Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
VLLGDVNGDGTINSTDLTMLKRSVLRAITLTDDAKARADVDKNGSINAADVLLLSRYLLRVI

The query sequence (length=62) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2ccl:B 62 62 1.0000 1.0000 1.0000 1.45e-36 2ccl:D, 1ohz:B
2 4fl4:A 68 62 0.5645 0.5147 0.5645 1.68e-18 4fl4:D, 4fl4:G, 4fl4:J
3 1daq:A 71 62 0.4677 0.4085 0.4677 1.60e-10 1dav:A, 2mte:A
4 1daq:A 71 26 0.1774 0.1549 0.4231 0.45 1dav:A, 2mte:A
5 4dh2:B 72 63 0.4194 0.3611 0.4127 9.34e-09 4dh2:D
6 3ul4:B 63 62 0.4194 0.4127 0.4194 1.26e-08
7 3ul4:B 63 26 0.2258 0.2222 0.5385 0.010
8 8x3a:A 151 59 0.4032 0.1656 0.4237 1.85e-07 8x39:A, 8x39:B
9 8x3a:A 151 58 0.3065 0.1258 0.3276 0.001 8x39:A, 8x39:B
10 8x3a:A 151 55 0.2258 0.0927 0.2545 0.16 8x39:A, 8x39:B
11 2y3n:B 60 57 0.3548 0.3667 0.3860 1.98e-07
12 2vn6:B 64 63 0.3548 0.3438 0.3492 2.58e-06 2vn5:B, 2vn5:D
13 2vn6:B 64 25 0.1613 0.1562 0.4000 5.3 2vn5:B, 2vn5:D
14 5nrk:B 68 62 0.3548 0.3235 0.3548 4.96e-05 5nrk:D, 5nrm:B
15 5nrk:B 68 26 0.1935 0.1765 0.4615 0.21 5nrk:D, 5nrm:B
16 4uyp:B 73 60 0.3548 0.3014 0.3667 6.30e-05 4uyp:D, 4uyq:B
17 2y3n:D 49 57 0.3065 0.3878 0.3333 0.001
18 6kg9:A 67 53 0.2903 0.2687 0.3396 0.004 6kgc:B, 6kgd:B, 6kge:D, 6kge:B, 6kgf:D, 6kgf:B
19 6kg9:A 67 20 0.1613 0.1493 0.5000 9.0 6kgc:B, 6kgd:B, 6kge:D, 6kge:B, 6kgf:D, 6kgf:B
20 5lxv:B 65 57 0.2903 0.2769 0.3158 0.005 5lxv:D
21 5m2s:B 79 72 0.3387 0.2658 0.2917 0.016
22 6u2m:A 464 54 0.2903 0.0388 0.3333 0.092 8aht:C, 1ak8:A, 3b32:A, 7cqv:E, 5dsu:A, 2i08:A, 1j7o:A, 6jiu:C, 6jiu:F, 6jiu:I, 6jiu:L, 2kug:A, 6pjx:B, 2pq3:A, 4q57:A, 6u2m:C, 3uct:B, 3ucw:C, 3ucy:A
23 6hr1:A 406 54 0.2903 0.0443 0.3333 0.14 6hr1:B
24 3u0k:A 397 54 0.2742 0.0428 0.3148 0.16
25 1qx7:M 115 61 0.3226 0.1739 0.3279 0.16
26 6k67:B 83 54 0.2903 0.2169 0.3333 0.19 6k67:D
27 6k4k:D 95 52 0.2742 0.1789 0.3269 0.20
28 3o78:A 402 54 0.2903 0.0448 0.3333 0.21 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
29 4fl4:I 309 56 0.2258 0.0453 0.2500 0.25 2b59:B, 4fl4:C, 4fl4:F, 4fl4:L, 5g5d:B, 3kcp:A
