Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
VPLPEGNQLFGVVEQALGAGWMDVRCEDGKIRRCRIPGKLRRRVWIRVGDLVIVQPWPVQSDKRGDIVYRYTQTQVDWLL
RKGKITQEFLTG

The query sequence (length=92) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5jb3:6 95 92 1.0000 0.9684 1.0000 9.69e-63 5jbh:6, 6sw9:6, 6swc:6, 6swd:6, 7zag:6, 7zah:6, 7zai:6
2 1d7q:A 143 86 0.2935 0.1888 0.3140 8.82e-10 7a09:G, 4kzy:n, 4kzz:n, 8oz0:G, 8p03:j, 8p09:j, 8pj1:q, 8pj2:q, 8pj3:q, 8pj4:q, 8pj5:q, 8pj6:q, 8ppl:Iq, 7qp6:q, 7qp7:q, 7syq:A, 7syr:A, 7sys:A, 7syv:A, 7syw:A, 7syx:A, 7tql:4, 6yal:j, 6yam:j, 6ybw:q, 6zmw:q, 6zp4:G
3 6fyx:i 121 81 0.2826 0.2149 0.3210 9.48e-10 8cah:i, 8cas:A, 6fyy:i, 6gsm:i, 6gsn:i, 3j80:i, 3j81:i, 3jam:i, 3jap:i, 8rw1:i, 8s8d:i, 8s8e:i, 8s8f:i, 8s8g:i, 8s8h:i, 8s8i:i, 8s8j:i, 4uer:0, 6zce:i, 6zu9:A
4 4bts:A0 99 78 0.3152 0.2929 0.3718 1.65e-08 4bts:B0, 4bts:C0, 4bts:D0
5 7ase:w 147 89 0.2609 0.1633 0.2697 7.75e-07
6 6zxg:j 116 81 0.2174 0.1724 0.2469 0.003 6zxf:j, 6zxh:j
7 6opc:B 741 37 0.1739 0.0216 0.4324 0.063 8dar:A, 8dar:B, 8dar:C, 8dar:D, 8dar:E, 8dar:F, 8das:A, 8das:B, 8das:C, 8das:D, 8das:E, 8das:F, 8dat:A, 8dat:B, 8dat:C, 8dat:D, 8dat:E, 8dat:F, 8dau:A, 8dau:B, 8dau:C, 8dau:D, 8dau:E, 8dau:F, 8dav:A, 8dav:B, 8dav:C, 8dav:D, 8dav:E, 8dav:F, 8daw:A, 8daw:B, 8daw:C, 8daw:D, 8daw:E, 8daw:F, 6oa9:A, 6oa9:B, 6oa9:C, 6oa9:E, 6oa9:F, 6oaa:B, 6oaa:C, 6oaa:D, 6oab:D, 6oab:B, 6oab:C, 6oab:A, 6omb:A, 6omb:B, 6omb:C, 6omb:D, 6omb:E, 6opc:A, 6opc:C, 6opc:D, 6opc:E
8 7vcs:A 766 43 0.1848 0.0222 0.3953 0.074 8b5r:A, 8b5r:B, 8b5r:C, 5b6c:A, 9boq:A, 9boq:B, 9boq:C, 9boq:D, 9boq:E, 9boq:F, 9boq:G, 9boq:H, 9boq:I, 9boq:J, 9boq:K, 9boq:L, 7bp8:A, 7bp8:B, 7bp8:C, 7bp8:D, 7bp8:E, 7bp8:F, 7bp9:A, 7bp9:B, 7bp9:C, 7bp9:D, 7bp9:E, 7bp9:F, 7bpa:A, 7bpa:F, 7bpa:B, 7bpa:C, 7bpa:D, 7bpa:E, 7bpb:A, 7bpb:F, 