Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SSVLQFLGLYKKTGKLVFLGLDNAGKTTLLHMLKPTSEELTIAGMTFTTFDLGRRVWKNYLPAINGIVFLVDCADHERLL
ESKEELDSLMTDETIANVPILILGNKIDRPEAISEERLREMFGLYGQTTGKGSVSLKELNARPLEVFMCSVLKRQGYGEG
FRWMAQYID

The query sequence (length=169) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8e0a:A 168 169 0.9822 0.9881 0.9822 6.51e-119 8e0b:A
2 8e0c:A 185 185 0.9882 0.9027 0.9027 1.47e-117 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
3 8e0h:A 179 179 0.8994 0.8492 0.8492 3.90e-109 8dzm:A, 8dzm:B, 8dzn:A, 8dzn:B, 8dzo:A, 8dzo:B, 8dzt:A, 8dzt:B, 8e0h:B, 2gao:A, 2gao:B
4 6zga:C 168 172 0.5621 0.5655 0.5523 4.82e-58 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
5 6pta:A 165 166 0.2840 0.2909 0.2892 2.07e-21 6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
6 5de3:A 166 172 0.2959 0.3012 0.2907 2.80e-21 5di3:A
7 2h57:B 167 178 0.2840 0.2874 0.2697 4.54e-21 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
8 2b6h:A 171 168 0.2899 0.2865 0.2917 9.17e-21
9 4bas:A 172 174 0.3195 0.3140 0.3103 1.36e-20
10 4v0l:A 168 175 0.3018 0.3036 0.2914 1.37e-20 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
11 5uf8:D 160 168 0.2840 0.3000 0.2857 4.22e-20
12 3lvq:E 420 131 0.2722 0.1095 0.3511 1.09e-19 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
13 3o47:A 289 128 0.2485 0.1453 0.3281 1.17e-19 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
14 3lrp:A 181 178 0.3136 0.2928 0.2978 1.27e-19
15 6bbp:A 520 130 0.2722 0.0885 0.3538 1.43e-19 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
16 2k5u:A 181 173 0.2840 0.2652 0.2775 2.64e-19 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
17 3aq4:A 170 170 0.2722 0.2706 0.2706 9.00e-19 3aq4:B
18 8d4c:C 180 138 0.2663 0.2500 0.3261 1.01e-18 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
19 3doe:A 189 140 0.2722 0.2434 0.3286 1.03e-18 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
20 1moz:A 178 181 0.3077 0.2921 0.2873 1.73e-18 8ezj:C, 8ezj:D, 1moz:B
21 7rll:B 177 139 0.2840 0.2712 0.3453 3.55e-18 7rll:A
22 4y0v:A 165 128 0.2544 0.2606 0.3359 1.33e-17 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
23 8oun:A 181 185 0.3254 0.3039 0.2973 3.98e-17 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
24 1z6x:A 175 172 0.2899 0.2800 0.2849 1.25e-16 1z6x:B
25 4ile:A 176 134 0.2485 0.2386 0.3134 1.66e-16 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
