Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
RPEWIWLALGTALMGLGTLYFLVKGMGVSDPDAKKFYAITTLVPAIAFTMYLSMLLGYGLTMVPFGGEQNPIYWARYADW
LFTTPLLLLDLALLVDADQGTILALVGADGIMIGTGLVGALTKVYSYRFVWWAISTAAMLYILYVLFFGFTSKAESMRPE
VASTFKVLRNVTVVLWSAYPVVWLIGSEGAGIVPLNIETLLFMVLDVSAKVGFGLILLR

The query sequence (length=219) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1cwq:A 238 219 1.0000 0.9202 1.0000 1.24e-154 5a44:A, 5a45:A, 1ap9:A, 1at9:A, 2at9:A, 5b34:A, 5b35:A, 5b6v:A, 5b6w:A, 5b6x:A, 5b6y:A, 5b6z:A, 1bm1:A, 1brr:B, 1brr:A, 1brr:C, 1brx:A, 2brd:A, 5br2:A, 5br5:A, 1c3w:A, 1c8r:A, 3coc:A, 3coc:B, 3cod:A, 3cod:B, 1cwq:B, 1dze:A, 1e0p:A, 1f4z:A, 1f50:A, 1fbb:A, 1fbk:A, 4fpd:A, 6g7h:A, 6g7i:A, 6g7j:A, 6g7k:A, 6g7l:A, 6ga1:A, 6ga2:A, 6ga3:A, 6ga4:A, 6ga5:A, 6ga6:A, 6ga7:A, 6ga8:A, 6ga9:A, 6gaa:A, 6gab:A, 6gac:A, 6gad:A, 6gae:A, 6gaf:A, 6gag:A, 6gah:A, 6gai:A, 5h2h:A, 5h2i:A, 5h2j:A, 5h2k:A, 5h2l:A, 5h2m:A, 5h2n:A, 5h2o:A, 5h2p:A, 3han:A, 3hao:A, 3hao:B, 3hap:A, 3haq:A, 3har:A, 3has:A, 4hwl:A, 4hwl:B, 4hyx:A, 4hyx:B, 2i1x:A, 2i20:A, 2i21:A, 1iw6:A, 1iw9:A, 1ixf:A, 5j7a:A, 1jv6:A, 1jv7:A, 1kg8:A, 1kg9:A, 1kgb:A, 1kme:A, 1kme:B, 1m0k:A, 1m0l:A, 1m0m:A, 3mbv:A, 4md1:A, 4md2:A, 1mgy:A, 3ns0:A, 3nsb:A, 2ntu:A, 2ntw:A, 1o0a:A, 4ov0:A, 1p8h:A, 1p8i:A, 1p8u:A, 1pxr:A, 1pxr:B, 1pxs:A, 1pxs:B, 1py6:A, 1py6:B, 7q35:A, 7q38:A, 1q5i:A, 1q5i:B, 1q5j:A, 1q5j:B, 1qhj:A, 1qko:A, 1qkp:A, 1qm8:A, 1r2n:A, 1r84:A, 6rmk:A, 6rnj:A, 6rph:A, 6rqo:A, 6rqp:A, 1s51:A, 1s51:B, 1s52:A, 1s52:B, 1s53:A, 1s53:B, 1s54:A, 1s54:B, 1s8j:A, 1s8l:A, 3t45:A, 3t45:B, 3t45:C, 1tn0:A, 1tn0:B, 1tn5:A, 1tn5:B, 1ucq:A, 3utv:A, 3utw:A, 3utx:A, 3utx:B, 3uty:A, 3uty:B, 3vhz:A, 3vi0:A, 1vjm:A, 7vso:A, 2wjk:A, 2wjl:A, 1x0i:1, 1x0k:1, 1x0s:A, 4x31:A, 4x32:A, 1xji:A, 7xjc:A, 7xjd:A, 7xje:A, 4xxj:A, 4xxj:C, 4xxj:B, 4y9h:A, 7z0e:P, 2zfe:A, 5zil:A, 5zim:A, 5zin:A, 2zzl:A
2 1c8s:A 196 216 0.8813 0.9847 0.8935 2.51e-129
3 1brd:A 170 218 0.7717 0.9941 0.7752 4.86e-85
4 6gux:A 241 219 0.6073 0.5519 0.6073 4.33e-79 6guy:A, 6guz:A, 6s63:A, 6s6c:A, 1uaz:A, 1uaz:B, 7zy3:A
