Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SLAALKSELQALKKEGFSPEELAALESELQALEKKLAALKSKLQALKG

The query sequence (length=48) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1g6u:A 48 48 1.0000 1.0000 1.0000 2.57e-23 1g6u:B
2 6egl:A 36 25 0.3958 0.5278 0.7600 0.002 6egm:A, 6egn:C, 6egn:B, 6ego:A, 6egp:A, 5kb0:A, 5kb1:A, 5kb2:A, 6mcd:A, 7n2y:A, 7n2z:A
3 4g1e:A 964 34 0.3958 0.0197 0.5588 0.018 5ffg:A, 5ffo:A, 5ffo:E, 4g1m:A, 3ije:A, 1jv2:A, 1l5g:A, 1m1x:A, 6mk0:A, 4mmx:A, 4mmy:A, 4mmz:A, 6msl:A, 6msu:A, 6naj:A, 5nem:A, 5ner:A, 5net:A, 4o02:A, 6om1:A, 6om1:C, 6om1:E, 6om1:G, 6om2:A, 6om2:C, 8tcf:A, 8tcg:A, 1u8c:A, 6uja:A, 6ujb:A, 6ujc:A, 4um8:C, 4um8:A, 4um9:A, 4um9:C, 8vs6:A, 8vsd:A, 7y1t:A
4 4g1e:A 964 25 0.3125 0.0156 0.6000 0.084 5ffg:A, 5ffo:A, 5ffo:E, 4g1m:A, 3ije:A, 1jv2:A, 1l5g:A, 1m1x:A, 6mk0:A, 4mmx:A, 4mmy:A, 4mmz:A, 6msl:A, 6msu:A, 6naj:A, 5nem:A, 5ner:A, 5net:A, 4o02:A, 6om1:A, 6om1:C, 6om1:E, 6om1:G, 6om2:A, 6om2:C, 8tcf:A, 8tcg:A, 1u8c:A, 6uja:A, 6ujb:A, 6ujc:A, 4um8:C, 4um8:A, 4um9:A, 4um9:C, 8vs6:A, 8vsd:A, 7y1t:A
5 3r4a:B 30 27 0.3125 0.5000 0.5556 0.073 3r4a:C, 3r4h:B, 3r4h:C
6 3r4a:B 30 33 0.3333 0.5333 0.4848 3.7 3r4a:C, 3r4h:B, 3r4h:C
7 7p3h:A 36 25 0.2500 0.3333 0.4800 0.13
8 7p3h:A 36 19 0.2292 0.3056 0.5789 2.3
9 6zxg:j 116 29 0.2292 0.0948 0.3793 0.20 6zxf:j, 6zxh:j
10 4eqy:G 260 37 0.2708 0.0500 0.3514 0.21
11 4dzl:F 32 27 0.2292 0.3438 0.4074 0.25 4dzl:I, 4dzl:E, 4dzl:H, 4dzl:C, 4dzl:J, 4dzl:K
12 5oyj:A 161 27 0.2292 0.0683 0.4074 0.32 5oyj:B
13 7q1s:E 30 26 0.2708 0.4333 0.5000 0.43 7q1s:M, 7q1s:A
14 2qyj:A 154 32 0.2500 0.0779 0.3750 0.66
15 2qyj:A 154 27 0.2083 0.0649 0.3704 1.0
16 2qyj:A 154 27 0.2083 0.0649 0.3704 1.0
17 2qxf:A 433 36 0.2708 0.0300 0.3611 0.90
18 4js4:A 468 36 0.2708 0.0278 0.3611 1.1 3c94:A, 4hcb:A, 4hcb:B, 4hcc:A, 4hcc:B, 3hl8:A, 3hp9:A, 4jrp:A, 4jrp:B, 4jrq:A, 4jrq:B, 4js4:B, 4js5:A, 4js5:B