26 1yzg:A 168 167 0.2722 0.2738 0.2754 2.24e-16
27 1upt:G 170 169 0.2663 0.2647 0.2663 7.15e-16 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
28 6vs4:A 223 118 0.2485 0.1883 0.3559 8.47e-16 6vs4:B
29 2x77:A 181 143 0.2663 0.2486 0.3147 1.34e-15 2x77:B
30 5di3:B 204 177 0.3136 0.2598 0.2994 2.36e-15 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
31 1zj6:A 173 163 0.2722 0.2659 0.2822 3.24e-15 2h16:A, 2h16:B, 2h16:C, 2h16:D, 2h17:A, 1z6y:A, 1z6y:B
32 6a8d:A 181 168 0.2604 0.2431 0.2619 7.70e-15
33 8oul:A 185 135 0.2367 0.2162 0.2963 2.60e-13 8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
34 4zi2:A 185 172 0.2781 0.2541 0.2733 2.69e-13 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
35 4q66:C 134 127 0.2485 0.3134 0.3307 4.65e-12
36 8xql:A 240 114 0.1716 0.1208 0.2544 8.43e-10
37 8fn0:B 212 105 0.1893 0.1509 0.3048 8.83e-10
38 8pjk:A 222 122 0.1775 0.1351 0.2459 6.70e-05 7e2x:A, 7e2z:A
39 3t1t:A 193 114 0.2012 0.1762 0.2982 0.004 3t12:A, 3t1o:A, 3t1o:B, 3t1q:A, 3t1t:B, 3t1t:C, 3t1t:D, 3t1v:A, 3t1v:B, 3t1v:C, 3t1v:D
40 2lkd:A 178 59 0.1124 0.1067 0.3220 0.011
41 2p5s:B 161 74 0.1243 0.1304 0.2838 0.012 2p5s:A
42 2zet:A 181 91 0.1183 0.1105 0.2198 0.012 2f7s:A, 2f7s:B, 2iey:A, 2iey:B, 2iez:A, 2iez:B, 2iez:H, 2iez:I, 2if0:A, 2if0:B, 2zet:B
43 8hf4:A 563 54 0.1065 0.0320 0.3333 0.031 8hf4:B, 8hf5:A, 8hf5:B, 8hf6:A, 8hf6:B, 8hf7:B, 8k4b:A, 8k4b:B, 8k7a:A, 8k7a:B
44 1agr:A 350 84 0.1183 0.0571 0.2381 0.056 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
45 5ck5:A 221 140 0.2189 0.1674 0.2643 0.059 5ck4:A, 5ck4:B, 5ck5:B, 5ck5:C, 5ck5:D
46 4yer:A 285 38 0.1124 0.0667 0.5000 0.091 4yer:B
47 1shz:D 327 85 0.1183 0.0612 0.2353 0.12 1shz:A
48 6k8h:B 441 41 0.1183 0.0454 0.4878 0.13 6k8h:A
49 4fid:A 318 101 0.1420 0.0755 0.2376 0.20 4fid:B
50 7odt:t 316 115 0.1953 0.1044 0.2870 0.20
51 3h2y:A 309 66 0.1065 0.0583 0.2727 0.23
52 1xzq:A 449 171 0.2663 0.1002 0.2632 0.26 1xzq:B
53 3v00:C 353 85 0.1065 0.0510 0.2118 0.33 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
54 6hh2:A 174 57 0.1243 0.1207 0.3684 0.55 8fo2:B
55 8ij9:A 168 156 0.2130 0.2143 0.2308 0.57 3bbp:A, 3bbp:B, 3bbp:C, 3cwz:A, 4dkx:A, 4dkx:B, 2e9s:A, 2e9s:B, 2e9s:C, 2fe4:A, 2ffq:A, 2gil:A, 2gil:B, 2gil:C, 2gil:D, 8ij9:B, 5lef:A, 5lef:B, 2y8e:A, 2y8e:B, 1yzq:A
56 7unv:x 593 46 0.1065 0.0304 0.3913 0.73 7unq:x, 7unr:x, 7unt:x, 7unu:x, 7unw:x