7bpb:B, 7bpb:C, 7bpb:D, 7bpb:E, 5c18:A, 5c18:B, 5c18:C, 5c18:D, 5c18:E, 5c18:F, 5c1a:A, 5c1a:B, 5c1a:C, 5c1a:D, 5c1a:E, 5c1a:F, 5c1a:G, 5c1a:H, 5c1a:I, 5c1a:J, 5c1a:K, 5c1a:L, 5c1b:D, 5c1b:A, 5c1b:B, 5c1b:C, 5c1b:E, 5c1b:F, 3cf1:A, 3cf1:B, 3cf1:C, 3cf2:A, 3cf2:B, 3cf2:C, 3cf2:D, 3cf3:A, 3cf3:B, 3cf3:C, 5dyg:A, 5dyi:A, 5dyi:B, 5dyi:C, 5dyi:D, 5dyi:E, 5dyi:F, 5dyi:G, 5dyi:H, 5dyi:I, 5dyi:J, 5dyi:K, 5dyi:L, 1e32:A, 5epp:A, 8fcl:A, 8fcl:B, 8fcl:C, 8fcl:D, 8fcl:E, 8fcl:F, 8fcm:B, 8fcm:E, 8fcm:D, 8fcm:C, 8fcm:A, 8fcm:F, 8fcn:F, 8fcn:E, 8fcn:D, 8fcn:C, 8fcn:B, 8fcn:A, 8fco:C, 8fco:B, 8fco:A, 8fco:F, 8fco:E, 8fco:D, 8fcp:E, 8fcp:D, 8fcp:C, 8fcp:B, 8fcp:A, 8fcp:F, 8fcq:B, 8fcq:A, 8fcq:F, 8fcq:E, 8fcq:D, 8fcq:C, 8fcr:A, 8fcr:B, 8fcr:C, 8fcr:D, 8fcr:E, 8fcr:F, 8fct:F, 8fct:A, 8fct:B, 8fct:C, 8fct:D, 8fct:E, 5ftj:A, 5ftj:B, 5ftj:C, 5ftj:D, 5ftj:E, 5ftj:F, 5ftk:A, 5ftk:B, 5ftk:C, 5ftk:D, 5ftk:E, 5ftk:F, 5ftl:A, 5ftl:B, 5ftl:C, 5ftl:D, 5ftl:E, 5ftl:F, 5ftm:A, 5ftm:F, 5ftm:B, 5ftm:C, 5ftm:D, 5ftm:E, 5ftn:A, 5ftn:B, 5ftn:C, 5ftn:D, 5ftn:E, 5ftn:F, 5glf:A, 5glf:C, 5glf:E, 5glf:G, 6hd0:B, 6hd0:T, 6hd0:U, 6hd0:V, 6hd0:A, 6hd0:C, 8hl7:B, 8hrz:A, 8hrz:B, 8hrz:C, 8hrz:D, 8hrz:E, 8hrz:F, 8hrz:G, 8hrz:H, 8hrz:I, 8hrz:J, 8hrz:K, 8hrz:L, 3hu1:A, 3hu1:B, 3hu1:C, 3hu1:D, 3hu1:E, 3hu1:F, 3hu2:A, 3hu2:B, 3hu2:C, 3hu2:D, 3hu2:E, 3hu2:F, 3hu3:A, 3hu3:B, 5ifs:B, 5ifs:D, 7jy5:A, 7jy5:F, 7jy5:B, 7jy5:C, 7jy5:D, 7jy5:E, 8kg2:A, 8kg2:B, 8kg2:C, 8kg2:D, 8kg2:E, 8kg2:F, 8kg2:G, 8kg2:H, 8kg2:I, 8kg2:J, 8kg2:K, 8kg2:L, 5kiw:A, 5kiw:B, 5kiy:A, 4kln:A, 4kln:B, 4kln:C, 4kln:D, 4kln:E, 4kln:F, 4ko8:A, 4ko8:B, 4kod:A, 4kod:B, 4kod:C, 4kod:D, 4kod:E, 4kod:F, 4kod:G, 4kod:H, 4kod:I, 4kod:J, 4kod:K, 4kod:L, 7lmy:A, 7lmy:B, 7lmy:C, 7lmy:D, 7lmy:E, 7lmy:F, 7lmz:B, 7lmz:C, 7lmz:D, 7lmz:E, 7lmz:A, 7ln0:B, 7ln0:C, 7ln0:D, 