Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SISSRVKSKRIQLGLNQAELAQKVGTTQQSIEQLENGKTKRPRFLPELASALGVSVDWLLNGT

The query sequence (length=63) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2or1:L 63 63 1.0000 1.0000 1.0000 3.30e-40 2or1:R, 1per:L, 1per:R, 1rpe:L, 1rpe:R
2 3cro:L 66 63 0.5238 0.5000 0.5238 2.49e-16 3cro:R
3 8tac:B 66 37 0.2540 0.2424 0.4324 2.69e-05
4 1b0n:A 103 62 0.3175 0.1942 0.3226 0.002 3zkc:A, 3zkc:B
5 3kxa:A 131 49 0.3016 0.1450 0.3878 0.029 3kxa:B, 3kxa:C, 3kxa:D
6 4yg1:A 72 36 0.2222 0.1944 0.3889 0.13 3dnv:B, 3hzi:B, 5k98:B, 5k98:P, 4yg1:B, 4yg1:C, 4yg1:D, 4yg4:A, 4yg4:B, 4yg4:D, 4yg7:B, 4yg7:E, 4yg7:C, 4yg7:G, 4z58:A, 4z59:A, 4z5c:A, 4z5c:B, 4z5d:A, 4z5d:B, 4z5h:A
7 2fmy:A 218 31 0.2063 0.0596 0.4194 0.16 2fmy:B, 2fmy:C, 2fmy:D, 2hkx:A, 2hkx:B
8 4or2:B 366 48 0.2063 0.0355 0.2708 0.85 4or2:A
9 4r7p:A 485 41 0.2381 0.0309 0.3659 1.8 4r7p:B, 4r7p:C
10 8ox6:A 575 59 0.2857 0.0313 0.3051 2.0
11 2aut:D 210 29 0.1905 0.0571 0.4138 2.3 2aut:A, 2aut:B, 2aut:C, 1z5g:A, 1z5g:B, 1z5g:C, 1z5g:D, 1z5u:A, 1z5u:B, 1z5u:C, 1z5u:D, 1z88:A, 1z88:B, 1z88:C
12 3bdn:A 234 29 0.1905 0.0513 0.4138 2.5 3bdn:B, 2hnf:A, 2ho0:A, 1lli:A, 1lli:B, 1lmb:3, 1lmb:4, 1rio:A, 1rio:B
13 6chv:D 91 50 0.2222 0.1538 0.2800 2.8 6chv:A, 6chv:C, 6chv:B, 6chv:G, 6chv:H
14 4bmv:C 258 46 0.2540 0.0620 0.3478 2.9 4bmv:A, 4bmv:B, 4bmv:D, 4bmv:E, 4bmv:F, 4bmv:G, 4bmv:H, 4bmv:I, 4bmv:J
15 3fym:A 82 67 0.2381 0.1829 0.2239 3.0
16 7jvt:D 199 29 0.1905 0.0603 0.4138 3.1 7jvt:C
17 6v7b:a 126 31 0.2063 0.1032 0.4194 4.2 6v7b:b, 6v7b:c, 6v7b:d, 6v7b:e, 6v7b:f, 6v7b:g, 6v7b:h, 6v7b:i, 6v7b:j, 6v7b:k, 6v7b:l, 6v7b:m, 6v7b:n, 6v7b:o, 6v7b:p, 6v7b:q, 6v7b:r, 6v7b:s, 6v7b:t, 6v7b:u, 6v7b:v, 6v7b:w
18 5hsq:A 488 63 0.2857 0.0369 0.2857 5.3 8co5:A, 5i5l:A, 6r26:A, 6r27:A, 6r27:B, 6r27:C, 6r27:D
19 4hnd:A 353 49 0.3016 0.0538 0.3878 6.3 4hnd:B, 4hne:A, 4hne:B
20 4r5o:A 426 38 0.2222 0.0329 0.3684 6.6
21 8har:A 357 21 0.1429 0.0252 0.4286 7.4 8har:B
22 7xrc:C 134 25 0.1429 0.0672 0.3600 8.0 2xsd:C
