Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSERGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIVH
KPGPITLTVAKS

The query sequence (length=92) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6zbq:A 89 92 0.9457 0.9775 0.9457 1.15e-56 6zc4:A
2 1l6o:A 95 89 0.9239 0.8947 0.9551 2.65e-56 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
3 2kaw:A 90 90 0.8587 0.8778 0.8778 2.20e-52 6lcb:A, 2mx6:A
4 8bq8:C 93 65 0.2935 0.2903 0.4154 1.04e-10 8bq8:A, 8bq8:B
5 2exg:A 101 93 0.4022 0.3663 0.3978 1.58e-10 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
6 8bp4:A 93 77 0.3043 0.3011 0.3636 6.22e-10 8bp4:C, 8bp4:B
7 2ka9:A 189 64 0.2935 0.1429 0.4219 5.42e-09 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
8 2ka9:A 189 65 0.2717 0.1323 0.3846 2.26e-06 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
9 2m0z:A 97 71 0.2935 0.2784 0.3803 7.06e-09 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
10 7p73:A 420 64 0.2826 0.0619 0.4062 1.32e-08 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
11 8cn1:H 101 65 0.2717 0.2475 0.3846 1.53e-08 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
12 7pc3:A 405 64 0.2826 0.0642 0.4062 1.91e-08 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
13 2koh:A 111 92 0.3478 0.2883 0.3478 1.51e-07 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
14 8bv7:A 95 48 0.2065 0.2000 0.3958 4.68e-07 8buw:A, 8buw:B
15 1b8q:A 127 76 0.2717 0.1969 0.3289 1.79e-05
16 6xa7:B 96 64 0.2391 0.2292 0.3438 3.53e-05 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
17 3jxt:A 96 60 0.2391 0.2292 0.3667 7.58e-05 3jxt:B
18 4xh7:A 110 75 0.2717 0.2273 0.3333 1.05e-04
19 4wyu:A 201 71 0.2826 0.1294 0.3662 1.06e-04 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
20 5zys:A 90 82 0.2935 0.3000 0.3293 1.72e-04
21 5heb:A 119 60 0.2500 0.1933 0.3833 2.29e-04 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
22 8c1t:A 90 64 0.2283 0.2333 0.3281 4.33e-04 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
23 4e34:A 87 74 0.2826 0.2989 0.3514 4.98e-04 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
24 1n7f:A 86 73 0.2609 0.2791 0.3288 8.23e-04 1n7f:B
25 4xhv:A 94 65 0.2391 0.2340 0.3385 0.001
26 7x2e:A 163 46 0.1848 0.1043 0.3696 0.002 2kbs:A
27 3tsz:A 341 47 0.1739 0.0469 0.3404 0.002 3shw:A
28 3cyy:B 81 40 0.1739 0.1975 0.4000 0.005 3cyy:A
29 2kpl:A 129 62 0.1957 0.1395 0.2903 0.009
30 8b82:A 108 77 0.2717 0.2315 0.3247 0.012 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
31 5n7d:A 423 62 0.1957 0.0426 0.2903 0.014 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
32 5f67:A 98 70 0.2500 0.2347 0.3286 0.020 5f67:B
33 7p70:A 407 60 0.2391 0.0541 0.3667 0.022 7pc4:A, 7qql:A
34 7qct:A 90 75 0.2065 0.2111 0.2533 0.023 7qct:B
35 7qqn:C 414 85 0.2826 0.0628 0.3059 0.024 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
36 6nid:B 88 59 0.1848 0.1932 0.2881 0.026 6nid:A, 6nid:C
37 6ar4:B 87 72 0.2065 0.2184 0.2639 0.042 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
38 2ejy:A 85 56 0.1848 0.2000 0.3036 0.042
39 6gbe:A 119 45 0.1413 0.1092 0.2889 0.047
40 1n7t:A 103 77 0.2609 0.2330 0.3117 0.049 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
41 7qqm:A 413 76 0.2500 0.0557 0.3026 0.049
42 2qt5:A 194 72 0.1957 0.0928 0.2500 0.053 2qt5:B
43 2qt5:A 194 47 0.1522 0.0722 0.2979 0.061 2qt5:B
44 3ch8:A 190 48 0.1630 0.0789 0.3125 0.091 2qbw:A
45 2jk8:A 291 39 0.1630 0.0515 0.3846 0.093 5nh2:A
46 6kz1:A 97 61 0.1848 0.1753 0.2787 0.11 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
47 2pdz:A 86 71 0.2609 0.2791 0.3380 0.12
48 2i0i:A 81 48 0.1957 0.2222 0.3750 0.14 2i0i:B, 2i0i:C
49 7pc5:A 405 87 0.3152 0.0716 0.3333 0.20
50 1zub:A 109 77 0.2065 0.1743 0.2468 0.22
51 7pcb:A 415 44 0.1413 0.0313 0.2955 0.34 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
52 4wsi:A 372 47 0.1413 0.0349 0.2766 0.64 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
53 3vqg:A 85 43 0.1413 0.1529 0.3023 0.96
54 2r4h:C 98 76 0.2065 0.1939 0.2500 1.1
55 2jq5:A 128 33 0.1304 0.0938 0.3636 1.4
56 8blu:B 195 49 0.1630 0.0769 0.3061 1.5 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
57 8sxg:A 366 49 0.1957 0.0492 0.3673 1.7 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
58 6q0m:B 94 48 0.1522 0.1489 0.2917 1.8
59 1gmm:A 126 63 0.2500 0.1825 0.3651 1.8 1uxx:X
60 1ihj:B 95 77 0.2283 0.2211 0.2727 2.5 1ihj:A
61 1u38:A 89 57 0.1957 0.2022 0.3158 2.7
62 6gua:A 821 31 0.1304 0.0146 0.3871 3.0 6gua:B, 6gua:C, 6gua:D, 6gua:E, 6gua:F, 6gua:G, 6gua:H
63 8hp4:A 540 96 0.2717 0.0463 0.2604 4.3 8hp4:B
64 7vbq:A 276 66 0.2065 0.0688 0.2879 4.6
65 7ri3:C 583 62 0.1630 0.0257 0.2419 6.2 7ri3:A, 7ri3:B, 7ri3:D
66 2f3o:A 773 37 0.1304 0.0155 0.3243 6.5 2f3o:B
67 6vbg:B 397 38 0.1739 0.0403 0.4211 6.8 6c9w:A, 4oaa:A, 4oaa:B, 6vbg:A, 2y5y:A, 2y5y:B, 4zyr:A, 4zyr:B
68 2k7w:A 192 63 0.1957 0.0938 0.2857 8.0 4bd6:A, 8spe:C, 8spe:D, 8spe:J, 8spe:M, 8srx:B, 8srx:D, 4zie:A, 4zif:A, 4zig:A, 4zih:A, 4zii:A
69 5ocs:A 369 58 0.2065 0.0515 0.3276 9.4 5ocs:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218