BioLiP

>protein
VLKIISWNVNGLRAVHRKGFLKWFMEEKPDILCLQEIKAAPEQLPRKLRHVEGYRSFFTPAERKGYSGVAMYTKVPPSSL
REGFGVERFDTEGRIQIADFDDFLLYNIYFPNGKMSEERLKYKLEFYDAFLEDVNRERDSGRNVIICGDFNTAHREIDLA
RPKENSNVSGFLPVERAWIDKFIENGYVDTFRMFNSDPGQYTWWSYRTRARERNVGWRLDYFFVNEEFKGKVKRSWILSD
VMGSDHCPIGLEIE

The query sequence (length=254) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3fzi:A	258	254	1.0000	0.9845	1.0000	0.0	3g00:A, 3g00:B, 3g0a:A, 3g0r:A, 3g0r:B, 3g1k:A, 3g1k:B, 3g2c:A, 3g2c:B, 3g2d:A, 3g2d:B, 3g38:A, 3g3c:A, 3g3c:B, 3g3y:B, 3g3y:A, 3g4t:A, 3g4t:B, 3ga6:A, 3ga6:B, 3w2x:A, 3w2y:A, 3w2y:D
2	5j8n:A	258	251	0.5709	0.5620	0.5777	6.84e-114
3	5cfe:A	252	254	0.4567	0.4603	0.4567	1.00e-74
4	8igi:A	251	256	0.4213	0.4263	0.4180	4.52e-70	8igi:B
5	4b5g:A	259	253	0.4094	0.4015	0.4111	6.34e-68	4b5f:A, 4b5g:B, 4b5g:C, 4b5h:A, 4b5i:A, 4b5j:A, 4b5m:A, 4b5m:B, 4b5m:C, 2jc5:A
6	6mkk:A	282	255	0.4134	0.3723	0.4118	4.12e-64	6boq:A, 6bor:A, 6bos:A, 6bot:A, 6bou:A, 6bov:A, 6bow:A, 7cd5:A, 7cd6:A, 5cfg:A, 1de8:B, 1de8:A, 1de9:A, 1de9:B, 1dew:B, 1dew:A, 5dff:A, 5dfh:A, 5dfi:A, 5dfj:A, 5dg0:A, 4iem:A, 4iem:B, 4iem:C, 4iem:D, 2isi:A, 2isi:B, 2isi:C, 4lnd:A, 4lnd:B, 4lnd:C, 7lpg:D, 7lph:D, 7lpi:D, 7lpj:D, 7mcr:A, 7mev:A, 6p93:A, 6p94:A, 4qh9:A, 4qhe:A, 7suv:B, 7svb:B, 7tc2:A, 7tc2:B, 7tc2:C, 7tc2:D, 7tr7:A, 7u50:K, 3u8u:A, 3u8u:B, 3u8u:C, 3u8u:D, 3u8u:E, 3u8u:F, 6w0q:A, 6w2p:A, 6w3l:B, 6w3n:B, 6w3q:B, 6w3u:B, 6w43:A, 6w4i:A, 6w4i:B, 6w4t:A, 6w4t:B, 5wn0:A, 5wn1:A, 5wn2:A, 5wn3:B, 5wn4:B, 5wn5:B, 5wn5:A
7	8ka5:A	297	260	0.4252	0.3636	0.4154	1.16e-59	8ka3:A, 8ka4:B, 8ka4:C
8	8bvh:H	262	250	0.3150	0.3053	0.3200	4.80e-47	8bvh:I, 8bvh:B, 8bvh:G, 8bvj:Q, 8bvj:G, 8bvj:C, 8bvj:A, 8bvm:A, 8bvm:H, 8bvm:N, 6o1k:A, 6o1k:B, 6o1l:A, 6o1l:B, 6o1l:R, 6o1m:A, 6o1m:B, 6o1m:S, 6o1m:R
9	6wcd:A	314	292	0.3661	0.2962	0.3185	2.27e-34
