BioLiP

>protein
SRRKVLEEEKASDWQIELNGTLFDSELQPGSSFKAEGFRKIADKLKINVSSSRDNRASNRRFQQDIEAQKAAILLSLNQL
NKRKKPVMFARSAIHNWGLYALDSIAAKEMIIEYVGERIRQPVAEMREKRYLKNGIGSSYLFRVDENTVIDATKKGGIAR
FINHCCDPNCTAKIIKVGGRRRIVIYALRDIAASEELTYDYKFEPCLCGAPNCKGFLN

The query sequence (length=218) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6ven:N	218	218	1.0000	1.0000	1.0000	1.46e-163
2	6uh5:M	222	213	0.7661	0.7523	0.7840	1.68e-114	6chg:C
3	6ugm:M	188	207	0.6651	0.7713	0.7005	1.23e-97
4	6kiu:K	179	135	0.3165	0.3855	0.5111	1.51e-41	6kiv:K, 6kix:K, 6kiz:K, 7ud5:K
5	2w5z:A	180	143	0.3211	0.3889	0.4895	2.83e-41	5f5e:A, 5f6l:A, 6pwv:C, 6pww:C, 7u5v:A, 6u9k:A, 6u9k:B, 6u9m:A, 6u9m:B, 6u9n:A, 6u9n:B, 6u9r:A, 6u9r:B, 2w5y:A, 7w67:C, 7w6a:C, 7w6i:C, 7w6j:C
6	7bre:B	163	141	0.3349	0.4479	0.5177	3.08e-41	7bre:E
7	7w6l:C	158	143	0.2982	0.4114	0.4545	6.93e-35	5f59:A, 5f6k:C, 5f6k:E, 6kiw:K, 7w6l:E
8	4z4p:A	161	142	0.2890	0.3913	0.4437	2.36e-30
9	8fbh:A	232	146	0.2706	0.2543	0.4041	1.86e-29	8fbg:A, 8fbg:B, 6kqp:A, 6kqq:A, 6kqq:B, 3ooi:A
10	6nzo:S	233	149	0.2661	0.2489	0.3893	5.92e-28	6px3:S
11	6cen:A	226	126	0.2385	0.2301	0.4127	1.95e-26	7crp:I, 7crq:L, 7crq:I, 7crr:I, 5upd:A
12	5jlb:A	248	182	0.2615	0.2298	0.3132	1.96e-25	7ea8:L, 4fmu:A, 4h12:A, 6j9j:A, 5jjy:A, 5jle:A, 5lss:A, 5lsx:A, 5lsy:A, 5lsz:A, 5lt6:A, 5lt6:B, 5lt7:A, 5lt8:A, 7lzb:A, 7lzd:A, 7lzf:A, 8q5p:A, 7ty2:A, 7ty3:A, 5v21:A, 5v22:A, 6vdb:A
13	7td5:F	447	120	0.2431	0.1186	0.4417	8.19e-25
14	5lsu:A	231	174	0.2706	0.2554	0.3391	1.04e-24	7cro:I, 7e8d:K, 5lsu:B
15	7td5:A	497	120	0.2431	0.1066	0.4417	1.37e-24
16	7kso:A	395	118	0.2431	0.1342	0.4492	2.94e-24	7ksr:A, 7ktp:A
17	7at8:A	311	120	0.2339	0.1640	0.4250	5.04e-24
18	5ij7:B	469	120	0.2339	0.1087	0.4250	1.47e-23	6b3w:A, 6b3w:B, 6c23:K, 6c24:K, 5ij7:A, 5ij8:A, 5ij8:B, 4w2r:A, 4w2r:B
19	5wg6:A	517	120	0.2339	0.0986	0.4250	1.48e-23	5wg6:C