30 8aht:A 140 59 0.3387 0.1500 0.3559 0.26 8aht:B
31 1osa:A 148 59 0.3226 0.1351 0.3390 0.29 1clm:A, 5e1k:A, 5e1n:A, 5e1p:A, 1exr:A, 2kxw:A, 2m5e:A
32 5e37:A 313 54 0.2903 0.0575 0.3333 0.30 5e37:C
33 2ozn:B 131 56 0.2419 0.1145 0.2679 0.36
34 5h7d:E 113 54 0.2903 0.1593 0.3333 0.38 5h7d:F, 5h7d:G, 5h7d:H, 5h7d:K, 5h7d:L, 5h7d:O, 5h7d:P
35 8b6q:A 466 54 0.2742 0.0365 0.3148 0.42 1a29:A, 1ahr:A, 8ahs:A, 8aht:D, 6ale:R, 4anj:B, 6b8m:B, 6b8m:D, 6b8m:F, 6b8m:H, 6b8n:B, 6b8n:D, 6b8n:F, 6b8n:H, 6b8p:B, 6b8p:D, 6b8p:F, 6b8p:H, 6b8q:B, 6b8q:D, 6b8q:H, 6b8q:F, 2bbm:A, 2bbn:A, 2bcx:A, 8bd2:A, 2be6:A, 2be6:B, 2be6:C, 7bf1:AAA, 7bf2:AAA, 2bkh:B, 2bki:B, 4bw8:A, 4bw8:B, 3bxk:A, 3bxk:C, 3bxl:A, 3bya:A, 4bya:A, 4byf:D, 1cdl:A, 1cdl:B, 1cdl:C, 1cdl:D, 1cdm:A, 1cff:A, 1ckk:A, 1cll:A, 3cln:A, 4cln:A, 1cm1:A, 1cm4:A, 6cnn:E, 6cnn:F, 6cnn:G, 6cnn:H, 6cno:E, 6cno:F, 6cno:G, 6cno:H, 2col:B, 7cqh:B, 7cqp:B, 7cqv:A, 1ctr:A, 6ctb:A, 6czq:R, 6dad:A, 6dad:B, 6dae:B, 6dae:A, 6daf:A, 6daf:B, 6dah:A, 6dah:B, 6dah:C, 6dah:D, 4dbp:C, 4dbq:B, 5dbr:A, 4dck:B, 8dgh:A, 8dgk:A, 4djc:A, 5dow:A, 5dow:C, 5dow:E, 5dow:G, 3dve:A, 3dvj:A, 3dvk:A, 3dvm:A, 6e2f:E, 6e2g:E, 6eeb:A, 4ehq:A, 3ewt:A, 3ewv:A, 2f2o:A, 2f3y:A, 2f3z:A, 6feg:B, 6feh:B, 8fny:B, 8fny:D, 2fot:A, 8fo6:B, 1fw4:A, 4g27:R, 4g28:R, 1g4y:R, 3g43:A, 3g43:B, 3g43:C, 3g43:D, 6gdk:A, 5ggm:A, 8gm4:B, 8gm5:B, 3gn4:B, 3gn4:D, 3gn4:F, 3gn4:H, 3gof:A, 3gof:B, 4gow:D, 3gp2:A, 6hcs:A, 6hcs:C, 6hcs:E, 6hcs:G, 4hex:A, 4hex:B, 2hf5:A, 5hit:A, 2hqw:A, 3hr4:B, 3hr4:D, 3hr4:F, 3hr4:H, 3if7:A, 3ifk:A, 3ifk:B, 1iq5:A, 1iwq:A, 5j03:B, 3j41:E, 3j41:F, 1j7p:A, 5j7j:A, 5j8h:A, 4j9y:R, 4j9z:R, 6jiy:C, 6jiy:F, 6jiy:I, 6jiy:L, 4jpz:C, 4jpz:I, 4jq0:C, 5jqa:A, 5jth:A, 6jv2:B, 6jv2:D, 6jv2:F, 6jv2:H, 2jzi:A, 2k0e:A, 2k0f:A, 2k0j:A, 6k4k:C, 6k4l:C, 6k4l:D, 6k4r:C, 6k4r:D, 2k61:A, 5k8q:A, 1k90:D, 1k90:E, 1k90:F, 1k93:D, 1k93:E, 1k93:F, 8k9z:B, 8k9z:D, 8ka0:B, 8ka0:D, 8ka0:F, 8ka0:H, 8ka1:F, 2kdu:A, 7kl5:A, 2kne:A, 2kuh:A, 1l7z:A, 2l7l:A, 