19 6f37:A 113 20 0.2500 0.1062 0.6000 1.1 5ajb:A, 5ajb:B, 5ajb:C, 5ajc:A, 5ajc:B, 5ajc:C, 7alf:A, 7alf:B, 7alg:A, 7alg:B, 2bs5:A, 2bs6:A, 2bs6:B, 2bs6:C, 8c9y:A, 8c9z:A, 8cf6:A, 8cf6:C, 8cf6:B, 8cf7:A, 8cf7:B, 8cf7:C, 8cf7:D, 8cf7:E, 8cf7:F, 6f37:B, 6f7w:A, 6f7w:B, 6f7w:C, 6f7x:A, 6f7x:C, 6f7x:B, 6gl5:A, 6gl5:B, 6gl5:C, 4i6s:A, 4i6s:B, 4i6s:C, 5o7u:A, 5o7u:B, 5o7w:A, 5o7w:B, 7p2h:A, 7p2h:B, 7p2i:A, 7p2i:C, 7p2i:B, 7p2j:A, 7p2j:B, 7pr5:A, 7pr5:C, 7pr5:F, 7pr5:B, 7pr5:D, 7pr5:E, 7pr5:G, 7pr5:I, 7pr5:H, 7pr5:J, 7pr5:L, 7pr5:K, 8q6a:A, 8q6b:A, 8q6c:A, 6s99:A, 6s99:C, 6s99:B, 6s99:D, 6s99:F, 6s99:E, 6sth:A, 6sth:B, 6t99:A, 6t99:B, 6t99:C, 6t99:D, 6t99:E, 6t99:F, 6t99:G, 6t99:H, 6t99:I, 6t9a:A, 6t9a:B, 6t9a:C, 6t9b:A, 6t9b:B, 6t9b:C, 6t9b:D, 6t9b:E, 6t9b:F, 6t9b:G, 6t9b:H, 6t9b:I, 6y0x:B, 6y0x:F, 6y0x:C, 6y0x:D, 6y0x:E, 6y0x:A, 6z5g:A, 6z5m:A, 6z5p:A, 6z5p:B, 6z5q:A, 6z5q:B, 6z5w:A, 6z5x:A, 6z5z:A, 6z60:A, 6z62:A, 6zuk:A, 6zuk:B, 6zuk:C, 6zul:A, 6zul:B, 6zul:C, 6zul:D, 6zul:E, 6zul:F, 6zum:A
20 6f37:A 113 21 0.2292 0.0973 0.5238 7.6 5ajb:A, 5ajb:B, 5ajb:C, 5ajc:A, 5ajc:B, 5ajc:C, 7alf:A, 7alf:B, 7alg:A, 7alg:B, 2bs5:A, 2bs6:A, 2bs6:B, 2bs6:C, 8c9y:A, 8c9z:A, 8cf6:A, 8cf6:C, 8cf6:B, 8cf7:A, 8cf7:B, 8cf7:C, 8cf7:D, 8cf7:E, 8cf7:F, 6f37:B, 6f7w:A, 6f7w:B, 6f7w:C, 6f7x:A, 6f7x:C, 6f7x:B, 6gl5:A, 6gl5:B, 6gl5:C, 4i6s:A, 4i6s:B, 4i6s:C, 5o7u:A, 5o7u:B, 5o7w:A, 5o7w:B, 7p2h:A, 7p2h:B, 7p2i:A, 7p2i:C, 7p2i:B, 7p2j:A, 7p2j:B, 7pr5:A, 7pr5:C, 7pr5:F, 7pr5:B, 7pr5:D, 7pr5:E, 7pr5:G, 7pr5:I, 7pr5:H, 7pr5:J, 7pr5:L, 7pr5:K, 8q6a:A, 8q6b:A, 8q6c:A, 6s99:A, 6s99:C, 6s99:B, 6s99:D, 6s99:F, 6s99:E, 6sth:A, 6sth:B, 6t99:A, 6t99:B, 6t99:C, 6t99:D, 6t99:E, 6t99:F, 6t99:G, 6t99:H, 6t99:I, 6t9a:A, 6t9a:B, 6t9a:C, 6t9b:A, 6t9b:B, 6t9b:C, 6t9b:D, 6t9b:E, 6t9b:F, 6t9b:G, 6t9b:H, 6t9b:I, 6y0x:B, 6y0x:F, 6y0x:C, 6y0x:D, 6y0x:E, 6y0x:A, 6z5g:A, 6z5m:A, 6z5p:A, 6z5p:B, 6z5q:A, 6z5q:B, 6z5w:A, 6z5x:A, 6z5z:A, 6z60:A, 6z62:A, 6zuk:A, 6zuk:B, 6zuk:C, 6zul:A, 6zul:B, 6zul:C, 6zul:D, 6zul:E, 6zul:F, 6zum:A