7ln0:E, 7ln0:A, 7ln1:B, 7ln1:C, 7ln1:D, 7ln1:E, 7ln1:A, 7ln2:A, 7ln2:B, 7ln2:C, 7ln2:D, 7ln2:E, 7ln3:A, 7ln3:B, 7ln3:C, 7ln3:D, 7ln3:E, 7ln4:A, 7ln4:B, 7ln4:C, 7ln4:D, 7ln4:E, 7ln5:A, 7ln5:B, 7ln5:C, 7ln5:D, 7ln5:E, 7ln6:A, 7ln6:B, 7ln6:C, 7ln6:D, 7ln6:E, 7mdm:B, 7mdm:C, 7mdm:D, 7mdm:E, 7mdm:A, 7mdm:F, 7mdo:A, 7mdo:B, 7mdo:C, 7mdo:D, 7mdo:E, 7mdo:F, 7mhs:A, 7mhs:B, 7mhs:C, 7mhs:D, 7oat:B, 8ooi:A, 8ooi:F, 8ooi:B, 8ooi:D, 8ooi:C, 8ooi:E, 8pqx:A, 8pqx:B, 8pqx:C, 8pqx:D, 8pqx:E, 8pqx:F, 7pux:A, 3qq7:A, 1r7r:A, 7r7s:A, 7r7s:B, 7r7s:C, 7r7s:D, 7r7s:E, 7r7s:F, 7r7t:A, 7r7t:B, 7r7t:F, 7r7t:E, 7r7t:D, 7r7t:C, 7rl6:A, 7rl6:B, 7rl6:C, 7rl6:D, 7rl6:E, 7rl6:F, 7rl7:A, 7rl7:B, 7rl7:C, 7rl7:D, 7rl7:E, 7rl7:F, 7rl9:A, 7rl9:B, 7rl9:C, 7rl9:D, 7rl9:E, 7rl9:F, 7rla:A, 7rla:F, 7rla:B, 7rla:C, 7rla:D, 7rla:E, 7rlb:A, 7rlb:B, 7rlb:C, 7rlb:D, 7rlb:E, 7rlb:F, 7rlc:A, 7rlc:B, 7rlc:C, 7rlc:D, 7rlc:E, 7rlc:F, 7rld:A, 7rld:B, 7rld:C, 7rld:D, 7rld:E, 7rld:F, 7rlf:A, 7rlf:B, 7rlf:C, 7rlf:D, 7rlf:E, 7rlf:F, 7rlg:A, 7rlg:B, 7rlg:C, 7rlg:D, 7rlg:E, 7rlg:F, 7rlh:A, 7rlh:B, 7rlh:C, 7rlh:D, 7rlh:E, 7rlh:F, 7rli:A, 7rli:B, 7rli:C, 7rli:D, 7rli:E, 7rli:F, 7rli:G, 7rli:H, 7rli:I, 7rli:J, 7rli:K, 7rli:L, 7rlj:A, 7rlj:B, 7rlj:C, 7rlj:D, 7rlj:E, 7rlj:F, 7rlj:L, 7rlj:G, 7rlj:H, 7rlj:I, 7rlj:J, 7rlj:K, 8rsb:A, 8rsb:B, 8rsb:C, 8rsb:D, 8rsb:E, 8rsb:F, 8rsc:A, 8rsc:B, 8rsc:C, 8rsc:D, 8rsc:E, 8rsc:F, 1s3s:A, 1s3s:B, 1s3s:C, 1s3s:D, 1s3s:E, 1s3s:F, 3tiw:A, 3tiw:B, 8uv2:A, 8uv2:B, 8uv2:C, 8uv2:D, 8uv2:E, 8uv2:F, 8uvo:A, 8uvo:B, 8uvo:C, 8uvo:D, 8uvo:E, 8uvo:F, 8uvp:A, 8uvp:B, 8uvp:C, 8uvp:D, 8uvp:E, 8uvp:F, 8uvq:A, 8uvq:B, 8uvq:C, 8uvq:D, 8uvq:E, 8uvq:F, 7vcs:B, 7vcs:C, 7vcs:D, 7vcs:E, 7vcs:F, 7vcs:G, 7vcs:H, 7vcs:I, 7vcs:J, 7vcs:K, 7vcs:L, 7vct:A, 7vct:B, 7vct:C, 7vct:D, 7vct:E, 7vct:F, 7vcu:K, 7vcu:B, 7vcu:C, 7vcu:D, 