BioLiP

>protein
RTADLERARLGDDGLDFQDDAAQARAFAQGVFLLEIPEWLDLSAGDRFARQFFQGTGVEPYGKYRDLSSEHFGDELLGYH
SRVDQLEQFLLERRFWGEVYPSEIATLGEHLTLLSHRVLRSVLASAGIPEEDWHRASGGCSETNGSYHLTFNHYRSAHQD
IGLSSHKDDGFITVLRTTAQGLEVNRDDVWEKVPVDPACFVVNFGLSMEILTSACVTPLSAIMHRVSHQNFDRSSFGHFS
SSRCLPGADDGIYRYLPSAGLERVCGSRELIEENDHEIYM

The query sequence (length=280) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7v3n:A	317	280	0.9964	0.8801	0.9964	0.0	8hiv:A, 7v2t:A, 7v2u:A, 7v2x:A, 7v34:A, 7v36:A, 7v3e:A, 7v3e:B, 7v3e:C, 7v3o:A
2	6lsv:A	338	146	0.1643	0.1361	0.3151	8.88e-12	6lsv:B
3	5o9w:A	356	104	0.1250	0.0983	0.3365	4.62e-07
4	7ekd:A	343	83	0.1143	0.0933	0.3855	1.05e-05
5	6ku3:B	318	148	0.1536	0.1352	0.2905	4.13e-05	6ku3:A, 6ku3:D, 6ku3:C
6	6tto:A	311	95	0.1107	0.0997	0.3263	4.13e-05	6ttm:A, 6ttn:A
7	1gp6:A	349	152	0.1286	0.1032	0.2368	9.49e-05	2brt:A, 1gp4:A, 1gp5:A
8	5tcv:A	299	95	0.1107	0.1037	0.3263	1.93e-04	1wa6:X
9	8y4u:A	298	81	0.0857	0.0805	0.2963	5.91e-04
10	5gja:A	299	94	0.1036	0.0970	0.3085	0.002	5gj9:A, 5gj9:B, 5gja:B, 5gja:C, 5gja:D, 5gja:E, 5gja:F, 5gja:G, 5gja:H
11	8cvc:A	327	79	0.0893	0.0765	0.3165	0.003	8cv8:A, 8cv9:A, 8cva:A, 8cvb:A, 8cvd:A, 8cve:A, 8cvf:A, 8cvg:A, 8cvh:A
12	6kun:A	294	59	0.0857	0.0816	0.4068	0.006	6kun:B
13	6xjj:A	291	89	0.0929	0.0893	0.2921	0.34
14	8pbz:A	1003	63	0.0786	0.0219	0.3492	0.99	8pbz:D, 8pc0:A, 6r41:A, 6r43:A
15	7o6y:K	177	54	0.0607	0.0960	0.3148	1.4	6gcs:K, 7o71:K, 6rfq:K, 6rfr:K, 6rfs:K, 4wz7:K, 6y79:K, 6yj4:B
16	6in2:A	124	27	0.0500	0.1129	0.5185	2.3	5fg6:A, 5n49:B, 3rcw:C
17	5pny:B	124	27	0.0500	0.1129	0.5185	2.5	5amf:A, 5pnx:A, 5pnz:B, 5po0:A, 5po1:B, 5po2:A, 5po3:B, 5po4:B, 5po6:A, 5po7:A, 5po7:B, 5po8:A, 5po8:B, 5po9:A, 5po9:B, 5poa:B, 5pob:A, 5pob:B, 5poc:A, 5pod:A, 5pod:B, 5poe:A, 5poe:B, 5pof:A, 5pof:B, 5pog:A, 5pog:B, 5poh:A, 5poh:B, 5poi:A, 5poi:B, 5poj:A, 5poj:B, 5pok:A, 5pok:B, 5pol:A, 5pol:B, 5pom:A, 5pom:B, 5pon:A, 5pon:B, 5poo:A, 5poo:B, 5pop:A, 5pop:B, 5poq:A, 5poq:B, 5pos:A, 5pos:B, 5pot:A, 5pou:B, 5pov:A, 5pov:B, 5pow:A, 5pow:B, 5pox:A, 5poy:A, 5poy:B, 5poz:A, 5pp0:B
18	3m0v:C	433	60	0.0750	0.0485	0.3500	4.2	4gji:A, 4gji:B, 4gji:C, 4gji:D, 4gjj:A, 4gjj:B, 4gjj:C, 4gjj:D, 2hcv:A, 2hcv:B, 2hcv:C, 2hcv:D, 2i56:A, 2i56:B, 2i56:C, 2i56:D, 2i57:A, 2i57:B, 2i57:C, 2i57:D, 3itl:A, 3itl:B, 3itl:C, 3itl:D, 3ito:A, 3ito:B, 3ito:C, 3ito:D, 3itt:A, 3itt:B, 3itt:C, 3itt:D, 3itv:A, 3itv:B, 3itv:C, 3itv:D, 3itx:A, 3itx:B, 3itx:C, 3itx:D, 3iud:A, 3iud:B, 3iud:C, 3iud:D, 3iuh:A, 3iuh:B, 3iuh:C, 3iuh:D, 3iui:A, 3iui:B, 3iui:C, 3iui:D, 3m0h:A, 3m0h:B, 3m0h:C, 3m0h:D, 3m0l:A, 3m0l:B, 3m0l:C, 3m0l:D, 3m0m:A, 3m0m:B, 3m0m:C, 3m0m:D, 3m0v:A, 3m0v:B, 3m0v:D, 3m0x:A, 3m0x:B, 3m0x:C, 3m0x:D, 3m0y:A, 3m0y:B, 3m0y:C, 3m0y:D
19	7aqr:D	385	67	0.0714	0.0519	0.2985	4.5	7a23:G, 7a24:G, 7ar7:D, 7ar8:D, 7arb:D, 8bee:D, 8bpx:D, 8bq5:D, 8bq6:D, 8e73:S2, 6x89:S2
20	6kwa:A	267	178	0.1429	0.1498	0.2247	4.8	6kwa:B, 6kwb:A, 6kwb:B
21	7arc:B	154	62	0.0536	0.0974	0.2419	5.5	7ard:B
22	7arc:D	395	64	0.0714	0.0506	0.3125	7.1	7ard:D
23	8b9z:B	182	55	0.0500	0.0769	0.2545	9.2	8ba0:B, 8esw:S7, 8esz:S7

[Back]