Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
VSTGALRTITLSKMKQSLGISISGGIESKVQPMVKIEKIFPGGAAFLCGDLQAGFELVAVDGESLEQVTHQRAVDTIRRA
YRNKAREPMELVVRVP

The query sequence (length=96) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7weg:B 96 96 1.0000 1.0000 1.0000 8.96e-67 7weg:A
2 7pc5:A 405 91 0.8958 0.2123 0.9451 1.84e-56
3 6kz1:A 97 87 0.3229 0.3196 0.3563 2.10e-10 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
4 2m0z:A 97 77 0.2917 0.2887 0.3636 1.42e-09 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
5 8bq8:C 93 79 0.3125 0.3226 0.3797 2.23e-09 8bq8:A, 8bq8:B
6 7pc3:A 405 73 0.3125 0.0741 0.4110 2.46e-08 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
7 2ka9:A 189 76 0.3021 0.1534 0.3816 4.42e-08 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
8 2ka9:A 189 96 0.3229 0.1640 0.3229 3.67e-07 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
9 8c1t:A 90 75 0.2917 0.3111 0.3733 5.46e-08 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
10 4e34:A 87 72 0.3125 0.3448 0.4167 1.88e-07 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
11 7p70:A 407 63 0.2917 0.0688 0.4444 8.24e-07 7pc4:A, 7qql:A
12 2pdz:A 86 74 0.3125 0.3488 0.4054 1.13e-06
13 7p73:A 420 75 0.2708 0.0619 0.3467 1.33e-06 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
14 3jxt:A 96 74 0.2604 0.2604 0.3378 2.46e-06 3jxt:B
15 2koh:A 111 65 0.2500 0.2162 0.3692 1.34e-05 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
16 4wyu:A 201 77 0.2812 0.1343 0.3506 3.58e-05 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
17 4wyu:A 201 82 0.3021 0.1443 0.3537 0.001 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
18 2exg:A 101 75 0.2917 0.2772 0.3733 6.37e-05 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
19 8cn1:H 101 75 0.2604 0.2475 0.3333 1.05e-04 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
20 5heb:A 119 74 0.2292 0.1849 0.2973 2.36e-04 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
21 2r4h:C 98 75 0.2083 0.2041 0.2667 3.69e-04
22 8bp4:A 93 68 0.2604 0.2688 0.3676 4.15e-04 8bp4:C, 8bp4:B
23 2l4t:A 124 105 0.3021 0.2339 0.2762 6.65e-04 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
24 6xa7:B 96 81 0.2396 0.2396 0.2840 6.79e-04 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
25 6hks:B 94 78 0.2396 0.2447 0.2949 7.23e-04 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
26 2qt5:A 194 75 0.2604 0.1289 0.3333 0.002 2qt5:B
27 2qt5:A 194 69 0.1875 0.0928 0.2609 0.040 2qt5:B
28 5zys:A 90 74 0.2708 0.2889 0.3514 0.002
29 2m0u:A 117 74 0.2708 0.2222 0.3514 0.005
30 6gbe:A 119 78 0.2083 0.1681 0.2564 0.010
31 1l6o:A 95 89 0.2812 0.2842 0.3034 0.015 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
32 6x23:A 89 72 0.1979 0.2135 0.2639 0.024
