BioLiP

>protein
WHDLKWPRDLRPLAHHDLLYMGQISEDRGDFNATLRNFLVPRVVGSQKHREVREFIVRSLKDLDWDVEEDCFDGQTPHGI
KPFCNVIATLNPSACHRLVLACHYDSLLHKEGTFIGATDSAVPCAQLLYLARSLNGKLQNQKTRGDGLTLQLVFFDGEEA
FERWSSHDSLYGSRHLAQKWHEDRTSAERLESCLERSEIANQIDRMEVMVLLDLLGAENPRFYSYFGETQPVYRRLVNIE
SRLNDAGLMELPRRRRRTNYFSNSSTVGFIEDDHIPFLKRSVPIVHIIPSPFPDVWHTLDDNEQNLHHPTISNLNKIFKA
FVSEYLQL

The query sequence (length=328) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7d21:A	328	328	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7d1h:A, 7d1n:A, 7d1y:A, 7d2d:A, 7d2i:A, 7d2j:A, 4mhn:A, 4mhy:A, 4mhz:A
2	4fai:B	305	302	0.4421	0.4754	0.4801	7.14e-89	4fai:A, 4fbe:A, 4fbe:B
3	3si1:A	323	299	0.4482	0.4551	0.4916	6.11e-88	3si2:A
4	6yi1:A	329	302	0.4543	0.4529	0.4934	2.26e-87	2afm:A, 2afm:B, 2afo:A, 2afo:B, 2afs:A, 2afs:B, 2afu:A, 2afu:B, 2afw:A, 2afw:B, 2afx:A, 2afx:B, 2afz:A, 2afz:B, 7cm0:A, 7cm0:B, 7cm0:C, 7cm0:D, 7coz:A, 7coz:B, 7coz:C, 7cp0:A, 7cp0:B, 7cp0:C, 7d8e:A, 7d8e:B, 7d8e:C, 9fxh:A, 9fxh:B, 9fxh:C, 9fxi:A, 9fxi:B, 9fxi:C, 9fxj:A, 9fxj:B, 9fxj:C, 6gbx:A, 6gbx:B, 6gbx:C, 8hy3:A, 3pbb:A, 3pbb:B, 3pbe:A, 3pbe:B, 3si0:A, 8xgb:B, 8xgt:B, 8xgt:A, 8xgt:C, 8xgt:D, 8xgt:E, 8xgt:F, 8xgt:G, 8xgt:H, 8xgt:I, 8xgt:J, 8xgt:K, 8xgt:L, 8xgy:B, 8xgy:E, 8xgy:A, 8xgy:D, 8xgy:C, 8xgy:K, 8xgy:F, 8xgy:I, 8xgy:G, 8xgy:H, 8xgy:J, 8xgy:L, 6yi1:B, 6yjy:A, 6yjy:B, 4yu9:A, 4yu9:B, 4yu9:C, 4ywy:A, 4ywy:B, 4ywy:C, 2zed:A, 2zed:B, 2zee:A, 2zee:B, 2zef:A, 2zef:B, 2zeg:A, 2zeg:B, 2zeh:A, 2zeh:B, 2zel:A, 2zel:B, 2zem:A, 2zem:B, 2zen:A, 2zen:B, 2zeo:A, 2zeo:B, 2zep:A, 2zep:B
5	4f9v:A	307	308	0.4207	0.4495	0.4481	4.32e-85	4f9u:B, 4f9u:A, 4f9v:B, 4fwu:A
6	3pb6:X	313	312	0.4390	0.4601	0.4615	7.59e-80	3pb4:X, 3pb7:X, 3pb8:X, 3pb9:X, 8xfv:X, 8xfv:A, 8xfv:B, 8xfv:C, 8xfv:D, 8xfv:E, 8xfv:F, 8xfv:G, 8xfv:H, 8xfv:I, 8xfv:J, 8xga:A, 8xga:B, 8xga:C, 8xga:D, 8xga:E, 8xga:F, 8xga:G, 8xga:H, 8xga:I, 8xga:J, 8xga:K
7	7d17:A	321	300	0.3689	0.3769	0.4033	4.23e-59
8	7d18:A	293	284	0.2439	0.2730	0.2817	1.51e-22
9	7cje:C	289	306	0.2409	0.2734	0.2582	1.66e-16	7cje:A, 7cjg:A, 7cjg:B, 6qql:A, 6qql:B
10	3tc8:A	293	292	0.2043	0.2287	0.2295	3.02e-09	3tc8:B
11	6qro:A	291	293	0.1768	0.1993	0.1980	1.12e-06	6qro:B, 6qro:C, 6qro:D
12	7d1d:A	294	294	0.2043	0.2279	0.2279	3.73e-05	7d1e:A, 4fuu:A
13	7d1b:A	302	308	0.1982	0.2152	0.2110	6.12e-05
14	2ek8:A	412	246	0.1738	0.1383	0.2317	0.003	2ek9:A, 5ib9:A
15	1h54:B	754	65	0.0579	0.0252	0.2923	0.30
16	8a98:SN	101	39	0.0457	0.1485	0.3846	1.5	8a3w:SN, 6az1:N, 8ovj:SN, 8rxh:SN, 8rxx:SN, 5t2a:AD

[Back]