Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TENLYFQSMDFYTVELERGAKGFGFSLRGGREYNMDLYVLRLAEDGPAERSGKMRIGDEILEINGETTKNMKHSRAIELI
KNGGRRVRLFLKRGETSV

The query sequence (length=98) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2r4h:C 98 98 1.0000 1.0000 1.0000 1.66e-67
2 8cn1:H 101 89 0.2959 0.2871 0.3258 5.20e-14 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
3 7qqn:C 414 79 0.3163 0.0749 0.3924 3.42e-13 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
4 6xa7:B 96 88 0.2959 0.3021 0.3295 6.16e-13 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
5 2ka9:A 189 90 0.2959 0.1534 0.3222 1.92e-12 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
6 2ka9:A 189 74 0.2551 0.1323 0.3378 4.06e-09 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
7 7p73:A 420 90 0.3469 0.0810 0.3778 2.42e-12 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
8 5wou:A 95 91 0.2653 0.2737 0.2857 7.76e-12
9 1n7f:A 86 83 0.3163 0.3605 0.3735 1.59e-11 1n7f:B
10 5heb:A 119 79 0.2755 0.2269 0.3418 5.46e-11 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
11 8b82:A 108 87 0.2959 0.2685 0.3333 6.95e-11 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
12 2m0z:A 97 91 0.2653 0.2680 0.2857 7.45e-11 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
13 8c1t:A 90 88 0.2347 0.2556 0.2614 8.32e-11 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
14 7d6f:A 87 69 0.2449 0.2759 0.3478 9.86e-11
15 2kpl:A 129 86 0.2959 0.2248 0.3372 1.97e-10
16 8bp4:A 93 76 0.2551 0.2688 0.3289 5.02e-10 8bp4:C, 8bp4:B
17 2pdz:A 86 73 0.2449 0.2791 0.3288 5.56e-10
18 4e34:A 87 67 0.2041 0.2299 0.2985 6.13e-10 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
19 5n7d:A 423 86 0.2959 0.0686 0.3372 3.26e-09 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
20 2kqf:A 96 81 0.2857 0.2917 0.3457 4.15e-09 2kyl:A
21 7pc3:A 405 89 0.2755 0.0667 0.3034 4.30e-09 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
22 4ydp:A 83 82 0.2755 0.3253 0.3293 5.78e-09 4ydp:B
23 3jxt:A 96 66 0.2551 0.2604 0.3788 1.89e-08 3jxt:B
24 7qqm:A 413 90 0.2959 0.0702 0.3222 2.09e-08
25 5zys:A 90 90 0.2551 0.2778 0.2778 2.13e-08
26 7p70:A 407 71 0.2143 0.0516 0.2958 2.69e-08 7pc4:A, 7qql:A
27 2m0u:A 117 82 0.3061 0.2564 0.3659 4.57e-08
28 8bv7:A 95 57 0.1735 0.1789 0.2982 1.03e-07 8buw:A, 8buw:B
29 8bq8:C 93 88 0.2347 0.2473 0.2614 2.26e-07 8bq8:A, 8bq8:B
30 2qt5:A 194 92 0.2755 0.1392 0.2935 3.45e-07 2qt5:B
31 2qt5:A 194 67 0.2347 0.1186 0.3433 4.64e-05 2qt5:B
32 4xhv:A 94 89 0.2245 0.2340 0.2472 4.03e-07
33 6hks:B 94 76 0.2551 0.2660 0.3289 5.44e-07 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
34 6x23:A 89 76 0.2755 0.3034 0.3553 6.50e-07