7vcu:E, 7vcu:F, 7vcu:A, 7vcu:L, 7vcu:G, 7vcu:H, 7vcu:I, 7vcu:J, 7vcv:A, 7vcv:F, 7vcv:E, 7vcv:D, 7vcv:C, 7vcv:B, 7vcx:A, 7vcx:B, 7vcx:C, 7vcx:D, 7vcx:E, 7vcx:F, 7wub:A, 7wub:B, 7wub:C, 7wub:D, 7wub:E, 7wub:F, 7wub:G, 7wub:H, 7wub:I, 7wub:J, 7wub:K, 7wub:L, 7y4w:A, 7y4w:B, 7y4w:E, 7y4w:F, 7y53:A, 7y53:B, 7y53:C, 7y53:D, 7y53:E, 7y53:F, 7y59:A, 7y59:B, 7y59:C, 7y59:D, 7y59:E, 7y59:F
9 5ifw:B 702 43 0.1848 0.0242 0.3953 0.075
10 7ln6:F 714 43 0.1848 0.0238 0.3953 0.075 3cf0:A, 3cf0:B, 3cf0:C, 3cf0:D, 3cf0:E, 3cf0:F, 3cf0:G, 3cf0:H, 3cf0:I, 3cf0:J, 3cf0:K, 3cf0:L, 3cf0:M, 3cf0:N, 6g2v:A, 6g2w:A, 6g2x:A, 6g2y:A, 6g2z:A, 6g30:A, 7lmz:F, 7ln0:F, 7ln1:F, 7ln2:F, 7ln3:F, 7ln4:F, 7ln5:F, 6mck:A, 6mck:B, 6mck:C, 6mck:D, 6mck:E, 6mck:F, 6mck:G, 6mck:H, 6mck:I, 6mck:J, 6mck:K, 6mck:L, 8vku:A, 8vku:B, 8vku:C, 8vku:D, 8vku:E, 8vku:F, 8vls:A, 8vls:B, 8vls:C, 8vls:D, 8vls:E, 8vls:F, 8vls:G, 8vls:H, 8vls:I, 8vls:J, 8vls:K, 8vls:L, 8vov:A, 8vov:B, 8vov:C, 8vov:D, 8vov:E, 8vov:F
11 8any:AF 208 44 0.1630 0.0721 0.3409 0.37 7a5f:F6, 7a5g:F6, 7a5i:F6, 7a5k:F6, 8csp:F, 8csq:F, 8csr:F, 8css:F, 8cst:F, 8csu:F, 3j9m:AF, 8k2a:SG, 7l08:AF, 6nu2:AF, 6nu3:AF, 7og4:AF, 8oir:AF, 8ois:AF, 7p2e:F, 7pnx:F, 7pny:F, 7pnz:F, 7po0:F, 7po1:F, 7po2:F, 7po3:F, 7qi4:AF, 7qi5:AF, 7qi6:AF, 8qrk:F, 8qrl:F, 8qrm:F, 8qrn:F, 6rw4:F, 6rw5:F, 6vlz:AF, 6vmi:AF, 8xt0:SG, 8xt2:SG, 6zm5:AF, 6zm6:AF, 6zs9:AF, 6zsa:AF, 6zsb:AF, 6zsc:AF, 6zsd:AF, 6zse:AF, 6zsg:AF
12 7d5t:RQ 339 51 0.1957 0.0531 0.3529 3.9
13 4wj3:B 456 34 0.1304 0.0263 0.3529 6.0 4wj3:K, 4wj3:H, 4wj3:E
14 1b12:C 226 36 0.1304 0.0531 0.3333 6.0 1b12:B, 3iiq:A, 3iiq:B, 3s04:B, 3s04:A, 1t7d:A, 1t7d:B
15 7pnt:F 208 24 0.1087 0.0481 0.4167 6.3 7pnu:F, 7pnv:F, 7pnw:F
16 2eer:B 347 77 0.2391 0.0634 0.2857 6.3 2eer:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417