Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SDPLPDNWEMAYTEKGEVYFIDHNTKTTSWLDPRLAKKAKPPEECKENELPYGWEKIDDPIYGTYYVDHINRRTQFENPV
LEAKRKLQ

The query sequence (length=88) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6jjz:B 96 88 1.0000 0.9167 1.0000 5.16e-63 6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
2 6jjy:A 128 86 0.4432 0.3047 0.4535 7.67e-21 6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
3 6jjy:A 128 35 0.2386 0.1641 0.6000 4.50e-06 6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
4 2kxq:A 90 82 0.3636 0.3556 0.3902 1.12e-13 2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
5 2kxq:A 90 36 0.2159 0.2111 0.5278 1.05e-08 2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
6 2ltv:A 36 33 0.2614 0.6389 0.6970 2.55e-12 2law:A
7 2ltv:A 36 33 0.1364 0.3333 0.3636 1.3 2law:A
8 5cq2:A 76 77 0.3409 0.3947 0.3896 8.71e-11 5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
9 5cq2:A 76 37 0.2273 0.2632 0.5405 8.91e-10 5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
10 5cq2:A 76 35 0.1818 0.2105 0.4571 0.021 5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
11 4lcd:A 419 33 0.2500 0.0525 0.6667 7.16e-10 4lcd:B
12 2djy:A 42 38 0.2273 0.4762 0.5263 7.95e-10
13 2djy:A 42 35 0.1932 0.4048 0.4857 1.70e-04
14 2m3o:W 43 32 0.2159 0.4419 0.5938 1.32e-08 2kpz:A, 2kq0:A, 2mpt:A, 4n7h:A
15 2m3o:W 43 39 0.1364 0.2791 0.3077 0.40 2kpz:A, 2kq0:A, 2mpt:A, 4n7h:A
16 2lb1:A 35 33 0.2045 0.5143 0.5455 1.34e-08 2ltx:A
17 2lb1:A 35 32 0.1818 0.4571 0.5000 0.006 2ltx:A
18 2jmf:A 43 32 0.2045 0.4186 0.5625 1.67e-08
19 2jmf:A 43 35 0.1705 0.3488 0.4286 0.019
20 2laj:A 40 32 0.2159 0.4750 0.5938 1.02e-07
21 2laj:A 40 36 0.1364 0.3000 0.3333 4.6
22 1jmq:A 46 34 0.2159 0.4130 0.5588 1.41e-07 1k5r:A, 1k9q:A, 1k9r:A, 2lax:A, 2lay:A, 2ltw:A
23 1jmq:A 46 30 0.1136 0.2174 0.3333 2.0 1k5r:A, 1k9q:A, 1k9r:A, 2lax:A, 2lay:A, 2ltw:A
24 2ez5:W 46 38 0.1705 0.3261 0.3947 1.52e-07
25 2ez5:W 46 39 0.1477 0.2826 0.3333 0.66
26 5dws:C 40 32 0.1932 0.4250 0.5312 3.95e-07
27 5dws:C 40 35 0.1705 0.3750 0.4286 0.009
28 1i5h:W 50 37 0.2045 0.3600 0.4865 1.48e-06
29 1i5h:W 50 44 0.1250 0.2200 0.2500 2.4
30 2n8t:A 39 35 0.1705 0.3846 0.4286 1.25e-05
31 2n8t:A 39 33 0.1477 0.3333 0.3939 0.015
32 7lp2:E 37 30 0.1477 0.3514 0.4333 2.23e-04 2lb2:A, 7lp2:A, 7lp2:C, 2lty:A
