BioLiP

>protein
TQVHPRAPLLQILKVAGAQEEVFTLKEVMHYLGQYIMMKQLYDKQRQHIVHCHDDPLGELLEVGSFSVKNPSPVYEMLKR
NLVILN

The query sequence (length=86) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2z5t:O	93	85	0.9651	0.8925	0.9765	3.23e-58	3dac:M, 3dac:A, 8ebk:A, 8gjs:A, 4n5t:A, 6v4e:A, 6v4e:B, 6v4f:A, 6v4g:A, 6v4h:A, 6v4h:C, 2z5s:M, 2z5s:N, 2z5s:O, 2z5t:M, 2z5t:N
2	8hdg:D	98	85	0.6744	0.5918	0.6824	1.79e-32	7c3q:A, 7c3y:A, 7c44:A, 3dab:A, 3dab:C, 3dab:E, 3dab:G, 7el4:A, 3eqy:A, 3eqy:B, 3fdo:A, 3fe7:A, 3fea:A, 8hdg:A, 8hdg:C, 8hdg:B, 8ia5:A, 3jzo:A, 3jzp:A, 3jzq:A, 3jzq:B, 7kjn:A, 3lbj:E, 2mwy:A, 2n06:A, 2n0u:A, 2n0w:A, 2n14:A, 6q9q:A, 6q9q:B, 6q9q:C, 6q9q:D, 6q9s:A, 6q9s:B, 6q9s:C, 6q9u:A, 6q9w:A, 6q9w:B, 6q9y:A, 6q9y:B, 4rxz:A, 4rxz:B, 3u15:A, 3u15:B, 3u15:C, 3u15:D, 5uml:A, 5uml:B, 5uml:E, 5uml:G, 5vk1:A, 5vk1:I, 5vk1:C, 5vk1:E, 5vk1:G, 5vk1:K, 5vk1:M, 5vk1:O
3	1ttv:A	107	84	0.5930	0.4766	0.6071	3.97e-32	4ipf:A, 4j3e:A, 4j74:A, 4j7d:A, 4j7e:A, 4jrg:A, 4jrg:B, 4jsc:A, 4jsc:B, 4lwt:A, 4lwu:A, 4lwv:A, 4lwv:B, 4lwv:C, 1ycq:A
4	2lzg:A	125	70	0.4651	0.3200	0.5714	1.93e-25	6aaw:A, 7ad0:A, 7ad0:F, 7ad0:B, 7ad0:C, 7ad0:D, 7ad0:E, 8aeu:A, 5afg:A, 2axi:A, 7bir:A, 7bit:A, 7biv:A, 7bj0:A, 7bj0:B, 7bj6:A, 7bmg:A, 5c5a:A, 5c5a:B, 4dij:A, 4dij:B, 8ei9:B, 8eia:B, 8eib:B, 8eic:B, 3eqs:A, 4ere:A, 4ere:B, 4erf:A, 4erf:C, 4erf:E, 8f0z:A, 8f10:A, 8f12:A, 8f13:A, 3g03:A, 3g03:C, 6ggn:A, 2gv2:A, 6h22:A, 6h22:B, 4hbm:A, 4hbm:B, 4hbm:C, 4hbm:D, 4hbm:E, 4hbm:F, 4hbm:G, 4hbm:H, 4hfz:A, 4hfz:C, 6hfa:A, 6hfa:B, 4hg7:A, 5hmh:A, 5hmh:B, 5hmi:A, 5hmi:B, 5hmk:A, 5hmk:B, 6i29:A, 6i3s:A, 3iux:A, 3iux:C, 3iwy:A, 3iwy:C, 5j7f:A, 5j7f:D, 5j7f:B, 5j7f:C, 5j7g:A, 5j7g:B, 5j7g:C, 5j7g:D, 8j81:A, 4jv7:A, 4jv9:A, 4jve:A, 4jvr:A, 4jvr:C, 4jvr:E, 4jwr:A, 4jwr:B, 