21 4etp:A 379 23 0.2292 0.0290 0.4783 2.0 1f9t:A, 1f9u:A, 1f9v:A, 3kar:A
22 4etp:A 379 19 0.2292 0.0290 0.5789 7.8 1f9t:A, 1f9u:A, 1f9v:A, 3kar:A
23 7q1s:J 30 26 0.2292 0.3667 0.4231 2.2 7q1s:N, 7q1s:F
24 5hje:A 676 31 0.2500 0.0178 0.3871 3.3 5hyv:A, 5i51:A, 5i5e:A, 5i5g:A, 5xps:A, 5xqa:A, 5xqk:A, 5xrv:A, 5xry:A, 5xs6:A, 5xsa:A, 5xsb:A, 5xsm:A, 5xt0:A, 5xt4:A, 5xtl:A, 5xtv:A, 5xtx:A, 5xu2:A, 5xu9:A, 5xuf:A, 5xvt:A
25 6i1j:A 30 27 0.2292 0.3667 0.4074 3.5
26 7b4w:A 161 27 0.1875 0.0559 0.3333 3.6 7b4w:C
27 5uxt:A 33 26 0.2500 0.3636 0.4615 4.1 5uxt:C
28 5nug:A 2920 24 0.2500 0.0041 0.5000 4.3 5nug:B
29 4etp:B 287 21 0.2500 0.0418 0.5714 4.6
30 7mu5:A 110 31 0.2500 0.1091 0.3871 5.2 7mu5:E, 7mu5:B, 7mu5:H, 7mu5:C, 7mu5:D, 7mu5:F, 7mu5:G
31 6w6i:F 605 45 0.4167 0.0331 0.4444 5.4 6w6j:F
32 6w6h:C 636 45 0.4167 0.0314 0.4444 5.6 6w6e:B, 6w6e:C, 6w6g:A, 6w6g:B, 6w6g:C, 6w6h:A, 6w6h:B, 6w6h:F, 6w6i:A, 6w6i:B, 6w6i:C, 6w6j:A, 6w6j:B, 6w6j:C
33 4apy:A 414 34 0.2083 0.0242 0.2941 5.8 5dqn:A
34 7ayx:B 396 30 0.2292 0.0278 0.3667 6.0 7ayx:A
35 6jrq:A 407 25 0.1875 0.0221 0.3600 6.1 6jrq:B, 6jrq:C, 6jrq:D
36 7ccf:A 405 36 0.2292 0.0272 0.3056 6.3 5gwe:A, 5gwe:B, 5gwe:C, 5gwe:D, 5xjn:A
37 6ofs:A 905 49 0.3542 0.0188 0.3469 6.4
38 8ptk:f 4502 24 0.2500 0.0027 0.5000 6.6 8ptk:e
39 3vke:A 76 30 0.2292 0.1447 0.3667 6.6 2axy:B, 2axy:D, 2pqu:C, 2pqu:B, 2py9:B, 2py9:C, 3vke:B, 3vke:C, 3vke:D, 1ztg:A, 1ztg:D, 1ztg:B, 1ztg:C
40 3dv9:A 243 30 0.2500 0.0494 0.4000 7.0
41 6ei1:A 335 38 0.2083 0.0299 0.2632 8.3
42 3woj:A 698 36 0.2500 0.0172 0.3333 8.6 3woi:B, 3woj:B, 3wol:A, 3wol:B, 3wom:A, 3wom:B, 3won:A, 3won:B, 3woo:A, 3woo:B, 3wop:A, 3wop:B, 3woq:A, 3woq:B, 3wor:A, 3wor:B, 4y06:A, 4y06:B
43 8gcc:A 707 34 0.2292 0.0156 0.3235 9.8 8gcc:B
44 6u7a:D 429 34 0.2500 0.0280 0.3529 10.0 5c6u:A, 6u78:A, 6u78:B, 6u78:C, 6u78:D, 6u7a:A, 6u7a:B, 6u7a:C, 6u7a:E, 6u7a:F, 6u7a:G, 6u7a:H

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218