Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TKNVIRGKYHPEFLQNEVLADIFAHTAQTLPDKTALIEADKTLSYGELYQQALIMAQHLALKGVKPGHIVGLWLPRGIEL
LKAQLAICLSGAAWLPFDMDTPADRIAVCLEDAEAVGMITTDEWYEHLAEVPQTKWTNTELQKPLSESVSLAKTTPDQPA
YIIYTSKPKGIVITQKNICHFLRSENSILGIQEQDKVYQGFSVAFDMSFEEIWLSYLVGATLWIAPKSLVSDPERLCQTL
KQEQITVLHAVPTLLALFPEDVPNLRIINLGGEMCPDSLVDRWALPHHQMFNTYGPTETTVSASLELLERGKPVTIGKPL
PNYGMLVINSERELLEQGETGELCIFGPSVAQGYLGRPDLTADKFIENPWAMSVEEELLYRTGDLAKIDEFGQVHCLGRA

The query sequence (length=400) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8g96:A 406 404 1.0000 0.9852 0.9901 0.0 8g96:B, 8g97:A, 8g97:B, 8g98:A
2 7ywk:A 401 401 0.3400 0.3392 0.3392 1.54e-64 5n81:A, 5n81:B, 5n82:A, 7ywk:B
3 5u89:A 1039 408 0.3600 0.1386 0.3529 6.11e-64
4 5ja2:A 1238 405 0.3575 0.1155 0.3531 5.07e-58 5ja1:A, 5t3d:A
5 1amu:A 509 400 0.3150 0.2475 0.3150 2.01e-57 1amu:B
6 7wew:A 481 395 0.3500 0.2911 0.3544 5.13e-57
7 6ea3:B 417 407 0.3450 0.3309 0.3391 5.34e-57
8 2vsq:A 1273 402 0.3575 0.1123 0.3557 1.08e-55
9 8www:A 501 408 0.3375 0.2695 0.3309 2.17e-54 8www:B
10 6mfz:A 1789 410 0.3500 0.0783 0.3415 4.92e-53 5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
11 6mfz:A 1789 399 0.3125 0.0699 0.3133 2.79e-46 5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
12 6mg0:B 1687 406 0.3475 0.0824 0.3424 5.76e-53
13 6mg0:B 1687 399 0.3125 0.0741 0.3133 2.09e-46
14 5n9x:A 489 406 0.3200 0.2618 0.3153 1.80e-52 5n9x:B
15 8jbr:A 1023 397 0.3175 0.1241 0.3199 2.26e-50
16 4d56:A 482 407 0.3175 0.2635 0.3120 1.35e-47 4d4g:A, 4d4i:A, 4d57:A
17 6p4u:A 843 402 0.3250 0.1542 0.3234 2.27e-46 6ozv:A, 6p3i:A
18 8gic:A 392 393 0.2950 0.3010 0.3003 1.58e-44 8gic:B, 8gkm:A, 8gkm:B
19 6n8e:A 1332 410 0.2950 0.0886 0.2878 1.85e-44
20 3vnq:A 497 405 0.3250 0.2616 0.3210 4.08e-44 3vnr:A, 3vns:A
21 8hlk:A 910 404 0.3150 0.1385 0.3119 1.77e-43
22 7xbt:A 487 398 0.3100 0.2546 0.3116 9.22e-41 7xbu:A, 7xbv:A
23 6ltb:A 928 401 0.2825 0.1218 0.2818 5.85e-40 6ltc:A, 6ltd:A, 6ltd:B
24 4zxh:A 1314 401 0.3100 0.0944 0.3092 2.55e-39 4zxi:A
25 7ly7:A 908 398 0.2925 0.1289 0.2940 2.38e-38
26 6vhy:C 540 403 0.3100 0.2296 0.3077 2.17e-36 6vhv:A, 6vhw:A, 6vhw:B, 6vhx:A, 6vhx:B, 6vhy:D, 6vhy:A, 6vhy:B, 6vhz:A, 6vhz:B
27 3fcc:A 500 403 0.2850 0.2280 0.2829 1.23e-35 3dhv:A, 3fce:A
