BioLiP

>protein
TYKERAATHPSPVAAKLFNIMHEKQTNLCASLDVRTTKELLELVEALGPKICLLKTHVDILTDFSMEGTVKPLKALSAKY
NFLLFEDRKFADIGNTVKLQYSAGVYRIAEWADITNAHGVVGPGIVSGLKQAAEEVTKEPRGLLMLAELSCKGSLATGEY
TKGTVDIAKSDKDFVIGFIAQRDMGGRDEGYDWLIMTPGVGLDDKGDALGQQYRTVDDVVSTGSDIIIVGRGLFAKGRDA
KVEGERYRKAGWEAYLR

The query sequence (length=257) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1dqx:A	267	257	0.9961	0.9588	0.9961	0.0	1dqx:B, 1dqx:C, 1dqx:D, 3gdl:A, 3gdl:B, 3gdt:A, 3gdt:B, 3gdt:C, 3gdt:D
2	2v30:A	262	246	0.4942	0.4847	0.5163	1.01e-81	7am9:A, 7asq:A, 3bgg:A, 3bgj:A, 3bgj:B, 3bk0:A, 3bk0:B, 3bvj:A, 3bvj:B, 3dbp:A, 3dbp:B, 3ewu:A, 3ewu:B, 3eww:A, 3eww:B, 3ewx:A, 3ewy:A, 3ewz:A, 3ewz:B, 3ewz:C, 3ewz:D, 3ex1:A, 3ex1:B, 3ex2:A, 3ex2:B, 3ex3:A, 3ex3:B, 3ex4:A, 3ex6:A, 3ex6:B, 3g3d:A, 3g3d:B, 3g3m:A, 4hib:A, 4hib:B, 4hkp:A, 4hkp:B, 3l0k:A, 3l0k:B, 3l0n:A, 3l0n:B, 3mi2:A, 3mi2:B, 3mo7:A, 3mw7:A, 3mw7:B, 7oqf:A, 7oqf:B, 7oqi:A, 7oqi:B, 7oqk:A, 7oqk:B, 7oqm:A, 7oqm:B, 7oqn:A, 7oqn:B, 7otu:A, 7ouz:A, 7ov0:A, 7q1h:A, 2qcd:A, 2qcd:B, 2qcf:A, 2qcg:A, 2qcg:B, 2qch:A, 2qch:B, 2qcl:A, 2qcl:B, 2qcm:A, 2qcn:A, 2qcn:B, 2v30:B, 6yvk:A, 6yvl:A, 6yvm:A, 6yvn:A, 6yvo:A, 6ywt:A, 6ywu:A, 6zwy:A, 6zx0:A, 6zx1:A, 6zx2:A, 6zx3:A
3	8u0z:A	260	258	0.5175	0.5115	0.5155	1.02e-75	8u0z:B
4	2cze:A	208	212	0.1984	0.2452	0.2406	5.42e-04	2cze:B, 2czf:A, 2czf:B
5	3uwq:B	224	216	0.2101	0.2411	0.2500	0.003	3uwq:A
6	1eix:C	232	219	0.1907	0.2112	0.2237	0.025	1eix:A, 1eix:B, 1eix:D, 1jjk:A, 1jjk:B, 1jjk:C, 1jjk:D, 1jjk:E, 1jjk:F, 1jjk:G, 1jjk:H, 1jjk:I, 1jjk:J, 1jjk:K, 1jjk:L, 1jjk:M, 1jjk:N, 1jjk:O, 1jjk:P
7	4luj:A	214	231	0.2179	0.2617	0.2424	0.041	4luj:B
8	4muz:A	212	238	0.2412	0.2925	0.2605	0.061	4muz:B
9	8cso:C	231	220	0.1829	0.2035	0.2136	0.77	8cso:A, 8cso:B, 8cso:D, 8cso:E, 8cso:F, 8ek7:C, 8ek7:E
10	6jbc:A	295	35	0.0545	0.0475	0.4000	1.5	6jbd:A
11	4dbe:A	213	154	0.1518	0.1831	0.2532	3.3	4dbe:B
12	1cr6:B	541	72	0.0817	0.0388	0.2917	5.2	1cr6:A, 1ek1:A, 1ek1:B, 1ek2:A, 1ek2:B
13	7kmo:A	511	57	0.0778	0.0391	0.3509	6.6
14	1djn:A	729	25	0.0467	0.0165	0.4800	8.6	1djn:B, 1djq:A, 1djq:B, 1o94:A, 1o94:B, 1o95:A, 1o95:B, 2tmd:A, 2tmd:B
15	6gsz:A	863	82	0.0934	0.0278	0.2927	9.1

[Back]