BioLiP

>protein
SRARQVELLLVADASMARKYGRGLQHYLLTLASIANRLYSHASIENHIRLAVVKVVVLGKSLEVSKNAATTLKNFCKWQH
QHNQLGDDHEEHYDAAILFTREDLCGHHSCDTLGMADVGTICSPERSCAVIEDDGLHAAFTVAHEIGHLLGLSHDDSKFC
EETFGSTEDKRLMSSILTSIDASKPWSKCTSATITEFLDDGHGNCLLDLPRKQILVP

The query sequence (length=217) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2rjq:A	292	220	0.9908	0.7363	0.9773	1.04e-156	3b8z:A, 3b8z:B, 3hy7:A, 3hy7:B, 3hy9:A, 3hy9:B, 3hyg:A, 3hyg:B, 3ljt:A, 6yjm:A, 6yjm:B
2	2jih:B	286	217	0.5760	0.4371	0.5760	7.02e-90	2jih:A, 3q2g:A, 3q2g:B, 3q2h:A, 3q2h:B, 2v4b:A, 2v4b:B
3	3b2z:F	293	221	0.4885	0.3618	0.4796	2.01e-73	3b2z:A, 3b2z:B, 3b2z:C, 3b2z:D, 3b2z:E, 3b2z:G, 3b2z:H, 2rjp:A, 2rjp:B, 2rjp:C, 2rjp:D, 4wk7:A, 4wke:A, 4wki:A
4	6qig:A	581	212	0.2765	0.1033	0.2830	1.96e-22	3ghm:A, 3ghn:A, 3vn4:A
5	1nd1:A	202	214	0.2673	0.2871	0.2710	9.15e-16	2w12:A, 2w13:A, 2w14:A, 2w15:A
6	3dsl:A	416	213	0.2903	0.1514	0.2958	1.35e-15	3dsl:B
7	6x5x:A	200	213	0.2627	0.2850	0.2676	3.26e-15
8	1r54:A	206	217	0.2903	0.3058	0.2903	5.02e-15	1r55:A
9	1bsw:A	197	211	0.2719	0.2995	0.2796	5.91e-15	1bud:A
10	3gbo:A	200	214	0.2811	0.3050	0.2850	8.11e-14
11	9clp:A	420	221	0.3088	0.1595	0.3032	1.37e-13
12	1kuf:A	201	213	0.2765	0.2985	0.2817	1.52e-13	1kug:A, 1kui:A, 1kuk:A
13	2dw1:A	415	214	0.2857	0.1494	0.2897	2.36e-13	2dw0:A, 2dw0:B, 2dw1:B, 2dw2:B, 2dw2:A
14	1qua:A	197	209	0.2811	0.3096	0.2919	1.29e-12
15	4dd8:D	208	219	0.2949	0.3077	0.2922	3.17e-12	4dd8:A, 4dd8:B, 4dd8:C
16	2e3x:A	416	219	0.2765	0.1442	0.2740	5.07e-12
17	3hdb:A	417	218	0.2765	0.1439	0.2752	8.87e-12
18	4q1l:A	202	218	0.2627	0.2822	0.2615	1.29e-11
19	1dth:A	202	156	0.2028	0.2178	0.2821	1.37e-11	1atl:A, 1atl:B, 1dth:B, 1htd:A, 1htd:B
20	2ero:A	426	219	0.2995	0.1526	0.2968	2.02e-11	2ero:B, 2erp:A, 2erp:B, 2erq:A, 2erq:B
21	1wni:A	198	211	0.2396	0.2626	0.2464	5.61e-11
22	4j4m:B	200	213	0.2488	0.2700	0.2535	3.14e-10	4j4m:A
23	3k7l:A	409	167	0.2166	0.1149	0.2814	3.74e-10
24	1yp1:A	199	212	0.2673	0.2915	0.2736	4.06e-10
25	2aig:P	201	158	0.1935	0.2090	0.2658	1.09e-08	3aig:A, 4aig:A, 1iag:A
26	3k7n:A	396	212	0.2396	0.1313	0.2453	1.65e-08