10	6fk4:A	257	259	0.2717	0.2685	0.2664	1.99e-28	6fk5:A, 6fke:A, 2jc4:A
11	2voa:A	257	257	0.3071	0.3035	0.3035	1.59e-27	2voa:B
12	7n3z:A	379	343	0.3071	0.2058	0.2274	1.66e-15	7n3y:B, 7n3y:C, 7n3y:A, 7n3y:D
13	8uw3:A	1265	258	0.2362	0.0474	0.2326	2.96e-10	7n8s:A, 7n94:A, 7n94:B, 8sp5:A, 8sp5:B, 8sp7:A, 8sxt:A, 8sxu:A, 1vyb:B
14	4fpv:B	257	50	0.0709	0.0700	0.3600	0.13	6ca4:A, 6ca4:B, 4f1h:A, 4f1h:B, 4fpv:A
15	6ca4:C	229	50	0.0709	0.0786	0.3600	0.39
16	3n5f:A	406	37	0.0591	0.0369	0.4054	1.7	3n5f:B
17	9c4d:E	140	81	0.0866	0.1571	0.2716	2.5	9c4c:E, 9c4c:F, 9c4c:G, 9c4c:H, 9c4d:F, 9c4d:G, 9c4d:I, 9c4d:D, 9c4d:H, 9c4d:J, 9c4d:C, 2ev0:A, 2ev0:B, 2ev5:A, 2ev5:B, 2ev6:A, 2ev6:B, 2f5c:A, 2f5d:A, 2f5d:B, 2f5e:A, 2f5e:B, 2f5f:A, 2f5f:B, 4hv5:A, 4hv5:B, 4hv6:A, 4hv6:B, 4hx4:A, 4hx4:B, 1on1:A, 1on1:B, 1on2:A, 1on2:B, 3r60:A, 3r60:B, 3r61:A, 3r61:B
18	8z0f:A	549	63	0.0906	0.0419	0.3651	2.8	8z0f:B
19	8v55:A	902	81	0.0709	0.0200	0.2222	2.9
20	8g5k:A	905	53	0.0591	0.0166	0.2830	3.0
21	8v5r:A	944	53	0.0591	0.0159	0.2830	3.1	8g5i:A, 8g5l:A, 8g5m:A, 8g5n:A, 8g5o:A, 8g5p:A, 8t7e:A
22	6jcx:F	186	48	0.0472	0.0645	0.2500	3.1	6kon:F, 6koo:F, 5zx2:F
23	8udk:A	1012	53	0.0591	0.0148	0.2830	3.1	5c51:A, 5c52:A, 5c53:A, 4ztu:A, 4ztz:A
24	8g5j:A	941	53	0.0591	0.0159	0.2830	3.2
25	8d33:A	974	53	0.0591	0.0154	0.2830	3.2	8d37:A, 8d3r:A, 8d42:A, 8udl:A, 8v54:A
26	2vq3:A	181	38	0.0591	0.0829	0.3947	4.1	2vq3:B
27	7aih:Ax	167	29	0.0394	0.0599	0.3448	5.1	7am2:Ax, 7ane:Ax
28	4aci:B	177	24	0.0433	0.0621	0.4583	5.8	4aci:A, 4af5:A
29	5y6p:ex	233	154	0.1693	0.1845	0.2792	5.9	5y6p:ew, 5y6p:fz, 5y6p:fd
30	8z9x:B	567	21	0.0433	0.0194	0.5238	6.7	8z9x:A
31	6bt2:B	271	46	0.0630	0.0590	0.3478	7.7
32	8oh5:C	1172	61	0.0748	0.0162	0.3115	7.9	8oh5:F, 8oh5:I, 8oh5:L, 8oh9:C, 8oh9:F, 8oh9:I, 8oh9:L
33	8ci0:AAA	666	127	0.1220	0.0465	0.2441	9.2	8ci0:BBB, 8ci0:CCC, 1itz:A, 1itz:B, 1itz:C

[Back]