97 0.9495 0.7581 0.9691 5.29e-65 6exj:A, 6exj:C, 5izu:C, 5ovc:A, 5ovp:A, 5ovv:A
2 6yx0:B 112 97 0.7778 0.6875 0.7938 1.89e-52 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
3 3o5n:E 92 97 0.8182 0.8804 0.8351 5.59e-51
4 7pcb:A 415 88 0.3535 0.0843 0.3977 1.66e-12 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
5 6x23:A 89 86 0.2929 0.3258 0.3372 1.02e-08
6 2os6:A 89 85 0.3030 0.3371 0.3529 3.28e-08
7 2m0u:A 117 83 0.3333 0.2821 0.3976 7.78e-08
8 2m0v:A 128 88 0.2929 0.2266 0.3295 4.49e-07
9 2r4h:C 98 97 0.2828 0.2857 0.2887 1.88e-06
10 8b82:A 108 85 0.2828 0.2593 0.3294 4.39e-06 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
11 4e34:A 87 93 0.3030 0.3448 0.3226 8.28e-06 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
12 5wou:A 95 86 0.2828 0.2947 0.3256 3.17e-05
13 2egn:A 83 96 0.2727 0.3253 0.2812 5.45e-05
14 7d6f:A 87 93 0.2121 0.2414 0.2258 6.07e-05
15 6xa7:B 96 83 0.2727 0.2812 0.3253 6.77e-05 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
16 2kqf:A 96 88 0.2626 0.2708 0.2955 1.38e-04 2kyl:A
17 2qt5:A 194 46 0.1616 0.0825 0.3478 7.97e-04 2qt5:B
18 2qt5:A 194 97 0.2323 0.1186 0.2371 0.008 2qt5:B
19 6ezi:A 86 55 0.2020 0.2326 0.3636 0.002 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
20 7qqn:C 414 38 0.1414 0.0338 0.3684 0.003 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
21 4xh7:A 110 46 0.1717 0.1545 0.3696 0.010
22 5zys:A 90 86 0.2929 0.3222 0.3372 0.019
23 4wyu:A 201 39 0.1414 0.0697 0.3590 0.022 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
24 4wyu:A 201 92 0.2626 0.1294 0.2826 0.50 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
25 7x2e:A 163 35 0.1212 0.0736 0.3429 0.037 2kbs:A
26 3bpu:A 86 33 0.1414 0.1628 0.4242 0.054
27 2l4t:A 124 80 0.2525 0.2016 0.3125 0.18 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
28 3ch8:A 190 54 0.1717 0.0895 0.3148 0.20 2qbw:A
29 2m0z:A 97 47 0.1717 0.1753 0.3617 0.20 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
30 1n7t:A 103 54 0.1717 0.1650 0.3148 0.22 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
31 4gvc:A 94 26 0.1212 0.1277 0.4615 0.25 4gvd:A, 4gvd:B, 3kze:A, 3kze:B, 3kze:C, 4nxq:A, 4nxq:B, 4nxq:C, 4nxr:A
32 4ynn:A 400 90 0.2525 0.0625 0.2778 0.27 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
33 4ynn:A 400 45 0.1212 0.0300 0.2667 4.3 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
34 3jxt:A 96 29 0.1111 0.1146 0.3793 0.30 3jxt:B
35 7xft:A 86 54 0.2020 0.2326 0.3704 0.36
36 3pv3:A 392 74 0.2020 0.0510 0.2703 0.40 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
37 6hiv:DB 1111 39 0.1616 0.0144 0.4103 0.53 6hiw:DB, 6hiz:DB, 7pua:DB
38 7p73:A 420 54 0.1616 0.0381 0.2963 0.70 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
39 7w6x:A 447 45 0.1616 0.0358 0.3556 0.72
40 7pc3:A 405 58 0.1818 0.0444 0.3103 0.83 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
41 3cs0:A 392 47 0.1616 0.0408 0.3404 0.87 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
42 5heb:A 119 36 0.1111 0.0924 0.3056 1.3 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
43 2kpl:A 129 78 0.2323 0.1783 0.2949 1.4
44 5n7d:A 423 77 0.2424 0.0567 0.3117 1.6 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
45 7p70:A 407 39 0.1010 0.0246 0.2564 2.4 7pc4:A, 7qql:A
46 3ram:A 391 82 0.2525 0.0639 0.3049 3.6 3ram:B, 3ram:C, 3ram:D
47 5xxb:p 122 60 0.1717 0.1393 0.2833 4.5
48 2pdz:A 86 88 0.2020 0.2326 0.2273 5.2
49 8blu:B 195 53 0.1212 0.0615 0.2264 6.6 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
50 7aor:ab 1110 41 0.1414 0.0126 0.3415 7.2
51 6hks:B 94 76 0.2121 0.2234 0.2763 8.3 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
52 8tua:A 1329 39 0.1414 0.0105 0.3590 8.5 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
53 1jwh:D 204 23 0.0909 0.0441 0.3913 9.4 4dgl:A, 4dgl:B, 3eed:A, 3eed:B, 1jwh:C, 4md7:A, 4md7:B, 4md7:C, 4md7:D, 4md8:A, 4md8:B, 4md8:C, 4md8:D, 4md9:A, 4md9:B, 4md9:C, 4md9:D, 4md9:I, 4md9:J, 4md9:N, 4md9:O, 4nh1:C, 4nh1:D, 1qf8:A, 1qf8:B, 2r6m:A, 2r6m:B, 1rqf:B, 1rqf:E, 1rqf:D, 1rqf:J, 1rqf:A, 1rqf:G, 1rqf:H, 1rqf:K

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417