7l8v:A, 3l9i:C, 2lgf:A, 1lin:A, 2ll6:A, 2ll7:A, 2llo:A, 2llq:A, 2lqc:A, 2lqp:A, 1lvc:D, 1lvc:E, 1lvc:F, 2lv6:A, 2m0j:A, 2m0k:A, 4m1l:A, 2m3s:A, 2m55:A, 6m7h:A, 6mba:B, 6mc9:B, 2mes:A, 2mg5:A, 2mgu:A, 7mir:B, 7mis:B, 1mux:A, 6mud:A, 6mue:A, 1mxe:A, 1mxe:B, 2n27:A, 6n5w:C, 2n8j:A, 1niw:A, 1niw:C, 1niw:E, 1niw:G, 5nin:A, 5nin:B, 7nqc:A, 1nwd:A, 6o20:F, 2o5g:A, 6o5g:A, 2o60:A, 5oeo:A, 1ooj:A, 6os4:A, 4ovn:A, 4ovn:B, 4ovn:C, 4ovn:D, 4ovn:E, 3oxq:A, 3oxq:B, 3oxq:C, 3oxq:D, 6paw:D, 6paw:G, 6paw:H, 6paw:C, 4pjj:B, 1pk0:D, 1pk0:E, 1pk0:F, 6plm:C, 6plm:D, 7ppo:B, 7pqe:B, 1prw:A, 7psz:A, 7pu9:A, 4q5u:A, 1qiv:A, 1qiw:A, 1qiw:B, 4qnh:R, 1qs7:A, 1qs7:C, 1qtx:A, 2r28:A, 2r28:B, 4rjd:A, 4rjd:B, 2ro8:A, 1s26:D, 1s26:E, 1s26:F, 7shq:B, 8sik:B, 8sik:F, 8sik:H, 8sim:B, 8sim:D, 8sim:F, 8sim:H, 3sjq:A, 3sjq:B, 1sk6:D, 1sk6:E, 1sk6:F, 3sui:A, 1sw8:A, 1sy9:A, 5sy1:C, 5sy1:D, 6sz5:A, 5t0x:A, 7t2q:A, 7tci:B, 7tci:F, 7tci:D, 7tci:H, 7tcp:B, 7tcp:F, 7tcp:H, 7tcp:D, 5tp6:A, 7tzc:K, 7tzc:D, 7tzc:E, 7tzc:C, 6u39:A, 6u39:C, 6u39:E, 6u39:G, 6u39:I, 6u39:K, 6u39:M, 6u39:O, 6u39:Q, 6u39:S, 6u3a:A, 6u3a:B, 6u3b:A, 6u3d:A, 6u3d:B, 3uct:A, 3ucw:A, 3ucw:B, 3ucw:D, 4umo:C, 4umo:D, 1up5:A, 1up5:B, 4upu:A, 8uxl:I, 8uxl:J, 8uxl:L, 8uxl:K, 8uxm:I, 8uxm:J, 8uxm:L, 8uxm:K, 6uzz:B, 6uzz:D, 6uzz:F, 6uzz:H, 2v01:A, 2v02:A, 4v0c:C, 4v0c:D, 5v02:R, 5v03:R, 6v00:B, 6v00:E, 6v00:H, 6v00:K, 6v01:B, 6v01:E, 6v01:H, 6v01:K, 2vas:B, 2vay:A, 2vb6:B, 5vms:B, 1vrk:A, 7vuo:C, 7vvd:C, 7vvd:E, 7vvh:C, 8w41:B, 2w73:A, 2w73:B, 2w73:E, 2w73:F, 5wbx:R, 5wc5:R, 2wel:D, 1wrz:A, 5wsv:A, 5wsv:C, 1x02:A, 2x0g:B, 2x51:B, 1xa5:A, 1xfu:O, 1xfu:P, 1xfu:Q, 1xfu:R, 1xfu:S, 1xfu:T, 1xfv:O, 1xfv:P, 1xfv:Q, 1xfv:R, 1xfv:S, 1xfv:T, 1xfw:O, 1xfw:P, 1xfw:Q, 1xfw:R, 1xfw:S, 1xfw:T, 1xfx:O, 1xfx:P, 1xfx:Q, 1xfx:R, 1xfx:S, 1xfx:T, 1xfy:O, 1xfy:P, 1xfy:Q, 1xfy:R, 1xfy:S, 1xfy:T, 1xfz:O, 1xfz:P, 1xfz:Q, 1xfz:R, 1xfz:S, 1xfz:T, 6xxf:AAA, 6xxx:AAA, 6xy3:AAA, 1y0v:H, 1y0v:I, 1y0v:J, 1y0v:K, 1y0v:L, 1y0v:M, 2y4v:A, 6y4o:A, 6y4p:A, 1y6w:A, 6y94:A, 2ygg:B, 6yns:A, 6yns:C, 6yns:B, 6yns:K, 6yns:D, 6yns:E, 6yns:F, 6yns:G, 6yns:H, 6yns:I, 6yns:J, 6yns:L, 6ynu:A, 6ynu:C, 1yr5:A, 1yrt:B, 1yru:B, 6zbi:A, 4zlk:B, 1zot:B, 7zrp:A, 7zrp:C, 7zrq:A, 1zuz:A
