Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SQYLDIVLLRGSSGLGFSIAGGTDNPHFDNDTSIYITKVIPGGAAEADGRLKVYDTIVAVDDQLMEDVAHQVCVDALKSG
SEVKLRVKR

The query sequence (length=89) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8c1t:A 90 90 1.0000 0.9889 0.9889 1.90e-59 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
2 8cn1:H 101 89 0.5955 0.5248 0.5955 7.06e-30 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
3 2ka9:A 189 89 0.5843 0.2751 0.5843 4.04e-29 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
4 2ka9:A 189 82 0.4719 0.2222 0.5122 4.03e-22 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
5 7pc3:A 405 87 0.4719 0.1037 0.4828 4.36e-21 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
6 8bq8:C 93 81 0.4382 0.4194 0.4815 1.43e-19 8bq8:A, 8bq8:B
7 7p73:A 420 85 0.4270 0.0905 0.4471 4.59e-17 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
8 5zys:A 90 91 0.3596 0.3556 0.3516 7.57e-11
9 8b82:A 108 91 0.3483 0.2870 0.3407 1.05e-09 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
10 4wyu:A 201 89 0.3933 0.1741 0.3933 1.29e-09 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
11 4wyu:A 201 69 0.3146 0.1393 0.4058 1.07e-07 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
12 2koh:A 111 68 0.2809 0.2252 0.3676 2.32e-09 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
13 3jxt:A 96 80 0.2921 0.2708 0.3250 4.43e-09 3jxt:B
14 2r4h:C 98 88 0.2584 0.2347 0.2614 5.50e-09
15 5heb:A 119 78 0.3034 0.2269 0.3462 7.25e-09 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
16 6xa7:B 96 75 0.2921 0.2708 0.3467 2.43e-08 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
17 7weg:B 96 81 0.3258 0.3021 0.3580 7.30e-08 7weg:A
18 2m0z:A 97 80 0.2809 0.2577 0.3125 2.11e-07 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
19 7pc5:A 405 81 0.3146 0.0691 0.3457 3.09e-07
20 5wou:A 95 91 0.3820 0.3579 0.3736 5.57e-07
21 2i0i:A 81 56 0.2584 0.2840 0.4107 9.39e-07 2i0i:B, 2i0i:C
22 6gbe:A 119 89 0.3146 0.2353 0.3146 1.40e-06
23 7p70:A 407 83 0.3708 0.0811 0.3976 2.02e-06 7pc4:A, 7qql:A
24 2l4t:A 124 84 0.3820 0.2742 0.4048 2.56e-06 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
25 2pdz:A 86 78 0.3371 0.3488 0.3846 2.57e-06
26 8bp4:A 93 66 0.2809 0.2688 0.3788 2.88e-06 8bp4:C, 8bp4:B
27 4xhv:A 94 91 0.3034 0.2872 0.2967 1.75e-05
28 2exg:A 101 84 0.2697 0.2376 0.2857 9.14e-05 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
29 2kaw:A 90 64 0.2472 0.2444 0.3438 9.78e-05 6lcb:A, 2mx6:A
30 2kpl:A 129 91 0.3034 0.2093 0.2967 1.30e-04
31 7qqm:A 413 76 0.2921 0.0630 0.3421 1.98e-04
32 1l6o:A 95 64 0.2472 0.2316 0.3438 2.13e-04 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
