BioLiP

>protein
SRIPVVLLACGSFNPITNMHLRMFEVARDHLHQTGMYQVIQGIISPVNDTYGKKDLAASHHRVAMARLALQTSDWIRVDP
WESEQAQWMETVKVLRHHHSKLLRVPELKLLCGADVLKTFQTPNLWKDAHIQEIVEKFGLVCVGRVSHDPKGYIAESPIL
RMHQHNIHLAKEPVQNEISATYIRRALGQGQSVKYLIPDAVITYIKDHGLYT

The query sequence (length=212) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1nup:A	213	212	0.9953	0.9906	0.9953	5.31e-160	1nup:B, 1nuq:A, 1nuq:B, 1nus:A, 1nus:B, 1nut:A, 1nut:B, 1nuu:A, 1nuu:B
2	1kqo:A	233	212	0.5613	0.5107	0.5613	5.50e-88	1gzu:A, 1gzu:B, 1gzu:C, 1kqn:A, 1kqn:B, 1kqn:C, 1kqn:D, 1kqn:E, 1kqn:F, 1kqo:B, 1kqo:C, 1kqo:D, 1kqo:E, 1kqo:F, 1kr2:A, 1kr2:B, 1kr2:C, 1kr2:D, 1kr2:E, 1kr2:F, 8qe8:4, 8qe8:3
3	1kaq:A	186	206	0.2642	0.3011	0.2718	3.28e-12	1kaq:B, 1kaq:C, 1kaq:D, 1kaq:E, 1kaq:F
4	8aih:A	184	209	0.2500	0.2880	0.2536	4.74e-10	8aii:A, 9fyb:A, 9fyb:B
5	2h2a:A	189	211	0.2594	0.2910	0.2607	3.15e-08	2h29:A, 2h29:B, 2h2a:B
6	1yum:A	212	226	0.2500	0.2500	0.2345	6.47e-08	1yum:B, 1yum:C, 1yum:D, 1yun:A, 1yun:B
7	1k4m:A	213	222	0.2830	0.2817	0.2703	1.32e-06	1k4m:B, 1k4m:C
8	4wso:A	227	122	0.1792	0.1674	0.3115	5.06e-06	4wso:B
9	5db4:B	175	205	0.2311	0.2800	0.2390	7.81e-06
10	4ymi:B	198	207	0.2358	0.2525	0.2415	2.12e-05	5db4:A, 5deo:A, 5deo:B, 5deo:C, 5deo:D, 5vir:A, 5vir:B, 4ymi:A
11	5das:A	198	202	0.2217	0.2374	0.2327	2.54e-05	6buv:B, 4s1o:A, 4ybr:A, 4ybr:B
12	5das:C	180	203	0.2264	0.2667	0.2365	0.022	5das:B, 5das:D, 4s1o:B
13	1f9a:A	164	95	0.1132	0.1463	0.2526	0.32	1f9a:B, 1f9a:C, 1f9a:D, 1f9a:E, 1f9a:F
14	3e27:C	189	34	0.0566	0.0635	0.3529	0.33	3e27:A, 3e27:B, 3e27:D, 3hfj:A, 3hfj:B, 3mla:A, 3mla:B, 3mlb:A, 3mlb:B, 3mmx:B, 3mmx:C, 3mmx:A, 3mmx:D, 2qtn:B, 2qtr:A, 2qtr:B, 2qtr:C
15	5z9y:B	234	56	0.0708	0.0641	0.2679	0.36	5z9y:A
16	6ayh:A	192	68	0.0802	0.0885	0.2500	0.57
17	8ouw:D	203	38	0.0660	0.0690	0.3684	1.1
18	3l92:A	159	57	0.0849	0.1132	0.3158	1.6
19	6pnz:A	293	107	0.1368	0.0990	0.2710	2.0	6pnz:B, 6pnz:C
20	5c0w:K	576	100	0.0849	0.0312	0.1800	2.4	5c0y:B, 5c0y:A, 2hbk:A, 2hbl:A, 2hbm:A, 5k36:J, 4oo1:J, 4wfd:A
21	7cpx:A	2262	75	0.1038	0.0097	0.2933	4.0	7cpx:B, 7cpy:A, 7cpy:B
22	7o4x:A	103	32	0.0660	0.1359	0.4375	4.0
23	3otw:A	157	93	0.0943	0.1274	0.2151	6.3	3otw:D, 3otw:B, 3otw:C, 3otw:E, 3otw:F
24	3ty7:B	454	76	0.1085	0.0507	0.3026	6.4
25	8hui:C	399	54	0.0708	0.0376	0.2778	6.7	8hui:A, 8hui:B
26	4k6n:A	352	60	0.0802	0.0483	0.2833	8.2
27	7dwa:B	327	75	0.0802	0.0520	0.2267	8.4	7dvj:B, 7dvj:A, 7dw8:A, 7dw8:B, 7dwa:A
28	7oj1:A	401	46	0.0755	0.0399	0.3478	8.5

[Back]