BioLiP

>protein
TDLKFRLVRESFADAVSWVAKNLPTRPAVPVLSGVLLTGSDEGLTISGFDYEVSAEVRVPAEIASPGTVLVSGRLLSDIT
RALPNKPVDFYVDGNRVALTCGNARFSLPTMAVEDYPTLPTLPEDTGTLPAELFSEAIGQVAIAAGRDDTLPMLTGIRVE
ISGEKVVLAATDRFRLAVRELTWNALSPDIEAAVLVPAKTLGEAAKDGSEVRLSLGAGMGVGKDGLLGISGDGKRSTTRL
LDAEFPKFRQLLPAEHTAVASADVAELTEAIKLVALVADRGAQVRMEFADGMLRLSAGADDVGRAEEDIAVEFAGQPLTI
AFNPTYLIDGLASLHSERVSFGFTTPGKPALLRPASAEDRIVDQGPFAAVPTDYVYLLMPVRLP

The query sequence (length=384) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6dly:B	384	384	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	6dly:A
2	5agv:B	393	391	0.8672	0.8473	0.8517	0.0	5agu:A, 5agu:B, 5agv:A, 6fvn:A, 6fvn:B, 6fvn:C, 6fvn:D, 6fvo:A, 6fvo:B, 6fvo:C, 6fvo:D
3	8djq:B	390	388	0.7865	0.7744	0.7784	0.0	8dj6:A, 8dj6:B, 8dj6:C, 8dj6:D, 8djq:A, 8djq:C, 8djq:D, 8dk9:A, 8dk9:B, 8dk9:C, 8dk9:D
4	5ah2:C	382	387	0.7812	0.7853	0.7752	0.0	5ah2:A, 5ah2:B, 5ah2:D, 5ah4:A, 5ah4:B
5	6pth:A	369	390	0.2917	0.3035	0.2872	2.29e-36	4tsz:A, 4tsz:B, 4tsz:C, 4tsz:D, 4tsz:E, 4tsz:F, 4tsz:G, 4tsz:H, 4tsz:I, 4tsz:J, 4tsz:K, 4tsz:L, 4tsz:M, 4tsz:N, 4tsz:O, 4tsz:P
6	6p81:A	440	387	0.2708	0.2364	0.2687	2.07e-31	7az5:A, 7az5:B, 7az5:C, 7az5:D, 7az6:A, 7az7:A, 7az8:A, 7az8:B, 7azc:A, 7azc:C, 7azc:B, 7azc:D, 7azd:A, 7azd:B, 7azd:D, 7azd:C, 7aze:A, 7aze:B, 7azf:A, 7azf:D, 7azf:B, 7azf:C, 7azg:A, 7azg:C, 7azg:B, 7azg:D, 7azg:E, 7azg:G, 7azg:F, 7azg:H, 7azk:A, 7azk:B, 7azk:C, 7azk:D, 7azl:A, 7azl:B, 7azl:C, 7azl:D, 3bep:B, 3bep:A, 8cix:A, 8ciy:A, 8ciz:A, 8ciz:B, 3d1e:A, 3d1f:A, 3d1f:B, 3d1g:A, 3d1g:B, 3f1v:A, 3f1v:B, 6fvl:A, 6fvl:B, 6fvl:C, 6fvl:D, 6fvm:A, 6fvm:B, 5jne:C, 5jne:G, 4k3k:A, 4k3k:B, 4k3l:A, 4k3l:B, 4k3m:A, 4k3m:B, 4k3o:A, 4k3o:B, 4k3p:A, 4k3q:A, 4k3q:B, 4k3r:A, 4k3s:A, 4k74:A, 4k74:B, 5m1s:C, 4mjp:B, 4mjq:A, 4mjq:B, 4mjr:A, 4mjr:B, 4n94:A, 4n94:B, 4n95:A, 4n96:A, 4n96:B, 4n97:A, 4n97:B, 4n98:A, 4n98:B, 4n99:A, 4n99:B, 4n9a:A, 4n9a:B, 1ok7:B, 4ovf:A, 4ovf:B, 4ovg:A, 4ovg:B, 4ovh:A, 8pat:A, 8pay:A, 4pnu:A, 4pnu:B, 4pnv:A, 4pnv:B, 4pnw:A, 4pnw:B, 3q4j:B, 3q4j:C, 3q4j:D, 3q4j:E, 3q4j:F, 3q4k:A, 3q4k:B, 3q4l:A, 3q4l:B, 3qsb:A, 3qsb:B, 3v62:A, 3v62:D, 8var:G
7	6ptr:B	372	405	0.2682	0.2769	0.2543	1.70e-28	6ptr:A
8	6djk:A	376	374	0.2188	0.2234	0.2246	1.82e-23
9	6dm6:A	378	370	0.2161	0.2196	0.2243	1.49e-22	6dm6:B, 6ptv:B, 6ptv:C
10	8dt6:C	381	367	0.2005	0.2021	0.2098	2.08e-20	8dt6:A, 8dt6:B, 8dt6:D
11	5fxt:A	374	391	0.1953	0.2005	0.1918	1.38e-10	5frq:A, 5frq:D, 5fve:A, 5g48:A, 5g48:B, 5g4q:B
12	3o47:A	289	54	0.0495	0.0657	0.3519	0.45	4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
13	1g4u:S	360	32	0.0260	0.0278	0.3125	0.51
14	2jg7:A	509	106	0.0729	0.0550	0.2642	0.60	2jg7:B, 2jg7:C, 2jg7:D, 2jg7:E, 2jg7:F, 2jg7:G, 2jg7:H
15	3af5:A	638	107	0.0807	0.0486	0.2897	6.0	3af6:A
16	7y9y:A	1482	51	0.0495	0.0128	0.3725	8.0	8wml:A
17	8eey:A	1544	51	0.0495	0.0123	0.3725	8.0	7yna:A, 7ynb:A, 7ync:A
18	7wah:A	1473	53	0.0573	0.0149	0.4151	9.3

[Back]