Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
VGSVAALLTVVFYIAAVMATNLYGATFPEWFGDLSKSLYTLFQVMTLESWSMGIVRPVMNVHPNAWVFFIPFIMLTTFTV
LNLFIGIIVDAMA

The query sequence (length=93) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6sxc:A 271 93 0.9892 0.3395 0.9892 4.23e-62 5bzb:B, 5bzb:C, 5bzb:D, 4cbc:A, 4cbc:B, 4cbc:C, 4cbc:D, 4oxs:A, 4oxs:B, 4oxs:C, 4oxs:D, 4p2z:B, 4p30:A, 4p30:B, 4p30:C, 4p30:D, 4p9o:A, 4p9o:B, 4p9o:C, 4p9o:D, 4p9p:B, 4p9p:D, 4pa3:A, 4pa3:B, 4pa3:C, 4pa3:D, 4pa4:A, 4pa4:B, 4pa4:C, 4pa4:D, 4pa6:A, 4pa6:B, 4pa6:C, 4pa6:D, 4pa7:A, 4pa7:B, 4pa7:C, 4pa7:D, 4pa9:A, 4pa9:B, 4pa9:C, 4pa9:D, 8s6j:A, 6sx5:A, 6sx7:A, 6sxe:A, 6sxf:A, 6sxf:B, 6sxg:A, 4x88:A, 4x88:B, 4x88:C, 4x88:D, 4x89:B, 4x8a:B, 4x8a:C, 4x8a:D, 6yz0:A, 6yz2:A, 6z8c:A, 3zjz:A, 3zjz:B, 3zjz:C, 3zjz:D
2 5ek0:A 250 91 0.6882 0.2560 0.7033 4.59e-41 5ek0:B, 5ek0:C, 5ek0:D
3 6n4i:C 226 90 0.6667 0.2743 0.6889 6.50e-40 6n4i:A, 6n4i:D, 6n4i:B
4 7pgg:A 147 91 0.6344 0.4014 0.6484 7.83e-40 7pgg:B, 7pgi:E
5 5hk7:A 139 89 0.6022 0.4029 0.6292 9.95e-39 5hk7:B, 5hk7:C, 7pgb:c, 7pgb:Z, 7pgb:d, 7pgb:o, 7pgb:l, 7pgb:h, 7pgb:e
6 5klb:A 267 91 0.6559 0.2285 0.6703 1.25e-38 6c1e:A, 6c1e:B, 6c1k:A, 6c1k:B, 6c1m:A, 6c1m:B, 8h9w:A, 6juh:C, 6ke5:A, 6ke5:B, 6ke5:C, 6ke5:D, 6keb:C, 6keb:D, 5klb:B, 5klb:C, 5klb:D, 5klg:D, 5klg:C, 5kls:C, 5kmf:A, 5kmh:A
7 4dxw:A 210 89 0.4086 0.1810 0.4270 7.23e-16
8 8j7m:A 257 94 0.3333 0.1206 0.3298 7.85e-10 8j7m:C, 8j7m:D, 8j7m:B
9 8j7h:B 290 69 0.2581 0.0828 0.3478 1.84e-09 8j7f:A, 8j7f:B, 8j7f:C, 8j7f:D, 8j7h:C, 8j7h:D, 7x5v:A, 7x5v:B, 7x5v:C
10 7eeb:A 258 95 0.3226 0.1163 0.3158 4.62e-06
11 6kzp:A 1014 70 0.2258 0.0207 0.3000 3.91e-05
12 6kzp:A 1014 96 0.2473 0.0227 0.2396 0.003
13 6kzp:A 1014 59 0.2043 0.0187 0.3220 0.88
14 6kzp:A 1014 65 0.1505 0.0138 0.2154 2.9
15 6kzo:A 967 70 0.2258 0.0217 0.3000 3.98e-05
16 6kzo:A 967 95 0.2473 0.0238 0.2421 0.002
17 6kzo:A 967 59 0.2043 0.0196 0.3220 0.90
18 6kzo:A 967 65 0.1505 0.0145 0.2154 3.0
19 9ayh:A 1056 70 0.2258 0.0199 0.3000 6.64e-05 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
20 9ayh:A 1056 94 0.2366 0.0208 0.2340 0.001 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
21 9ayh:A 1056 59 0.2043 0.0180 0.3220 0.56 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
22 7wli:A 1135 86 0.2581 0.0211 0.2791 2.39e-04 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
23 7wli:A 1135 103 0.2366 0.0194 0.2136 0.005 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
24 7wli:A 1135 59 0.2043 0.0167 0.3220 0.85 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
25 8e59:A 1230 113 0.3118 0.0236 0.2566 7.44e-04 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
26 8e59:A 1230 67 0.2043 0.0154 0.2836 0.013 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