27	3g5c:A	486	225	0.2581	0.1152	0.2489	3.53e-08	3g5c:B, 8hpy:A, 8hpy:B, 8hq0:A, 8hq0:B, 8hq0:C, 8hq1:A, 8hq1:B, 8hq1:C, 8hq2:A, 8hq2:B, 5y2z:A, 5y2z:C, 5y2z:E, 5y2z:I, 5y2z:K, 5y31:A, 5y31:C, 8y6b:A, 8y6b:B, 8y6b:C
28	5y2z:G	462	224	0.2581	0.1212	0.2500	4.71e-08
29	8snl:A	656	257	0.2949	0.0976	0.2490	0.043	2a8h:A, 2a8h:B, 3b92:A, 1bkc:A, 1bkc:C, 1bkc:E, 1bkc:I, 3cki:A, 2ddf:A, 2ddf:B, 3e8r:A, 3e8r:B, 3edz:A, 3edz:B, 3ewj:A, 3ewj:B, 2fv5:A, 2fv5:B, 2fv9:A, 2fv9:B, 3g42:A, 3g42:B, 3g42:C, 3g42:D, 2i47:A, 2i47:B, 2i47:C, 2i47:D, 3kmc:A, 3kmc:B, 3kme:A, 3kme:B, 3l0t:A, 3l0t:B, 3l0v:A, 3l0v:B, 3le9:A, 3le9:B, 3lea:A, 3lea:B, 3lgp:A, 3lgp:B, 3o64:A, 3o64:B, 2oi0:A, 8snm:B, 8snn:A, 8sno:A, 1zxc:A, 1zxc:B
30	8esv:A	446	75	0.1014	0.0493	0.2933	0.15	6bdz:A, 6be6:B, 6be6:A, 6be6:C, 6be6:D
31	4on1:A	334	20	0.0553	0.0359	0.6000	0.82	4on1:B
32	1akl:A	470	62	0.0922	0.0426	0.3226	0.85	1jiw:P, 1kap:P, 3vi1:A, 3vi1:B
33	1gxd:A	624	102	0.1014	0.0353	0.2157	1.1	1ck7:A, 1eak:A, 1eak:B, 1eak:D, 1eak:C, 1gen:A, 1gxd:B, 1rtg:A
34	7cs6:F	300	100	0.0922	0.0667	0.2000	1.8	7cs3:A, 7cs3:B, 7cs3:C, 7cs3:D, 7cs3:E, 7cs3:F, 7cs4:E, 7cs4:A, 7cs4:F, 7cs4:D, 7cs4:C, 7cs4:B, 7cs5:E, 7cs5:A, 7cs5:F, 7cs5:D, 7cs5:C, 7cs5:B, 7cs6:A, 7cs6:B, 7cs6:C, 7cs6:D, 7cs6:E, 7cs7:A, 7cs7:B, 7cs7:C, 7cs7:D, 7cs7:E, 7cs7:F, 7cs8:A, 7cs8:B, 7cs8:C, 7cs8:D, 7cs8:E, 7cs8:F
35	3lmc:A	191	33	0.0645	0.0733	0.4242	2.0
36	3aiq:A	491	25	0.0553	0.0244	0.4800	2.0	3air:A, 3ais:A, 3aiv:A, 3aiw:A
37	4l63:A	249	21	0.0507	0.0442	0.5238	2.4	4l6t:A
38	6ixx:A	463	21	0.0553	0.0259	0.5714	5.3	1g9k:A, 1h71:P, 1o0q:A, 1o0t:A, 1om6:A, 1om7:A, 1om8:A, 1omj:A, 3u1r:A
39	4aa1:A	598	102	0.1336	0.0485	0.2843	6.0	5a2r:A, 4aa2:A, 4asq:A, 4asr:A, 4ca7:A, 4ca8:A, 1j36:A, 1j36:B, 1j37:A, 1j37:B, 1j38:A, 1j38:B, 2x8y:A, 2x8z:A, 2x90:A, 2x91:A, 2x92:A, 2x93:A, 2x94:A, 2x95:A, 2x96:A, 2x97:A, 2xhm:A, 3zqz:A
40	3per:A	477	28	0.0553	0.0252	0.4286	6.7	3per:B, 3pf7:A, 3pf7:B, 3pm5:A, 3pm5:B, 3pm5:C, 3pm5:D, 3q1g:A, 3q1g:B, 3q1g:C, 3q1g:D
41	1af0:A	470	42	0.0783	0.0362	0.4048	7.7	5d7w:A, 4i35:A, 1sat:A, 1smp:A, 1srp:A

[Back]