Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SPRVVRIVKSESGYGFNVRGQVSEGGQLRSINGELYAPLQHVSAVLPGGAADRAGVRKGDRILEVNGVNVEGATHKQVVD
LIRAGEKELILTVLSV

The query sequence (length=96) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7pcb:A 415 95 0.9792 0.2265 0.9895 5.48e-60 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
2 2m0v:A 128 94 0.3854 0.2891 0.3936 4.53e-14
3 2m0u:A 117 83 0.3542 0.2906 0.4096 6.41e-14
4 6yx0:B 112 88 0.3542 0.3036 0.3864 2.05e-13 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
5 6ezi:A 86 93 0.3646 0.4070 0.3763 3.22e-11 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
6 6x23:A 89 77 0.3021 0.3258 0.3766 1.85e-10
7 2m0z:A 97 80 0.3646 0.3608 0.4375 4.82e-10 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
8 5izu:A 124 88 0.3854 0.2984 0.4205 8.40e-10 6exj:A, 6exj:C, 5izu:C, 5ovc:A, 5ovp:A, 5ovv:A
9 3jxt:A 96 84 0.3542 0.3542 0.4048 2.73e-09 3jxt:B
10 1rzx:A 98 95 0.3542 0.3469 0.3579 3.73e-08 5i7z:A, 1x8s:A
11 2os6:A 89 84 0.3333 0.3596 0.3810 4.35e-08
12 5heb:A 119 93 0.3646 0.2941 0.3763 1.68e-07 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
13 3o5n:E 92 61 0.3229 0.3370 0.5082 2.00e-07
14 6xa7:B 96 92 0.3333 0.3333 0.3478 2.69e-07 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
15 4wyu:A 201 52 0.2708 0.1294 0.5000 4.48e-07 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
16 4wyu:A 201 44 0.2188 0.1045 0.4773 0.004 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
17 8b82:A 108 42 0.2292 0.2037 0.5238 4.56e-07 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
18 2kqf:A 96 82 0.3333 0.3333 0.3902 6.06e-07 2kyl:A
19 2egn:A 83 53 0.2396 0.2771 0.4340 3.28e-06
20 2qt5:A 194 53 0.1979 0.0979 0.3585 3.84e-06 2qt5:B
21 2r4h:C 98 83 0.2812 0.2755 0.3253 6.45e-06
22 5wou:A 95 52 0.2188 0.2211 0.4038 8.95e-06
23 3bpu:A 86 91 0.3229 0.3605 0.3407 1.56e-05
24 5oak:A 90 44 0.2083 0.2222 0.4545 1.72e-05 5oak:C
25 6hks:B 94 97 0.3229 0.3298 0.3196 3.43e-05 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
26 5zys:A 90 85 0.2604 0.2778 0.2941 3.55e-05
27 7pc3:A 405 80 0.2604 0.0617 0.3125 3.77e-05 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
28 4e34:A 87 56 0.2292 0.2529 0.3929 4.52e-05 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
29 5ez0:D 95 97 0.3333 0.3368 0.3299 1.26e-04 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
30 7x2e:A 163 54 0.1875 0.1104 0.3333 1.34e-04 2kbs:A
31 4xh7:A 110 43 0.1771 0.1545 0.3953 1.80e-04
32 8bv7:A 95 54 0.1875 0.1895 0.3333 1.88e-04 8buw:A, 8buw:B
33 4ydp:A 83 60 0.1771 0.2048 0.2833 2.40e-04 4ydp:B
34 7p73:A 420 80 0.2812 0.0643 0.3375 2.49e-04 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
35 7pc5:A 405 82 0.2396 0.0568 0.2805 3.52e-04
36 2i0i:A 81 71 0.2812 0.3333 0.3803 3.54e-04 2i0i:B, 2i0i:C
37 4wsi:A 372 42 0.1667 0.0430 0.3810 3.62e-04 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
38 7weg:B 96 82 0.2292 0.2292 0.2683 5.62e-04 7weg:A
39 7p70:A 407 93 0.3021 0.0713 0.3118 5.63e-04 7pc4:A, 7qql:A
40 7qqn:C 414 35 0.1667 0.0386 0.4571 6.78e-04 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
41 2pdz:A 86 53 0.2083 0.2326 0.3774 7.40e-04
42 2kpl:A 129 82 0.2812 0.2093 0.3293 8.21e-04
43 2l4t:A 124 37 0.1667 0.1290 0.4324 8.70e-04 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
44 1ihj:B 95 53 0.1771 0.1789 0.3208 0.001 1ihj:A
45 8bq8:C 93 76 0.2604 0.2688 0.3289 0.001 8bq8:A, 8bq8:B
46 5n7d:A 423 79 0.2917 0.0662 0.3544 0.002 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
47 3vqg:A 85 50 0.1979 0.2235 0.3800 0.003
