BioLiP

>protein
SHMLGLIKKNTLLGIDISSTSVKLLELSRSRYKVEAYAVEPLPPNAVVEKNIVELEGVGQALSRVLVKAKTNLKSAVVAV
AGSAVITKTIEMEAGLSEDELENQLKIEADQYIPYPLEEVAIDFEVQGLSARNPERVDVLLAACRKENVEVREAALALAG
LTAKVVDVEAYALERSYALLSSQLGADTDQLTVAVVDIGATMTTLSVLHNGRTIYTREQLFGGRQLTEEIQRRYGLSVEE
AGLAKKQGGLPDDYDSEVLRPFKDAVVQQVSRSLQFFFAAGQFNDVDYIVLAGGTASIQDLDRLIQQKIGTPTLVANPFA
DMALNGKVNAGALASDAPALMIACGLALRSFD

The query sequence (length=352) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5eq6:A	357	356	1.0000	0.9860	0.9888	0.0	5eou:B, 5eox:A, 5eox:B, 5eoy:A, 5eoy:B, 5eq6:B
2	3jc9:Ma	355	357	0.3295	0.3268	0.3249	9.05e-49	3jc9:Mb, 3jc9:Mc, 3jc9:Md, 3jc9:Me, 3jc9:Mf, 3jc9:Mg, 3jc9:Mh, 3jc9:Mi, 3jc9:Mj, 3jc9:Mk, 3jc9:Ml
3	2ych:A	336	344	0.3011	0.3155	0.3081	3.89e-34
4	7q6i:D	362	343	0.2188	0.2127	0.2245	1.34e-04
5	7q6i:B	383	365	0.2330	0.2141	0.2247	8.99e-04	7q6f:A, 7q6f:B, 7q6i:A, 7q6i:C, 7q6i:E, 7q6i:F, 7q6i:G, 7q6i:H, 7q6i:I, 7q6i:J, 7q6i:K, 7q6i:L, 7q6i:M, 7q6i:N, 7q6i:O, 7q6i:P
6	8azg:M	328	195	0.1420	0.1524	0.2564	0.008	8aam:M, 8ab4:M, 7zpu:M
7	4ybg:A	238	99	0.0767	0.1134	0.2727	0.12
8	3h1q:B	272	143	0.0966	0.1250	0.2378	0.26	3h1q:A
9	6asy:A	606	71	0.0625	0.0363	0.3099	0.33	7a4v:A, 6asy:B, 6cz1:A, 6cz1:B, 6dfm:A, 6dfm:B, 6dfo:A, 6dfo:B, 6do2:A, 6do2:B, 6dws:A, 6dws:B, 5e84:A, 5e84:B, 5e84:C, 5e84:D, 5e84:E, 5e84:F, 6eoe:A, 6eof:A, 5evz:A, 5evz:B, 5ex5:A, 5ex5:B, 5exw:A, 5exw:B, 5ey4:A, 5ey4:B, 5f0x:A, 5f0x:B, 5f1x:A, 5f1x:B, 5f2r:A, 5f2r:B, 3iuc:A, 3iuc:C, 3ldl:A, 3ldl:B, 3ldo:A, 3ldo:B, 3ldp:A, 3ldp:B, 7n1r:A, 7n1r:B, 6zmd:A, 6zyh:A, 6zyh:B
10	7q6g:A	388	257	0.1790	0.1624	0.2451	0.45	7q6d:A
11	3wqt:B	334	144	0.0966	0.1018	0.2361	0.83
12	8ide:A	929	114	0.0994	0.0377	0.3070	1.2
13	7nup:D	884	151	0.1108	0.0441	0.2583	1.2	5ab0:C, 5ab2:B, 4e36:A, 4e36:B, 6ea4:A, 6ea4:B, 5j6s:B, 4jbs:A, 4jbs:B, 7nsk:B, 7nup:C, 7p7p:B, 7pfs:B, 3se6:A, 3se6:B
14	7pfs:A	916	151	0.1108	0.0426	0.2583	1.2	5ab0:A, 5ab2:A, 5j6s:A, 5k1v:A, 7nsk:A, 7nup:A, 7nup:B, 7p7p:A, 7sh0:A
15	5k1v:B	849	151	0.1108	0.0459	0.2583	1.3	7sh0:B
16	7mit:E	1438	47	0.0568	0.0139	0.4255	1.3	7mjo:E, 7mjp:E, 7mjq:E, 7y1l:A
17	4czm:A	336	174	0.1307	0.1369	0.2644	1.9	4czf:A, 4czg:A, 4czh:A, 4czj:A, 4czj:B, 4czk:A, 4czl:A, 4czm:B
18	3wt0:D	378	68	0.0568	0.0529	0.2941	4.2	3wqt:A, 3wqt:C, 3wqt:D, 3wqu:A, 3wqu:B, 3wqu:C, 3wqu:D, 3wt0:A, 3wt0:B, 3wt0:C
19	4pne:B	272	194	0.1364	0.1765	0.2474	4.8	4pne:A
20	2bvf:A	453	93	0.0540	0.0419	0.2043	5.8	2bvf:B, 2bvg:A, 2bvg:B, 2bvg:C, 2bvg:D, 2bvh:A, 2bvh:B, 2bvh:C, 2bvh:D
21	3c7n:A	649	211	0.1307	0.0709	0.2180	6.6
22	3d2e:A	629	211	0.1307	0.0731	0.2180	7.0	3d2e:C, 3d2f:A, 3d2f:C, 2qxl:A, 2qxl:B
23	7z0s:F	164	30	0.0341	0.0732	0.4000	7.8	7z0t:F
24	7nfe:A	3585	71	0.0568	0.0056	0.2817	8.1
25	8bot:A	3528	71	0.0568	0.0057	0.2817	8.4
26	6jja:A	154	48	0.0398	0.0909	0.2917	9.3
27	2v7y:A	504	53	0.0398	0.0278	0.2642	9.8

[Back]