BioLiP

>protein
RVMYYGKGDVFAYRTYLKPLTGVRTIPESPFSGRDHILFGVNVKISVGGTKLLTSFTKGDNSLVVATDSMKNFIQKHLAS
YTGTTIEGFLEYVATSFLKKYSHIEKISLIGEEIPFETTFAVASELVFKKSRNEYATAYLNMVRNEDNTLNITEQQSGLA
GLQLIKVSGNSFVGFIRDEYTTLPEDSNRPLFVYLNIKWKYKNTEDSFGTNPENYVAAEQIRDIATSVFHETETLSIQHL
IYLIGRRILERFPQLQEVYFESQNHTWDKIVEEIGKVYTEPCPPYGFQCFTVTQ

The query sequence (length=294) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1j2g:A	306	304	0.9966	0.9575	0.9638	0.0	5ayj:A, 5ayj:B, 5ayj:C, 5ayj:D, 7cmn:A, 7cmn:B, 7cmq:A, 7cmq:B, 7cuc:A, 7cuc:B, 7cuf:A, 7cuf:B, 7cug:A, 7cug:B, 1j2g:B, 1j2g:C, 1j2g:D, 3wlv:A, 3wlv:B, 3wlv:C, 3wlv:D, 4xfp:A, 4xfp:B, 4xfp:C, 4xfp:D, 5y2p:A, 5y2p:B, 5y52:A, 5y52:B, 5y52:C, 5y52:D, 5yj2:A, 5yj2:B, 5yj2:C, 5yj2:D, 5yja:A, 5yja:B, 5yja:C, 5yja:D, 5z27:A, 5z27:B, 5z2b:A, 5z2b:B
2	4cw0:A	301	307	0.2823	0.2757	0.2704	5.31e-22	7a0l:A, 3bjp:A, 3bk8:A, 3cks:A, 3cku:A, 4cw2:A, 4cw3:A, 4cw6:A, 4d12:A, 4d13:A, 4d17:A, 4d19:A, 3f2m:A, 5frc:A, 4fsk:A, 2fub:A, 2fxl:A, 3gko:A, 6i9x:A, 6i9z:A, 6ia1:A, 6ia3:A, 6ia9:aaa, 6ia9:aba, 2iba:A, 2ic0:A, 2icq:A, 6ic1:A, 3l8w:A, 3l9g:A, 3lbg:A, 3ld4:A, 4n3m:A, 4n9m:A, 4n9s:A, 4n9v:A, 3obp:A, 4op6:A, 4op9:A, 4oqc:A, 7p0c:A, 7p0d:A, 7p0g:A, 3p9f:A, 3p9o:A, 2pes:A, 3pjk:A, 3pk3:A, 3pk4:A, 3pk5:A, 3pk6:A, 3pk8:A, 3pkf:A, 3pkg:A, 3pkh:A, 3pkk:A, 3pkl:A, 3pks:A, 3pkt:A, 3pku:A, 3ple:A, 3plg:A, 3plh:A, 3pli:A, 3plj:A, 3plm:A, 4poe:A, 4pr8:A, 4puv:A, 7puf:A, 7puf:B, 7pwn:A, 7pwn:B, 7q09:A, 7q09:B, 7qar:AAA, 1r4s:A, 1r4u:A, 1r51:A, 6rgm:A, 6rgt:A, 1wrr:A, 1ws2:A, 1ws2:B, 1ws2:C, 1ws2:D, 1ws3:A, 1ws3:B, 1ws3:C, 1ws3:D, 1xt4:A, 1xxj:A, 1xxj:B, 1xxj:C, 1xxj:D, 1xy3:A, 1xy3:B, 1xy3:C, 1xy3:D, 1xy3:E, 1xy3:F, 1xy3:G, 1xy3:H, 2zka:A, 2zkb:A
3	1vay:A	287	223	0.2109	0.2160	0.2780	8.51e-19	1vay:D, 1vay:B, 1vay:C, 1vay:E, 1vay:H, 1vay:F, 1vay:G, 2yzb:A, 2yzb:D, 2yzb:B, 2yzb:C, 2yzb:E, 2yzb:H, 2yzb:F, 2yzb:G, 2yzc:A, 2yzc:D, 2yzc:B, 2yzc:C, 2yzc:E, 2yzc:H, 2yzc:F, 2yzc:G, 2yzd:A, 2yzd:D, 2yzd:B, 2yzd:C, 2yzd:E, 2yzd:H, 2yzd:F, 2yzd:G, 2yze:A, 2yze:D, 2yze:B, 2yze:C, 2yze:E, 2yze:H, 2yze:F, 2yze:G
4	7f2w:A	300	264	0.2211	0.2167	0.2462	2.33e-14	7f2w:B
5	8oh8:BBB	303	207	0.1667	0.1617	0.2367	1.66e-10	8ofk:AAA, 8ofk:BBB, 8ofk:CCC, 8ofk:DDD, 8oh8:AAA, 8oh8:CCC, 8oh8:DDD, 8oih:AAA, 8oih:BBB, 8oih:CCC, 8oih:DDD, 8oiw:AAA, 8oiw:DDD, 8oiw:BBB, 8oiw:CCC
6	4rdr:A	706	103	0.0918	0.0382	0.2621	0.85
7	4rdt:A	635	109	0.0918	0.0425	0.2477	2.1	4rdt:B
8	1m2x:A	219	104	0.0782	0.1050	0.2212	2.9	1m2x:B, 1m2x:C, 1m2x:D
9	6vgs:BBB	543	122	0.1156	0.0626	0.2787	3.5	6vgs:AAA, 6vgs:CCC, 6vgs:DDD
10	8pi1:B	276	96	0.0884	0.0942	0.2708	3.6	3hea:A, 3hea:B, 3hea:C, 3hea:D, 3hea:E, 3hea:F, 3hi4:A, 3hi4:B, 3hi4:C, 3hi4:D, 3hi4:E, 3hi4:F, 3ia2:A, 3ia2:B, 3ia2:C, 3ia2:D, 3ia2:E, 3ia2:F, 8pi1:A, 8pi1:C, 8pi1:D, 8pi1:E, 8pi1:F, 8pi1:G, 8pi1:H, 8pi1:I, 8pi1:J, 8pi1:K, 8pi1:M, 8pi1:N, 8pi1:O
11	4rvw:A	610	105	0.0918	0.0443	0.2571	4.6
12	1d4m:1	284	49	0.0510	0.0528	0.3061	5.7
13	4c20:B	605	67	0.0544	0.0264	0.2388	9.4	4c20:A, 4c21:A, 4c21:B, 4c22:A, 4c22:B
14	1mqt:A	271	49	0.0578	0.0627	0.3469	9.9

[Back]