57 2xtz:A 343 85 0.0947 0.0466 0.1882 0.95
58 1ky2:A 180 157 0.2071 0.1944 0.2229 1.2 1ky3:A, 4phf:A, 4phg:A, 4phh:A, 4phh:B, 4phh:C, 4phh:D
59 2xtz:B 291 85 0.0947 0.0550 0.1882 1.3
60 8bmp:B 281 40 0.1065 0.0641 0.4500 1.4 8bmq:B, 8bms:B, 5d3m:B, 5d3m:F
61 4tmk:A 210 33 0.0888 0.0714 0.4545 1.5 5tmp:A
62 7o9k:G 337 139 0.2130 0.1068 0.2590 1.6 7of5:x, 7of7:x
63 1wf3:A 296 45 0.0947 0.0541 0.3556 1.9
64 3sfv:A 179 58 0.1006 0.0950 0.2931 2.6 8alk:B, 7eq2:A, 7eq2:B, 4fmb:B, 4fmb:D, 4fmb:F, 4fmc:B, 4fmc:D, 4fmd:B, 4fmd:D, 4fmd:F, 4fme:B, 4fme:E, 2fol:A, 4hlq:B, 4hlq:D, 4hlq:F, 4hlq:H, 4hlq:J, 4i1o:A, 4i1o:C, 4i1o:E, 4i1o:G, 4iru:B, 4iru:D, 4iru:F, 4jvs:B, 3nkv:A, 3nkv:B, 5o74:B, 5o74:D, 5o74:F, 5o74:H, 5o74:J, 5o74:L, 6sku:B, 5szh:B, 5szk:B, 3tkl:A
65 2qu8:A 194 129 0.1716 0.1495 0.2248 3.7
66 3cdz:A 630 53 0.0828 0.0222 0.2642 3.8 3j2q:A
67 6mf2:A 1222 53 0.0828 0.0115 0.2642 3.8 4bdv:A, 4bdv:B, 3cdz:B, 3j2q:B, 5k8d:A, 5k8d:B, 2r7e:B
68 3c5c:B 167 24 0.0710 0.0719 0.5000 3.8 3c5c:A, 3c5c:C, 3c5c:D
69 2r7e:A 693 53 0.0828 0.0202 0.2642 4.1
70 2xtz:C 270 78 0.0888 0.0556 0.1923 4.3
71 3ou7:A 214 31 0.0710 0.0561 0.3871 4.5 3ou2:A, 3ou6:A, 3ou6:B, 3ou6:C, 3ou6:D, 3ou7:B, 3ou7:C, 3ou7:D
72 2hup:A 162 109 0.1302 0.1358 0.2018 4.6 2hup:B
73 5erg:B 324 55 0.0888 0.0463 0.2727 4.6
74 3fvq:B 350 52 0.1065 0.0514 0.3462 4.7 3fvq:A
75 7k66:A 1265 53 0.0828 0.0111 0.2642 4.8 1d7p:M, 3hnb:M, 7kbt:A, 6mf0:A, 6mf0:B, 4xzu:M
76 2awn:D 301 66 0.1420 0.0797 0.3636 5.3 2awo:D
77 7xf0:C 598 47 0.1006 0.0284 0.3617 6.0 7xf0:A, 7xf0:B, 7xf1:A, 7xg3:L, 7xg4:L
78 4zo6:B 724 27 0.0592 0.0138 0.3704 6.7 4zo6:A, 4zo7:B, 4zo7:A, 4zo8:A, 4zo8:B, 4zo9:A, 4zo9:B, 4zoa:A, 4zoa:B, 4zob:A, 4zob:B, 4zoc:A, 4zoc:B, 4zod:A, 4zod:B, 4zoe:A, 4zoe:B
79 2wkp:A 320 61 0.1183 0.0625 0.3279 6.7 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
80 8fl2:NC 511 73 0.1420 0.0470 0.3288 6.9 8fkz:NC, 8fl0:NC, 8fl3:NC, 8fl4:NC, 8idt:A, 8idy:A, 8ie3:A, 8ine:A, 8inf:A, 8ink:w, 8ipd:w, 8ipx:w, 8ipy:w, 8ir1:w, 8ir3:w
81 5hzh:A 320 61 0.1183 0.0625 0.3279 7.2
82 4cz2:B 179 69 0.0947 0.0894 0.2319 9.2 4cym:A, 4cym:B, 4cym:C, 4cz2:A, 4cz2:C, 6ff8:A, 6ff8:B, 5oec:B, 5oed:B
83 1kao:A 167 49 0.0592 0.0599 0.2041 9.5 2rap:A, 3rap:R, 3rap:S
84 2kwi:A 178 85 0.1302 0.1236 0.2588 9.7 2ke5:A, 6zqt:A, 6zqt:B, 6zrn:A, 6zrn:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218