Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SVAILQKRDHEGFGFVLRGAKAEPTPAFPALQYLESVDVEGVAWKAGLRTGDFLIEVNGVNVVKVGHKQVVGLIRQGGNR
LVMKVVSVT

The query sequence (length=89) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5izu:A 124 95 0.9775 0.7016 0.9158 1.62e-56 6exj:A, 6exj:C, 5izu:C, 5ovc:A, 5ovp:A, 5ovv:A
2 3o5n:E 92 88 0.9101 0.8804 0.9205 3.86e-52
3 6yx0:B 112 93 0.7865 0.6250 0.7527 7.03e-44 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
4 7pcb:A 415 88 0.3933 0.0843 0.3977 6.45e-12 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
5 6x23:A 89 79 0.3258 0.3258 0.3671 7.77e-10
6 2m0v:A 128 81 0.3371 0.2344 0.3704 2.45e-09
7 2m0u:A 117 76 0.3708 0.2821 0.4342 9.03e-09
8 2os6:A 89 75 0.3034 0.3034 0.3600 1.97e-08
9 2r4h:C 98 78 0.2697 0.2449 0.3077 3.60e-06
10 4e34:A 87 86 0.3146 0.3218 0.3256 5.86e-06 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
11 2egn:A 83 85 0.2809 0.3012 0.2941 6.93e-06
12 7d6f:A 87 86 0.2360 0.2414 0.2442 7.50e-06
13 8b82:A 108 79 0.3034 0.2500 0.3418 9.13e-06 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
14 2kqf:A 96 87 0.2921 0.2708 0.2989 2.47e-05 2kyl:A
15 6ezi:A 86 75 0.2809 0.2907 0.3333 6.67e-05 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
16 7qqn:C 414 75 0.2472 0.0531 0.2933 1.57e-04 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
17 5wou:A 95 80 0.3034 0.2842 0.3375 1.63e-04
18 6xa7:B 96 69 0.2584 0.2396 0.3333 2.21e-04 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
19 2qt5:A 194 46 0.1798 0.0825 0.3478 6.52e-04 2qt5:B
20 2qt5:A 194 85 0.2360 0.1082 0.2471 0.036 2qt5:B
21 4xh7:A 110 46 0.1910 0.1545 0.3696 0.007
22 5zys:A 90 70 0.2697 0.2667 0.3429 0.008
23 4ynn:A 400 83 0.2697 0.0600 0.2892 0.017 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
24 4ynn:A 400 45 0.1348 0.0300 0.2667 2.8 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
25 4wyu:A 201 39 0.1573 0.0697 0.3590 0.020 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
26 4wyu:A 201 89 0.3034 0.1343 0.3034 0.21 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
27 7x2e:A 163 35 0.1348 0.0736 0.3429 0.033 2kbs:A
28 3bpu:A 86 33 0.1573 0.1628 0.4242 0.049
29 7p73:A 420 79 0.2360 0.0500 0.2658 0.061 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
30 1n7t:A 103 54 0.1910 0.1650 0.3148 0.096 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
31 3ch8:A 190 54 0.1910 0.0895 0.3148 0.10 2qbw:A
32 2m0z:A 97 47 0.1910 0.1753 0.3617 0.17 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
33 7p70:A 407 81 0.2247 0.0491 0.2469 0.19 7pc4:A, 7qql:A
34 2l4t:A 124 37 0.1685 0.1210 0.4054 0.23 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
35 4gvc:A 94 26 0.1348 0.1277 0.4615 0.24 4gvd:A, 4gvd:B, 3kze:A, 3kze:B, 3kze:C, 4nxq:A, 4nxq:B, 4nxq:C, 4nxr:A
36 7xft:A 86 54 0.2247 0.2326 0.3704 0.27
37 7pc3:A 405 80 0.2472 0.0543 0.2750 0.30 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
38 3jxt:A 96 29 0.1236 0.1146 0.3793 0.34 3jxt:B
39 2pdz:A 86 83 0.2135 0.2209 0.2289 0.35
40 5n7d:A 423 70 0.2360 0.0496 0.3000 0.36 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
41 2kpl:A 129 71 0.2360 0.1628 0.2958 0.44
42 3pv3:A 392 69 0.2135 0.0485 0.2754 0.71 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
43 3cs0:A 392 47 0.1798 0.0408 0.3404 0.91 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
44 5heb:A 119 36 0.1236 0.0924 0.3056 1.3 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
45 7w6x:A 447 47 0.1910 0.0380 0.3617 1.5
46 8bq8:C 93 84 0.2247 0.2151 0.2381 2.1 8bq8:A, 8bq8:B
47 6hks:B 94 68 0.2247 0.2128 0.2941 2.4 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
48 7msm:x 553 69 0.2360 0.0380 0.3043 3.1 7msc:x, 7msh:x, 7msz:x, 7mu0:A, 7mu0:B
49 8tua:A 1329 57 0.2247 0.0150 0.3509 3.2 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
50 5xxb:p 122 60 0.1910 0.1393 0.2833 3.7
51 8blu:B 195 85 0.2022 0.0923 0.2118 4.1 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
52 6q0m:B 94 54 0.1685 0.1596 0.2778 4.8
53 1jwh:D 204 23 0.1011 0.0441 0.3913 6.1 4dgl:A, 4dgl:B, 3eed:A, 3eed:B, 1jwh:C, 4md7:A, 4md7:B, 4md7:C, 4md7:D, 4md8:A, 4md8:B, 4md8:C, 4md8:D, 4md9:A, 4md9:B, 4md9:C, 4md9:D, 4md9:I, 4md9:J, 4md9:N, 4md9:O, 4nh1:C, 4nh1:D, 1qf8:A, 1qf8:B, 2r6m:A, 2r6m:B, 1rqf:B, 1rqf:E, 1rqf:D, 1rqf:J, 1rqf:A, 1rqf:G, 1rqf:H, 1rqf:K
54 2ejy:A 85 45 0.1236 0.1294 0.2444 9.3
55 5ez0:D 95 80 0.2360 0.2211 0.2625 9.7 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
56 3fed:A 690 24 0.1236 0.0159 0.4583 10.0 3fec:A, 3fee:A, 3ff3:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417