36 5coc:A 124 54 0.2903 0.1452 0.3333 0.50
37 6xyr:A 348 54 0.2903 0.0517 0.3333 0.55
38 2n6a:A 162 54 0.2903 0.1111 0.3333 0.58
39 2f2p:A 169 54 0.2903 0.1065 0.3333 0.59 2f2o:B, 2f2p:B
40 5n5p:B 87 49 0.2742 0.1954 0.3469 0.96 5n5p:D
41 5n5p:B 87 21 0.1613 0.1149 0.4762 1.6 5n5p:D
42 5lmx:B 1115 28 0.1774 0.0099 0.3929 1.3
43 5m5w:B 1183 28 0.1774 0.0093 0.3929 1.3 4c2m:B, 4c2m:Q, 4c3h:B, 4c3i:B, 4c3j:B, 5g5l:B, 6h67:B, 6h68:B, 6hko:B, 6hlq:B, 6hlr:B, 5m3f:B, 5m3m:B, 5m5x:B, 5m5y:B, 5m64:B, 5n5y:B, 5n5z:B, 5n60:B, 5n61:B, 5oa1:B, 6rqh:B, 6rql:B, 6rqt:B, 6rrd:B, 6rui:B, 6ruo:B, 6rwe:B, 6tps:B, 5w5y:B, 5w64:B, 5w65:B, 5w66:B, 4ym7:AB, 4ym7:BB, 4ym7:CB, 4ym7:DB, 4ym7:EB, 4ym7:FB
44 6m5a:A 844 14 0.1613 0.0118 0.7143 1.3
45 5by0:A 465 35 0.2097 0.0280 0.3714 1.5 5f13:A, 5f13:B, 5f13:C, 3pt1:A
46 2l4h:A 184 58 0.2581 0.0870 0.2759 1.6 2l4i:A, 2lm5:A, 6ocx:D, 6ocx:C, 6ocx:A, 6ocx:B, 6od0:A, 6od0:B, 1xo5:A, 1xo5:B, 1y1a:A, 1y1a:B
47 4i2y:A 381 54 0.2581 0.0420 0.2963 1.8 4i2y:B
48 5ukg:A 393 54 0.2581 0.0407 0.2963 1.8 5ukg:B
49 5m2o:B 74 64 0.2419 0.2027 0.2344 2.0
50 2wys:B 516 54 0.2419 0.0291 0.2778 2.4 2w5f:A, 2w5f:B, 2wys:A, 2wze:A, 2wze:B
51 5fno:A 568 26 0.1935 0.0211 0.4615 4.0 5fno:B
52 1ggz:A 144 59 0.2742 0.1181 0.2881 4.0
53 3h4s:E 96 17 0.1290 0.0833 0.4706 4.4
54 1vg0:A 481 41 0.2097 0.0270 0.3171 4.9
55 6xw2:A 387 57 0.2742 0.0439 0.2982 5.2
56 2l1w:A 149 54 0.2903 0.1208 0.3333 5.9 2ksz:A, 2roa:A, 2rob:A
57 4u3s:B 156 55 0.2419 0.0962 0.2727 6.1 4wi0:B
58 6dmw:E 113 62 0.3226 0.1770 0.3226 8.7
59 1omr:A 201 67 0.2742 0.0846 0.2537 8.7 2het:A, 2het:B, 2het:C, 2het:D, 2i94:A, 1jsa:A, 1la3:A, 4m2o:A, 4m2p:A, 4m2q:A, 4mlw:A, 1omv:A, 1rec:A, 4yi8:A, 4yi9:A
60 6tj7:A 134 50 0.2097 0.0970 0.2600 9.4

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218