Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
YEYEEITLERGNSGLGFSIAGGTDNPDSSIFITKIITGGAAAQDGRLRVNDCILRVNEVDVRDVTHSKAVEALKEAGSIV
RLYVKRR

The query sequence (length=87) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8cn1:H 101 91 1.0000 0.8614 0.9560 1.02e-56 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
2 2ka9:A 189 90 0.9080 0.4180 0.8778 9.94e-49 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
3 2ka9:A 189 86 0.5287 0.2434 0.5349 4.24e-21 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
4 8c1t:A 90 89 0.6092 0.5889 0.5955 4.04e-29 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
5 8bq8:C 93 85 0.5057 0.4731 0.5176 1.48e-21 8bq8:A, 8bq8:B
6 7pc3:A 405 86 0.5057 0.1086 0.5116 2.27e-19 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
7 7p73:A 420 88 0.4943 0.1024 0.4886 1.45e-18 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
8 5heb:A 119 86 0.4368 0.3193 0.4419 1.65e-16 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
9 3jxt:A 96 79 0.4138 0.3750 0.4557 1.03e-15 3jxt:B
10 4wyu:A 201 93 0.4713 0.2040 0.4409 5.66e-15 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
11 4wyu:A 201 78 0.3563 0.1542 0.3974 1.03e-09 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
12 2r4h:C 98 85 0.3333 0.2959 0.3412 7.32e-15
13 7p70:A 407 72 0.4483 0.0958 0.5417 5.55e-14 7pc4:A, 7qql:A
14 6xa7:B 96 84 0.4023 0.3646 0.4167 7.23e-14 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
15 5wou:A 95 90 0.4138 0.3789 0.4000 4.48e-13
16 8b82:A 108 92 0.4598 0.3704 0.4348 5.93e-13 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
17 2i0i:A 81 81 0.4253 0.4568 0.4568 9.09e-13 2i0i:B, 2i0i:C
18 8bp4:A 93 76 0.3448 0.3226 0.3947 9.34e-13 8bp4:C, 8bp4:B
19 2pdz:A 86 81 0.4253 0.4302 0.4568 5.24e-12
20 2koh:A 111 87 0.3793 0.2973 0.3793 4.03e-11 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
21 5zys:A 90 89 0.3678 0.3556 0.3596 1.76e-10
22 2m0z:A 97 84 0.3103 0.2784 0.3214 2.19e-10 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
23 8bv7:A 95 60 0.2989 0.2737 0.4333 3.97e-10 8buw:A, 8buw:B
24 7qct:A 90 87 0.3563 0.3444 0.3563 1.99e-09 7qct:B
25 4xhv:A 94 86 0.3448 0.3191 0.3488 2.27e-09
26 2kaw:A 90 62 0.2989 0.2889 0.4194 2.90e-09 6lcb:A, 2mx6:A
27 2l4t:A 124 85 0.3908 0.2742 0.4000 6.13e-09 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
28 4e34:A 87 70 0.3218 0.3218 0.4000 1.35e-08 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
29 1n7f:A 86 82 0.2989 0.3023 0.3171 2.63e-08 1n7f:B
30 6zbq:A 89 61 0.2759 0.2697 0.3934 4.01e-08 6zc4:A
31 2kpl:A 129 73 0.2644 0.1783 0.3151 4.22e-08
32 1l6o:A 95 71 0.2874 0.2632 0.3521 6.63e-08 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
33 5n7d:A 423 67 0.2644 0.0544 0.3433 7.88e-08 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
34 6x23:A 89 83 0.2989 0.2921 0.3133 9.72e-08
35 2exg:A 101 84 0.3103 0.2673 0.3214 7.66e-07 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
36 7qqm:A 413 82 0.3563 0.0751 0.3780 1.30e-06
37 6gbe:A 119 88 0.3218 0.2353 0.3182 2.32e-06
38 2qt5:A 194 84 0.2874 0.1289 0.2976 2.86e-06 2qt5:B
39 1ihj:B 95 86 0.3333 0.3053 0.3372 3.64e-06 1ihj:A
40 1b8q:A 127 67 0.2644 0.1811 0.3433 3.83e-06
41 7pc5:A 405 76 0.2874 0.0617 0.3289 7.47e-06
42 7weg:B 96 72 0.2874 0.2604 0.3472 1.42e-05 7weg:A
43 6kz1:A 97 71 0.2529 0.2268 0.3099 1.81e-04 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
44 3vqg:A 85 73 0.2529 0.2588 0.3014 4.17e-04
45 2m0u:A 117 78 0.2644 0.1966 0.2949 0.002
46 1rzx:A 98 79 0.2759 0.2449 0.3038 0.002 5i7z:A, 1x8s:A
47 4xh7:A 110 76 0.2644 0.2091 0.3026 0.003
48 3bpu:A 86 89 0.3218 0.3256 0.3146 0.004
49 2ejy:A 85 60 0.2069 0.2118 0.3000 0.007
50 3cyy:B 81 59 0.1609 0.1728 0.2373 0.28 3cyy:A
51 4ynn:A 400 51 0.1494 0.0325 0.2549 1.8 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
52 1u38:A 89 30 0.1034 0.1011 0.3000 2.0
53 6nid:B 88 56 0.1954 0.1932 0.3036 2.1 6nid:A, 6nid:C
54 7jro:e 94 28 0.1149 0.1064 0.3571 2.6 7jrp:e
55 2qag:B 246 38 0.1149 0.0407 0.2632 2.9
56 6ar4:B 87 83 0.2299 0.2299 0.2410 3.5 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
57 4g7e:B 833 39 0.1494 0.0156 0.3333 3.7
58 6ldo:A 381 72 0.2644 0.0604 0.3194 5.0 6ldo:B, 6ldo:C, 6ldo:D, 6ldo:E, 6ldo:F, 6le4:A, 6le4:B, 6le4:C, 6le4:D, 6le4:E, 6le4:F
59 8gzh:C 1052 73 0.2759 0.0228 0.3288 5.3 8gzg:C
60 8rpl:B 630 63 0.1954 0.0270 0.2698 6.7 8rpk:A, 8rpk:B, 8rpk:C, 8rpk:D, 8rpl:A, 8rpl:C, 8rpl:D
61 1gvr:A 364 35 0.1609 0.0385 0.4000 9.4 2aba:A, 2abb:A, 3f03:K, 6gi7:A, 6gi8:A, 6gi9:A, 6gia:A, 1gvo:A, 1gvq:A, 1gvs:A, 1h50:A, 1h51:A, 1h60:A, 1h61:A, 1h62:A, 1h63:A, 3kft:A, 3kft:B, 5lgx:A, 5lgz:A, 3p62:A, 3p67:A, 3p74:A, 3p7y:A, 3p80:A, 3p81:A, 3p82:A, 3p84:A, 3p8i:A, 3p8j:A, 1vyp:X, 1vyr:A, 1vys:X
62 9bht:E 288 30 0.1034 0.0312 0.3000 9.6 9bht:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417