Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
VGSVAALLTVVFYIAAVMATNLYGATFPEWFGDLSKSLYTLFQVMTLDSWSMGIVRPVMNVHPNAWVFFIPFIMLTTFTV
LNLFIGIIVDAM

The query sequence (length=92) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6sxc:A 271 92 0.9783 0.3321 0.9783 6.11e-61 5bzb:B, 5bzb:C, 5bzb:D, 4cbc:A, 4cbc:B, 4cbc:C, 4cbc:D, 4oxs:A, 4oxs:B, 4oxs:C, 4oxs:D, 4p2z:B, 4p30:A, 4p30:B, 4p30:C, 4p30:D, 4p9o:A, 4p9o:B, 4p9o:C, 4p9o:D, 4p9p:B, 4p9p:D, 4pa3:A, 4pa3:B, 4pa3:C, 4pa3:D, 4pa4:A, 4pa4:B, 4pa4:C, 4pa4:D, 4pa6:A, 4pa6:B, 4pa6:C, 4pa6:D, 4pa7:A, 4pa7:B, 4pa7:C, 4pa7:D, 4pa9:A, 4pa9:B, 4pa9:C, 4pa9:D, 8s6j:A, 6sx5:A, 6sx7:A, 6sxe:A, 6sxf:A, 6sxf:B, 6sxg:A, 4x88:A, 4x88:B, 4x88:C, 4x88:D, 4x89:B, 4x8a:B, 4x8a:C, 4x8a:D, 6yz0:A, 6yz2:A, 6z8c:A, 3zjz:A, 3zjz:B, 3zjz:C, 3zjz:D
2 5ek0:A 250 90 0.6739 0.2480 0.6889 5.55e-40 5ek0:B, 5ek0:C, 5ek0:D
3 7pgg:A 147 91 0.6304 0.3946 0.6374 1.48e-39 7pgg:B, 7pgi:E
4 6n4i:C 226 90 0.6630 0.2699 0.6778 1.57e-39 6n4i:A, 6n4i:D, 6n4i:B
5 5klb:A 267 90 0.6630 0.2285 0.6778 1.15e-38 6c1e:A, 6c1e:B, 6c1k:A, 6c1k:B, 6c1m:A, 6c1m:B, 8h9w:A, 6juh:C, 6ke5:A, 6ke5:B, 6ke5:C, 6ke5:D, 6keb:C, 6keb:D, 5klb:B, 5klb:C, 5klb:D, 5klg:D, 5klg:C, 5kls:C, 5kmf:A, 5kmh:A
6 5hk7:A 139 89 0.5978 0.3957 0.6180 2.32e-38 5hk7:B, 5hk7:C, 7pgb:c, 7pgb:Z, 7pgb:d, 7pgb:o, 7pgb:l, 7pgb:h, 7pgb:e
7 4dxw:A 210 89 0.4130 0.1810 0.4270 8.00e-16
8 8j7m:A 257 94 0.3261 0.1167 0.3191 1.93e-09 8j7m:C, 8j7m:D, 8j7m:B
9 8j7h:B 290 69 0.2500 0.0793 0.3333 5.55e-09 8j7f:A, 8j7f:B, 8j7f:C, 8j7f:D, 8j7h:C, 8j7h:D, 7x5v:A, 7x5v:B, 7x5v:C
10 7eeb:A 258 95 0.3370 0.1202 0.3263 1.46e-06
11 6kzo:A 967 70 0.2391 0.0228 0.3143 8.63e-06
12 6kzo:A 967 95 0.2391 0.0228 0.2316 0.006
13 6kzo:A 967 64 0.1630 0.0155 0.2344 0.75
14 6kzo:A 967 59 0.1957 0.0186 0.3051 3.0
15 6kzp:A 1014 70 0.2391 0.0217 0.3143 9.08e-06
16 6kzp:A 1014 96 0.2391 0.0217 0.2292 0.008
17 6kzp:A 1014 64 0.1630 0.0148 0.2344 0.79
18 6kzp:A 1014 59 0.1957 0.0178 0.3051 3.1
19 9ayh:A 1056 70 0.2391 0.0208 0.3143 1.47e-05 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
20 9ayh:A 1056 94 0.2174 0.0189 0.2128 0.004 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
21 9ayh:A 1056 59 0.1957 0.0170 0.3051 2.0 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
22 7wli:A 1135 86 0.2717 0.0220 0.2907 6.69e-05 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
23 7wli:A 1135 103 0.2174 0.0176 0.1942 0.018 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
24 7wli:A 1135 59 0.1957 0.0159 0.3051 3.1 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
25 7wli:A 1135 81 0.1848 0.0150 0.2099 5.9 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
26 8e59:A 1230 113 0.3043 0.0228 0.2478 0.002 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
27 8e59:A 1230 67 0.1957 0.0146 0.2687 0.041 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
