Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SRHVACLARSERGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEGGAAHRAGTLQVGDRVLSINGVDVTEARHDHAVSLLTAA
SPTIALLLERE

The query sequence (length=91) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6xa7:B 96 91 1.0000 0.9479 1.0000 3.81e-60 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
2 5wou:A 95 85 0.4615 0.4421 0.4941 8.61e-24
3 8b82:A 108 86 0.4615 0.3889 0.4884 8.46e-21 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
4 8bq8:C 93 85 0.3736 0.3656 0.4000 1.00e-17 8bq8:A, 8bq8:B
5 7pc3:A 405 80 0.4066 0.0914 0.4625 2.45e-17 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
6 2ka9:A 189 80 0.3846 0.1852 0.4375 6.76e-17 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
7 2ka9:A 189 85 0.4066 0.1958 0.4353 2.30e-14 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
8 8cn1:H 101 84 0.3956 0.3564 0.4286 2.52e-15 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
9 7p73:A 420 83 0.4066 0.0881 0.4458 4.04e-15 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
10 2l4t:A 124 81 0.3846 0.2823 0.4321 4.60e-15 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
11 1n7t:A 103 80 0.3736 0.3301 0.4250 2.86e-14 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
12 3ch8:A 190 80 0.3736 0.1789 0.4250 1.32e-13 2qbw:A
13 2r4h:C 98 88 0.3187 0.2959 0.3295 4.31e-13
14 7qqm:A 413 81 0.3626 0.0799 0.4074 1.19e-12
15 4wyu:A 201 87 0.3956 0.1791 0.4138 1.65e-12 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
16 4wyu:A 201 78 0.3297 0.1493 0.3846 4.33e-08 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
17 6q0m:B 94 93 0.3516 0.3404 0.3441 2.59e-12
18 8bv7:A 95 60 0.2747 0.2632 0.4167 2.86e-12 8buw:A, 8buw:B
19 5heb:A 119 82 0.3516 0.2689 0.3902 5.53e-12 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
20 3jxt:A 96 76 0.3516 0.3333 0.4211 6.43e-11 3jxt:B
21 2m0z:A 97 84 0.3626 0.3402 0.3929 1.11e-10 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
22 4e34:A 87 77 0.3297 0.3448 0.3896 1.14e-10 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
23 7p70:A 407 85 0.3736 0.0835 0.4000 2.44e-10 7pc4:A, 7qql:A
24 2pdz:A 86 74 0.3297 0.3488 0.4054 6.67e-10
25 8c1t:A 90 84 0.3077 0.3111 0.3333 7.87e-10 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
26 1ihj:B 95 88 0.2967 0.2842 0.3068 4.39e-09 1ihj:A
27 7x2e:A 163 77 0.3077 0.1718 0.3636 1.24e-08 2kbs:A
28 8bp4:A 93 92 0.3407 0.3333 0.3370 1.44e-08 8bp4:C, 8bp4:B
29 2os6:A 89 83 0.2967 0.3034 0.3253 1.75e-08
30 1rzx:A 98 83 0.2857 0.2653 0.3133 3.99e-08 5i7z:A, 1x8s:A
31 2qt5:A 194 88 0.2967 0.1392 0.3068 7.72e-08 2qt5:B
32 2qt5:A 194 78 0.2747 0.1289 0.3205 5.85e-06 2qt5:B
33 2i0i:A 81 61 0.2857 0.3210 0.4262 9.02e-08 2i0i:B, 2i0i:C
34 2m0u:A 117 85 0.2967 0.2308 0.3176 9.88e-08
35 2exg:A 101 83 0.2747 0.2475 0.3012 2.12e-07 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
36 2ejy:A 85 45 0.2418 0.2588 0.4889 3.29e-07
37 3vqg:A 85 64 0.2418 0.2588 0.3438 3.82e-07
38 6gbe:A 119 84 0.2637 0.2017 0.2857 4.49e-07
39 6x23:A 89 85 0.2967 0.3034 0.3176 5.20e-07
40 6yx0:B 112 92 0.2857 0.2321 0.2826 1.13e-06 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
