Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SPTFKHESYYATVNELTPVGTTIFTGFSGDNGATGPNGQIEYVIQYNPDDPTSNDTFEIPLMLTGNIVLRKRLNYEDKTR
YFVIIQANDRTTTTLTVDVLDGDDLGPMFLPCVLNDCRPLTYQAAIPELRTPEELNPIIVTPPIQAIDQDRNIQPPSDRP
GILYSILVGTPEDYPRFFHMHPRTAELSLLEPVNRDFHQKFDLVIKAEQDNGHPLPAFAGLHIEILDE

The query sequence (length=228) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6cv7:A 365 244 0.9649 0.6027 0.9016 6.46e-156 4apx:B, 4aq8:C, 4aq8:D, 4aqa:B, 4aqe:B, 4axw:B, 6eb5:B, 6eb5:A, 6n22:A, 6n2e:A, 6n2e:B, 5uly:A, 5uly:D, 4xxw:B, 4xxw:A
2 5uly:C 221 229 0.9430 0.9729 0.9389 2.38e-151 5uly:B
3 6mfo:A 333 238 0.8904 0.6096 0.8529 4.19e-129
4 5t4m:A 347 127 0.5307 0.3487 0.9528 1.59e-82 6e8f:A, 6e8f:C, 6e8f:B, 5t4m:B, 5t4n:A, 5t4n:B
5 8ton:A 224 130 0.4956 0.5045 0.8692 2.38e-74
6 8e51:C 238 120 0.3553 0.3403 0.6750 1.99e-48
7 7sz8:A 420 230 0.2895 0.1571 0.2870 1.31e-08 7sz8:B
8 7sz8:A 420 112 0.1184 0.0643 0.2411 0.35 7sz8:B
9 8d40:B 427 237 0.2544 0.1358 0.2447 1.39e-07 8d40:A
10 5cyx:A 318 182 0.2193 0.1572 0.2747 4.24e-07
11 5szn:A 523 230 0.2544 0.1109 0.2522 6.70e-06
12 5szn:A 523 114 0.1404 0.0612 0.2807 1.8
13 2a62:A 319 159 0.1974 0.1411 0.2830 1.80e-05
14 2a62:A 319 92 0.1096 0.0784 0.2717 3.2
15 6cg6:A 207 165 0.1754 0.1932 0.2424 2.24e-05
16 6cg6:A 207 91 0.1272 0.1401 0.3187 0.081
17 5szr:A 424 237 0.2632 0.1415 0.2532 4.62e-05 5szr:B, 5szr:C
18 8egx:A 421 137 0.1754 0.0950 0.2920 4.78e-05 8egw:A
19 8egx:A 421 166 0.1842 0.0998 0.2530 0.21 8egw:A
20 6cgs:A 207 153 0.1974 0.2174 0.2941 4.91e-05 6cgs:B
21 6cgs:A 207 111 0.1360 0.1498 0.2793 1.8 6cgs:B
22 5czr:B 216 83 0.1053 0.1111 0.2892 1.11e-04 5czr:A, 5czr:C, 5czr:D, 7n86:A, 7n86:B, 7n86:C, 7n86:D
23 6e6b:A 633 236 0.2588 0.0932 0.2500 1.71e-04 6e6b:B
24 6e6b:A 633 240 0.2456 0.0885 0.2333 8.97e-04 6e6b:B
25 6cg7:A 207 166 0.1930 0.2126 0.2651 2.56e-04 6cg7:B
26 6cg7:A 207 121 0.1447 0.1594 0.2727 0.73 6cg7:B
27 6cgu:A 207 165 0.1798 0.1981 0.2485 5.36e-04 6cgu:B, 6cgu:C, 6cgu:D, 3lnd:A, 3lnd:B, 3lnd:C, 3lnd:D
28 6cgu:A 207 91 0.1140 0.1256 0.2857 1.3 6cgu:B, 6cgu:C, 6cgu:D, 3lnd:A, 3lnd:B, 3lnd:C, 3lnd:D
29 4zpm:A 317 90 0.1096 0.0789 0.2778 5.60e-04 4zpm:B
30 5tpk:A 202 208 0.2412 0.2723 0.2644 0.001
31 5szq:A 422 112 0.1623 0.0877 0.3304 0.002
32 5szq:A 422 233 0.2368 0.1280 0.2318 0.61
