BioLiP

>protein
RRRLGVMGGTFDPIHNGHLVAASEVADRFALDEVIFVPTGQRKVSPAEHRYLMTVIATASNPRFTVSRADIDRGGATYTV
DTLTDLRTAHPDADLYFITGADALASILSWENWEQLFTLAKFIGVSRPGYELSGLSLVEVPALAISSTDCRIRAGQARPI
WYLVPDGVVQYVAKHRLYSG

The query sequence (length=180) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4ymi:B	198	197	1.0000	0.9091	0.9137	5.71e-126	5db4:A, 5deo:A, 5deo:B, 5deo:C, 5deo:D, 5vir:A, 5vir:B, 4ymi:A
2	5db4:B	175	182	0.9611	0.9886	0.9505	2.42e-121
3	5das:A	198	194	0.7833	0.7121	0.7268	1.64e-99	6buv:B, 4s1o:A, 4ybr:A, 4ybr:B
4	5das:C	180	183	0.7611	0.7611	0.7486	2.52e-94	5das:B, 5das:D, 4s1o:B
5	1kaq:A	186	186	0.3889	0.3763	0.3763	2.68e-43	1kaq:B, 1kaq:C, 1kaq:D, 1kaq:E, 1kaq:F
6	3e27:C	189	188	0.3778	0.3598	0.3617	1.09e-40	3e27:A, 3e27:B, 3e27:D, 3hfj:A, 3hfj:B, 3mla:A, 3mla:B, 3mlb:A, 3mlb:B, 3mmx:B, 3mmx:C, 3mmx:A, 3mmx:D, 2qtn:B, 2qtr:A, 2qtr:B, 2qtr:C
7	8aih:A	184	183	0.3611	0.3533	0.3552	1.90e-37	8aii:A, 9fyb:A, 9fyb:B
8	1yum:A	212	208	0.3667	0.3113	0.3173	1.76e-28	1yum:B, 1yum:C, 1yum:D, 1yun:A, 1yun:B
9	4wso:A	227	222	0.4389	0.3480	0.3559	4.73e-28	4wso:B
10	2h2a:A	189	187	0.3000	0.2857	0.2888	2.09e-26	2h29:A, 2h29:B, 2h2a:B
11	1k4m:A	213	207	0.3278	0.2770	0.2850	5.94e-22	1k4m:B, 1k4m:C
12	5llt:A	205	200	0.2500	0.2195	0.2250	9.83e-09	5llt:B, 5lm3:A
13	1kqo:A	233	208	0.3556	0.2747	0.3077	2.26e-08	1gzu:A, 1gzu:B, 1gzu:C, 1kqn:A, 1kqn:B, 1kqn:C, 1kqn:D, 1kqn:E, 1kqn:F, 1kqo:B, 1kqo:C, 1kqo:D, 1kqo:E, 1kqo:F, 1kr2:A, 1kr2:B, 1kr2:C, 1kr2:D, 1kr2:E, 1kr2:F, 8qe8:4, 8qe8:3
14	1nup:A	213	206	0.2778	0.2347	0.2427	4.68e-06	1nup:B, 1nuq:A, 1nuq:B, 1nus:A, 1nus:B, 1nut:A, 1nut:B, 1nuu:A, 1nuu:B
15	3nd6:A	152	68	0.1333	0.1579	0.3529	0.056	3nd6:B, 3nd6:C, 3nd6:D, 3nd6:E, 3nd6:F, 3nd7:A, 3nd7:B, 3nd7:C, 3nd7:D, 3nd7:E, 3nd7:F
16	3otw:A	157	18	0.0500	0.0573	0.5000	0.69	3otw:D, 3otw:B, 3otw:C, 3otw:E, 3otw:F
17	3ele:A	398	84	0.1333	0.0603	0.2857	1.3	3ele:B, 3ele:C, 3ele:D
18	4nah:C	160	31	0.0778	0.0875	0.4516	1.4	3f3m:A, 4nah:A, 4nah:B, 4nah:D, 4nah:E, 4nah:F, 4nat:A, 4nat:B, 4nat:C, 4nau:A, 4nau:B, 4nau:C
19	1f9a:A	164	31	0.0667	0.0732	0.3871	1.8	1f9a:B, 1f9a:C, 1f9a:D, 1f9a:E, 1f9a:F
20	8cli:C	579	51	0.0944	0.0294	0.3333	3.0	8clj:C, 8clj:H
21	9iye:B	173	28	0.0778	0.0809	0.5000	3.5	8i8j:A, 8i8j:B, 8i8j:C, 8i8j:D, 8i8j:E, 8i8j:F, 8i8k:A, 8i8k:B, 8i8k:C, 8i8k:D, 8i8k:E, 8i8k:F, 8i8l:A, 8i8l:B, 8i8l:C, 8i8l:D, 8i8l:E, 8i8l:F, 8i8m:A, 8i8m:B, 8i8m:C, 8i8m:D, 8i8m:E, 8i8m:F, 8i8n:A, 8i8n:B, 8i8n:C, 8i8n:D, 8i8n:E, 8i8n:F, 8i8o:A, 8i8o:B, 8i8o:C, 8i8o:D, 8i8o:E, 8i8o:F, 9iye:A, 9iye:C, 9iye:D, 9iye:E, 9iye:F, 9iyf:A, 9iyf:B, 9iyf:C, 9iyf:D, 9iyf:E, 9iyf:F, 9iyh:A, 9iyh:B, 9iyh:C, 9iyh:D, 9iyh:E, 9iyh:F, 8zn2:A, 8zn2:B, 8zn2:C, 8zn2:D, 8zn2:E, 8zn2:F, 8zn3:A, 8zn3:B, 8zn3:C, 8zn3:D, 8zn3:E, 8zn3:F
22	3l92:A	159	15	0.0556	0.0629	0.6667	4.2
23	1lw7:A	344	19	0.0444	0.0233	0.4211	5.4
24	6a6d:A	163	27	0.0722	0.0798	0.4815	5.8	6a75:A, 6a7d:A, 8i8p:A, 6j3m:A, 6jnh:A, 6jog:A, 6kkw:A, 5yh7:A, 5yrr:A, 5zzc:A
25	6cck:B	160	35	0.0722	0.0813	0.3714	6.8	1b6t:B, 6b7a:A, 6b7a:B, 6b7b:A, 6b7b:B, 6b7c:A, 6b7c:B, 6b7d:A, 6b7e:B, 6b7f:A, 6b7f:B, 6cck:A, 6ccl:A, 6ccl:B, 6ccm:A, 6ccn:A, 6ccn:B, 6cco:A, 6ccq:A, 6ccq:B, 6ccs:A, 6ccs:B, 6chl:A, 6chl:B, 6chm:A, 6chm:B, 6chn:A, 6chn:B, 6cho:A, 6cho:B, 6chp:A, 6chp:B, 6chq:A, 6ckw:A, 6ckw:B, 1gn8:A, 1gn8:B, 1h1t:A, 1h1t:B, 1qjc:B
26	3bxd:A	258	34	0.0611	0.0426	0.3235	8.2	2huo:A

[Back]