Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SVLQFLGLYKKSGKLVFLGLDNAGKTTLLHMLKVPTLHPTSEELTIAGMTFTTFDLRVWKNYLPAINGIVFLVDCADHSR
LVESKVELNALMTDETISNVPILILGNKIDRTDAISEEKLREIFGLYGQTTGKGNVTLKELNARPMEVFMCSVLKRQGYG
EGFRWLSQYID

The query sequence (length=171) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8e0h:A 179 178 0.9883 0.9441 0.9494 4.65e-120 8dzm:A, 8dzm:B, 8dzn:A, 8dzn:B, 8dzo:A, 8dzo:B, 8dzt:A, 8dzt:B, 8e0h:B, 2gao:A, 2gao:B
2 8e0c:A 185 185 0.9006 0.8324 0.8324 3.10e-111 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
3 8e0a:A 168 172 0.8655 0.8810 0.8605 5.11e-107 8e0b:A
4 6zga:C 168 172 0.5673 0.5774 0.5640 1.83e-59 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
5 5de3:A 166 173 0.2807 0.2892 0.2775 5.15e-22 5di3:A
6 3aq4:A 170 168 0.2749 0.2765 0.2798 6.06e-21 3aq4:B
7 2h57:B 167 178 0.2924 0.2994 0.2809 4.67e-20 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
8 4bas:A 172 175 0.3333 0.3314 0.3257 6.83e-20
9 5uf8:D 160 167 0.2690 0.2875 0.2754 3.04e-19
10 6pta:A 165 166 0.2690 0.2788 0.2771 3.96e-19 6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
11 6bbp:A 520 130 0.2573 0.0846 0.3385 9.92e-19 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
12 3lvq:E 420 130 0.2573 0.1048 0.3385 1.28e-18 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
13 4v0l:A 168 176 0.2807 0.2857 0.2727 3.66e-18 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
14 2k5u:A 181 172 0.2690 0.2541 0.2674 3.74e-18 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
15 3lrp:A 181 178 0.2924 0.2762 0.2809 5.09e-18
16 2b6h:A 171 168 0.2749 0.2749 0.2798 1.74e-17
17 1moz:A 178 170 0.2690 0.2584 0.2706 1.93e-17 8ezj:C, 8ezj:D, 1moz:B
18 8oun:A 181 185 0.3099 0.2928 0.2865 2.12e-17 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
19 7rll:B 177 127 0.2573 0.2486 0.3465 2.62e-17 7rll:A
20 8d4c:C 180 181 0.2807 0.2667 0.2652 7.05e-17 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
21 3doe:A 189 140 0.2456 0.2222 0.3000 2.26e-16 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
22 4y0v:A 165 127 0.2339 0.2424 0.3150 3.15e-16 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
23 1upt:G 170 167 0.2690 0.2706 0.2754 3.21e-16 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
24 3o47:A 289 170 0.2632 0.1557 0.2647 4.81e-16 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
25 1z6x:A 175 172 0.2749 0.2686 0.2733 5.63e-15 1z6x:B
26 6vs4:A 223 118 0.2339 0.1794 0.3390 1.01e-14 6vs4:B
27 6a8d:A 181 168 0.2690 0.2541 0.2738 1.05e-14
28 1yzg:A 168 171 0.2456 0.2500 0.2456 1.28e-14
29 4ile:A 176 134 0.2222 0.2159 0.2836 1.95e-14 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
30 5di3:B 204 110 0.2339 0.1961 0.3636 2.91e-14 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
31 2x77:A 181 142 0.2632 0.2486 0.3169 2.61e-13 2x77:B