35 1ihj:B 95 86 0.2347 0.2421 0.2674 7.25e-07 1ihj:A
36 6gbe:A 119 95 0.2959 0.2437 0.3053 1.31e-06
37 2i0i:A 81 76 0.2653 0.3210 0.3421 1.31e-06 2i0i:B, 2i0i:C
38 6ar4:B 87 69 0.2143 0.2414 0.3043 1.67e-06 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
39 2os6:A 89 71 0.2245 0.2472 0.3099 2.20e-06
40 3ch8:A 190 79 0.2449 0.1263 0.3038 3.16e-06 2qbw:A
41 1n7t:A 103 83 0.2551 0.2427 0.3012 3.40e-06 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
42 2l4t:A 124 84 0.2857 0.2258 0.3333 3.47e-06 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
43 3cyy:B 81 80 0.2449 0.2963 0.3000 6.77e-06 3cyy:A
44 1u38:A 89 59 0.2143 0.2360 0.3559 7.44e-06
45 6yx0:B 112 85 0.2653 0.2321 0.3059 1.04e-05 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
46 5ez0:D 95 65 0.2041 0.2105 0.3077 1.72e-05 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
47 2egn:A 83 75 0.2449 0.2892 0.3200 6.16e-05
48 4wyu:A 201 93 0.2551 0.1244 0.2688 6.58e-05 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
49 4wyu:A 201 81 0.1939 0.0945 0.2346 1.72e-04 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
50 6kz1:A 97 68 0.1939 0.1959 0.2794 1.51e-04 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
51 2exg:A 101 74 0.2041 0.1980 0.2703 1.63e-04 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
52 7pcb:A 415 89 0.2755 0.0651 0.3034 2.65e-04 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
53 7weg:B 96 75 0.2041 0.2083 0.2667 3.77e-04 7weg:A
54 3bpu:A 86 91 0.2449 0.2791 0.2637 4.50e-04
55 6q0m:B 94 79 0.2347 0.2447 0.2911 4.64e-04
56 7pc5:A 405 75 0.2143 0.0519 0.2800 4.83e-04
57 7qct:A 90 57 0.1939 0.2111 0.3333 0.001 7qct:B
58 4xh7:A 110 73 0.2041 0.1818 0.2740 0.002
59 7x2e:A 163 65 0.1735 0.1043 0.2615 0.003 2kbs:A
60 6ezi:A 86 76 0.2041 0.2326 0.2632 0.003 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
61 2ejy:A 85 32 0.1531 0.1765 0.4688 0.005
62 4wsi:A 372 54 0.2143 0.0565 0.3889 0.005 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
63 4gvc:A 94 67 0.2347 0.2447 0.3433 0.007 4gvd:A, 4gvd:B, 3kze:A, 3kze:B, 3kze:C, 4nxq:A, 4nxq:B, 4nxq:C, 4nxr:A
64 3vqg:A 85 57 0.1735 0.2000 0.2982 0.010
65 5izu:A 124 83 0.2551 0.2016 0.3012 0.011 6exj:A, 6exj:C, 5izu:C, 5ovc:A, 5ovp:A, 5ovv:A
66 1rzx:A 98 54 0.1735 0.1735 0.3148 0.018 5i7z:A, 1x8s:A
67 7xs0:A 376 64 0.2143 0.0559 0.3281 0.035
68 7w6z:A 414 73 0.2347 0.0556 0.3151 0.040 7w6y:A
69 6nid:B 88 32 0.1429 0.1591 0.4375 0.048 6nid:A, 6nid:C
70 3o5n:E 92 71 0.2347 0.2500 0.3239 0.060
71 8blu:B 195 57 0.1531 0.0769 0.2632 0.066 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
72 1b8q:A 127 65 0.1837 0.1417 0.2769 0.074
73 3gvu:A 271 90 0.2857 0.1033 0.3111 0.11