28 8e59:A 1230 68 0.1848 0.0138 0.2500 0.82 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
29 6jp5:A 1274 113 0.2935 0.0212 0.2389 0.005 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
30 6jp5:A 1274 60 0.1848 0.0133 0.2833 0.027 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
31 6jp5:A 1274 68 0.1739 0.0126 0.2353 1.1 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
32 7jpx:A 1116 113 0.2935 0.0242 0.2389 0.006 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
33 7jpx:A 1116 60 0.1848 0.0152 0.2833 0.026 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
34 7jpx:A 1116 68 0.1739 0.0143 0.2353 1.0 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
35 7mix:A 1326 54 0.1848 0.0128 0.3148 0.007 7miy:A
36 7mix:A 1326 108 0.2717 0.0189 0.2315 0.052 7miy:A
37 8wea:A 1206 107 0.2935 0.0224 0.2523 0.007
38 8wea:A 1206 59 0.1739 0.0133 0.2712 0.35
39 8wea:A 1206 68 0.1848 0.0141 0.2500 0.50
40 7vfs:A 1266 60 0.1957 0.0142 0.3000 0.008 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
41 7vfs:A 1266 108 0.2717 0.0197 0.2315 0.052 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
42 7xm9:A 1230 70 0.2174 0.0163 0.2857 0.013 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
43 7xm9:A 1230 84 0.2391 0.0179 0.2619 0.11 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
44 7xm9:A 1230 61 0.1739 0.0130 0.2623 4.1 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
45 7w9l:A 1420 61 0.2065 0.0134 0.3115 0.015 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
46 7w9l:A 1420 84 0.2391 0.0155 0.2619 0.10 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
47 7w9l:A 1420 58 0.1630 0.0106 0.2586 5.0 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
48 8x90:A 1377 51 0.1739 0.0116 0.3137 0.020 8x91:A, 8x93:A
49 8x90:A 1377 89 0.2826 0.0189 0.2921 0.046 8x91:A, 8x93:A
50 8x90:A 1377 26 0.1304 0.0087 0.4615 0.10 8x91:A, 8x93:A
51 8fhd:A 1294 70 0.2174 0.0155 0.2857 0.021
52 8fhd:A 1294 83 0.2283 0.0162 0.2530 0.30
53 8gz2:B 1174 70 0.2174 0.0170 0.2857 0.022 8gz1:B
54 8gz2:B 1174 81 0.2065 0.0162 0.2346 0.35 8gz1:B
55 6agf:A 1138 62 0.2283 0.0185 0.3387 0.023
56 6agf:A 1138 84 0.2283 0.0185 0.2500 3.6
57 8fhs:A 1282 111 0.2935 0.0211 0.2432 0.026 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
58 8fhs:A 1282 59 0.1739 0.0125 0.2712 0.34 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
59 8fhs:A 1282 68 0.1848 0.0133 0.2500 0.48 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
60 7xlq:A 1319 50 0.1739 0.0121 0.3200 0.026 8epl:A, 7yg5:A
61 7xlq:A 1319 119 0.3043 0.0212 0.2353 0.061 8epl:A, 7yg5:A
62 7xlq:A 1319 91 0.2609 0.0182 0.2637 0.067 8epl:A, 7yg5:A
63 8epm:A 991 59 0.1848 0.0172 0.2881 0.028
64 8epm:A 991 89 0.2391 0.0222 0.2472 0.060