28 4gr5:C 457 393 0.2725 0.2385 0.2774 5.03e-34 4gr5:A, 4gr5:B, 4gr5:D
29 5wmm:A 870 393 0.2875 0.1322 0.2926 8.12e-34
30 3e7w:A 508 405 0.2825 0.2224 0.2790 1.18e-33 3e7x:A
31 7thq:B 505 411 0.2700 0.2139 0.2628 3.78e-32 6o6e:B, 7thq:A
32 3wv5:A 387 400 0.2550 0.2636 0.2550 3.44e-31 3wvn:A
33 7en2:B 1410 400 0.2700 0.0766 0.2700 1.81e-29 7emy:A, 7emy:B, 7en1:A, 7en1:B, 7en2:A
34 7r27:B 398 399 0.2575 0.2588 0.2581 2.01e-28 7r27:A
35 3lgx:A 508 394 0.2675 0.2106 0.2716 6.19e-28 3lgx:B, 3lgx:C, 3lgx:D
36 8k4r:A 506 398 0.2625 0.2075 0.2638 1.38e-26 8k4r:C
37 4oxi:A 526 441 0.2750 0.2091 0.2494 5.67e-25
38 5x8f:B 485 390 0.2650 0.2186 0.2718 3.32e-24 5buq:B, 5bur:A, 5bur:B, 5bus:A, 5bus:B, 5gtd:A, 5gtd:B, 5x8f:A, 5x8f:C, 5x8f:D, 5x8g:A, 5x8g:B, 5x8g:D, 5x8g:C
39 8yyr:A 496 399 0.2725 0.2198 0.2732 6.80e-24 7dq5:A, 7dq5:B, 7dq6:A, 7dq6:B, 6m01:A, 8yyq:A
40 3wv5:B 359 362 0.2175 0.2423 0.2403 8.61e-24 3wvn:B
41 8wev:A 486 404 0.2575 0.2119 0.2550 1.18e-22 8wev:B
42 7thn:B 478 363 0.2650 0.2218 0.2920 3.86e-22
43 5jjq:C 489 409 0.2750 0.2249 0.2689 1.84e-20 5jjq:A, 5jjq:B, 5jjq:D
44 5ie2:A 506 421 0.2700 0.2134 0.2565 2.49e-20 5ie2:B, 5ie3:A, 5ie3:B
45 4dg9:A 575 396 0.2575 0.1791 0.2601 4.42e-20 4dg8:A
46 6akd:A 488 406 0.2750 0.2254 0.2709 1.10e-18
47 7vhv:A 485 395 0.2625 0.2165 0.2658 2.10e-17 7vhv:D, 7vhv:C, 7vhv:B
48 6qjz:A 504 418 0.2525 0.2004 0.2416 2.29e-16
49 3r44:A 502 387 0.2275 0.1813 0.2351 5.64e-16 5zrn:A, 5zrn:B
50 4gxq:A 506 410 0.2425 0.1917 0.2366 1.48e-15 4fut:A, 4gxq:B, 4gxq:C, 4gxr:A
51 4r0m:A 637 418 0.2525 0.1586 0.2416 4.78e-14 4r0m:B
52 5oe3:A 394 266 0.1700 0.1726 0.2556 5.97e-14 5oe3:B, 5oe3:C, 5oe3:D, 5oe4:A, 5oe4:B, 5oe5:A, 5oe6:A, 5oe6:B, 5oe6:C, 5oe6:D
53 7tz4:A 530 424 0.2625 0.1981 0.2476 2.80e-13 7tyb:A
54 5wm3:A 537 433 0.2600 0.1937 0.2402 1.38e-11 5wm2:A, 5wm4:A, 5wm5:A, 5wm6:A, 5wm7:A
55 3a9v:A 528 365 0.2225 0.1686 0.2438 2.07e-11 3ni2:A
56 4rlf:B 519 400 0.2525 0.1946 0.2525 1.15e-10 6m2t:A, 6m2t:B, 6m2t:C, 6m2t:D, 6m2u:A, 6m2u:B, 4rlf:A, 4rlq:A, 4rlq:B, 4rm2:A, 4rm2:B, 4rm3:A, 4rm3:B, 4rmn:A, 4rmn:B, 4zjz:A, 4zjz:B
57 3rg2:C 613 431 0.2675 0.1746 0.2483 2.69e-10 6iyk:A, 6iyk:B, 6iyl:A, 6iyl:B, 4iz6:A, 4iz6:B, 8k5s:A, 8k5s:B, 8k5t:A, 8k5t:B, 3rg2:A, 3rg2:B, 3rg2:H, 3rg2:D, 3rg2:E, 3rg2:F, 3rg2:I, 3rg2:G, 3rg2:J
