BioLiP

>protein
TGTTYEAETGTTLTDAVVETLYPGYTGSGYVNFNAYTNSAIEWNAINNMTTGTKNVKFRYALESGTRNLDIYVNGTKVLS
NEPFTETGSWSTWGEKTIQVAMNSGVNTLRIVTTGTEGPNMDNITVTAS

The query sequence (length=129) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4qaw:A	537	129	1.0000	0.2402	1.0000	1.46e-84	4qaw:B, 4qaw:C, 4qaw:D, 4qaw:E, 4qaw:F, 4qaw:G, 4qaw:H, 4qb1:A, 4qb2:A, 4qb6:A
2	2vzp:B	127	124	0.3953	0.4016	0.4113	5.40e-21	2vzp:A, 2vzq:A, 2vzq:B, 2vzr:A, 2vzr:B
3	2w47:A	135	126	0.3798	0.3630	0.3889	2.25e-18	2w1w:A, 2w1w:B
4	2w87:A	139	128	0.3488	0.3237	0.3516	1.60e-13	2w46:A, 2w46:B, 2w87:B
5	3wnk:A	712	129	0.3411	0.0618	0.3411	3.11e-09	3wnl:A, 3wnm:A, 3wnn:A, 3wnn:B, 3wno:A, 3wno:B, 3wnp:A, 3wnp:B
6	5hxm:A	1060	127	0.3023	0.0368	0.3071	1.50e-07	5f7u:A, 5hpo:A, 5i0d:A, 5i0d:B, 4kmq:A, 4kwu:A
7	5x7o:A	1247	115	0.2946	0.0305	0.3304	1.71e-07	5x7o:B, 5x7p:B, 5x7p:A, 5x7q:A, 5x7q:B, 5x7r:A, 5x7r:B, 5x7s:A, 5x7s:B
8	5x7o:A	1247	84	0.2248	0.0233	0.3452	0.090	5x7o:B, 5x7p:B, 5x7p:A, 5x7q:A, 5x7q:B, 5x7r:A, 5x7r:B, 5x7s:A, 5x7s:B
9	5x7g:A	700	131	0.3488	0.0643	0.3435	2.37e-07	5x7h:A
10	2w3j:A	137	125	0.2248	0.2117	0.2320	4.29e-06
11	2wz8:A	135	140	0.3101	0.2963	0.2857	4.68e-04
12	3zm8:A	444	110	0.2946	0.0856	0.3455	0.003
13	5ifm:C	256	73	0.1628	0.0820	0.2877	0.15	5ifm:A
14	5awp:A	596	111	0.2171	0.0470	0.2523	2.7	5awq:A
15	5g56:A	707	66	0.1705	0.0311	0.3333	3.4	5la0:A, 5la1:A, 5la2:A, 5la2:B, 2y8k:A
16	4bdt:A	563	107	0.2171	0.0497	0.2617	3.7	8aen:B, 8aen:A, 8aev:A, 8aev:B, 6cqt:A, 6cqt:B, 6cqu:A, 6cqu:B, 6cqv:A, 6cqv:B, 6cqw:A, 6cqw:B, 6cqx:A, 6cqx:B, 6cqy:A, 6cqy:B, 6cqz:A, 6cqz:B, 7d9o:A, 7d9o:B, 7d9p:A, 7d9p:B, 7d9q:A, 7d9q:B, 8dt4:A, 8dt4:B, 8dt5:A, 8dt5:B, 8dt7:A, 8dt7:B, 7e3h:A, 7e3h:B, 4ey5:A, 4ey5:B, 4ey6:A, 4ey6:B, 4ey7:A, 4ey7:B, 6f25:A, 6f25:B, 5hf6:B, 5hf6:A, 5hf8:A, 5hf8:B, 5hf9:A, 5hf9:B, 5hfa:A, 5hfa:B, 5hq3:A, 5hq3:B, 4m0e:A, 4m0e:B, 4m0f:A, 4m0f:B, 6nea:A, 6nea:B, 6ntg:A, 6ntg:B, 6nth:A, 6nth:B, 6ntk:A, 6ntk:B, 6ntl:A, 6ntl:B, 6ntm:A, 6ntm:B, 6ntn:A, 6ntn:B, 6nto:A, 6nto:B, 6o4w:A, 6o4w:B, 6o4x:A, 6o4x:B, 6o50:A, 6o50:B, 6o52:A, 6o52:B, 6o5r:A, 6o5r:B, 6o5s:A, 6o5s:B, 6o5v:A, 6o5v:B, 6o66:A, 6o66:B, 7p1n:aa, 7p1n:A, 7p1n:bb, 7p1p:aa, 7p1p:A, 7p1p:bb, 7rb5:A, 7rb6:A, 7rb6:B, 7rb7:A, 7rb7:B, 6u34:A, 6u34:B, 6u37:A, 6u37:B, 6u3p:A, 6wuv:A, 6wuv:B, 6wuy:A, 6wuy:B, 6wuz:A, 6wuz:B, 6wv1:A, 6wv1:B, 6wvc:A, 6wvc:B, 6wvo:A, 6wvo:B, 6wvp:A, 6wvp:B, 6wvq:A, 6wvq:B, 7xn1:A, 7xn1:B, 6zwe:A
17	6ntw:A	505	47	0.1163	0.0297	0.3191	6.3
18	6g5q:B	381	61	0.1240	0.0420	0.2623	6.7	6g5o:A, 6g5o:B, 6g5q:A

[Back]