41 7qqn:C 414 85 0.2967 0.0652 0.3176 1.33e-06 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
42 1n7f:A 86 78 0.2637 0.2791 0.3077 1.40e-06 1n7f:B
43 4wsi:A 372 55 0.2198 0.0538 0.3636 2.10e-06 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
44 2koh:A 111 71 0.2637 0.2162 0.3380 2.36e-06 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
45 7d6f:A 87 80 0.2637 0.2759 0.3000 2.47e-06
46 4xhv:A 94 84 0.2857 0.2766 0.3095 6.26e-06
47 7pcb:A 415 89 0.3297 0.0723 0.3371 6.79e-06 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
48 2kaw:A 90 64 0.2527 0.2556 0.3594 1.64e-05 6lcb:A, 2mx6:A
49 7qct:A 90 63 0.2308 0.2333 0.3333 2.40e-05 7qct:B
50 6nid:B 88 31 0.1868 0.1932 0.5484 2.63e-05 6nid:A, 6nid:C
51 1l6o:A 95 64 0.2418 0.2316 0.3438 2.93e-05 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
52 5f67:A 98 82 0.3407 0.3163 0.3780 3.36e-05 5f67:B
53 5zys:A 90 75 0.2747 0.2778 0.3333 4.56e-05
54 1zub:A 109 79 0.2308 0.1927 0.2658 1.02e-04
55 5ez0:D 95 68 0.2527 0.2421 0.3382 1.18e-04 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
56 1b8q:A 127 74 0.2308 0.1654 0.2838 1.36e-04
57 7pc5:A 405 74 0.2418 0.0543 0.2973 2.49e-04
58 6zbq:A 89 49 0.1758 0.1798 0.3265 6.33e-04 6zc4:A
59 6hks:B 94 82 0.2857 0.2766 0.3171 7.56e-04 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
60 7weg:B 96 68 0.2308 0.2188 0.3088 8.41e-04 7weg:A
61 3cyy:B 81 58 0.1978 0.2222 0.3103 0.001 3cyy:A
62 2egn:A 83 52 0.2088 0.2289 0.3654 0.003
63 1u38:A 89 29 0.1209 0.1236 0.3793 0.003
64 6kz1:A 97 45 0.1758 0.1649 0.3556 0.006 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
65 2kpl:A 129 73 0.2088 0.1473 0.2603 0.013
66 5gmj:B 224 86 0.2857 0.1161 0.3023 0.014 5gmi:A, 5gmi:B, 5gmj:A, 5h3j:A
67 5n7d:A 423 73 0.2088 0.0449 0.2603 0.021 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
68 8blu:B 195 60 0.2308 0.1077 0.3500 0.14 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
69 2m0v:A 128 89 0.2418 0.1719 0.2472 0.29
70 4xh7:A 110 78 0.2308 0.1909 0.2692 0.34
71 3pv3:A 392 60 0.2198 0.0510 0.3333 0.62 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
72 7t2r:C 152 46 0.1538 0.0921 0.3043 0.77 7t2r:H
73 5oak:A 90 45 0.1648 0.1667 0.3333 0.87 5oak:C
74 4d1t:A 229 54 0.2198 0.0873 0.3704 1.8 4d1u:A, 4d1v:A, 4d1w:A, 2y87:A, 2y8a:A, 2y8b:A
75 5izu:A 124 81 0.3077 0.2258 0.3457 1.9 6exj:A, 6exj:C, 5izu:C, 5ovc:A, 5ovp:A, 5ovv:A
76 7w6z:A 414 54 0.1868 0.0411 0.3148 3.2 7w6y:A
77 7xr4:A 425 34 0.1868 0.0400 0.5000 4.2 7vr7:A, 7vr8:A, 7xr4:B, 7xr4:C, 7xr6:A, 7xr6:B, 7xr6:C
78 3th0:A 552 45 0.1868 0.0308 0.3778 4.5 1tyu:A, 1tyw:A, 1tyx:A
79 8xud:D 651 47 0.1429 0.0200 0.2766 7.4 6iqq:C, 6iqq:D, 5wql:D, 5wql:C, 8xud:C
80 5zm3:B 286 27 0.1099 0.0350 0.3704 7.5 7wpy:A, 7wpy:B, 7wpy:C, 7wpy:D, 5zm3:A, 5zm3:C, 5zm3:D, 5zm4:A, 5zm4:B, 5zm4:C, 5zm4:D
81 5hj1:A 97 81 0.2198 0.2062 0.2469 7.9
82 5e6t:B 284 22 0.1209 0.0387 0.5000 8.1
83 8kar:A 414 39 0.1319 0.0290 0.3077 8.4 8kao:C, 8kar:B, 8kar:C
84 6ar4:B 87 49 0.1429 0.1494 0.2653 9.3 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
85 8con:A 379 57 0.2198 0.0528 0.3509 9.4 4rqt:A, 4rqu:A, 4rqu:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417