Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SKPFTCLDGTATIPFDQVNDDYCDCKDGSDEPGTAACPNGSFHCTNTGYKPLYILSSRVNDGVCDCCDGTDEYNSGTVCE
NTCR

The query sequence (length=84) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8d43:B 100 84 0.9286 0.7800 0.9286 6.32e-54 8emr:B, 5f0e:B, 5h9o:B, 5h9o:D, 5hjo:B, 5hjo:D, 5hjr:B, 5hjr:D, 5ied:B, 5iee:B, 5ief:B, 5ieg:B, 7jty:B, 7jty:D, 7k9n:B, 7k9n:D, 7k9o:B, 7k9o:D, 7k9q:B, 7k9q:D, 7k9t:B, 7k9t:D, 7kad:B, 7kad:D, 7kb6:B, 7kb6:D, 7kb8:B, 7kb8:D, 7kbj:B, 7kbj:D, 7kbr:B, 7kbr:D, 7kry:B, 7kry:D, 7l9e:B, 7l9e:D
2 5jqp:B 131 111 0.5714 0.3664 0.4324 5.35e-15
3 8em7:A 4378 80 0.3690 0.0071 0.3875 0.001 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
4 8em7:A 4378 53 0.2738 0.0053 0.4340 0.017 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
5 8em7:A 4378 72 0.3095 0.0059 0.3611 0.020 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
6 8em7:A 4378 79 0.3452 0.0066 0.3671 0.021 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
7 8em7:A 4378 77 0.3571 0.0069 0.3896 0.026 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
8 8em7:A 4378 73 0.3452 0.0066 0.3973 0.041 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
9 8em7:A 4378 76 0.3214 0.0062 0.3553 0.10 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
10 8em7:A 4378 75 0.3333 0.0064 0.3733 0.20 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
11 8em7:A 4378 57 0.2619 0.0050 0.3860 0.88 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
12 8em7:A 4378 86 0.3452 0.0066 0.3372 1.0 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
13 8em7:A 4378 78 0.3095 0.0059 0.3333 2.4 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
14 8em7:A 4378 77 0.3571 0.0069 0.3896 2.5 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
15 8em7:A 4378 51 0.2500 0.0048 0.4118 3.6 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
16 8em7:A 4378 77 0.3095 0.0059 0.3377 4.6 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
17 8em7:A 4378 73 0.3214 0.0062 0.3699 5.3 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
18 8em7:A 4378 56 0.2500 0.0048 0.3750 6.3 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
19 8em4:A 3818 80 0.3690 0.0081 0.3875 0.001 8em4:B
20 8em4:A 3818 72 0.3095 0.0068 0.3611 0.025 8em4:B
21 8em4:A 3818 79 0.3452 0.0076 0.3671 0.027 8em4:B
22 8em4:A 3818 73 0.3333 0.0073 0.3836 0.033 8em4:B
23 8em4:A 3818 73 0.3452 0.0076 0.3973 0.042 8em4:B
24 8em4:A 3818 76 0.3214 0.0071 0.3553 0.12 8em4:B
25 8em4:A 3818 57 0.2619 0.0058 0.3860 1.0 8em4:B
26 8em4:A 3818 78 0.3095 0.0068 0.3333 2.9 8em4:B
27 8em4:A 3818 51 0.2500 0.0055 0.4118 2.9 8em4:B
28 8em4:A 3818 73 0.3214 0.0071 0.3699 7.3 8em4:B
29 8jxc:A 1337 76 0.3690 0.0232 0.4079 0.007 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
30 8jxc:A 1337 77 0.3452 0.0217 0.3766 0.012 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
31 8jxc:A 1337 78 0.3214 0.0202 0.3462 0.21 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
32 8jxc:A 1337 57 0.2738 0.0172 0.4035 0.52 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
33 8jxc:A 1337 34 0.1905 0.0120 0.4706 1.1 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
34 8jxc:A 1337 71 0.3095 0.0194 0.3662 2.3 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
35 1f5y:A 85 74 0.3095 0.3059 0.3514 0.24
36 7qbg:D 81 75 0.3214 0.3333 0.3600 0.46 7qbd:C, 7qbd:D, 7qbf:C, 4zrp:C, 4zrp:D, 4zrq:C, 4zrq:D
37 7oik:A 4426 55 0.2024 0.0038 0.3091 0.65 7oim:A, 6tax:A, 6tay:A
38 1jrf:A 47 46 0.2024 0.3617 0.3696 0.71
39 3hhs:A 669 18 0.1071 0.0135 0.5000 1.4
40 8jxd:B 156 74 0.2738 0.1474 0.3108 1.4
41 8jxj:A 570 72 0.3333 0.0491 0.3889 1.4 8jxj:B
42 2xrc:C 454 69 0.2857 0.0529 0.3478 3.0
43 2xrc:B 485 69 0.2857 0.0495 0.3478 3.0 5o32:D, 5o32:H, 2xrc:A, 2xrc:D
44 3gzc:A 403 22 0.1190 0.0248 0.4545 9.4 3gzc:B, 3gzd:A, 3gzd:B, 3gzd:C, 3gzd:D
45 2ixu:A 338 33 0.1429 0.0355 0.3636 9.6 2ixv:A, 2j8f:A, 2j8g:A, 1oba:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218