5 2z55:A 242 220 0.5616 0.5083 0.5591 3.60e-71 2ei4:A, 1vgo:A, 1vgo:B, 3wqj:A, 2z55:B, 2z55:D, 2z55:E
6 5itc:A 228 218 0.5571 0.5351 0.5596 4.20e-67 5itc:B, 5itc:C, 5ite:A, 5ite:B, 5ite:C, 5kkh:A, 5kkh:B, 5kkh:C, 4qi1:A, 4qi1:B, 4qi1:C, 4qid:A, 4qid:B, 4wav:A, 4wav:B
7 4l35:A 244 223 0.5616 0.5041 0.5516 1.29e-65 4jr8:A, 4pxk:A
8 4fbz:A 238 219 0.5571 0.5126 0.5571 1.26e-58
9 8wew:A 233 220 0.4658 0.4378 0.4636 2.59e-55 8wew:B
10 6lm0:C 242 213 0.3607 0.3264 0.3709 6.85e-42 6lm0:A, 6lm0:B
11 7zoy:A 226 215 0.3379 0.3274 0.3442 5.67e-40 7zou:A, 7zov:A
12 6kfq:A 229 221 0.4566 0.4367 0.4525 3.12e-39
13 6lm1:A 226 204 0.3425 0.3319 0.3676 3.75e-35 6lm1:B, 6lm1:C
14 6xl3:A 223 215 0.3379 0.3318 0.3442 8.69e-30 6k6i:A, 6k6j:A, 6k6k:A, 6wp8:A, 6xl3:B
15 8h79:A 236 215 0.3014 0.2797 0.3070 2.16e-29
16 5ahz:A 243 219 0.3470 0.3128 0.3470 4.24e-26 5ahy:A, 1e12:A, 5g36:A, 2jaf:A, 2jag:A
17 5b0w:A 261 230 0.3333 0.2797 0.3174 6.45e-24 3a7k:A, 3a7k:D, 3a7k:B, 3abw:A, 3abw:D, 3abw:B, 5b0w:E, 5b0w:B, 5b0w:F, 5b0w:D, 5b0w:G, 5etz:A, 5etz:B, 5etz:D, 3qbg:A, 3qbg:B, 3qbg:D, 3qbi:A, 3qbi:B, 3qbi:D, 3qbk:A, 3qbk:D, 3qbk:B, 3qbl:A, 3qbl:B, 3qbl:D, 4qry:A, 4qry:E, 4qry:B, 4qry:F, 4qry:C, 4qry:G, 3vvk:A, 3vvk:D, 3vvk:B, 3vvk:E, 3vvk:C, 3vvk:F
18 2ksy:A 247 210 0.2877 0.2551 0.3000 3.18e-20 2f93:A, 2f95:A, 1gu8:A, 1gue:A, 4gyc:A, 1h2s:A, 1h68:A, 1jgj:A, 5jje:A, 5jjf:A, 5jjj:A, 5jjn:A, 5jjn:C, 7pnc:A, 7q88:A, 3qap:A, 3qdc:A, 8qqo:A, 7zcm:A
19 7w74:A 226 222 0.3790 0.3673 0.3739 3.24e-19 7w74:B
20 2m3g:A 229 187 0.2648 0.2533 0.3102 5.94e-17 2m3g:B, 2m3g:C, 4tl3:A, 4tl3:B, 1xio:A
21 6gyh:A 225 148 0.2694 0.2622 0.3986 1.55e-16
22 3am6:A 224 192 0.3196 0.3125 0.3646 4.49e-15 3am6:B, 3am6:C, 3am6:D
23 7ytb:B 255 217 0.3059 0.2627 0.3088 5.32e-14 8i2z:A, 7ytb:A
24 5awz:A 235 176 0.2511 0.2340 0.3125 1.63e-12 5ax0:A, 5ax1:A
25 6nwd:A 246 147 0.1963 0.1748 0.2925 7.32e-10
26 7d7q:B 310 200 0.2329 0.1645 0.2550 7.43e-10 7cj3:A, 7cj3:B, 7d7q:A
27 7e4g:A 199 214 0.2374 0.2613 0.2430 7.97e-10 7e4g:B, 7e4g:C