27 8e59:A 1230 69 0.2043 0.0154 0.2754 0.062 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
28 6jp5:A 1274 113 0.3011 0.0220 0.2478 0.002 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
29 6jp5:A 1274 60 0.1935 0.0141 0.3000 0.008 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
30 6jp5:A 1274 69 0.1935 0.0141 0.2609 0.094 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
31 7vfs:A 1266 65 0.2151 0.0158 0.3077 0.002 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
32 7vfs:A 1266 108 0.2796 0.0205 0.2407 0.017 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
33 7vfs:A 1266 94 0.2688 0.0197 0.2660 1.3 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
34 7mix:A 1326 65 0.2151 0.0151 0.3077 0.002 7miy:A
35 7mix:A 1326 108 0.2796 0.0196 0.2407 0.018 7miy:A
36 7mix:A 1326 94 0.2688 0.0189 0.2660 1.4 7miy:A
37 7jpx:A 1116 113 0.3011 0.0251 0.2478 0.002 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
38 7jpx:A 1116 60 0.1935 0.0161 0.3000 0.007 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
39 7jpx:A 1116 69 0.1935 0.0161 0.2609 0.080 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
40 8wea:A 1206 107 0.3011 0.0232 0.2617 0.003
41 8wea:A 1206 69 0.2043 0.0158 0.2754 0.035
42 8wea:A 1206 59 0.1828 0.0141 0.2881 0.093
43 8x90:A 1377 90 0.3011 0.0203 0.3111 0.003 8x91:A, 8x93:A
44 8x90:A 1377 56 0.1935 0.0131 0.3214 0.005 8x91:A, 8x93:A
45 8x90:A 1377 26 0.1290 0.0087 0.4615 0.096 8x91:A, 8x93:A
46 8epm:A 991 90 0.2581 0.0242 0.2667 0.005
47 8epm:A 991 64 0.2043 0.0192 0.2969 0.007
48 8epm:A 991 119 0.3118 0.0293 0.2437 0.022
49 7xlq:A 1319 92 0.2796 0.0197 0.2826 0.005 8epl:A, 7yg5:A
50 7xlq:A 1319 55 0.1935 0.0136 0.3273 0.008 8epl:A, 7yg5:A
51 7xlq:A 1319 119 0.3118 0.0220 0.2437 0.022 8epl:A, 7yg5:A
52 7xm9:A 1230 70 0.2151 0.0163 0.2857 0.006 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
53 7xm9:A 1230 84 0.2366 0.0179 0.2619 0.090 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
54 7w9l:A 1420 70 0.2151 0.0141 0.2857 0.007 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
55 7w9l:A 1420 84 0.2366 0.0155 0.2619 0.079 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
56 8fhs:A 1282 111 0.3011 0.0218 0.2523 0.011 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
57 8fhs:A 1282 69 0.2043 0.0148 0.2754 0.036 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
58 8fhs:A 1282 59 0.1828 0.0133 0.2881 0.092 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
59 8gz2:B 1174 70 0.2151 0.0170 0.2857 0.012 8gz1:B
60 8gz2:B 1174 81 0.2043 0.0162 0.2346 0.27 8gz1:B
61 8fhd:A 1294 70 0.2151 0.0155 0.2857 0.012
62 8fhd:A 1294 83 0.2258 0.0162 0.2530 0.24
63 6agf:A 1138 62 0.2258 0.0185 0.3387 0.012