33 6vfr:A 428 89 0.1228 0.0654 0.3146 0.002 6vfr:B
34 6vg4:A 646 237 0.2325 0.0820 0.2236 0.003 6vfq:A, 6vfw:A, 6vfw:B, 6vfw:C, 6vfw:D, 6vfw:E
35 6vg4:A 646 191 0.1886 0.0666 0.2251 1.1 6vfq:A, 6vfw:A, 6vfw:B, 6vfw:C, 6vfw:D, 6vfw:E
36 6vg4:A 646 112 0.1272 0.0449 0.2589 1.1 6vfq:A, 6vfw:A, 6vfw:B, 6vfw:C, 6vfw:D, 6vfw:E
37 5t9t:A 526 99 0.1184 0.0513 0.2727 0.003 5t9t:B
38 4zpl:A 316 136 0.1667 0.1203 0.2794 0.004
39 4zi8:B 323 90 0.1184 0.0836 0.3000 0.006 4zi8:A
40 7rgf:A 418 240 0.2325 0.1268 0.2208 0.007 7jgz:A, 7rgf:B
41 5w4t:C 316 232 0.2325 0.1677 0.2284 0.007 5w4t:A, 5w4t:B, 5w4t:D
42 5dzv:B 522 168 0.1579 0.0690 0.2143 0.009 5dzv:A
43 5w1d:A 405 169 0.1754 0.0988 0.2367 0.010 6bwn:A, 6bxu:A, 6bxu:B
44 5vt8:C 211 227 0.2368 0.2559 0.2379 0.014 5vt8:B, 5vt8:A, 5vt8:D
45 5szo:B 414 126 0.1404 0.0773 0.2540 0.019 5szo:A, 5szp:A, 5szp:B
46 5szo:B 414 166 0.1886 0.1039 0.2590 0.039 5szo:A, 5szp:A, 5szp:B
47 5v5x:D 427 126 0.1404 0.0749 0.2540 0.035 5v5x:A, 5v5x:B, 5v5x:C
48 5v5x:D 427 107 0.1272 0.0679 0.2710 3.0 5v5x:A, 5v5x:B, 5v5x:C
49 5v5x:D 427 111 0.1272 0.0679 0.2613 6.0 5v5x:A, 5v5x:B, 5v5x:C
50 6vft:C 420 241 0.2018 0.1095 0.1909 0.047 6vft:A, 6vft:B, 6vft:D
51 1l3w:A 540 99 0.1053 0.0444 0.2424 0.058 1q55:A, 1q55:B, 1q55:C, 1q55:D, 1q5a:A, 1q5a:B, 1q5b:A, 1q5b:B, 1q5b:C, 1q5c:A, 1q5c:B, 1q5c:C, 1q5c:D
52 1l3w:A 540 62 0.0921 0.0389 0.3387 7.6 1q55:A, 1q55:B, 1q55:C, 1q55:D, 1q5a:A, 1q5a:B, 1q5b:A, 1q5b:B, 1q5b:C, 1q5c:A, 1q5c:B, 1q5c:C, 1q5c:D
53 5dzy:B 415 167 0.1886 0.1036 0.2575 0.26 5dzx:A, 5dzx:B, 5dzy:D, 5dzy:A, 5dzy:C, 5dzy:E, 5dzy:F
54 6pim:A 200 118 0.1360 0.1550 0.2627 0.28
55 6vfp:A 439 118 0.1316 0.0683 0.2542 0.30 6bx7:A, 6mga:A
56 6vfu:C 428 216 0.1974 0.1051 0.2083 0.37 6vfu:A, 6vfu:B
57 7uqu:BBB 108 111 0.1404 0.2963 0.2883 0.37
58 8pq7:C 289 74 0.0877 0.0692 0.2703 0.38 8pq7:A
59 7pvn:B 990 87 0.1140 0.0263 0.2989 0.46 7sol:C
60 8egx:B 425 242 0.2500 0.1341 0.2355 0.68 8egw:B
61 2o5c:A 634 62 0.0877 0.0315 0.3226 0.75 1i7d:A, 2o19:A, 2o19:B, 2o54:A, 2o54:B, 2o59:A, 2o59:B, 2o5c:B, 2o5e:A, 2o5e:B
62 2a4e:A 208 91 0.1184 0.1298 0.2967 0.78
63 7sgx:D 208 237 0.2412 0.2644 0.2321 0.80 7n4p:A, 7scm:A, 7scm:B, 7sgx:A, 7sgx:B, 7sgx:C
64 5jpf:A 290 74 0.0921 0.0724 0.2838 0.80
65 1tvp:B 291 60 0.0833 0.0653 0.3167 0.81