58 2d1r:A 539 240 0.1650 0.1224 0.2750 5.09e-10 2d1q:A, 2d1s:A, 2d1t:A
59 6k4d:A 539 419 0.2125 0.1577 0.2029 5.71e-10 6k4c:A
60 6e97:B 537 431 0.2425 0.1806 0.2251 6.00e-10 6e8o:A, 6e8o:B, 6e97:A
61 3dlp:X 504 427 0.2525 0.2004 0.2365 1.33e-09 3cw8:X, 3cw9:A, 3cw9:B, 2qvx:X, 2qvy:X, 2qvz:X, 2qw0:X, 1t5d:X, 1t5h:X
62 6q2m:A 544 240 0.1575 0.1158 0.2625 5.46e-09 1ba3:A, 5dwv:A, 4e5d:A, 4g36:A, 4g36:B, 4g37:A, 4g37:B, 5gyz:A, 5gz2:A, 6hps:A, 6hps:B, 3ies:A, 5kyt:A, 5kyt:B, 5kyv:A, 5kyv:B, 6q2m:B, 6q2m:C, 3rix:A, 5wys:A
63 7r7e:A 567 424 0.2500 0.1764 0.2358 9.74e-09 7r7e:B, 7r7f:A, 7r7f:B, 7r7g:A, 7r7g:B
64 3nyq:A 460 257 0.1600 0.1391 0.2490 9.86e-09 3nyr:A
65 1v26:B 510 262 0.1800 0.1412 0.2748 2.27e-08 1v25:A, 1v25:B, 1v26:A
66 3kxw:A 572 458 0.2375 0.1661 0.2074 9.06e-08 3lnv:A
67 5d6j:A 630 437 0.2375 0.1508 0.2174 9.90e-08 5ey8:A, 5ey8:B, 5ey8:C, 5ey8:D, 5ey8:E, 5ey8:F, 5ey8:G, 5ey8:H, 5icr:A, 5icr:B, 5icr:C, 5icr:D
68 7kdn:A 622 306 0.1925 0.1238 0.2516 1.97e-07 7kdn:B, 7kdn:C, 7kdn:D, 7kdn:E, 7kdn:F
69 2p20:A 641 448 0.2525 0.1576 0.2254 2.01e-07 5jrh:A, 5jrh:B, 2p20:B, 2p2b:A, 2p2b:B, 2p2f:A, 2p2f:B, 2p2j:A, 2p2j:B, 2p2m:A, 2p2m:B, 2p2q:A, 2p2q:B, 1pg3:A, 1pg3:B, 1pg4:A, 1pg4:B
70 5gxd:A 627 453 0.2400 0.1531 0.2119 2.08e-07
71 3pbk:A 555 424 0.2350 0.1694 0.2217 4.11e-07 3pbk:B
72 3u16:B 437 421 0.2100 0.1922 0.1995 6.60e-07 3o82:A, 3o82:B, 3o83:A, 3o83:B, 3o84:A, 3o84:B, 3u16:A, 3u17:A, 3u17:B
73 5bsm:A 530 369 0.1950 0.1472 0.2114 1.80e-06 5bsm:B, 5bsr:A, 5bst:A, 5bsu:A, 5bsv:A, 5bsw:A, 5bsw:B, 5u95:D, 5u95:B, 5u95:C
74 8ppp:A 500 395 0.2350 0.1880 0.2380 2.10e-06 8ppp:B, 8pyx:A, 8pyx:B
75 1md9:A 536 421 0.2300 0.1716 0.2185 6.50e-06 1mdb:A
76 8rpl:B 630 420 0.2300 0.1460 0.2190 1.00e-05 8rpk:A, 8rpk:B, 8rpk:C, 8rpk:D, 8rpl:A, 8rpl:C, 8rpl:D
77 7kvy:A 633 306 0.1825 0.1153 0.2386 1.03e-05 7kcp:A, 7kq6:A, 7kq6:B, 7kq6:C, 7kqz:A, 7l3p:A, 7l3q:A, 7l3q:B, 7l3q:C
78 5ups:A 520 427 0.2175 0.1673 0.2037 1.34e-05 5upq:A, 5upq:B, 5ups:B, 5upt:A
79 8biq:A 562 415 0.2550 0.1815 0.2458 2.07e-05 8biq:B, 8biq:C, 8biq:D, 8bit:A, 8bit:B
80 6sq8:B 494 181 0.1125 0.0911 0.2486 2.70e-05 6h1b:A, 6h1b:B, 6h1b:C, 6h1b:D, 6h1b:E, 6sq8:A, 6sq8:C, 6sq8:D, 6sq8:E
81 7kyd:A 534 409 0.2375 0.1779 0.2323 3.16e-05
