BioLiP

>protein
SLPMLQVALDNQTMDSAYETTRLIAEEVDIIEVGTILCVGEGVRAVRDLKALYPHKIVLADAKIADAGKILSRMCFEANA
DWVTVICCADINTAKGALDVAKEFNGDVQIELTGYWTWEQAQQWRDAGIGQVVYHRSRDAQAAGVAWGEADITAIKRLSD
MGFKVTVTGGLALEDLPLFKGIPIHVFIAGRSIRDAASPVEAARQFKRSIAELWG

The query sequence (length=215) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1xbz:B	216	215	0.9860	0.9815	0.9860	2.77e-156	1kv8:A, 1kv8:B, 1kw1:A, 1kw1:B, 1q6l:A, 1q6l:B, 1q6o:A, 1q6o:B, 1q6q:A, 1q6q:B, 1q6r:A, 1q6r:B, 1so3:A, 1so3:B, 1so4:A, 1so4:B, 1so5:A, 1so5:B, 1so6:A, 1so6:B, 1xbv:A, 1xbv:B, 1xbx:A, 1xbx:B, 1xby:A, 1xby:B, 1xbz:A
2	3exs:D	218	217	0.4744	0.4679	0.4700	4.98e-67	3exs:A, 3ext:A
3	3jr2:C	214	212	0.4372	0.4393	0.4434	1.54e-57	3jr2:A, 3jr2:B, 3jr2:D
4	3ajx:A	207	139	0.2605	0.2705	0.4029	7.80e-22	3ajx:B, 3ajx:C, 3ajx:D
5	4muz:A	212	219	0.2884	0.2925	0.2831	1.29e-09	4muz:B
6	1dvj:A	239	107	0.1349	0.1213	0.2710	2.11e-05	1dvj:B, 1dvj:C, 1dvj:D, 2e6y:A, 2e6y:B, 4fx6:M, 4fx6:N, 4fx8:A, 4fx8:B, 4fxr:A, 4fxr:B, 3g1a:A, 3g1a:B, 3g1d:A, 3g1d:B, 3g1f:A, 3g1f:B, 3g1f:C, 3g1f:D, 3g1f:E, 3g1f:F, 3g1f:G, 3g1f:H, 3g1f:I, 3g1f:J, 3g1f:K, 3g1f:L, 3g1f:M, 3g1h:A, 3g1h:B, 3g1h:C, 3g1h:D, 3g1h:E, 3g1h:F, 3g1h:G, 3g1h:H, 3g1h:I, 3g1h:J, 3g1h:K, 3g1h:L, 3g1h:M, 3g1v:A, 3g1v:B, 3g1x:A, 3g1x:B, 3g22:A, 3g22:B, 3g24:A, 3g24:B, 4gc4:A, 4gc4:B, 1kly:A, 1klz:A, 1km0:A, 1km0:B, 1km0:C, 1km0:D, 1km1:A, 1km1:B, 1km2:A, 1km3:A, 1km4:A, 1km5:A, 1km6:A, 4lc6:A, 4lc6:B, 4lc8:A, 4lc8:B, 3lht:A, 3lht:B, 3lhu:A, 3lhu:B, 3lhv:A, 3lhv:B, 3lhv:C, 3lhv:D, 3lhw:A, 3lhw:B, 3lhy:A, 3lhy:B, 3lhz:A, 3lhz:B, 3li0:A, 3li0:B, 3li1:A, 3li1:B, 3lld:A, 3lld:B, 3llf:A, 3llf:B, 1lol:A, 1lol:B, 1loq:A, 1lor:A, 1los:A, 1los:B, 1los:C, 1los:D, 1lp6:A, 1lp6:B, 3ltp:A, 3ltp:B, 3lts:A, 3lts:B, 3lty:A, 3lty:B, 3lv5:A, 3lv5:B, 3lv6:A, 