BioLiP

>protein
VPTPAEAALAAQTALAADDSPMGDAARWAMGLLTSSGLPRPEDVAARFIPTFAAANFAETVREWRSKGPFTVRAYHPVAH
KGWVVLSAPAGVRYILSLTLDSSGLIRILTLKPETVIPDMVTWNDVEETLHTPGVQHSVYAVRLTPDGHEVLHASAPERP
MPTGSAYKLYLMRALVAEIEKGTVGWDEILTLTPELRSLPTGDMQDLPDGTRVTVRETAHKMIALSDNTGADLVADRLGR
EVVERSLAAAGHHDPSLMRPFLTSHEVFELGWGDPERRAEWVRQDEAGRRELLEKMAGVMTVRGSDLGATVHQLGIDWHM
DAFDVVRVLEGLLQDSGRDTSGTVEEILTAYPGLLIDEERWRRVYFKAGASPGVMMFCWLLQDHAGISYVLVLRQSADEQ
RLIGDGLFLRGIGAKIIEAEAKLLSSG

The query sequence (length=427) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2xf3:B	428	428	0.9977	0.9953	0.9953	0.0	2xf3:A, 2xfs:A, 2xfs:B, 2xh9:A, 2xh9:B
2	2jbf:D	274	79	0.0585	0.0912	0.3165	6.92e-06	2j8y:A, 2j8y:B, 2j8y:C, 2j8y:D, 2jbf:A, 2jbf:B, 2jbf:C
3	2v1z:A	270	129	0.0820	0.1296	0.2713	0.004	1axb:A, 1bt5:A, 8de0:A, 8de0:B, 8de0:C, 8de0:D, 8de1:A, 8de1:B, 8de1:C, 8de1:D, 8de2:A, 8de2:B, 8de2:C, 8de2:D, 1erm:A, 1ero:A, 1erq:A, 1esu:A, 1fqg:A, 1jvj:A, 1jwv:A, 1jwz:A, 1li0:A, 1m40:A, 1nxy:A, 1ny0:A, 1nym:A, 1nyy:A, 4opz:A, 4oq0:A, 4oqg:A, 4oqg:B, 4oqg:C, 4oqg:D, 4oqg:F, 4oqh:A, 1pzo:A, 1pzp:A, 7qlp:A, 7qlp:C, 7qlp:D, 7qlp:E, 7qnk:A, 7qnk:B, 7qnk:C, 7qnk:D, 7qnk:E, 4rva:A, 1tem:A, 2v20:A, 1xpb:A
4	4dxb:A	637	106	0.0632	0.0424	0.2547	0.098	4dxb:B, 4dxc:A
5	8of9:A	254	85	0.0632	0.1063	0.3176	0.55	8rqu:B
6	5zqa:A	248	110	0.0609	0.1048	0.2364	1.3	5zqb:A, 5zqb:B, 5zqb:C, 5zqb:D, 5zqc:A, 5zqc:B, 5zqc:C, 5zqc:D, 5zqd:A, 5zqd:B, 5zqd:C, 5zqd:D, 5zqd:E, 5zqd:F, 5zqd:G, 5zqd:H, 5zqe:A, 5zqe:B, 5zqe:C, 5zqe:D, 5zqe:E, 5zqe:F, 5zqe:G, 5zqe:H
7	4mf6:A	240	98	0.0703	0.1250	0.3061	1.4	4mf5:A
8	8i4a:A	1218	63	0.0492	0.0172	0.3333	2.7	8bwo:A, 8i4c:A, 8j3w:A, 8j3z:A, 8xol:A, 8xom:A
9	7q8b:A	370	97	0.0585	0.0676	0.2577	4.2	8c47:A, 7q8b:B, 7q8b:C, 7q8b:D, 7q8b:E, 7q8c:A, 7q8c:B, 7q8c:C, 7q8c:D, 7q8c:E, 7q8s:A, 7q8s:C, 7q8s:D, 7q8s:E, 7q8s:F
10	1wdl:A	715	72	0.0468	0.0280	0.2778	4.6	2d3t:A, 2d3t:B, 1wdk:A, 1wdk:B, 1wdl:B, 1wdm:A, 1wdm:B
11	8apw:A	250	46	0.0328	0.0560	0.3043	5.7	8apt:A, 8apu:A, 8apv:A, 3axz:A, 5d9f:A, 4mcb:A, 4mcb:B, 4mcc:A, 4mcc:B, 4mcd:A, 1uak:A, 1ual:A, 1uam:A, 4ypw:A, 4ypx:A, 4ypy:A, 4ypz:A, 4yq0:A, 4yq1:A, 4yq2:A, 4yq3:A, 4yq4:A, 4yq5:A, 4yq6:A, 4yq7:A, 4yq8:A, 4yq9:A, 4yqa:A, 4yqb:A, 4yqc:A, 4yqd:A, 4yqg:A, 4yqi:A, 4yqj:A, 4yqk:A, 4yql:A, 4yqn:A, 4yqo:A, 4yqp:A, 4yqq:A, 4yqr:A, 4yqs:A, 4yqt:A, 4yvg:A, 4yvh:A, 4yvi:A, 4yvi:B, 4yvj:A, 4yvj:B, 4yvk:A, 4yvk:B
12	8ccn:A	372	186	0.1077	0.1237	0.2473	6.2	4cbx:A, 8ccn:B, 8ccn:C, 8ccn:D, 8ccn:E, 8ccn:F, 8cco:A, 8cco:B, 8cco:C, 8cco:D, 8cco:E, 8cco:F, 6i4m:A
13	4pl7:A	382	54	0.0445	0.0497	0.3519	6.3	4pl7:B, 7zvw:B
14	2xgf:A	216	38	0.0328	0.0648	0.3684	6.3	2xgf:B, 2xgf:C
15	2ik0:B	286	112	0.0609	0.0909	0.2321	7.1	117e:A, 117e:B, 1e6a:A, 1e6a:B, 1e9g:A, 1e9g:B, 1huj:A, 1huj:B, 1huk:A, 1huk:B, 2ihp:A, 2ihp:B, 2ik0:A, 2ik1:A, 2ik1:B, 2ik2:A, 2ik2:B, 2ik4:A, 2ik4:B, 2ik6:A, 2ik6:B, 2ik7:A, 2ik7:B, 2ik9:A, 1m38:A, 1m38:B, 8prk:A, 8prk:B, 1wgi:A, 1wgi:B, 1wgj:A, 1wgj:B, 1ypp:A, 1ypp:B
16	1c0g:A	368	54	0.0445	0.0516	0.3519	7.3	1dej:A, 8xvg:K, 8xvt:K
17	5f83:A	268	85	0.0562	0.0896	0.2824	7.7	5f83:B, 4gog:A, 4gog:B, 4h8r:A, 4h8r:B, 3nia:A, 6q35:A, 6q35:B, 4qu3:A, 4qu3:B, 8v9g:A, 8v9g:B, 8v9h:A, 8v9h:B
18	5xyi:J	162	72	0.0492	0.1296	0.2917	9.1

[Back]