33 5n7d:A 423 91 0.3034 0.0638 0.2967 3.90e-04 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
34 4e34:A 87 72 0.2697 0.2759 0.3333 4.20e-04 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
35 6x23:A 89 87 0.2697 0.2697 0.2759 6.38e-04
36 1b8q:A 127 69 0.2360 0.1654 0.3043 6.67e-04
37 1n7t:A 103 68 0.2584 0.2233 0.3382 8.74e-04 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
38 8bv7:A 95 49 0.1685 0.1579 0.3061 8.88e-04 8buw:A, 8buw:B
39 2qt5:A 194 90 0.3034 0.1392 0.3000 0.001 2qt5:B
40 2qt5:A 194 75 0.2472 0.1134 0.2933 8.1 2qt5:B
41 1ihj:B 95 71 0.2360 0.2211 0.2958 0.002 1ihj:A
42 1rzx:A 98 51 0.2022 0.1837 0.3529 0.002 5i7z:A, 1x8s:A
43 3ch8:A 190 71 0.2697 0.1263 0.3380 0.002 2qbw:A
44 1u38:A 89 60 0.1910 0.1910 0.2833 0.005
45 6zbq:A 89 64 0.2247 0.2247 0.3125 0.013 6zc4:A
46 4ydp:A 83 75 0.2472 0.2651 0.2933 0.022 4ydp:B
47 3r0h:D 199 47 0.2022 0.0905 0.3830 0.039 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
48 7qct:A 90 76 0.2247 0.2222 0.2632 0.052 7qct:B
49 6q0m:B 94 34 0.1685 0.1596 0.4412 0.083
50 5csu:A 518 59 0.2135 0.0367 0.3220 0.11 5cps:A, 5cps:B, 5cpt:A, 5cpt:B, 5cq1:A, 5cq1:B, 5csu:B, 5csy:A, 5csy:B
51 7pcb:A 415 84 0.2360 0.0506 0.2500 0.26 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
52 4afd:A 128 22 0.1348 0.0938 0.5455 1.9
53 3vqg:A 85 47 0.1461 0.1529 0.2766 2.2
54 4wsi:A 372 29 0.1124 0.0269 0.3448 3.2 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
55 8any:F 252 40 0.1461 0.0516 0.3250 3.6 7a5f:F3, 7a5g:F3, 7a5h:F, 7a5i:F3, 7a5j:F, 7a5k:F3, 6i9r:F, 3j7y:F, 3j9m:F, 8k2a:LD, 8k2b:LD, 7l08:F, 7l20:F, 6nu2:F, 6nu3:F, 7o9k:F, 7o9m:F, 7odr:F, 7ods:F, 7odt:F, 7of0:F, 7of2:F, 7of3:F, 7of4:F, 7of5:F, 7of6:F, 7of7:F, 7og4:XF, 7oi6:F, 7oi7:F, 7oi8:F, 7oi9:F, 7oia:F, 7oib:F, 7oic:F, 7oid:F, 7oie:F, 8oir:BN, 8oit:BN, 5ool:F, 5oom:F, 7pd3:F, 8pk0:F, 7po4:F, 7qh6:F, 7qh7:F, 7qi4:F, 7qi5:F, 7qi6:F, 8qsj:F, 8qu1:F, 8qu5:F, 6vlz:F, 6vmi:F, 8xt0:LD, 8xt1:LD, 8xt2:LD, 8xt3:LD, 6zm5:F, 6zm6:F, 6zs9:XF, 6zsa:XF, 6zsb:XF, 6zsc:XF, 6zsd:XF, 6zse:XF, 6zsg:XF
56 6qp7:A 620 30 0.1461 0.0210 0.4333 3.8 6qp7:B
57 7k88:A 501 18 0.0899 0.0160 0.4444 4.1 7k8g:A, 3kvc:A, 3kvc:B
58 4f30:A 521 18 0.0899 0.0154 0.4444 4.2 8doc:A, 4f2z:A, 4f2z:E, 4f3a:A, 4f3d:A, 4f3d:B, 3fsn:A, 3fsn:B, 7k88:B, 7k89:A, 7k89:B, 7k8g:B, 7l0e:A, 7l0e:B, 4rsc:A, 4rsc:B, 4rse:A, 4rse:B, 4ryx:A, 4ryy:A, 4ryy:B, 4ryz:A, 4ryz:B, 5ul5:A, 5ul5:B, 5ulg:A, 5ulg:B, 4zhk:A, 4zhk:B
59 7ykg:A 188 64 0.2135 0.1011 0.2969 5.1 7ykf:A, 7ykf:C, 7ykg:C, 7ykh:A, 7ykh:C, 7yki:A, 7yki:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417