Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SLPGSKSITARALFLAAAADGVTTLVRPLRSDDTEGFAEGLVRLGYRVGRTPDTWQVDGRPQGPAVAEADVYCRDGATTA
RFLPTLAAAGHGTYRFDASPQMRRRPLLPLSRALRDLGVDLRHEEAEGHHPLTVRAAGVEGGEVTLDAGQSSQYLTALLL
LGPLTRQGLRIRVAPYVEITLAMMRAFGVEVAREGDVFVVPPGGYRATTYAIEPDASTASYFFAAAALTPGAEVTVPGLG
TGALQGDLGFVDVLRRMGAEVSVGADATTVRGTGELRGLTANMRDISDTMPTLAAIAPFASAPVRIEDVANTRVKECDRL
EACAENLRRLGVRVATGPDWIEIHPGPATGAQVTSYGDHRIVMSFAVTGLRVPGISFDDPGCVRKTFPGFHEAFAELRRG

The query sequence (length=400) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7m0o:A 400 400 1.0000 1.0000 1.0000 0.0
2 3nvs:A 426 412 0.3925 0.3685 0.3811 1.63e-79
3 2aa9:A 427 412 0.3875 0.3630 0.3762 1.62e-69 2aay:A, 3fjx:A, 3fjz:A, 3fk0:A, 3fk1:A, 1g6s:A, 1g6t:A, 1mi4:A, 2pq9:A, 1q36:A, 2qfq:A, 2qfs:A, 2qft:A, 2qfu:A, 1x8r:A, 1x8t:A
4 7tm5:B 427 410 0.3775 0.3536 0.3683 2.25e-67 7tm5:A, 7tm6:A, 7tm6:B
5 8umj:A 443 427 0.3850 0.3476 0.3607 8.51e-60 8umj:B, 8umk:A, 8umk:B, 8uml:A, 8uml:B, 8umm:A, 8umm:B, 8umn:A, 8umn:B
6 7tbu:A 450 430 0.3625 0.3222 0.3372 6.42e-57 7tbu:B
7 6hqv:A 1555 426 0.3450 0.0887 0.3239 1.31e-50 6hqv:B
8 2o0b:A 424 413 0.3675 0.3467 0.3559 3.44e-45 2o0d:A, 2o0e:A, 2o0x:A, 2o0z:A
9 3slh:D 440 421 0.3025 0.2750 0.2874 5.57e-29 4egr:A, 4egr:B, 4egr:C, 4egr:D, 4egr:E, 4egr:F, 3slh:A, 3slh:B, 3slh:C, 4znd:A
10 2gg6:A 445 428 0.2925 0.2629 0.2734 7.72e-28 2gga:A, 2ggd:A, 2pqb:A, 2pqc:A, 2pqd:A
11 1rf4:A 427 416 0.2325 0.2178 0.2236 2.24e-21 1rf4:B, 1rf4:C, 1rf4:D, 1rf6:A, 1rf6:B, 1rf6:C, 1rf6:D
12 6cn1:A 422 174 0.1175 0.1114 0.2701 0.002 6cn1:B, 6cn1:C, 6cn1:D, 6cn1:E, 6cn1:F, 6cn1:G, 6cn1:H
13 6cn1:A 422 82 0.0575 0.0545 0.2805 9.6 6cn1:B, 6cn1:C, 6cn1:D, 6cn1:E, 6cn1:F, 6cn1:G, 6cn1:H
14 8u2r:A 664 88 0.0600 0.0361 0.2727 0.044 8sf3:A, 8u2s:A, 8u2s:B, 8u2t:A, 8u2u:A
15 5bq2:A 425 174 0.1125 0.1059 0.2586 0.048 5bq2:B, 5bq2:C, 5bq2:D
16 7cu1:A 535 95 0.0700 0.0523 0.2947 0.13 8ad7:A, 8ad8:A, 7aqu:A, 7aqu:B, 7cu0:A, 7cu0:B, 7cu1:B, 7cu2:A, 7cu2:B, 6h44:A, 6h44:B, 6sls:A, 6sls:B, 6slt:A, 6slt:B
17 7zn6:A 576 141 0.0875 0.0608 0.2482 0.20
18 6q03:A 416 256 0.1400 0.1346 0.2188 0.54 6q0a:A, 6q0y:A, 6q11:A
