BioLiP

>protein
SRKKMGLLVMAYGTPYKEEDIERYYTHIRRGRKPEPEMLQDLKDRYEAIGGISPLAQITEQQAHNLEQHLNEIQDEITFK
AYIGLKHIEPFIEDAVAEMHKDGITEAVSIVLAPHFSTFSVQSYNKRAKEEAEKLGGLTITSVESWYDEPKFVTYWVDRV
KETYASMPEDERENAMLIVSAHSLPEKIKEFGDPYPDQLHESAKLIAEGAGVSEYAVGWQSEGNTPDPWLGPDVQDLTRD
LFEQKGYQAFVYVPVGFVADHLEVLYDNDYECKVVTDDIGASYYRPEMPNAKPEFIDALATVVLKKLGR

The query sequence (length=309) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2hk6:A	309	309	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	1c1h:A, 1c9e:A, 1ld3:A, 3m4z:A, 2q2n:A, 2q2o:A, 2q3j:A
2	8aw7:A	309	304	0.6570	0.6570	0.6678	1.17e-153	8at8:A, 8bbv:A, 9f0f:A, 9f0g:A, 8ofl:A, 8omm:A, 6sv3:A
3	3aqi:A	359	274	0.2524	0.2173	0.2847	5.00e-34	3aqi:B, 7ct7:A, 7ct7:B, 7ctc:A, 7ctc:D, 4f4d:A, 4f4d:B, 3hcn:A, 3hcn:B, 3hco:A, 3hco:B, 3hcp:A, 3hcp:B, 3hcr:A, 3hcr:B, 1hrk:A, 1hrk:B, 2hrc:A, 2hrc:B, 2hre:A, 2hre:B, 2hre:C, 2hre:D, 4kla:A, 4kla:B, 4klc:A, 4klc:B, 4klr:A, 4klr:B, 4kmm:A, 4kmm:B, 4mk4:A, 4mk4:B, 2pnj:A, 2pnj:B, 2po5:A, 2po5:B, 2po7:A, 2po7:B, 2qd1:A, 2qd1:B, 2qd1:C, 2qd1:D, 2qd2:A, 2qd2:B, 2qd3:A, 2qd3:B, 2qd4:A, 2qd4:B, 2qd5:A, 2qd5:B, 3w1w:A, 3w1w:B
4	1l8x:B	354	291	0.2362	0.2062	0.2509	1.63e-23
5	8em4:A	3818	119	0.1003	0.0081	0.2605	0.55	8em4:B
6	8em7:A	4378	119	0.1003	0.0071	0.2605	0.55	8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
7	7oz9:BBB	483	64	0.0680	0.0435	0.3281	0.93	7oz9:AAA
8	2iv7:A	370	37	0.0453	0.0378	0.3784	1.2	2iw1:A
9	1ds7:A	217	71	0.0712	0.1014	0.3099	1.3	8c5e:A, 8c5e:B, 8c5f:A, 8c5f:B, 8c5p:A, 8c5p:B, 8ccv:A, 8ccv:B, 8cj0:A, 8cj0:B, 1ds7:B, 1icr:A, 1icr:B, 1icu:A, 1icu:B, 1icu:C, 1icu:D, 1icv:A, 1icv:B, 1icv:C, 1icv:D, 1idt:A, 1idt:B, 8og3:A, 8og3:B, 1oo5:A, 1oo5:B, 1oo6:A, 1oo6:B, 1oon:A, 1oon:B, 1ooq:A, 1ooq:B, 8qes:A, 8qes:C, 8qes:B, 8qes:D, 8qpo:A, 8qpo:B, 8qpo:C, 8qpo:G, 8qpo:D, 8qpo:E, 8qpo:F, 8qpo:H, 3x21:A, 3x21:B, 3x21:C, 3x21:D, 3x21:E, 3x21:F, 3x21:G, 3x21:H, 3x21:I, 3x21:J, 3x22:A, 3x22:B, 7x32:A, 7x32:C, 7x32:B, 7x32:H, 7x32:D, 7x32:F, 7x32:E, 7x32:G, 7xww:B, 7xww:A, 7xww:H, 7xww:I, 1yki:A, 1yki:B, 1yki:C, 1yki:D, 1ylr:A, 1ylr:B, 1ylu:A, 1ylu:B
10	3q5i:A	470	107	0.0874	0.0574	0.2523	3.2
11	2vr2:A	478	99	0.0939	0.0607	0.2929	3.6
12	8urb:A	921	75	0.0680	0.0228	0.2800	3.9	8g6r:A
13	6hxq:B	410	111	0.0971	0.0732	0.2703	4.0
14	8kbj:B	104	78	0.0647	0.1923	0.2564	4.6	8kbj:A, 8kbj:C, 8kbj:D, 8kbk:A, 8kbk:C, 8kbk:D, 8kbk:B, 8kbl:A, 8kbm:A, 8kbm:B, 8wjc:A, 8wjc:D, 8wjc:B, 8wjc:C
15	1gl6:B	420	84	0.0583	0.0429	0.2143	5.9	1gki:A, 1gki:B, 1gki:D, 1gki:E, 1gki:F, 1gki:G, 1gl6:A, 1gl6:D, 1gl6:E, 1gl6:F, 1gl6:G, 1gl7:A, 1gl7:B, 1gl7:D, 1gl7:E, 1gl7:F, 1gl7:G
16	1ubw:A	348	72	0.0647	0.0575	0.2778	6.4	1ubx:A, 1uby:A
17	2qhs:A	210	72	0.0615	0.0905	0.2639	7.5	2qhu:A, 2qhv:A
18	5mrc:9	202	127	0.0939	0.1436	0.2283	8.3	3j6b:9, 5mre:9, 5mrf:9
19	3ct4:A	318	22	0.0388	0.0377	0.5455	9.0	3ct4:B, 3ct4:C
20	1lfu:P	82	42	0.0421	0.1585	0.3095	9.9	1b72:B, 1b8i:B, 4cyc:B, 1puf:B, 2r5y:B, 2r5z:B, 4uus:B, 4uus:F, 5zjq:B, 5zjr:B, 5zjs:B, 5zjt:B

[Back]