33 7qqm:A 413 63 0.2083 0.0484 0.3175 0.033
34 7umw:B 260 64 0.2396 0.0885 0.3594 0.042 1c14:A, 1c14:B, 5cg1:A, 5cg1:B, 5cg2:A, 5cg2:B, 4cv2:A, 4cv2:B, 4cv3:A, 4cv3:B, 4d46:A, 4d46:B, 1d8a:A, 1d8a:B, 1dfg:A, 1dfg:B, 1dfh:A, 1dfh:B, 1dfi:A, 1dfi:B, 1dfi:C, 1dfi:D, 1i2z:A, 1i2z:B, 1i30:A, 1i30:B, 4jqc:A, 4jqc:B, 4jx8:A, 4jx8:B, 1lx6:A, 1lx6:B, 1lxc:A, 1lxc:B, 1mfp:A, 1mfp:B, 3pjd:A, 3pjd:B, 3pje:A, 3pje:B, 3pjf:A, 3pjf:B, 1qg6:A, 1qg6:B, 1qg6:C, 1qg6:D, 1qsg:A, 1qsg:B, 1qsg:C, 1qsg:D, 1qsg:E, 1qsg:F, 1qsg:G, 1qsg:H, 7um8:A, 7um8:B, 7umw:A
35 4xhv:A 94 75 0.2396 0.2447 0.3067 0.050
36 2kaw:A 90 72 0.2292 0.2444 0.3056 0.050 6lcb:A, 2mx6:A
37 8b82:A 108 77 0.2500 0.2222 0.3117 0.086 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
38 3ch8:A 190 67 0.1979 0.1000 0.2836 0.26 2qbw:A
39 4ydp:A 83 66 0.2188 0.2530 0.3182 0.29 4ydp:B
40 1b8q:A 127 48 0.1667 0.1260 0.3333 0.29
41 1n7t:A 103 72 0.2083 0.1942 0.2778 0.30 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
42 5etl:D 160 24 0.1250 0.0750 0.5000 0.37 6an4:A, 6an6:A, 6an6:B, 1dy3:A, 1eqm:A, 5etk:A, 5etl:A, 5etl:B, 5etl:C, 5etm:A, 5etn:A, 5eto:A, 5etp:A, 1ex8:A, 4f7v:A, 1f9h:A, 1g4c:B, 3hd1:A, 3hd2:A, 1hq2:A, 3hsd:A, 3hsd:B, 3hsg:A, 3ht0:A, 3ilj:A, 3ilo:A, 3ip0:A, 7kdo:A, 7kdr:A, 3kuh:A, 4m5g:A, 4m5h:A, 4m5i:A, 4m5j:A, 4m5k:A, 4m5l:A, 4m5m:A, 4m5n:A, 4m5n:B, 1q0n:A, 1rao:A, 1rb0:A, 1rtz:A, 1ru1:A, 1ru1:B, 1ru2:A, 8sif:A, 1tmj:A, 1tmm:A, 1tmm:B, 3ud5:A, 3ude:A, 3udv:A
43 1rzx:A 98 66 0.2188 0.2143 0.3182 0.54 5i7z:A, 1x8s:A
44 2w2m:E 49 34 0.1354 0.2653 0.3824 0.69 2w2n:E, 2w2o:E, 2w2p:E, 2w2q:E
45 4xh7:A 110 69 0.2188 0.1909 0.3043 0.70
46 1u38:A 89 75 0.1979 0.2135 0.2533 0.96
47 4l87:A 476 57 0.1875 0.0378 0.3158 1.2 8p7d:D, 4rqe:A, 4rqf:B
48 2i0i:A 81 55 0.1771 0.2099 0.3091 1.3 2i0i:B, 2i0i:C
49 8p7b:B 455 57 0.1875 0.0396 0.3158 1.3 8p7b:D, 8p7c:B, 8p7c:D, 8p7d:B, 4rqe:C, 4rqf:A
50 7w6x:A 447 51 0.2188 0.0470 0.4118 2.1
51 8bv7:A 95 44 0.1354 0.1368 0.2955 2.2 8buw:A, 8buw:B
52 6cgs:A 207 61 0.2083 0.0966 0.3279 2.2 6cgs:B
53 1n7d:A 639 34 0.1354 0.0203 0.3824 2.4 1ajj:A, 3bps:E, 1d2j:A, 1f8z:A, 2fcw:B, 3gcw:E, 3gcx:E, 1hj7:A, 1hz8:A, 1i0u:A, 2kri:B, 2lgp:A, 3m0c:C, 3p5b:L, 3p5c:L, 1xfe:A
54 6n91:A 334 44 0.1354 0.0389 0.2955 2.8 6n91:B
55 4v6w:Ch 123 24 0.0833 0.0650 0.3333 2.9 6xu6:Ch, 6xu7:Ch, 6xu8:Ch
56 4gqy:A 147 47 0.1458 0.0952 0.2979 3.8 4gqy:B, 4gqy:C, 4gqy:D
57 2qag:B 246 44 0.1354 0.0528 0.2955 5.0
58 6uld:A 428 30 0.1042 0.0234 0.3333 6.2 6uld:B
59 6jq9:B 483 29 0.0938 0.0186 0.3103 7.7 6byp:A, 6byp:B, 6byt:A, 6byt:B, 6byx:A, 6byx:B, 6jq9:A
60 3j79:F 390 33 0.1250 0.0308 0.3636 9.9 3jbn:AF, 3jbo:AF, 3jbp:AF, 8tpu:AF, 5umd:F

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417