20	8t9g:C	536	120	0.2339	0.0951	0.4250	1.67e-23	8fyh:A, 8fyh:G
21	9c8u:A	475	120	0.2339	0.1074	0.4250	1.67e-23
22	8tas:E	570	120	0.2339	0.0895	0.4250	1.71e-23	8tb9:E
23	6wkr:C	606	120	0.2339	0.0842	0.4250	1.80e-23	4mi0:A, 4mi5:A, 8t9g:I
24	5hyn:A	581	120	0.2339	0.0878	0.4250	2.01e-23	5hyn:F, 5hyn:K, 5hyn:Q, 5ls6:A, 5ls6:G, 5ls6:J, 5ls6:D
25	6ine:A	247	127	0.2248	0.1984	0.3858	2.60e-23	6ago:A, 6ago:B, 3ope:A, 3ope:B, 6wzw:A, 6x0p:A, 6x0p:B, 6x0p:C, 6x0p:D, 4ynm:A, 4ynm:B, 4ynp:A, 4ynp:B, 4ypa:A, 4ypa:B, 4ypa:C, 4ypa:D, 4ype:A, 4ype:B, 4ypu:A, 4ypu:B
26	2r3a:A	270	145	0.2339	0.1889	0.3517	9.35e-20	6p0r:A, 6p0r:B
27	7ea5:K	228	177	0.2523	0.2412	0.3107	2.93e-19
28	7x73:A	274	145	0.2431	0.1934	0.3655	6.93e-17	7btv:A, 7btv:B, 7buc:A, 7buc:B, 7dcf:A, 7dcf:B, 5jhn:A, 5jhn:B, 5jin:A, 5jin:B, 5jiy:A, 5jiy:B, 5jj0:A, 5jj0:B, 3k5k:A, 3k5k:B, 4nvq:A, 4nvq:B, 2o8j:A, 2o8j:B, 2o8j:C, 2o8j:D, 3rjw:A, 3rjw:B, 5t0k:A, 5t0k:B, 5t0m:A, 5t0m:B, 7t7l:A, 7t7l:B, 7t7l:C, 7t7l:D, 5ttf:A, 5ttf:B, 5ttf:C, 5ttf:D, 5tuy:A, 5tuy:B, 5v9i:A, 5v9i:B, 5v9i:C, 5v9i:D, 5vsc:A, 5vsc:B, 5vse:A, 5vse:B, 7x73:B, 7xua:A, 7xua:B, 7xub:A, 7xub:B, 7xuc:A, 7xuc:B, 7xud:A, 7xud:B
29	6z2a:A	283	154	0.2339	0.1802	0.3312	6.97e-16	6box:A, 6box:B, 6bp4:B, 6bp4:A, 1mvh:A, 1mvx:A, 6z2a:B
30	3bo5:A	269	145	0.1972	0.1599	0.2966	1.52e-15
31	3hna:A	280	135	0.2110	0.1643	0.3407	1.79e-14	3fpd:A, 3fpd:B, 3hna:B, 4i51:A, 4i51:B, 2igq:A, 2igq:B, 6mbo:A, 6mbo:B, 6mbp:A, 6mbp:B, 3mo0:A, 3mo0:B, 3mo2:A, 3mo2:B, 3mo2:C, 3mo2:D, 3mo5:A, 3mo5:B, 3mo5:C, 3mo5:D, 2rfi:A, 2rfi:B, 3sw9:A, 3sw9:B, 3swc:A, 3swc:B, 7t7m:A, 7t7m:B, 7t7m:C, 7t7m:D, 5ttg:A, 5ttg:B, 5tuz:A, 5tuz:B, 5v9j:A, 5v9j:B, 5vsd:A, 5vsd:B, 5vsf:A, 5vsf:B, 8xpt:A, 8xpt:B, 8xpt:C, 8xpt:D
32	5tqr:B	809	121	0.2018	0.0544	0.3636	4.87e-14	5bjs:B, 5vk3:B
33	5kkl:B	839	121	0.2018	0.0524	0.3636	9.52e-14
34	5kjh:B	807	121	0.2018	0.0545	0.3636	1.16e-13	5m5g:B
