BioLiP

>protein
SMRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGE
TSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSED
QLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGAS
LKVEDFVQLLEGAK

The query sequence (length=254) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3uwv:A	255	254	1.0000	0.9961	1.0000	0.0	3uwu:A, 3uwu:B, 3uwv:B, 3uww:A, 3uww:B, 3uwz:A, 3uwz:B
2	1btm:A	251	253	0.5709	0.5777	0.5731	1.64e-102	1btm:B, 2btm:A, 2btm:B
3	6bve:A	242	251	0.4449	0.4669	0.4502	2.74e-70	6bve:B
4	6nee:B	252	248	0.4646	0.4683	0.4758	2.80e-70	6nee:A
5	8w06:B	251	248	0.4567	0.4622	0.4677	8.13e-70	8v09:A, 8v0a:B, 8w06:A, 8w06:C, 8w06:D, 8w06:E, 8w06:F, 8w06:G, 8w06:H
6	4y96:A	250	251	0.4331	0.4400	0.4382	1.36e-67	4y96:B
7	3tao:A	256	252	0.4449	0.4414	0.4484	4.09e-66
8	4mva:A	255	256	0.4291	0.4275	0.4258	2.53e-63	4mva:B
9	1aw1:A	255	241	0.4134	0.4118	0.4357	4.03e-63	1aw1:B, 1aw1:D, 1aw1:E, 1aw1:G, 1aw1:H, 1aw1:J, 1aw1:K
10	5eyw:A	244	248	0.4055	0.4221	0.4153	9.36e-58	5eyw:B
11	4ff7:A	247	248	0.4055	0.4170	0.4153	1.14e-57	4ff7:B, 7tim:A, 7tim:B, 2ypi:A, 2ypi:B, 3ypi:A, 3ypi:B
12	6ooi:C	255	243	0.3937	0.3922	0.4115	3.44e-57	6ooi:A, 6ooi:B, 6ooi:D, 6ooi:E, 6ooi:F, 6ooi:G, 6ooi:H
13	5zfx:B	248	248	0.3898	0.3992	0.3992	7.73e-57
14	4bi7:A	256	253	0.4252	0.4219	0.4269	4.80e-56	4bi6:A, 3pf3:A
15	1ssg:A	247	248	0.4173	0.4291	0.4274	2.95e-55	1ssg:B, 1su5:A, 1su5:B, 1sw0:A, 1sw0:B, 1sw3:A, 1sw3:B, 1sw7:A, 1sw7:B, 1tpb:1, 1tpb:2, 1tpc:1, 1tpc:2, 1tph:1, 1tph:2, 1tpu:A, 1tpu:B, 1tpv:A, 1tpv:B, 1tpw:A, 1tpw:B
16	6oog:A	252	253	0.3858	0.3889	0.3874	9.23e-54
17	1hti:B	248	248	0.4134	0.4234	0.4234	1.70e-53	4owg:A, 4owg:B, 4poc:B, 4pod:B, 1r2r:B, 7rde:B, 7t0q:A, 6up5:B, 6upf:A, 6upf:B, 7uxv:A, 7uxv:B
18	4y90:A	244	250	0.4016	0.4180	0.4080	2.40e-53	4y90:B, 4y90:C, 4y90:D
19	5gzp:A	246	252	0.3780	0.3902	0.3810	2.72e-52	5gv4:A, 5gzp:B, 1lyx:A, 1lzo:B, 1lzo:D, 1m7p:A, 1m7p:B, 1o5x:A, 1o5x:B, 3pvf:A, 1woa:A, 1woa:B, 1woa:C, 1woa:D, 1wob:A, 1wob:B, 1wob:C, 1wob:D
20	1amk:A	250	240	0.3701	0.3760	0.3917	2.05e-50	7abx:A, 7az3:A, 7az4:A, 7az9:A, 7aza:A, 1if2:A, 1n55:A, 1qds:A, 2vxn:A, 2y61:A, 2y62:A, 2y63:A
21	1ci1:B	249	250	0.3819	0.3896	0.3880	3.46e-50
22	1ag1:T	249	250	0.3780	0.3855	0.3840	1.63e-47	5i3h:B, 5i3i:A, 5i3i:B, 5i3i:C, 5i3i:D, 5i3k:B, 5i3k:C, 5i3k:D, 1iig:B, 2j27:A, 2j27:B, 1kv5:A, 1kv5:B, 4tim:B, 6tim:B, 1trd:B, 1tsi:A, 2v2c:A
23	2y6z:A	256	247	0.3543	0.3516	0.3644	8.37e-42	1ml1:A, 1ml1:C, 1ml1:E, 1ml1:G, 1ml1:I, 1ml1:K, 4pc8:A, 1tti:A, 1ttj:A, 2v2h:A, 2v2h:B, 2v2h:C, 2vek:B, 2vel:A, 2vel:B, 2vem:A, 2vem:B, 2wsr:A, 2x1r:A, 2x1r:B, 2x1s:A, 2x1s:B, 2x1t:B
24	2jgq:A	231	190	0.2638	0.2900	0.3526	5.89e-28	2jgq:B
25	5csr:C	220	99	0.1339	0.1545	0.3434	0.018	5csr:A, 5csr:B, 5csr:D, 5css:A, 5css:B, 5css:C, 5css:D
26	7ol9:B	203	81	0.0866	0.1084	0.2716	0.11	7ol9:A, 6y93:A, 6y93:B
27	1hg3:A	224	179	0.1654	0.1875	0.2346	0.50	1hg3:B, 1hg3:C, 1hg3:D, 1hg3:E, 1hg3:F, 1hg3:G, 1hg3:H
28	2opo:C	85	34	0.0512	0.1529	0.3824	2.3	2opo:A, 2opo:B, 2opo:D
29	1h4b:A	84	34	0.0512	0.1548	0.3824	2.6
30	2xr7:A	452	68	0.0748	0.0420	0.2794	9.3
31	4rgb:A	274	35	0.0551	0.0511	0.4000	9.6	4rgb:B
32	4imm:A	331	219	0.2008	0.1541	0.2329	9.9	4imm:B

[Back]