82 3b7w:A 537 379 0.2025 0.1508 0.2137 4.38e-05 3c5e:A, 3day:A, 3eq6:A, 3eq6:B, 3gpc:A, 3gpc:B, 2vze:A, 2vze:B, 2vze:C, 2wd9:A, 2wd9:B, 2wd9:C
83 8w0b:A 667 99 0.0900 0.0540 0.3636 6.94e-05 7kds:A, 8v4o:A, 8v4o:B, 8v4o:C, 8v4p:A, 8v4p:B, 8v4p:C, 8v4r:A, 8v4r:B, 8v4r:C, 8w0b:B, 8w0b:C, 8w0c:A, 8w0c:B, 8w0c:C, 8w0d:A, 8w0d:B, 8w0d:C, 8w0h:A, 8w0h:B, 8w0h:C, 8w0j:A, 8w0j:B, 8w0j:C, 8w0l:A, 8w0l:B, 8w0l:C, 8w0m:A, 8w0m:B, 8w0m:C
84 4wv3:B 518 366 0.1875 0.1448 0.2049 1.08e-04 4wv3:A
85 6ulw:A 1193 84 0.0600 0.0201 0.2857 1.27e-04 6ulw:D, 6ulx:A, 6uly:A, 6uly:B
86 7wua:A 603 316 0.1825 0.1211 0.2310 1.94e-04 7wua:B, 7wua:C, 7wua:D
87 7mmz:A 559 426 0.2250 0.1610 0.2113 2.18e-04
88 8iqu:A 545 409 0.2400 0.1761 0.2347 5.39e-04 8hd4:A, 8hdf:A
89 4wd1:A 646 190 0.1225 0.0759 0.2579 0.002
90 5hm3:A 625 398 0.2125 0.1360 0.2136 0.002 5ey9:A, 5ey9:B
91 7l4g:B 668 188 0.1325 0.0793 0.2819 0.002 9c8s:A, 9c8s:B, 9c8s:C, 8eps:A, 8eps:B, 8eps:C, 8g0r:A, 8g0r:B, 8g0r:C, 8g0s:A, 8g0s:B, 8g0s:C, 8g0t:A, 8g0t:B, 8g0t:C, 8g0u:A, 8g0u:B, 8g0v:A, 8g0v:B, 8g0v:C, 5ifi:A, 5ifi:B, 5ifi:C, 5k85:A, 5k85:B, 5k85:C, 5k8f:A, 5k8f:B, 5k8f:C, 7kno:A, 7kno:B, 7kno:C, 7knp:A, 7knp:B, 7knp:C, 7l4g:A, 7l4g:C, 5u29:A, 5u29:B, 5u29:C, 8v5g:A, 8v5g:B
92 8g0u:C 455 162 0.1175 0.1033 0.2901 0.003
93 8i22:A 530 419 0.2300 0.1736 0.2196 0.011 8i22:F, 8i22:B, 8i22:C, 8i22:D, 8i22:E, 8i3i:A, 8i3i:D, 8i3i:B, 8i3i:C, 8i49:A, 8i49:D, 8i49:E, 8i49:F, 8i49:C, 8i49:B, 8i51:A, 8i51:B, 8i51:C, 8i51:D, 8i51:E, 8i51:F, 8i6m:A, 8i6m:F, 8i6m:D, 8i6m:C, 8i6m:B, 8i6m:E, 8i8d:A, 8i8d:B, 8i8d:C, 8i8d:D, 8i8d:E, 8i8d:F, 8i8e:F, 8i8e:D, 8i8e:A, 8i8e:B, 8i8e:C, 8i8e:E, 8jyl:A, 8jyl:B, 8jyl:C, 8jyl:D, 8jyl:E, 8jyl:F, 8jyu:A, 8jyu:D, 8jyu:B, 8jyu:C, 8jyu:E, 8jyu:F
94 8rwj:D 676 109 0.0800 0.0473 0.2936 0.031 8rwj:I, 8rwj:A, 8rwj:B, 8rwj:C, 8rwj:E, 8rwj:F, 8rwj:G, 8rwj:H, 1ry2:A
95 6oz1:A 643 136 0.1025 0.0638 0.3015 0.28
96 6wng:A 466 33 0.0350 0.0300 0.4242 0.36 6wng:B, 6wng:D, 6wng:C
97 2qo3:B 873 62 0.0500 0.0229 0.3226 0.78 2qo3:A
98 4ir7:A 508 436 0.2425 0.1909 0.2225 0.92
99 5m1d:A 469 53 0.0400 0.0341 0.3019 1.7 5m1d:B, 5m1d:C, 5m1e:A, 5m1e:B, 5m1e:C
100 8ov8:A 349 67 0.0550 0.0630 0.3284 2.4 8ov8:B
101 5kk5:A 1201 74 0.0450 0.0150 0.2432 6.2
102 5msd:A 636 45 0.0375 0.0236 0.3333 9.5 5msc:A, 5msq:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218