BioLiP

>protein
RRGSRFTWRKECLAVMESYFNENQYPDEAKREEIANACNAVIQKPGKKLSDLERVTSLKVYNWFANRRKEIKRRAN

The query sequence (length=76) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4j19:A	77	74	0.9737	0.9610	1.0000	6.27e-51	4j19:B
2	2h8r:A	176	77	0.3553	0.1534	0.3506	1.59e-05	2h8r:B
3	8pi9:B	177	74	0.3289	0.1412	0.3378	6.63e-05	1ic8:A, 1ic8:B, 8pi7:A, 8pi7:B, 8pi8:A, 8pi8:B, 8pi9:A, 8pia:A, 8pia:B
4	1fjl:A	65	72	0.2895	0.3385	0.3056	5.24e-04	1fjl:B, 1fjl:C
5	2lkx:A	68	74	0.3158	0.3529	0.3243	7.20e-04
6	3cmy:A	60	67	0.2895	0.3667	0.3284	0.003
7	9b8u:B	66	39	0.1974	0.2273	0.3846	0.034	9b8u:A, 9b8u:C, 9b8u:D
8	8ejo:A	56	67	0.2632	0.3571	0.2985	0.053	8ejo:B, 8ejp:A, 8ejp:B
9	1lfu:P	82	70	0.2763	0.2561	0.3000	0.18	1b72:B, 1b8i:B, 4cyc:B, 1puf:B, 2r5y:B, 2r5z:B, 4uus:B, 4uus:F, 5zjq:B, 5zjr:B, 5zjs:B, 5zjt:B
10	1mnm:C	77	75	0.3289	0.3247	0.3333	0.23	1mnm:D
11	1akh:B	78	75	0.3289	0.3205	0.3333	0.24	1apl:C, 1apl:D, 1k61:A, 1k61:B, 1k61:C, 1k61:D, 1le8:B, 1yrn:B
12	4egc:A	539	65	0.2368	0.0334	0.2769	0.26
13	8osb:E	62	71	0.2500	0.3065	0.2676	0.27
14	3a01:F	61	56	0.2105	0.2623	0.2857	0.50	3a01:B, 3lnq:A
15	1le8:A	53	55	0.1974	0.2830	0.2727	0.51	1akh:A, 1yrn:A
16	3jys:A	479	33	0.1974	0.0313	0.4545	0.82
17	1ig7:A	58	61	0.2237	0.2931	0.2787	1.0
18	3j7a:S	128	49	0.2105	0.1250	0.3265	1.2	3jbn:S, 3jbo:S, 3jbp:S, 6okk:S, 8tpu:SS
19	4rdu:D	62	61	0.2105	0.2581	0.2623	1.3	4rdu:A, 4xrs:I, 4xrs:G
20	2me6:A	71	73	0.3158	0.3380	0.3288	2.2
21	5flv:M	229	28	0.1447	0.0480	0.3929	2.8	5flv:A, 5flv:E, 5flv:I, 4s0h:A, 4s0h:B, 4s0h:E, 4s0h:F, 6wc2:N, 6wc2:M, 6wc2:O, 6wc5:I, 6wc5:N, 2x6u:A, 2x6v:A, 2x6v:B
22	4uus:A	67	58	0.1974	0.2239	0.2586	3.7	4uus:E
23	9bh5:AS	148	26	0.1316	0.0676	0.3846	3.8	9cai:AS
24	7oho:AAA	605	32	0.1711	0.0215	0.4062	4.0	6qh5:A, 8t1o:A, 4uqi:A, 2vgl:A
25	4xrm:B	64	25	0.1447	0.1719	0.4400	4.0	5bng:B, 5bng:A, 5eg0:A, 5ego:A, 8vts:B, 8vts:D, 8vtt:D, 4xrm:A, 4xrs:A, 4xrs:B
26	1nk2:P	77	28	0.1579	0.1558	0.4286	4.4	1nk3:P
27	7d4i:RP	2084	23	0.1184	0.0043	0.3913	4.5	7d5t:RP
28	6lqs:RP	2180	23	0.1184	0.0041	0.3913	4.9	7d63:RP, 6lqp:RP, 6lqq:RP, 6lqr:RP, 6lqt:RP, 6lqu:RP, 6lqv:RP
29	7ao3:A	303	41	0.1579	0.0396	0.2927	5.0	7ao0:A, 7ao0:B, 7ao1:A, 7ao1:B, 7ao2:A, 7ao2:B, 7ao3:B, 7ao5:A, 7ao5:B, 6ggi:A, 6ggi:B, 6ggj:A, 6ggj:B, 6ggk:A, 6ggk:B, 6ggl:A, 6ggl:B, 5gue:A, 5gue:B, 5gue:C, 5gue:D, 8qws:A, 8qws:B
30	3pfq:A	523	55	0.1842	0.0268	0.2545	5.1	1a25:A, 1a25:B, 2i0e:A, 2i0e:B
31	4r2w:D	251	42	0.1447	0.0438	0.2619	6.0	7q2w:FFF, 4r2w:A, 4r2w:B, 4r2w:C, 4r2w:E, 4r2w:F, 4r2x:C, 4r2x:D, 4r2x:E, 4r2x:F, 4r2x:A, 4r2x:B, 4yjk:D, 4yjk:F, 4yjk:A
32	3rkq:A	58	68	0.2105	0.2759	0.2353	6.2	3rkq:B
33	3a01:A	78	73	0.2500	0.2436	0.2603	6.4	3a01:E
34	8w0o:A	259	33	0.1579	0.0463	0.3636	7.2	8w0n:A, 8w0n:B, 8w0o:B, 8w0o:C, 8w0o:D, 8w0o:E, 8w0o:H, 8w0o:F, 8w0o:G
35	6m3d:C	108	32	0.1447	0.1019	0.3438	7.3	1du0:A, 1du0:B, 1hdd:C, 1hdd:D, 2hdd:A, 2hdd:B, 3hdd:A, 3hdd:B, 2hos:A, 2hos:B, 2hot:A, 2hot:B
36	6m3d:C	108	32	0.1447	0.1019	0.3438	7.3	1du0:A, 1du0:B, 1hdd:C, 1hdd:D, 2hdd:A, 2hdd:B, 3hdd:A, 3hdd:B, 2hos:A, 2hos:B, 2hot:A, 2hot:B
37	5ere:A	540	12	0.1053	0.0148	0.6667	7.4
38	1b72:A	68	62	0.2632	0.2941	0.3226	8.7
39	5ztf:A	972	21	0.1579	0.0123	0.5714	10.0

[Back]