28 4hyj:A 236 211 0.3014 0.2797 0.3128 1.09e-09 4hyj:B
29 4jq6:B 203 214 0.2922 0.3153 0.2991 3.33e-09 4jq6:A, 4jq6:C
30 6csm:D 277 154 0.1826 0.1444 0.2597 2.83e-08 6csm:A, 6csm:B, 6csm:C, 7l1e:B
31 3ddl:A 252 152 0.1963 0.1706 0.2829 3.71e-08 3ddl:B
32 7q37:A 217 209 0.2283 0.2304 0.2392 2.41e-07
33 8ifu:A 259 187 0.2055 0.1737 0.2406 2.71e-06 8gi9:A, 8ifu:B, 8ifu:C
34 7c86:A 296 167 0.2009 0.1486 0.2635 3.69e-06 6csn:A, 6cso:A, 7e6x:A, 7e6y:A, 7e6z:A, 7e70:A, 7e71:A, 3ug9:A, 4yzi:A
35 4kly:B 232 214 0.2831 0.2672 0.2897 1.24e-05 4kly:A, 4kly:C, 4kly:D, 4kly:E, 4knf:A, 4knf:B, 4knf:C, 4knf:D, 4knf:E
36 6rf0:C 275 246 0.2877 0.2291 0.2561 1.50e-05 8cl7:A, 8cl8:A, 7q36:A, 6rex:A, 6rex:B, 6rex:C, 6rex:D, 6rex:E, 6rez:A, 6rez:B, 6rez:C, 6rez:D, 6rez:E, 6rf0:A, 6rf0:E, 6rf0:B, 6rf0:D, 6rf1:A, 6rf1:E, 6rf1:B, 6rf1:C, 6rf1:D, 6rf3:A, 6rf3:B, 6rf3:C, 6rf3:D, 6rf3:E, 6rf4:A, 6rf4:B, 6rf4:C, 6rf4:D, 6rf4:E, 6rf5:A, 6rf6:A, 6rf7:A, 6rf9:A, 6rfa:A, 6rfb:A, 6rfc:A, 6tk1:A, 6tk2:A, 6tk3:A, 6tk4:A, 6tk5:A, 6tk6:A, 6tk7:A, 3x3b:A, 3x3c:A, 4xtl:A, 4xtn:A, 4xtn:B, 4xtn:C, 4xtn:D, 4xtn:E, 4xtn:F, 4xtn:G, 4xtn:H, 4xtn:I, 4xtn:J, 4xto:A, 4xto:B, 4xto:C, 4xto:D, 4xto:E, 6xyt:A, 6xyt:B, 6xyt:C, 6xyt:D, 6xyt:E, 6yby:A, 6ybz:A, 6ybz:B, 6ybz:C, 6ybz:D, 6ybz:E, 6yc0:A, 6yc0:B, 6yc0:C, 6yc0:D, 6yc0:E, 6yc1:A, 6yc1:B, 6yc1:C, 6yc1:D, 6yc1:E, 6yc2:A, 6yc2:B, 6yc2:C, 6yc2:D, 6yc2:E, 6yc3:A, 6yc3:B, 6yc3:C, 6yc3:D, 6yc3:E, 6yc4:A, 6yc4:B, 6yc4:C, 6yc4:D, 6yc4:E, 6yt4:A, 6yt4:B, 6yt4:D, 6yt4:E, 6yt4:C
37 8h87:A 259 204 0.2009 0.1699 0.2157 5.04e-05
38 8cqd:A 242 217 0.2785 0.2521 0.2811 5.69e-05 7b03:A, 7b03:B, 7b03:C, 7b03:D, 7b03:E, 8cqc:A, 8cqc:B, 8cqc:C, 8cqc:D, 8cqc:E, 8cqd:B, 8cqd:C, 8cqd:E, 8cqd:F, 8cqd:D, 2l6x:A
39 8jh0:B 265 167 0.1918 0.1585 0.2515 9.92e-05 8jh0:A
40 8jxo:A 262 144 0.1553 0.1298 0.2361 1.35e-04 8jxo:D, 8jxo:E, 8jxp:A, 8jxp:B, 8jxp:C
41 6eid:A 247 167 0.1781 0.1579 0.2335 1.63e-04 8zam:A, 8zam:B, 8zan:A, 8zan:B
42 7sfj:A 284 161 0.1689 0.1303 0.2298 8.46e-04 7sfj:B, 7sfj:C, 7sfk:A, 7sfk:B, 7sfk:C, 7w9w:A
