BioLiP

>protein
TYSPLPDDYNCNVELALTSDGRTIVCYHPSVDIPYEHTKPIPREEGPMIEQLSKMFFTTKHRWYPHGRYHRCRKNLNPPK
DR

The query sequence (length=82) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6i9r:a	83	83	0.9878	0.9759	0.9759	4.68e-56	7a5f:a3, 7a5g:a3, 7a5h:a, 7a5i:a3, 7a5j:a, 7a5k:a3, 3j9m:a, 6nu2:a, 6nu3:a, 7o9k:a, 7o9m:a, 7of0:a, 7of2:a, 7of3:a, 7of4:a, 7of5:a, 7of6:a, 7of7:a, 7oi6:a, 7oi7:a, 7oi8:a, 7oi9:a, 7oia:a, 7oib:a, 7oic:a, 7oid:a, 7oie:a, 5ool:a, 5oom:a, 7pd3:a, 7qh6:a, 7qh7:a, 8qu5:a
2	8k2a:Lp	97	97	1.0000	0.8454	0.8454	2.71e-55	8k2b:Lp, 7og4:a, 8xt0:Lp, 8xt1:Lp, 8xt2:Lp, 8xt3:Lp, 6zs9:a, 6zsa:a, 6zsb:a, 6zsc:a, 6zsd:a, 6zse:a, 6zsg:a
3	7l08:a	108	108	1.0000	0.7593	0.7593	2.18e-53	8any:a, 3j7y:a, 7l20:a, 7odr:a, 7ods:a, 7odt:a, 8oir:Br, 8oit:Br, 8pk0:a, 7po4:a, 7qi4:a, 7qi5:a, 7qi6:a, 8qsj:a, 6vlz:a, 6vmi:a, 6zm5:a, 6zm6:a
4	6gaw:Bf	108	108	0.8902	0.6759	0.6759	2.26e-45	6gb2:Bf, 7nqh:Bf, 7nql:Bf, 7nsh:Bf, 7nsi:Bf, 7nsj:Bf, 8oin:Br, 8oiq:Br, 6ydp:Bf, 6ydw:Bf
5	5aj4:Bf	108	108	0.8780	0.6667	0.6667	3.11e-43
6	3j7a:F	257	70	0.2439	0.0778	0.2857	1.1	3jbn:F, 3jbo:F, 3jbp:F, 6okk:F, 8tpu:SF
7	4v7f:l	380	37	0.1585	0.0342	0.3514	1.2	5jcs:u, 4v8t:t
8	6hiv:BP	202	33	0.1585	0.0644	0.3939	1.5	6hix:BP
9	8hfr:pT	580	37	0.1585	0.0224	0.3514	1.6	5apn:x, 5apo:x, 7z34:4
10	7uoo:4	538	37	0.1585	0.0242	0.3514	1.6	6ft6:4, 3jct:4, 6m62:4, 6rzz:r, 7uqb:4, 7uqz:4, 7v08:4, 6ylg:4, 6ylh:4
11	8d3d:A	1314	24	0.1341	0.0084	0.4583	4.0	8d3c:A, 8d3c:B, 8d3c:C, 8d3c:D, 8d3c:E, 8d3c:F, 8d3c:G, 8d3c:H, 8d3c:I, 8d3c:J, 8d3c:K, 8d3c:L, 8d3c:M, 8d3c:N, 8d3c:O, 8d3c:P, 8d3d:B, 8d3d:C, 8d3d:D, 8d3d:E, 8d3d:F, 8d3d:G, 8d3d:H, 8d3d:I, 8d3d:J, 8d3d:K, 8d3d:L, 8d3d:M, 8d3d:N, 8d3d:O, 8d3d:P, 7f49:A, 3hxo:A, 3hxq:A, 7wn3:A, 7wn3:B, 7wn3:E, 7wn3:G, 7wn4:E, 7wn4:G, 7wn6:A, 7wn6:B, 7wn6:E, 7wn6:G, 7wpp:E, 7wpp:G, 7wpq:A, 7wpq:B, 7wpq:E, 7wpq:G, 7wpr:A, 7wpr:B, 7wpr:E, 7wpr:F, 7wpr:G, 7wpr:H, 7wpr:I, 7wpr:J, 7wpr:K, 7wpr:L, 7wpr:M, 7wpr:N, 7wpr:O, 7wpr:P, 7wpr:Q, 7wpr:R, 7wps:A, 7wps:B, 7wps:E, 7wps:G, 7wps:I, 7wps:K, 7wps:M, 7wps:O, 7wps:Q, 7wps:S, 7wps:U, 7wps:W, 7wps:Y, 7wps:a, 7wqt:A, 7wqt:B, 7wqt:E, 7wqt:F, 7wqt:G, 7wqt:H, 7wqt:I, 7wqt:J, 7wqt:K, 7wqt:L, 7wqt:M, 7wqt:N, 7wqt:O, 7wqt:P, 7wqt:Q, 7wqt:R
12	8azw:G	186	25	0.1098	0.0484	0.3600	5.3	8b2l:G3, 7qiw:S, 7qiz:S
13	2zze:A	744	49	0.2195	0.0242	0.3673	6.7	2zze:B, 2zzf:A, 2zzg:A, 2zzg:B
14	1a0r:B	339	22	0.1220	0.0295	0.4545	8.3	7e9h:B, 8jd6:B, 6rmv:A, 7tmw:B, 1xhm:A
15	8byi:A	320	21	0.0854	0.0219	0.3333	8.7	8byi:B, 8byi:C, 8byi:D, 8byi:E

[Back]