Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
RRRVTVRKADAGGLGISIKGGRENKMPILISKIFKGLAADQTEALFVGDAILSVNGEDLSSATHDEAVQALKKTGKEVVL
EVKYMK

The query sequence (length=86) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2pdz:A 86 86 1.0000 1.0000 1.0000 1.16e-57
2 7p70:A 407 86 0.8023 0.1695 0.8023 1.10e-41 7pc4:A, 7qql:A
3 7qqn:C 414 85 0.4535 0.0942 0.4588 8.66e-21 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
4 4e34:A 87 84 0.4884 0.4828 0.5000 8.71e-21 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
5 5heb:A 119 83 0.4186 0.3025 0.4337 2.40e-12 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
6 8cn1:H 101 88 0.4419 0.3762 0.4318 2.01e-11 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
7 1n7f:A 86 76 0.3488 0.3488 0.3947 3.25e-11 1n7f:B
8 5ez0:D 95 72 0.2674 0.2421 0.3194 1.88e-10 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
9 2r4h:C 98 73 0.2791 0.2449 0.3288 4.88e-10
10 6xa7:B 96 74 0.3488 0.3125 0.4054 7.68e-10 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
11 3jxt:A 96 83 0.3953 0.3542 0.4096 9.43e-10 3jxt:B
12 6hks:B 94 72 0.2907 0.2660 0.3472 1.08e-09 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
13 2qt5:A 194 81 0.3488 0.1546 0.3704 1.51e-09 2qt5:B
14 2qt5:A 194 85 0.3488 0.1546 0.3529 5.00e-08 2qt5:B
15 4wyu:A 201 88 0.4535 0.1940 0.4432 1.53e-09 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
16 4wyu:A 201 90 0.3837 0.1642 0.3667 1.04e-05 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
17 2ka9:A 189 84 0.4186 0.1905 0.4286 1.67e-09 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
18 2ka9:A 189 75 0.3837 0.1746 0.4400 3.38e-08 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
19 7pc3:A 405 75 0.3953 0.0840 0.4533 2.41e-09 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
20 8bq8:C 93 85 0.4186 0.3871 0.4235 2.74e-08 8bq8:A, 8bq8:B
21 2exg:A 101 82 0.3488 0.2970 0.3659 6.71e-08 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
22 8c1t:A 90 78 0.3488 0.3333 0.3846 8.26e-08 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
23 1b8q:A 127 76 0.3256 0.2205 0.3684 1.31e-07
24 7pc5:A 405 63 0.3256 0.0691 0.4444 5.46e-07
25 8b82:A 108 78 0.3721 0.2963 0.4103 5.50e-07 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
26 2koh:A 111 75 0.3023 0.2342 0.3467 6.59e-07 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
27 7p73:A 420 77 0.3488 0.0714 0.3896 7.86e-07 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
28 7weg:B 96 74 0.3488 0.3125 0.4054 1.01e-06 7weg:A
29 4ydp:A 83 73 0.2558 0.2651 0.3014 1.23e-06 4ydp:B
30 5wou:A 95 80 0.3721 0.3368 0.4000 1.59e-06
31 7x2e:A 163 62 0.3023 0.1595 0.4194 5.81e-06 2kbs:A
32 7d6f:A 87 57 0.2442 0.2414 0.3684 1.05e-05
33 2l4t:A 124 93 0.3721 0.2581 0.3441 1.55e-05 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
34 2m0z:A 97 70 0.2907 0.2577 0.3571 1.74e-05 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
35 8bv7:A 95 58 0.2791 0.2526 0.4138 2.44e-05 8buw:A, 8buw:B
36 1zub:A 109 84 0.2907 0.2294 0.2976 2.83e-05
37 6gbe:A 119 79 0.3140 0.2269 0.3418 4.42e-05
38 5zys:A 90 65 0.2558 0.2444 0.3385 4.56e-05
39 8bp4:A 93 81 0.3023 0.2796 0.3210 5.25e-05 8bp4:C, 8bp4:B
40 6kz1:A 97 70 0.3023 0.2680 0.3714 8.51e-05 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
41 2i0i:A 81 79 0.3837 0.4074 0.4177 9.19e-05 2i0i:B, 2i0i:C
42 2ejy:A 85 81 0.2558 0.2588 0.2716 6.55e-04
43 6ar4:B 87 79 0.2558 0.2529 0.2785 0.003 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
44 1ihj:B 95 86 0.3023 0.2737 0.3023 0.003 1ihj:A
45 2egn:A 83 84 0.2791 0.2892 0.2857 0.017
46 4wsi:A 372 69 0.2558 0.0591 0.3188 0.019 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
47 2os6:A 89 82 0.2674 0.2584 0.2805 0.031
48 7pcb:A 415 53 0.2209 0.0458 0.3585 0.044 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
49 4xh7:A 110 72 0.2326 0.1818 0.2778 0.069
50 2kaw:A 90 62 0.2442 0.2333 0.3387 0.069 6lcb:A, 2mx6:A
51 6x23:A 89 38 0.1512 0.1461 0.3421 0.098
52 2kqf:A 96 33 0.1512 0.1354 0.3939 0.11 2kyl:A
53 2m0u:A 117 70 0.2093 0.1538 0.2571 0.14
54 1l6o:A 95 71 0.2674 0.2421 0.3239 0.20 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
55 6zbq:A 89 70 0.2674 0.2584 0.3286 0.22 6zc4:A
56 3vqg:A 85 55 0.1744 0.1765 0.2727 0.24
57 7w6z:A 414 55 0.2674 0.0556 0.4182 0.28 7w6y:A
58 3bpu:A 86 47 0.1860 0.1860 0.3404 0.28
59 3tsz:A 341 68 0.2674 0.0674 0.3382 0.29 3shw:A
60 6nid:B 88 77 0.2442 0.2386 0.2727 0.41 6nid:A, 6nid:C
61 6yx0:B 112 93 0.2326 0.1786 0.2151 0.51 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
62 7qqm:A 413 89 0.2907 0.0605 0.2809 0.59
63 1u38:A 89 43 0.1512 0.1461 0.3023 0.60
64 5f67:A 98 74 0.2907 0.2551 0.3378 0.72 5f67:B
65 8blu:B 195 87 0.2558 0.1128 0.2529 0.79 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
66 3s6b:A 345 47 0.1860 0.0464 0.3404 2.1
67 8csd:A 397 22 0.1395 0.0302 0.5455 2.3 8csb:A, 8csb:B, 8csc:A, 8csc:B, 8csd:B, 8cse:B, 8cse:A, 8csf:A, 8csf:B, 5fa1:A, 5fa1:B
68 1ls5:A 328 41 0.1860 0.0488 0.3902 3.3 5i70:A, 5i70:B, 1ls5:B
69 3qo6:B 328 38 0.1744 0.0457 0.3947 4.2 3qo6:A, 3qo6:C
70 3hjb:B 551 68 0.2558 0.0399 0.3235 5.5
71 6ezi:A 86 54 0.1977 0.1977 0.3148 6.1 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
72 1n7t:A 103 80 0.2558 0.2136 0.2750 6.3 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
73 2j1p:A 276 27 0.1512 0.0471 0.4815 8.3
74 4c2c:A 433 75 0.2558 0.0508 0.2933 9.6 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417