32 1zj6:A 173 166 0.2222 0.2197 0.2289 2.32e-12 2h16:A, 2h16:B, 2h16:C, 2h16:D, 2h17:A, 1z6y:A, 1z6y:B
33 4zi2:A 185 173 0.2865 0.2649 0.2832 4.56e-12 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
34 8oul:A 185 135 0.2164 0.2000 0.2741 4.36e-10 8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
35 4q66:C 134 127 0.2398 0.3060 0.3228 1.44e-09
36 8xql:A 240 116 0.1637 0.1167 0.2414 2.61e-08
37 8fn0:B 212 106 0.1696 0.1368 0.2736 1.64e-07
38 8hf4:A 563 57 0.1170 0.0355 0.3509 0.002 8hf4:B, 8hf5:A, 8hf5:B, 8hf6:A, 8hf6:B, 8hf7:B, 8k4b:A, 8k4b:B, 8k7a:A, 8k7a:B
39 3t1t:A 193 94 0.1871 0.1658 0.3404 0.066 3t12:A, 3t1o:A, 3t1o:B, 3t1q:A, 3t1t:B, 3t1t:C, 3t1t:D, 3t1v:A, 3t1v:B, 3t1v:C, 3t1v:D
40 3clv:A 175 167 0.2339 0.2286 0.2395 0.070
41 1xzq:A 449 132 0.2047 0.0780 0.2652 0.090 1xzq:B
42 4yer:A 285 39 0.1111 0.0667 0.4872 0.13 4yer:B
43 8ij9:A 168 156 0.2047 0.2083 0.2244 0.15 3bbp:A, 3bbp:B, 3bbp:C, 3cwz:A, 4dkx:A, 4dkx:B, 2e9s:A, 2e9s:B, 2e9s:C, 2fe4:A, 2ffq:A, 2gil:A, 2gil:B, 2gil:C, 2gil:D, 8ij9:B, 5lef:A, 5lef:B, 2y8e:A, 2y8e:B, 1yzq:A
44 3c5c:B 167 42 0.0994 0.1018 0.4048 0.22 3c5c:A, 3c5c:C, 3c5c:D
45 1wf3:A 296 126 0.2047 0.1182 0.2778 0.43
46 8fkp:SO 307 35 0.0702 0.0391 0.3429 0.51 8fkq:SO, 8fkr:SO, 8fks:SO, 8fkt:SO, 8fku:SO, 8fkv:SO, 8fkw:SO, 8fkx:SO, 8fky:SO
47 6k8h:B 441 41 0.1053 0.0408 0.4390 0.64 6k8h:A
48 1mv5:A 242 49 0.0819 0.0579 0.2857 1.0 1mv5:B, 1mv5:C, 1mv5:D
49 2wkp:A 320 61 0.1287 0.0688 0.3607 1.1 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
50 2p5s:B 161 72 0.1053 0.1118 0.2500 1.1 2p5s:A
51 8pjk:A 222 127 0.1579 0.1216 0.2126 1.1 7e2x:A, 7e2z:A
52 4fid:A 318 92 0.1345 0.0723 0.2500 1.2 4fid:B
53 5hzh:A 320 61 0.1287 0.0688 0.3607 1.3
54 2lkd:A 178 75 0.1170 0.1124 0.2667 1.7
55 7de4:A 550 94 0.1520 0.0473 0.2766 2.3
56 3eph:A 402 93 0.1404 0.0597 0.2581 2.5 3eph:B, 3epj:A, 3epj:B, 3epk:A, 3epk:B, 3epl:A, 3epl:B
57 2hup:A 162 122 0.1696 0.1790 0.2377 2.9 2hup:B
58 7vua:A 785 73 0.1287 0.0280 0.3014 3.3 7vua:B
59 2nzj:B 160 124 0.1988 0.2125 0.2742 3.6 2nzj:A, 2nzj:C, 2nzj:D
60 2cjw:A 178 115 0.1520 0.1461 0.2261 4.0 2cjw:B, 2g3y:A, 2ht6:A, 2ht6:B
61 7obq:v 201 117 0.1637 0.1393 0.2393 4.2 2fh5:B, 6frk:v, 7nfx:v
62 2gf0:B 174 53 0.0877 0.0862 0.2830 4.3 2gf0:A, 2gf0:C, 2gf0:D
63 7e7o:A 2003 63 0.1345 0.0115 0.3651 4.3 7lkp:A
64 7ye1:G 103 39 0.0936 0.1553 0.4103 4.4 7ye2:G, 5yiv:A, 5yiv:B, 5yiv:C, 5yiv:D, 5yiw:A, 5yiw:C, 5yix:B, 5z7i:A, 5z7i:C
65 7vvc:B 263 46 0.0760 0.0494 0.2826 4.6 8jmo:A, 8jmo:B, 8jmp:A, 8qrj:A, 7vvc:A, 7vve:A, 7vve:B, 7w45:A, 7w45:B
66 7e7q:A 1958 63 0.1345 0.0117 0.3651 4.7
67 2bov:A 173 63 0.1345 0.1329 0.3651 4.9 2a78:A, 2a9k:A, 8fjh:B, 8fji:B, 6p0i:B, 6p0j:B, 6p0k:B, 6p0l:B, 6p0m:B, 6p0n:B, 6p0o:B, 1u8y:A, 1u8y:B, 1u8z:A, 1u8z:B, 1u90:A, 1u90:B, 1uad:A, 1uad:B, 1zc3:A, 1zc3:C, 1zc4:A, 1zc4:C