19 5u4h:A 420 275 0.1675 0.1595 0.2436 0.75 5u4h:B
20 5u4h:A 420 92 0.0625 0.0595 0.2717 4.4 5u4h:B
21 3swg:A 417 86 0.0600 0.0576 0.2791 0.77 2yvw:A
22 5wi5:A 422 329 0.1875 0.1777 0.2280 0.85 6nkj:A, 6nkj:B, 5wi5:B, 5wi5:C, 5wi5:D
23 5o6b:A 528 70 0.0475 0.0360 0.2714 1.3 5o6b:B, 5o6d:A, 5o6d:B, 5o6e:A, 5o6e:B, 8xak:A
24 8xak:C 490 70 0.0425 0.0347 0.2429 1.5
25 5dn1:A 240 129 0.1075 0.1792 0.3333 1.8
26 4e7b:A 419 271 0.1500 0.1432 0.2214 2.2 1a2n:A, 4e7b:B, 4e7b:C, 4e7b:D, 4e7c:A, 4e7c:B, 4e7d:A, 4e7e:A, 4e7e:D, 4e7f:A, 1eyn:A, 3iss:A, 3iss:B, 3iss:C, 3iss:D, 3iss:E, 3iss:F, 3iss:G, 3iss:H, 3iss:I, 3iss:J, 3iss:K, 3iss:L, 3kqa:A, 3kqa:B, 3kqa:C, 3kqa:D, 3kqj:A, 3kr6:A, 3lth:A, 1q3g:A, 1q3g:B, 1q3g:C, 1q3g:D, 1q3g:E, 1q3g:F, 1q3g:G, 1q3g:H, 1q3g:I, 1q3g:J, 1q3g:K, 1q3g:L, 1q3g:W, 1q3g:X, 1q3g:Y, 1q3g:Z, 1ryw:A, 1ryw:B, 1ryw:C, 1ryw:D, 1ryw:E, 1ryw:F, 1ryw:G, 1ryw:H, 3su9:A, 3swa:A, 3swa:B, 3swd:A, 3swd:B, 3swd:C, 3swd:D, 3swd:E, 3swd:F, 3swd:G, 3swd:H, 3swd:I, 3swd:J, 3swd:K, 3swd:L, 3swi:A, 3swq:A, 1uae:A, 3upk:A, 3v4t:A, 3v4t:B, 3v4t:C, 3v4t:D, 3v4t:E, 3v4t:F, 3v4t:G, 3v4t:H, 1ybg:A, 1ybg:B, 1ybg:C, 1ybg:D, 2z2c:A, 2z2c:B, 2z2c:C, 2z2c:D
27 3rb8:A 314 66 0.0475 0.0605 0.2879 2.5 3j5v:a, 3r4v:A
28 4buc:A 427 67 0.0500 0.0468 0.2985 3.3 4buc:B
29 5u8u:D 477 75 0.0500 0.0419 0.2667 6.1 1lpf:A, 1lpf:B, 5u8u:A, 5u8u:B, 5u8u:C, 5u8v:A, 5u8v:B, 5u8v:C, 5u8v:D, 5u8w:A, 5u8w:B, 5u8w:C, 5u8w:D
30 3pzr:A 370 61 0.0425 0.0459 0.2787 6.3 1mb4:A, 1mb4:B, 3pzr:B, 3q0e:A, 3q0e:B, 4r5m:A, 4r5m:B
31 5cw2:C 319 25 0.0375 0.0470 0.6000 7.0 5cw2:A, 5cw2:B, 5cw2:D
32 7f19:A 444 156 0.1025 0.0923 0.2628 7.7 2yxv:A, 2yxv:B, 2yxw:A, 2yxw:B
33 3od3:A 488 156 0.1025 0.0840 0.2628 8.3 4e9q:A, 4e9r:A, 4e9s:A, 4e9t:A, 7f0v:A, 7f0v:B, 4hak:A, 4hal:A, 4ner:A, 3uaa:A, 3uab:A, 3uac:A, 3uad:A, 3uae:A
34 5b7e:A 477 156 0.1025 0.0860 0.2628 8.5 5b7f:A, 5b7m:A, 5b7m:B, 5b7m:C, 4ef3:A, 2fqd:A, 2fqe:A, 2fqf:A, 2fqg:A, 6im7:A, 1kv7:A, 1n68:A, 3nsc:A, 3nsd:A, 3nsy:A, 3nt0:A, 3pau:A, 3pav:A, 1pf3:A, 3qqx:A, 5ys1:A, 5ys5:A
35 3hyu:B 146 62 0.0425 0.1164 0.2742 9.6 3a0g:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218