64 6agf:A 1138 84 0.2258 0.0185 0.2500 2.5
65 8eoi:K 1116 69 0.2043 0.0170 0.2754 0.033
66 8eoi:K 1116 115 0.3118 0.0260 0.2522 0.042
67 8eoi:K 1116 59 0.1828 0.0152 0.2881 0.079
68 8f6p:A 1091 70 0.2258 0.0192 0.3000 0.042
69 8f6p:A 1091 81 0.2151 0.0183 0.2469 0.67
70 6uz3:A 1126 70 0.2258 0.0187 0.3000 0.043 7fbs:A
71 6uz3:A 1126 81 0.2151 0.0178 0.2469 0.70 7fbs:A
72 7xsu:A 1085 70 0.2258 0.0194 0.3000 0.043
73 7xsu:A 1085 81 0.2151 0.0184 0.2469 0.68
74 8t6l:A 1237 70 0.2258 0.0170 0.3000 0.048 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
75 8t6l:A 1237 81 0.2151 0.0162 0.2469 0.73 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
76 6xiw:A 1256 70 0.1720 0.0127 0.2286 0.050
77 6xiw:A 1256 65 0.1720 0.0127 0.2462 0.41
78 6xiw:A 1256 61 0.1828 0.0135 0.2787 2.7
79 6xiw:A 1256 110 0.2903 0.0215 0.2455 5.9
80 7cu3:A 1277 70 0.1720 0.0125 0.2286 0.054
81 7cu3:A 1277 65 0.1720 0.0125 0.2462 0.46
82 7cu3:A 1277 61 0.1828 0.0133 0.2787 2.9
83 7cu3:A 1277 110 0.2903 0.0211 0.2455 5.9
84 6j8e:A 1139 71 0.2258 0.0184 0.2958 0.054 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
85 6j8e:A 1139 84 0.2366 0.0193 0.2619 0.26 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
86 7sx3:A 1386 70 0.1720 0.0115 0.2286 0.057 7sx4:A
87 7sx3:A 1386 65 0.1720 0.0115 0.2462 0.46 7sx4:A
88 7sx3:A 1386 61 0.1828 0.0123 0.2787 3.1 7sx4:A
89 7sx3:A 1386 110 0.2903 0.0195 0.2455 6.1 7sx4:A
90 8xmn:A 1277 70 0.2043 0.0149 0.2714 0.070 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
91 8xmn:A 1277 84 0.2366 0.0172 0.2619 0.081 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
92 7we4:A 1122 72 0.2473 0.0205 0.3194 0.11 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
93 7we4:A 1122 49 0.1398 0.0116 0.2653 5.8 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
94 8f0p:A 1116 73 0.2043 0.0170 0.2603 0.41 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
95 7roq:A 1831 41 0.1935 0.0098 0.4390 0.41
96 6a91:A 1323 73 0.2043 0.0144 0.2603 0.48 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
97 6c9a:B 723 61 0.1613 0.0207 0.2459 0.94 6c9a:A
98 3gyy:D 311 23 0.1290 0.0386 0.5217 1.5 3gyy:A, 3gyy:B, 3gyy:C, 2vpn:A, 2vpn:B, 2vpo:A, 2vpo:B
99 8ee6:A 1808 38 0.1505 0.0077 0.3684 1.7 8edw:A
100 8ouo:B 625 103 0.2366 0.0352 0.2136 1.8 6nq0:A, 6nq0:B, 6nq2:A, 6nq2:B
101 8ouo:A 648 103 0.2366 0.0340 0.2136 1.8
102 8eop:A 1687 38 0.1505 0.0083 0.3684 1.8
103 7tj9:A 1111 70 0.1935 0.0162 0.2571 2.4
104 1cf3:A 581 27 0.1290 0.0207 0.4444 4.8 1gal:A, 8jpz:A, 8jpz:B, 5nit:A, 5niw:A, 3qvp:A, 3qvr:A
105 7tbw:A 1928 38 0.1720 0.0083 0.4211 6.0
106 4xzw:A 305 37 0.1290 0.0393 0.3243 6.3
107 7tby:A 1788 38 0.1720 0.0089 0.4211 6.6 7tc0:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417