66 3mvs:A 210 93 0.1228 0.1333 0.3011 1.1 4apx:A, 4aq8:A, 4aq8:B, 4aqa:A, 4aqe:A, 4axw:A, 6n2e:C, 6n2e:D, 7sb6:A, 7sb6:B, 7sb6:C, 2wbx:A, 2wcp:A, 2wd0:A, 2wd0:C, 2whv:A, 4xxw:C, 4xxw:D
67 5dzw:A 417 167 0.1316 0.0719 0.1796 1.4
68 6s6t:A 1472 67 0.0877 0.0136 0.2985 1.8 6s6s:A, 6s6s:B, 6s6s:C, 6s6s:D, 6s6t:B, 6s6t:C, 6s6t:D, 6s6u:A, 6s6u:B, 6s6u:C, 6s6u:D, 6s6u:E, 6s6u:F, 6s6x:A, 6s6x:B, 6s6x:C, 6s6x:D, 6s6x:E, 6s6x:F, 2vdc:A, 2vdc:B, 2vdc:C, 2vdc:D, 2vdc:E, 2vdc:F
69 1ea0:A 1452 67 0.0877 0.0138 0.2985 1.9 1ea0:B
70 5ypz:A 480 108 0.1009 0.0479 0.2130 2.2 5ypz:C, 5ypz:B
71 7sol:A 1011 75 0.0965 0.0218 0.2933 2.3 7pvn:A
72 8e51:B 206 227 0.2237 0.2476 0.2247 2.3
73 8e51:B 206 90 0.1140 0.1262 0.2889 4.9
74 6vg1:A 642 237 0.2281 0.0810 0.2194 2.4 6vg1:B
75 5vvm:B 314 184 0.1798 0.1306 0.2228 2.4 5vvm:A
76 5iry:A 539 105 0.1096 0.0464 0.2381 2.6 5iry:B
77 3k5s:A 217 95 0.1228 0.1290 0.2947 2.7 3k5s:B, 3k6i:A
78 5vh2:A 209 90 0.1184 0.1292 0.3000 2.9 5vh2:B, 5vh2:C, 5vh2:D
79 4xhz:A 333 123 0.1491 0.1021 0.2764 3.1
80 4xhz:A 333 119 0.1447 0.0991 0.2773 5.3
81 7stz:C 540 225 0.2149 0.0907 0.2178 3.3 6cxy:C, 3ff8:A, 3ff8:B, 8h62:B, 1o6s:B, 2o72:A, 2omt:B, 2omv:B, 2omx:B, 2omy:B, 7stz:D, 6vel:C, 4zt1:A, 4zt1:B, 4zte:A, 4zte:B
82 7rxg:B 650 57 0.0658 0.0231 0.2632 3.9 7rxg:A, 7rxh:A
83 6vjb:A 1346 49 0.0702 0.0119 0.3265 3.9
84 7rx2:B 615 57 0.0658 0.0244 0.2632 3.9 6e0h:B, 6e0h:A, 6e1o:B, 6e1o:A, 7rwj:B, 7rwj:A, 7rx2:A
85 7rx3:B 591 57 0.0658 0.0254 0.2632 4.1 7rx3:A, 7rxa:A, 7rxa:B
86 5h2d:A 418 55 0.0746 0.0407 0.3091 4.6 5wvr:A
87 3q2w:A 541 82 0.0921 0.0388 0.2561 5.6 1ncj:A, 4num:A, 4num:B, 4num:C, 4num:D, 4nup:A, 4nup:B, 4nup:C, 4nuq:A, 2qvi:A
88 5szm:A 416 89 0.1096 0.0601 0.2809 5.6 4zps:A
89 1ulc:A 150 75 0.0877 0.1333 0.2667 6.0 1ulc:B, 1uld:A, 1uld:B, 1uld:C, 1uld:D, 1ule:A, 1ule:B, 1ulf:A, 1ulf:B, 1ulg:A, 1ulg:B, 1ulg:C, 1ulg:D, 2wkk:A, 2wkk:B, 2wkk:C, 2wkk:D
90 5xxz:B 1310 49 0.0702 0.0122 0.3265 6.6
91 7edd:A 1394 49 0.0702 0.0115 0.3265 6.6 5xyr:A
92 5szl:C 418 238 0.2412 0.1316 0.2311 6.6 5szl:A, 5szl:B, 5szl:D, 4zi9:A, 4zi9:B
93 7cym:B 418 68 0.0702 0.0383 0.2353 7.0 7cym:A, 7ev1:A, 7ev1:B, 6ulm:B, 6ulm:A
94 5xya:A 1358 49 0.0702 0.0118 0.3265 7.0 5xxz:A
95 7t3s:A 210 104 0.1272 0.1381 0.2788 8.6 7uqu:AAA

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218