48 5t63:A 283 37 0.1771 0.0601 0.4595 0.006 5b6l:A, 5gnd:A
49 7d6f:A 87 40 0.1771 0.1954 0.4250 0.007
50 6kz1:A 97 80 0.2500 0.2474 0.3000 0.014 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
51 1zub:A 109 48 0.1875 0.1651 0.3750 0.020
52 7xft:A 86 38 0.1667 0.1860 0.4211 0.020
53 3pv3:A 392 45 0.1771 0.0434 0.3778 0.038 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
54 2ejy:A 85 48 0.1979 0.2235 0.3958 0.058
55 3cs0:A 392 67 0.2188 0.0536 0.3134 0.063 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
56 7qqm:A 413 90 0.2604 0.0605 0.2778 0.082
57 8c1t:A 90 54 0.1771 0.1889 0.3148 0.11 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
58 8htg:B 334 55 0.2083 0.0599 0.3636 0.12 8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
59 8kic:A 300 27 0.1458 0.0467 0.5185 0.13 8kic:C, 8kic:B, 3stj:A, 3stj:B, 3stj:C, 3stj:D, 3stj:E, 3stj:F, 3stj:G, 3stj:H, 3stj:I, 3stj:J, 3stj:K, 3stj:L, 8w69:A, 8w69:C, 8w69:B
60 1n7t:A 103 88 0.2292 0.2136 0.2500 0.14 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
61 4ynn:A 400 45 0.1771 0.0425 0.3778 0.19 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
62 4gvc:A 94 81 0.2500 0.2553 0.2963 0.19 4gvd:A, 4gvd:B, 3kze:A, 3kze:B, 3kze:C, 4nxq:A, 4nxq:B, 4nxq:C, 4nxr:A
63 6nid:B 88 43 0.1562 0.1705 0.3488 0.20 6nid:A, 6nid:C
64 2kaw:A 90 44 0.1458 0.1556 0.3182 0.21 6lcb:A, 2mx6:A
65 3ch8:A 190 81 0.2188 0.1105 0.2593 0.23 2qbw:A
66 6zbq:A 89 44 0.1354 0.1461 0.2955 0.25 6zc4:A
67 1l6o:A 95 70 0.2083 0.2105 0.2857 0.25 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
68 8blu:B 195 65 0.1979 0.0974 0.2923 0.38 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
69 8sxg:A 366 33 0.1250 0.0328 0.3636 0.42 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
70 2exg:A 101 43 0.1562 0.1485 0.3488 0.48 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
71 7w6x:A 447 23 0.1250 0.0268 0.5217 0.63
72 6ar4:B 87 60 0.1875 0.2069 0.3000 0.92 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
73 6eg8:I 372 55 0.1875 0.0484 0.3273 1.5 6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
74 6yxx:EN 638 29 0.1354 0.0204 0.4483 1.8 6yxy:EN
75 6ex6:A 634 89 0.2396 0.0363 0.2584 2.1 6ex6:B
76 3tsz:A 341 38 0.1354 0.0381 0.3421 2.7 3shw:A
77 2joa:A 105 64 0.1771 0.1619 0.2656 2.9
78 4rf7:B 700 79 0.2500 0.0343 0.3038 3.6 4rf7:A, 4rf8:A, 4rf8:B, 4rf9:A, 4rf9:B
79 4rf7:B 700 77 0.2500 0.0343 0.3117 6.8 4rf7:A, 4rf8:A, 4rf8:B, 4rf9:A, 4rf9:B
80 6lbp:A 460 42 0.1667 0.0348 0.3810 4.0 6lbp:B
81 8tua:A 1329 44 0.1771 0.0128 0.3864 5.4 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
82 5fp2:B 538 61 0.1771 0.0316 0.2787 5.8
83 2dw6:A 388 26 0.1354 0.0335 0.5000 5.8 2dw6:B, 2dw6:C, 2dw6:D, 2dw7:A, 2dw7:B, 2dw7:C, 2dw7:D, 2dw7:E, 2dw7:F, 2dw7:G, 2dw7:H, 2dw7:I, 2dw7:J, 2dw7:K, 2dw7:L, 2dw7:M, 2dw7:N, 2dw7:O, 2dw7:P, 1tzz:A, 1tzz:B
84 7z42:C 718 40 0.1771 0.0237 0.4250 5.8
85 6qcs:C 742 40 0.1771 0.0229 0.4250 5.9 8bdr:C, 8be0:C, 8bf5:C, 5efa:A, 5efc:A, 6f5o:C, 5m3j:C, 5msg:C, 4or4:A, 4or4:B, 4or6:A, 4or6:B, 4oro:A, 4oro:B, 4oro:C, 4oro:D, 4q46:A, 4q46:B, 6qct:C, 6qcv:C, 6qcw:C, 6qcx:C, 7r1f:C, 6t0w:C, 4wrt:C, 4wsa:C, 7z42:F, 7z43:CCC
86 5fp2:A 499 61 0.1771 0.0341 0.2787 6.1
87 2bdg:A 223 27 0.1146 0.0493 0.4074 7.3 2bdg:B, 2bdh:A, 2bdh:B, 2bdh:C, 2bdh:D, 2bdi:A, 2bdi:B, 2bdi:C, 2bdi:D, 2bdi:E, 2bdi:F, 2bdi:G, 2bdi:H, 2bdi:I, 2bdi:J, 2bdi:K, 2bdi:L, 2bdi:M, 2bdi:N, 2bdi:O, 2bdi:P, 4k1e:A, 4k8y:A, 4kel:A, 4kga:A, 4kga:B, 6o21:A
88 4kem:A 390 17 0.1042 0.0256 0.5882 9.0 4kem:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417