35	5wf7:B	765	122	0.2018	0.0575	0.3607	4.32e-13	5kji:B
36	1peg:A	266	153	0.2064	0.1692	0.2941	1.64e-12	1ml9:A, 1peg:B
37	5wfd:B	774	121	0.1927	0.0543	0.3471	1.77e-12	5wfc:B
38	4qen:A	472	143	0.1972	0.0911	0.3007	6.36e-12	4qeo:A, 4qep:A
39	6a5m:A	488	160	0.2202	0.0984	0.3000	2.30e-11	6a5k:A
40	7xpx:K	167	108	0.1560	0.2036	0.3148	2.00e-10	6boz:A, 6boz:B, 2bqz:A, 2bqz:E, 3f9w:B, 3f9w:A, 3f9w:C, 3f9w:D, 3f9x:B, 3f9x:A, 3f9x:C, 3f9x:D, 3f9y:A, 3f9y:B, 3f9z:B, 3f9z:A, 3f9z:C, 3f9z:D, 4ij8:A, 4ij8:B, 5t5g:A, 5teg:A, 5teg:B, 5th7:A, 5th7:B, 5w1y:A, 5w1y:B, 1zkk:A, 1zkk:B, 1zkk:C, 1zkk:D
41	6a5n:A	502	148	0.2018	0.0876	0.2973	1.09e-09
42	4o30:A	217	126	0.1743	0.1751	0.3016	8.99e-05	4o30:B, 5va6:A, 5va6:B, 5vac:A, 5vah:A, 5vah:B, 5vbc:A, 5vbc:B
43	8t9f:K	264	74	0.1330	0.1098	0.3919	8.66e-04	4bup:A, 4bup:B, 5cpr:B, 8jhf:K, 8jhg:K, 3s8p:A, 3s8p:B, 5wbv:A, 5wbv:B, 7yrd:K, 7yrg:K
44	7yrg:L	240	74	0.1330	0.1208	0.3919	0.001
45	8sr6:A	451	108	0.1560	0.0754	0.3148	0.002	5czy:A, 8swi:A
46	5ex0:A	429	41	0.0780	0.0396	0.4146	0.025	7bj1:A, 5ccl:A, 5ccm:A, 5ex3:A, 5hi7:A, 5hq8:A, 5hq8:B, 6ijl:A, 3mek:A, 7o2a:A, 7o2b:A, 7o2c:A, 6o9o:A, 8owo:A, 3oxf:A, 3oxf:B, 3oxg:A, 3oxl:A, 6p6g:A, 6p6k:A, 6p7z:A, 6paf:A, 3pdn:A, 7qlb:A, 7qnr:A, 7qnu:A, 3qwp:A, 3ru0:A, 3ru0:B, 5v37:A, 5xxd:A, 5xxg:A, 5xxj:A, 5yjo:A, 6yuh:A, 6zrb:A
47	4au7:A	243	87	0.1330	0.1193	0.3333	0.038	4au7:B, 3rq4:A
48	4nj5:A	482	144	0.1514	0.0685	0.2292	0.094
49	6spf:N	120	63	0.0917	0.1667	0.3175	0.15	8cd1:N, 6spb:N, 6spd:N, 6spg:N, 7unr:P, 7unu:P, 7unv:P, 7unw:P
50	7dhw:A	726	76	0.0872	0.0262	0.2500	0.72
51	1zak:A	220	79	0.1009	0.1000	0.2785	3.2	1zak:B
52	3n71:A	468	51	0.0872	0.0406	0.3725	4.3
53	5j46:A	169	55	0.0963	0.1243	0.3818	6.5
54	4oes:A	498	94	0.1009	0.0442	0.2340	7.3
55	6uy4:A	354	59	0.0826	0.0508	0.3051	7.5
56	2zsm:A	425	81	0.0826	0.0424	0.2222	7.9	2epj:A, 2zsl:A, 2zsm:B, 2zsm:C

[Back]