3lv6:B, 4lw7:A, 4lw7:B, 3m1z:A, 3m1z:B, 3nq6:A, 3nq6:B, 3nq7:A, 3nq7:B, 3nqa:A, 3nqa:B, 3nqc:A, 3nqc:B, 3nqd:A, 3nqd:B, 3nqe:A, 3nqe:B, 3nqf:A, 3nqf:B, 3nqg:A, 3nqg:B, 3nqm:A, 3nqm:B, 4nt0:A, 4nt0:B, 4nuw:A, 4nuw:B, 4nx5:A, 4nx5:B, 4o11:A, 4o11:B, 4o8r:A, 4o8r:B, 4o8r:C, 4o8r:D, 4o8r:E, 4o8r:F, 4o8r:G, 4o8r:H, 4o8r:I, 4o8r:J, 4o8r:K, 4o8r:L, 4o8r:M, 3p5y:A, 3p5y:B, 3p5z:A, 3p5z:B, 3p60:A, 3p60:B, 3p61:A, 3p61:B, 3pbu:A, 3pbu:B, 3pbv:A, 3pbv:B, 3pbw:A, 3pbw:B, 3pby:A, 3pby:B, 3pc0:A, 3pc0:B, 3qez:A, 3qez:B, 3qf0:A, 3qf0:B, 3qmr:A, 3qmr:B, 3qms:A, 3qms:B, 3qmt:A, 3qmt:B, 3rlu:A, 3rlu:B, 3rlv:A, 3rlv:B, 3sec:A, 3sgu:A, 3siz:A, 3siz:B, 3sj3:A, 3sj3:B, 3ssj:A, 3sw6:A, 3sy5:A, 3sy5:B, 3thq:A, 3thq:B, 3v1p:A, 3v1p:B, 3w07:A, 3wjw:A, 3wjx:A, 3wjy:A, 3wjz:A, 3wk0:A, 3wk1:A, 3wk2:A, 3wk3:A, 1x1z:A, 1x1z:B, 2zz1:A, 2zz1:B, 2zz2:A, 2zz2:B, 2zz3:A, 2zz3:B, 2zz4:A, 2zz4:B, 2zz5:A, 2zz5:B, 2zz6:A, 2zz6:B, 2zz7:A
7	4luj:A	214	216	0.2651	0.2664	0.2639	3.92e-05	4luj:B
8	2cze:A	208	85	0.1256	0.1298	0.3176	0.003	2cze:B, 2czf:A, 2czf:B
9	3r4c:A	268	80	0.1070	0.0858	0.2875	1.2
10	6br7:B	125	60	0.0698	0.1200	0.2500	2.6	6br7:A, 6vbf:A, 6vbf:B
11	6s85:B	356	92	0.1070	0.0646	0.2500	4.5	7yzp:B
12	7ye1:C	1312	46	0.0744	0.0122	0.3478	4.8	7ye2:C
13	7en2:B	1410	85	0.1023	0.0156	0.2588	4.9	7emy:A, 7emy:B, 7en1:A, 7en1:B, 7en2:A
14	5ld5:C	342	32	0.0698	0.0439	0.4688	5.4	5ld5:A, 5ld5:B, 5ld5:D
15	7eof:B	181	54	0.0605	0.0718	0.2407	6.8
16	2jgd:A	812	60	0.0837	0.0222	0.3000	7.0	2jgd:B
17	7qh2:A	337	47	0.0698	0.0445	0.3191	7.5	7qh2:D
18	6bwj:B	617	60	0.0744	0.0259	0.2667	8.0	6bwj:A, 6oo3:A, 6oo3:B, 6oo3:C, 6oo3:D, 6oo4:A, 6oo4:D, 6oo4:B, 6oo4:C, 6oo5:A, 6oo5:B, 6oo5:C, 6oo5:D, 6oo7:A, 6oo7:B, 6oo7:C, 6oo7:D
19	2ffc:A	318	24	0.0465	0.0314	0.4167	9.5	2guu:A

[Back]