43 8zao:A 259 208 0.2009 0.1699 0.2115 0.003 8gi8:A, 8h86:A, 8iu0:A, 8zao:B, 8zao:C, 8zap:A, 8zap:B, 8zap:C, 8zaq:A, 8zaq:B, 8zaq:C
44 5fjg:A 269 148 0.1826 0.1487 0.2703 0.008 6ab9:A, 6aba:A, 5b2n:A, 7cri:A, 7crj:A, 7crk:A, 7crl:A, 7crs:A, 7crt:A, 7crx:A, 7cry:A, 5g28:A, 5g2a:A, 5g2c:A, 5g2d:A, 5g54:A, 6jy6:A, 6jy7:A, 6jy8:A, 6jy9:A, 6jya:A, 6jyb:A, 6jyc:A, 6jyd:A, 6jye:A, 6jyf:A, 7o8f:A, 7o8g:A, 7o8h:A, 7o8i:A, 7o8j:A, 7o8k:A, 7o8l:A, 7o8m:A, 7o8n:A, 7o8o:A, 7o8p:A, 7o8q:A, 7o8r:A, 7o8s:A, 7o8t:A, 7o8u:A, 7o8v:A, 7o8y:A, 7o8z:A, 7vgt:A, 7vgu:A, 7vgv:A, 7vgv:B, 7vgv:C, 5ztk:A, 5ztl:A
45 8yel:A 265 152 0.1644 0.1358 0.2368 0.009
46 6sqg:E 212 117 0.1324 0.1368 0.2479 0.027 6sqg:A, 6sqg:B, 6sqg:C, 6sqg:D
47 5mcp:E 387 73 0.1050 0.0594 0.3151 0.076 5mcp:G
48 6eyu:A 232 133 0.1735 0.1638 0.2857 0.096 6eyu:B, 6eyu:C
49 4af0:A 395 88 0.1096 0.0608 0.2727 0.29 4af0:B
50 5mcp:C 446 79 0.1142 0.0561 0.3165 0.75 5mcp:A, 5mcp:B, 5mcp:D, 6rpu:A
51 4z0g:B 390 72 0.1050 0.0590 0.3194 1.6 4xtd:A, 4xtd:B, 4xti:A, 4xti:B, 4z0g:A
52 8aji:A 348 28 0.0411 0.0259 0.3214 1.7 8aji:B, 8aji:C, 8aji:D, 8akh:A, 8akh:B
53 4z87:A 498 72 0.1050 0.0462 0.3194 1.9 5tc3:A, 5tc3:B, 4z87:B, 4z87:C, 4z87:D
54 3cx5:C 385 48 0.0685 0.0390 0.3125 3.5 3cx5:N, 3cxh:C, 3cxh:N, 8e7s:J, 8e7s:j, 8ec0:J, 8ec0:j, 1ezv:C, 6giq:C, 6giq:N, 6hu9:C, 6hu9:N, 2ibz:C, 1kb9:C, 1kyo:C, 1kyo:N, 1p84:C, 4pd4:C, 6t0b:C, 6t0b:N, 6t15:C, 6t15:N, 6ymx:C, 6ymx:N
55 1kpl:B 451 82 0.1142 0.0554 0.3049 3.5 1kpl:A, 1kpl:C, 1kpl:D
56 8c51:A 449 70 0.1005 0.0490 0.3143 4.7 8c51:B, 8c53:A, 8c53:B, 8cgy:A, 8cgy:B, 6rfu:A, 6rfu:B
57 3ala:D 711 130 0.1461 0.0450 0.2462 6.0 3ala:A, 3ala:B, 3ala:C, 3ala:E, 3ala:F, 3ala:G, 4btw:A, 4btw:B, 4btx:A, 4btx:B, 4bty:A, 4bty:B, 2c10:A, 2c10:B, 2c10:C, 2c10:D, 2c11:A, 2c11:B, 2c11:C, 2c11:D, 1pu4:A, 1pu4:B, 1us1:A, 1us1:B, 2y73:A, 2y73:B, 2y74:A, 2y74:B
58 7rje:K 384 52 0.0731 0.0417 0.3077 7.8 7rja:K, 7rja:T, 7rjb:K, 7rjc:K, 7rjd:K, 7rje:T

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218