74 4b9d:B 295 34 0.1735 0.0576 0.5000 0.90 4b9d:A
75 8xud:D 651 85 0.2347 0.0353 0.2706 1.3 6iqq:C, 6iqq:D, 5wql:D, 5wql:C, 8xud:C
76 1zub:A 109 58 0.1735 0.1560 0.2931 1.8
77 4c2c:A 433 98 0.2857 0.0647 0.2857 2.2 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
78 2kaw:A 90 45 0.1020 0.1111 0.2222 2.4 6lcb:A, 2mx6:A
79 1xex:A 166 39 0.1735 0.1024 0.4359 2.7 3kta:A, 3kta:C
80 5gmj:B 224 28 0.1224 0.0536 0.4286 2.9 5gmi:A, 5gmi:B, 5gmj:A, 5h3j:A
81 1l6o:A 95 46 0.1020 0.1053 0.2174 3.3 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
82 6mp4:E 137 11 0.1020 0.0730 0.9091 3.5 6drg:A, 7fy8:A, 7fy8:B, 7fy8:C, 7fy8:D, 7fy8:E, 7fy8:F, 7fy8:G, 7fy8:H, 7g00:A, 7g00:B, 7g00:C, 7g00:D, 7g00:E, 7g00:F, 7g00:G, 7g00:H, 7g00:I, 7g00:J, 7g00:K, 7g00:L, 7g00:M, 7g00:N, 7g00:O, 7g00:P, 2lkk:A, 6mp4:A, 6mp4:H, 3stk:A, 3stm:X
83 8hwj:A 162 37 0.1122 0.0679 0.2973 4.4 8hwj:B, 8hwj:C, 8hwj:D
84 6zbq:A 89 77 0.1939 0.2135 0.2468 4.6 6zc4:A
85 6xig:B 383 10 0.1020 0.0261 1.0000 5.2 6xi9:A, 6xi9:B, 6xig:A
86 4bbm:A 314 12 0.1020 0.0318 0.8333 5.2 4aaa:A, 4bbm:B
87 3dpm:A 522 21 0.0816 0.0153 0.3810 5.3 3dpm:B
88 7pvi:AAA 199 11 0.1020 0.0503 0.9091 5.4 7pvi:BBB, 7pwb:AAA, 7pwb:BBB
89 8s5h:A 507 27 0.1327 0.0256 0.4815 5.7 4coo:A, 4coo:B, 1jbq:A, 1jbq:B, 1jbq:C, 1jbq:D, 1jbq:E, 1jbq:F, 4l0d:A, 4l0d:B, 4l27:B, 4l27:D, 4l27:A, 4l27:C, 4l28:A, 4l28:B, 4l28:C, 4l28:D, 4l3v:B, 4l3v:A, 4l3v:C, 1m54:A, 1m54:B, 1m54:C, 1m54:D, 1m54:E, 1m54:F, 5mms:A, 5mms:F, 5mms:B, 5mms:C, 5mms:D, 5mms:E, 4pcu:A, 4pcu:B, 7qgt:A, 7qgt:B, 8s5h:B, 8s5h:C, 8s5h:D, 8s5h:E, 8s5h:F, 8s5h:G, 8s5h:H, 8s5i:A, 8s5i:B, 8s5i:C, 8s5i:D, 8s5i:E, 8s5i:F, 8s5j:A, 8s5j:B, 8s5j:C, 8s5j:D, 8s5j:E, 8s5j:F, 8s5j:G, 8s5j:H, 8s5j:I, 8s5j:J, 8s5k:A, 8s5k:B, 8s5k:C, 8s5k:D, 8s5k:E, 8s5k:F, 8s5k:G, 8s5k:H, 8s5l:A, 8s5l:B, 8s5l:C, 8s5l:D, 8s5m:A, 8s5m:B, 8s5m:C, 8s5m:D, 8s5m:E, 8s5m:F, 8s5m:G, 8s5m:H, 8s5m:I, 8s5m:J, 8stw:A, 8stw:B, 8stw:C, 8stw:D, 8stw:E, 8stw:F, 4uuu:A, 4uuu:B
90 4asx:A 310 23 0.1327 0.0419 0.5652 6.0 4asx:B, 3q4t:A, 3q4t:B, 3soc:A, 3soc:B
91 5cc2:A 256 46 0.1633 0.0625 0.3478 6.4 2v3t:A, 2v3t:B, 2v3u:A
92 3hqi:A 294 49 0.1531 0.0510 0.3061 6.8 7d3d:A, 7d3d:B, 6f8f:D, 6f8g:A, 6f8g:C, 6f8g:D, 6f8g:B, 3hqh:A, 3hqi:B, 3hql:A, 3hql:B, 3hqm:A, 3hqm:B, 3hsv:A, 3hsv:B, 3hu6:A, 3hu6:B, 6i41:A, 6i5p:A, 6i5p:C, 6i5p:E, 6i5p:G, 6i68:A, 6i68:C, 6i68:E, 6i68:G, 6i7a:A, 6i7a:C, 6i7a:E, 6i7a:G, 3ivb:A, 3ivq:A, 3ivq:B, 3ivv:A, 7klz:A, 7klz:B, 7kpk:A, 7lin:A, 7lio:A, 7lio:B, 4o1v:A
93 6oiu:C 900 56 0.1531 0.0167 0.2679 6.8 6oiu:A, 6oiu:B, 6oiu:D
94 3h3e:A 256 26 0.1224 0.0469 0.4615 7.0
95 4nhw:D 217 27 0.1224 0.0553 0.4444 9.7 4nhw:A, 4nhw:B, 4nhw:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218