23 7r6r:A 167 18 0.1270 0.0479 0.4444 8.9 7tz1:A
24 3gpb:A 833 43 0.2063 0.0156 0.3023 9.0 1a8i:A, 1abb:A, 1abb:B, 1abb:C, 1abb:D, 2amv:A, 3amv:A, 1axr:A, 1b4d:A, 3bcr:A, 3bcs:A, 3bd6:A, 3bd7:A, 3bd8:A, 3bda:A, 8bzs:A, 1c50:A, 1c8k:A, 1c8l:A, 4ctm:A, 4ctn:A, 4cto:A, 3cut:A, 3cuu:A, 3cuv:A, 3cuw:A, 3e3n:A, 3e3n:B, 3e3n:D, 3e3n:F, 3e3n:G, 3e3n:H, 3e3o:B, 3ebo:A, 3ebp:A, 4ej2:A, 4eke:A, 4eky:A, 4el0:A, 4el5:A, 2f3p:A, 2f3q:A, 2f3s:A, 2f3u:A, 6f3j:A, 6f3l:A, 6f3r:A, 6f3s:A, 6f3u:A, 2fet:A, 2ff5:A, 2ffr:A, 1fs4:A, 1ftq:A, 1ftw:A, 1fty:A, 1fu4:A, 1fu7:A, 1fu8:A, 3g2h:A, 3g2i:A, 3g2j:A, 3g2k:A, 3g2l:A, 3g2n:A, 2g9r:A, 2g9v:A, 1gfz:A, 1gg8:A, 1ggn:A, 1gpa:A, 1gpa:B, 1gpa:C, 1gpa:D, 1gpb:A, 1gpy:A, 2gpb:A, 4gpb:A, 5gpb:A, 6gpb:A, 7gpb:A, 7gpb:B, 7gpb:C, 7gpb:D, 8gpb:A, 9gpb:A, 9gpb:B, 9gpb:C, 9gpb:D, 1h5u:A, 1hlf:A, 5jtt:A, 5jtu:A, 1k06:A, 1k08:A, 1kti:A, 3l79:A, 3l7a:A, 3l7b:A, 3l7c:A, 3l7d:A, 5lrc:A, 5lrd:A, 5lre:A, 5lrf:A, 1lwn:A, 1lwo:A, 5mcb:A, 5mem:A, 4mho:A, 4mhs:A, 4mi3:A, 4mi6:A, 4mi9:A, 4mic:A, 3mqf:A, 3mrt:A, 3mrv:A, 3mrx:A, 4mra:A, 3ms2:A, 3ms4:A, 3ms7:A, 3msc:A, 3mt7:A, 3mt8:A, 3mt9:A, 3mta:A, 3mtb:A, 3mtd:A, 3nc4:A, 1noi:A, 1noi:B, 1noi:C, 1noi:D, 1noj:A, 1nok:A, 3np7:A, 3np9:A, 3npa:A, 5o50:A, 5o52:A, 5o54:A, 5o56:A, 2off:A, 7onf:A, 5owy:A, 5owz:A, 5ox0:A, 5ox1:A, 5ox3:A, 5ox4:A, 1p29:A, 1p2b:A, 1p2d:A, 1p2g:A, 1p4g:A, 1p4h:A, 1p4j:A, 2pri:A, 2prj:A, 2pyd:A, 2pyi:A, 7q5i:AAA, 6qa6:A, 6qa7:A, 6qa8:A, 2qlm:A, 2qln:A, 2qn1:A, 2qn2:A, 2qn3:A, 2qn7:A, 2qn8:A, 2qn9:A, 2qnb:A, 2qrg:A, 2qrh:A, 2qrm:A, 2qrp:A, 2qrq:A, 6r0h:A, 6r0i:A, 3s0j:A, 6s4h:A, 6s4k:A, 6s4o:A, 6s4p:A, 6s4r:A, 6s51:A, 6s52:A, 2skc:A, 2skd:A, 2ske:A, 3sym:A, 3syr:A, 3t3d:A, 3t3e:A, 3t3g:A, 3t3h:A, 3t3i:A, 1uzu:A, 1wut:A, 1wuy:A, 1wv0:A, 1wv1:A, 1ww2:A, 1ww3:A, 1xc7:A, 1xkx:A, 1xl0:A, 1xl1:A, 6y55:A, 6y5c:A, 6y5o:A, 4yi3:A, 4yi5:A, 4yua:A, 6yve:AAA, 4z5x:A, 1z62:A, 1z6p:A, 1z6q:A, 1z8d:A, 3zcp:A, 3zcq:A, 3zcr:A, 3zcs:A, 3zct:A, 3zcu:A, 3zcv:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417