33 7lp2:E 37 31 0.1705 0.4054 0.4839 0.002 2lb2:A, 7lp2:A, 7lp2:C, 2lty:A
34 7lp3:A 37 33 0.1591 0.3784 0.4242 2.80e-04 7lp3:C
35 7lp3:A 37 32 0.1932 0.4595 0.5312 4.65e-04 7lp3:C
36 2nc3:A 33 31 0.1591 0.4242 0.4516 0.054 2nc4:A, 2nc5:A, 2nc6:A
37 2nc3:A 33 30 0.1136 0.3030 0.3333 3.6 2nc4:A, 2nc5:A, 2nc6:A
38 8v9q:B 449 27 0.1250 0.0245 0.4074 0.12
39 8sg2:A 163 34 0.1705 0.0920 0.4412 0.34 6dun:A, 6dun:B, 7efj:A, 7efx:A, 7ekv:A, 7f0m:A, 7f0m:C, 7f0m:B, 7f0m:D, 1f8a:B, 4gwv:A, 3i6c:A, 3i6c:B, 1i8g:B, 1i8h:B, 3ikd:A, 3ikd:B, 3ikg:A, 3ikg:B, 9inr:A, 9inr:B, 2itk:A, 3jyj:A, 3jyj:B, 3kab:A, 3kac:A, 3kac:B, 3kad:A, 3kaf:A, 3kag:A, 3kah:A, 3kai:A, 3kce:A, 2lb3:A, 2n1o:A, 1nmw:A, 3ntp:A, 6o33:A, 6o34:A, 3odk:A, 3oob:A, 1pin:A, 2q5a:A, 3tc5:A, 3tcz:A, 3tdb:A, 4tns:A, 4tyo:A, 4tyo:B, 5uy9:A, 6vaj:A, 3wh0:A, 2xp3:A, 2xp4:A, 2xp5:A, 2xp6:A, 2xp7:A, 2xp8:A, 2xp9:A, 2xpa:A, 2xpb:A
40 8sg2:A 163 33 0.1250 0.0675 0.3333 5.1 6dun:A, 6dun:B, 7efj:A, 7efx:A, 7ekv:A, 7f0m:A, 7f0m:C, 7f0m:B, 7f0m:D, 1f8a:B, 4gwv:A, 3i6c:A, 3i6c:B, 1i8g:B, 1i8h:B, 3ikd:A, 3ikd:B, 3ikg:A, 3ikg:B, 9inr:A, 9inr:B, 2itk:A, 3jyj:A, 3jyj:B, 3kab:A, 3kac:A, 3kac:B, 3kad:A, 3kaf:A, 3kag:A, 3kah:A, 3kai:A, 3kce:A, 2lb3:A, 2n1o:A, 1nmw:A, 3ntp:A, 6o33:A, 6o34:A, 3odk:A, 3oob:A, 1pin:A, 2q5a:A, 3tc5:A, 3tcz:A, 3tdb:A, 4tns:A, 4tyo:A, 4tyo:B, 5uy9:A, 6vaj:A, 3wh0:A, 2xp3:A, 2xp4:A, 2xp5:A, 2xp6:A, 2xp7:A, 2xp8:A, 2xp9:A, 2xpa:A, 2xpb:A
41 1eg4:A 260 28 0.1250 0.0423 0.3929 1.1
42 5uam:A 440 18 0.1136 0.0227 0.5556 3.0 5uam:B, 5uas:A, 5uas:B
43 7khr:a 750 45 0.1591 0.0187 0.3111 3.4
44 7ase:p 310 58 0.1932 0.0548 0.2931 3.5 5opt:p
45 7ok0:D 261 43 0.1932 0.0651 0.3953 7.0 7oq4:D, 7oqy:D
46 7zcl:B 227 57 0.1705 0.0661 0.2632 7.1 7zcl:A
47 8hz5:A 350 20 0.1136 0.0286 0.5000 7.4
48 2os1:A 179 58 0.2045 0.1006 0.3103 8.2
49 6jcy:C 1139 29 0.1023 0.0079 0.3103 9.4 6bzo:C, 6c04:C, 6c06:C, 6dv9:C, 6dvb:C, 6dvc:C, 6dvd:C, 6dve:C, 8e74:C, 8e79:C, 8e82:C, 8e8m:C, 8e95:C, 6edt:C, 6ee8:C, 6eec:C, 8ehq:C, 8ej3:C, 8eoe:C, 8eof:C, 8eos:C, 8eot:C, 8exy:C, 6fbv:C, 8hih:C, 6jcx:C, 7kif:C, 7kin:C, 6koo:C, 6kop:C, 6koq:C, 6m7j:C, 7p5x:AC, 7rwi:C, 6tye:C, 6tyf:C, 6tyg:C, 7u22:C, 5uh5:C, 5uh6:C, 5uh8:C, 5uh9:C, 5uha:C, 5uhb:C, 5uhc:C, 5uhd:C, 5uhe:C, 5uhf:C, 5uhg:C, 5vi5:C, 6vvx:C, 6vvy:C, 6vvz:C, 6vw0:C, 5zx2:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417