68 1x3s:A 177 119 0.1579 0.1525 0.2269 5.0
69 8f5b:A 1924 63 0.1345 0.0120 0.3651 5.3 7lkz:A
70 7m1q:A 1911 63 0.1345 0.0120 0.3651 5.3
71 1byu:B 215 117 0.1813 0.1442 0.2650 5.3 6a38:A, 6a3a:A, 6a3b:A, 6a3c:A, 6a3e:A, 3a6p:C, 3a6p:H, 7b51:B, 2bku:A, 2bku:C, 5bxq:C, 5bxq:D, 5bxq:E, 1byu:A, 4c0q:C, 4c0q:D, 3ch5:A, 5ciq:A, 5ciq:B, 5cit:A, 5cit:B, 5ciw:A, 5ciw:B, 6cit:A, 5cj2:A, 5cj2:B, 5cj2:C, 5cj2:D, 5cj2:E, 5cj2:F, 5cj2:G, 5cj2:H, 5cll:A, 5cll:C, 5clq:A, 5clq:C, 7cnd:A, 7dbg:A, 5dh9:A, 5dha:A, 5dhf:A, 5di9:A, 5dif:A, 5dis:B, 5dlq:C, 5dlq:D, 3ea5:A, 3ea5:C, 3gj0:A, 3gj0:B, 3gj3:A, 3gj4:A, 3gj4:C, 3gj5:A, 3gj5:C, 3gj6:A, 3gj7:A, 3gj7:C, 3gj8:A, 3gj8:C, 3gjx:C, 3gjx:F, 4gmx:A, 4gpt:A, 4hat:A, 4hau:A, 4hav:A, 4haw:A, 4hax:A, 4hay:A, 4haz:A, 4hb0:A, 4hb2:A, 4hb3:A, 4hb4:A, 8hq3:A, 8hq4:A, 8hq5:A, 8hq6:A, 8huf:A, 8hug:A, 1ibr:A, 1ibr:C, 8itv:A, 5jlj:A, 1k5d:A, 1k5d:D, 1k5d:G, 1k5d:J, 1k5g:A, 1k5g:D, 1k5g:G, 1k5g:J, 6kft:A, 7l5e:A, 6lq9:A, 6m60:A, 6m6x:A, 7mnp:A, 7mnp:C, 7mnq:A, 7mnr:A, 7mns:A, 7mnt:A, 7mnt:C, 7mnu:A, 7mnv:A, 7mnw:A, 7mnw:C, 7mnw:E, 7mnw:G, 7mnx:A, 7mnx:C, 7mnx:E, 7mnx:G, 7mnx:I, 7mnx:K, 7mny:A, 7mny:C, 7mny:E, 7mny:G, 7mny:I, 7mny:K, 7mnz:A, 7mnz:C, 7mnz:E, 7mnz:G, 7mnz:I, 7mnz:K, 7mo0:A, 7mo0:C, 7mo1:A, 7mo2:A, 7mo2:C, 7mo3:A, 7mo3:C, 7mo4:A, 7mo4:C, 7mo5:A, 3nby:C, 3nby:F, 3nbz:C, 3nbz:F, 3nc0:C, 3nc0:F, 3nc1:C, 4ol0:A, 6q82:B, 6q84:B, 6q84:E, 1qbk:C, 1qg2:A, 1qg4:A, 1qg4:B, 3ran:A, 3ran:B, 3ran:C, 3ran:D, 1rrp:A, 1rrp:C, 6tvo:B, 5uwh:A, 5uwi:A, 5uwj:A, 5uwo:A, 5uwp:A, 5uwq:A, 5uwr:A, 5uws:A, 5uwt:A, 5uwu:A, 5uww:A, 3w3z:B, 1wa5:A, 4wvf:A, 6x2m:A, 6x2o:A, 6x2p:A, 6x2r:A, 6x2s:A, 6x2u:A, 6x2v:A, 6x2w:A, 6x2x:A, 6x2y:A, 6xjp:A, 6xjr:A, 6xjs:A, 6xjt:A, 6xju:A, 7ypz:A, 5yro:A, 5yst:A, 5ysu:A, 5ytb:A, 5yu6:B, 5yu6:D, 3zjy:A, 3zjy:D, 3zjy:F, 5zpu:A
72 5ja2:A 1238 46 0.0819 0.0113 0.3043 5.9 5ja1:A, 5t3d:A
73 4blt:A 305 31 0.0760 0.0426 0.4194 6.4 4blr:A, 4blr:B, 4blr:C, 4bls:A, 4bls:B, 4bls:C, 4blt:B, 4blt:C, 2vhc:A, 2vhc:C, 2vhc:B, 2vhj:A, 2vhj:B, 2vhj:C, 2vhq:A, 2vhq:B, 2vhq:C, 2vht:A, 2vht:B, 2vht:C, 2vhu:A, 2vhu:B, 2vhu:C, 1w44:A, 1w44:B, 1w44:C, 1w46:A, 1w46:B, 1w46:C, 1w47:A, 1w47:B, 1w47:C, 1w48:A, 1w48:B, 1w48:C, 1w49:A, 1w49:B, 1w49:C, 1w4a:A, 1w4a:B, 1w4a:C, 1w4b:A, 1w4b:B, 1w4b:C
74 2rfq:A 388 50 0.0819 0.0361 0.2800 6.4 2rfq:B, 2rfq:C, 2rfq:D
75 3h2y:A 309 66 0.0994 0.0550 0.2576 6.5
76 6d3r:A 1127 73 0.1287 0.0195 0.3014 7.0 6d3s:A
77 8fl2:NC 511 77 0.1520 0.0509 0.3377 7.9 8fkz:NC, 8fl0:NC, 8fl3:NC, 8fl4:NC, 8idt:A, 8idy:A, 8ie3:A, 8ine:A, 8inf:A, 8ink:w, 8ipd:w, 8ipx:w, 8ipy:w, 8ir1:w, 8ir3:w
78 5lr8:A 844 62 0.0994 0.0201 0.2742 8.3 5lr8:B, 5lra:A, 5lra:B, 5lrb:B, 5lrb:A
79 1zca:A 318 62 0.0936 0.0503 0.2581 9.0 1zca:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218