65 8epm:A 991 119 0.3043 0.0283 0.2353 0.068
66 7xsu:A 1085 70 0.2283 0.0194 0.3000 0.072
67 7xsu:A 1085 81 0.2174 0.0184 0.2469 0.97
68 7xsu:A 1085 51 0.1522 0.0129 0.2745 4.2
69 8f6p:A 1091 70 0.2283 0.0192 0.3000 0.073
70 8f6p:A 1091 81 0.2174 0.0183 0.2469 0.94
71 8f6p:A 1091 51 0.1522 0.0128 0.2745 4.0
72 6uz3:A 1126 70 0.2283 0.0187 0.3000 0.073 7fbs:A
73 6uz3:A 1126 81 0.2174 0.0178 0.2469 0.97 7fbs:A
74 6uz3:A 1126 51 0.1522 0.0124 0.2745 4.2 7fbs:A
75 8t6l:A 1237 70 0.2283 0.0170 0.3000 0.080 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
76 8t6l:A 1237 81 0.2174 0.0162 0.2469 1.0 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
77 8t6l:A 1237 51 0.1522 0.0113 0.2745 4.7 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
78 8xmn:A 1277 84 0.2391 0.0172 0.2619 0.098 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
79 8xmn:A 1277 70 0.2065 0.0149 0.2714 0.13 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
80 8xmn:A 1277 61 0.1739 0.0125 0.2623 4.0 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
81 6j8e:A 1139 71 0.2283 0.0184 0.2958 0.098 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
82 6j8e:A 1139 84 0.2391 0.0193 0.2619 0.29 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
83 8eoi:K 1116 115 0.3043 0.0251 0.2435 0.11
84 8eoi:K 1116 59 0.1739 0.0143 0.2712 0.29
85 8eoi:K 1116 68 0.1848 0.0152 0.2500 0.47
86 6xiw:A 1256 69 0.1630 0.0119 0.2174 0.20
87 6xiw:A 1256 62 0.1522 0.0111 0.2258 2.7
88 6xiw:A 1256 61 0.1848 0.0135 0.2787 4.2
89 7sx3:A 1386 69 0.1630 0.0108 0.2174 0.20 7sx4:A
90 7sx3:A 1386 62 0.1522 0.0101 0.2258 2.7 7sx4:A
91 7sx3:A 1386 61 0.1848 0.0123 0.2787 4.7 7sx4:A
92 7we4:A 1122 72 0.2500 0.0205 0.3194 0.21 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
93 7we4:A 1122 52 0.1630 0.0134 0.2885 1.4 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
94 7cu3:A 1277 69 0.1630 0.0117 0.2174 0.22
95 7cu3:A 1277 62 0.1522 0.0110 0.2258 3.1
96 7cu3:A 1277 61 0.1848 0.0133 0.2787 4.7
97 7roq:A 1831 41 0.1957 0.0098 0.4390 0.41
98 8f0p:A 1116 73 0.2065 0.0170 0.2603 0.65 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
99 6a91:A 1323 73 0.2065 0.0144 0.2603 0.77 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
100 8ouo:B 625 103 0.2391 0.0352 0.2136 1.1 6nq0:A, 6nq0:B, 6nq2:A, 6nq2:B
101 8ouo:A 648 103 0.2391 0.0340 0.2136 1.1
102 6c9a:B 723 61 0.1630 0.0207 0.2459 1.2 6c9a:A
103 4xzw:A 305 37 0.1413 0.0426 0.3514 1.4
104 3gyy:D 311 23 0.1304 0.0386 0.5217 1.5 3gyy:A, 3gyy:B, 3gyy:C, 2vpn:A, 2vpn:B, 2vpo:A, 2vpo:B
105 7tj9:A 1111 70 0.1957 0.0162 0.2571 1.5
106 8ee6:A 1808 38 0.1522 0.0077 0.3684 1.6 8edw:A
107 8eop:A 1687 38 0.1522 0.0083 0.3684 1.6
108 7tbw:A 1928 38 0.1739 0.0083 0.4211 5.8
109 7tby:A 1788 38 0.1739 0.0089 0.4211 6.4 7tc0:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417