4jwr:C, 3jzk:A, 3jzr:A, 3jzs:A, 7kjm:A, 7kjm:C, 6kzu:A, 5lav:A, 5law:A, 5lay:A, 5lay:B, 5lay:C, 5lay:D, 5lay:E, 5lay:F, 5laz:A, 3lbk:A, 3lbl:A, 3lbl:C, 3lbl:E, 3lnj:A, 3lnj:C, 3lnj:E, 3lnz:A, 3lnz:C, 3lnz:E, 3lnz:G, 3lnz:I, 3lnz:K, 3lnz:M, 3lnz:O, 5ln2:A, 4mdn:A, 4mdq:A, 2mps:A, 7na1:A, 7na1:B, 7na2:A, 7na2:B, 7na3:A, 7na4:A, 7nus:A, 7nus:B, 7nus:C, 4oas:A, 4oas:C, 4oas:E, 5oai:A, 4oba:A, 4oba:B, 4oba:C, 4occ:A, 4occ:C, 4occ:E, 5oc8:A, 4ode:A, 4odf:A, 4ogn:A, 4ogt:A, 4ogv:A, 4ogv:B, 4ogv:C, 4oq3:A, 4oq3:B, 4oq3:C, 4oq3:D, 6q96:A, 6q96:B, 6q9h:A, 6q9l:A, 6q9l:B, 6q9o:A, 6q9o:B, 7qdq:A, 4qo4:A, 4qoc:A, 4qoc:C, 4qoc:G, 4qoc:E, 4qoc:I, 4qoc:K, 1rv1:A, 1rv1:B, 1rv1:C, 6t2d:A, 6t2e:A, 6t2f:A, 1t4e:A, 1t4e:B, 1t4f:M, 3tj2:A, 3tj2:C, 3tpx:A, 3tpx:C, 3tpx:E, 5trf:A, 5trf:B, 5trf:C, 5trf:D, 5trf:E, 3tu1:A, 4ud7:A, 4ud7:B, 4ud7:C, 4ud7:D, 4ue1:A, 4ue1:B, 4ue1:C, 4ue1:D, 4umn:A, 4umn:B, 5umm:A, 5umm:C, 3v3b:B, 3v3b:A, 3vbg:A, 3vbg:B, 3vbg:C, 3vbg:D, 5vk0:A, 5vk0:M, 5vk0:C, 5vk0:E, 5vk0:K, 5vk0:G, 5vk0:Q, 5vk0:I, 5vk0:O, 5vk0:S, 5vk0:U, 5vk0:W, 3vzv:A, 3vzv:B, 3w69:A, 3w69:B, 4wt2:A, 5xxk:A, 5xxk:B, 6y4q:A, 6y4q:B, 1ycr:A, 5z02:A, 4zfi:A, 4zfi:B, 4zfi:C, 4zfi:D, 4zgk:A, 4zgk:B, 5zxf:A, 4zyc:A, 4zyc:C, 4zyc:B, 4zyf:A, 4zyi:A
5	3dtn:A	220	31	0.1279	0.0500	0.3548	0.089	3dtn:B
6	8glv:OD	370	39	0.1512	0.0351	0.3333	0.19
7	5xw2:A	375	59	0.1744	0.0400	0.2542	0.23	4e2p:A
8	1t3q:A	162	82	0.2791	0.1481	0.2927	1.4	1t3q:D
9	8a22:BF	370	25	0.1279	0.0297	0.4400	1.9	8apn:BF, 8apo:BF
10	4k2r:A	551	32	0.1279	0.0200	0.3438	5.1	2oq1:A, 2ozo:A, 1u59:A, 4xz0:A, 4xz1:A
11	3ll3:A	492	37	0.1163	0.0203	0.2703	5.3	3ll3:B
12	8t7j:A	365	63	0.2093	0.0493	0.2857	9.2	8t7j:B, 8t7j:C, 8t7j:D
13	2glf:A	450	21	0.1279	0.0244	0.5238	9.9	2glf:B, 2glf:C, 2glf:D

[Back]