BioLiP

>protein
VTSKEWIIPPRPKPGRKPATDTPPTKRKAQNRAAQRAFRERRAARVSELEDQIKKIEDDHEIHVATFKEQIANLSREVEQ
CRTEMGWWRDRSH

The query sequence (length=93) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7aw7:D	93	93	1.0000	1.0000	1.0000	1.40e-64	7aw7:E, 7aw9:D, 7aw9:E
2	1gd2:E	65	44	0.2366	0.3385	0.5000	1.03e-06	1gd2:F, 1gd2:G, 1gd2:H
3	3vkh:B	2908	59	0.2043	0.0065	0.3220	0.072
4	3vkg:B	2853	56	0.2151	0.0070	0.3571	0.17
5	3vkg:A	2954	45	0.1828	0.0058	0.3778	0.23
6	3vkh:A	3042	90	0.2581	0.0079	0.2667	0.28
7	5vpe:D	67	56	0.1720	0.2388	0.2857	0.52	5vpe:B, 5vpf:B, 5vpf:D
8	5wp6:A	977	25	0.0968	0.0092	0.3600	0.55	6bqv:A, 6bqv:C, 6bqv:B, 6bqv:D, 5wp6:B, 5wp6:C, 5wp6:D
9	1ej6:C	1221	40	0.1613	0.0123	0.3750	0.63	7elh:G, 7elh:K, 7elh:m, 7yed:A, 7yed:E, 7yed:B, 7yed:C, 7yed:a, 7yed:b, 7yed:c, 7yed:d, 7yed:e, 7yev:A, 7yev:B, 7yev:C, 7yev:a, 7yev:b, 7yev:c, 7yev:d, 7yev:e, 7yez:b, 7yf0:B, 7yf0:C, 7yf0:a, 7yf0:b, 7yf0:c, 7yf0:d, 7yf0:e, 7yfe:B, 7yfe:C, 7yfe:a, 7yfe:b, 7yfe:c, 7yfe:d, 7yfe:e
10	1yvg:A	397	25	0.1075	0.0252	0.4000	0.80	4j1l:A
11	5n0c:A	1293	25	0.1075	0.0077	0.4000	0.86	1dfq:A, 1diw:A, 1dll:A, 1fv2:A, 1fv3:A, 1fv3:B, 3hmy:A, 3hn1:A, 5n0b:A, 5n0c:B, 1yxw:A, 1yyn:A, 1z7h:A
12	5nz8:A	884	46	0.1398	0.0147	0.2826	1.4
13	6z1p:AL	145	57	0.1183	0.0759	0.1930	1.8
14	6bvd:A	429	24	0.1183	0.0256	0.4583	2.1	6bvd:B
15	7k7m:B	757	32	0.1290	0.0159	0.3750	2.4	7k7m:A, 7n6b:A
16	6aji:A	873	32	0.1290	0.0137	0.3750	2.4
17	6ajf:A	901	32	0.1290	0.0133	0.3750	2.4	6ajg:A, 6ajh:A, 6ajj:A, 7c2m:A, 7c2n:A, 6or2:A, 7wnx:A
18	5n8o:A	1432	25	0.0968	0.0063	0.3600	2.7	4l0j:A, 1p4d:A, 1p4d:B, 1p4d:C, 2q7t:A, 2q7t:B, 2q7u:A
19	5t01:A	62	56	0.1613	0.2419	0.2679	3.5	1a02:J, 1fos:F, 1fos:H, 5fv8:D, 2h7h:A, 2h7h:B, 1jnm:A, 1jnm:B, 1s9k:E, 5t01:B
20	3pif:D	1023	29	0.1290	0.0117	0.4138	4.1
21	3pif:C	1066	29	0.1290	0.0113	0.4138	4.2	3pif:A, 3pif:B
22	4ykn:A	1205	46	0.1290	0.0100	0.2609	6.1	4a55:A, 8am0:A, 8exl:A, 8exo:A, 8exu:A, 8exv:A, 5fi4:A, 8gub:A, 6gvf:A, 6gvg:A, 6gvi:A, 3hhm:A, 7jiu:A, 4jps:A, 4l23:A, 4l2y:A, 7mlk:A, 7myo:A, 4ovv:A, 8ow2:A, 7pg6:A, 6pys:A, 5sx9:A, 5sxj:A, 8tdu:A, 8tdu:C, 8tgd:A, 8tgd:C, 8ts9:A, 8tsa:A, 8tsb:A, 8tsc:A, 8tsd:A, 4tv3:A, 5uk8:A, 5ukj:A, 5ul1:A, 8v8h:A, 8v8h:C, 8v8i:A, 8v8i:C, 8v8j:A, 8v8j:C, 8v8v:A, 8v8v:C, 8w9a:A, 8w9b:A, 4waf:A, 5xgh:A, 5xgi:A, 3zim:A, 4zop:A
23	6wg3:B	693	55	0.1613	0.0216	0.2727	6.2
24	4oqr:A	386	55	0.2043	0.0492	0.3455	6.3	4oqs:A
25	7k84:A	793	23	0.1183	0.0139	0.4783	8.9
26	2i0q:A	461	27	0.1075	0.0217	0.3704	9.0	1jb7:A, 1k8g:A, 1k8g:B, 1kix:A, 1otc:A, 1pa6:A, 1ph1:A, 1ph2:A, 1ph3:A, 1ph4:A, 1ph5:A, 1ph6:A, 1ph7:A, 1ph8:A, 1ph9:A, 1phj:A
27	3ffz:A	1246	23	0.1183	0.0088	0.4783	9.1	3d3x:A, 3d3x:B, 3ffz:B, 7ovw:AAA, 7ovw:BBB, 1t3a:A, 1t3a:B, 1t3c:A, 1t3c:B, 7uib:D, 7uib:A, 1zkw:A, 1zkw:B, 1zkx:A, 4zkt:A, 4zkt:C, 4zkt:E, 1zl6:A, 1zn3:A

[Back]