BioLiP

>protein
RMKQIEDKIEEIESKQKKIENEIARIKKLLQLTVWGIKQLQARIL

The query sequence (length=45) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1czq:A	45	45	1.0000	1.0000	1.0000	3.89e-24	1gzl:A, 1gzl:B, 3l35:A, 3l35:C, 3l35:B, 3l36:A, 3l37:A, 3mgn:D, 3mgn:F, 3mgn:A, 3mgn:C, 3mgn:E, 3mgn:B, 6psa:A, 2q3i:A, 2r3c:A, 2r3c:B, 2r5b:A, 2r5b:C, 2r5b:B, 2r5d:A, 2r5d:C, 2r5d:B
2	1fav:A	78	69	0.8222	0.4744	0.5362	1.82e-11	6j5e:G, 6tvq:AaA, 6tvu:AaA, 6tvw:CCC, 3vgx:C, 3vu5:A, 3vu6:A, 3w19:C, 5yb4:E, 5yb4:F, 5yb4:D
3	2bni:C	34	30	0.5111	0.6765	0.7667	4.86e-08	2bni:D, 1u9h:A
4	1uny:B	30	30	0.5111	0.7667	0.7667	1.41e-07
5	1ysa:C	57	30	0.4222	0.3333	0.6333	1.88e-07	1dgc:A, 2dgc:A, 1ysa:D
6	5apw:B	64	44	0.4889	0.3438	0.5000	2.09e-07
7	5apw:B	64	29	0.4000	0.2812	0.6207	4.23e-06
8	1uo4:B	31	29	0.5111	0.7419	0.7931	4.77e-07	1uo5:A
9	3i5c:B	198	30	0.4222	0.0960	0.6333	1.28e-06	3i5c:A, 1ij0:A, 1ij0:B, 1ij0:C, 1ij1:A, 1ij1:B, 1ij1:C, 3k7z:A, 3k7z:B, 1rb4:A, 1rb4:B, 1swi:C, 6xne:C
10	2kp8:A	72	19	0.3778	0.2361	0.8947	2.29e-05	2kp8:B
11	7n6u:B	595	34	0.4000	0.0303	0.5294	2.79e-05	5fuu:A, 5fuu:D, 5fuu:E, 5fuu:F, 6j5e:K, 7n6u:C, 7n6u:A, 7n6w:A, 7n6w:B, 7n6w:C, 6olp:C, 7ska:B, 7ska:O, 7ska:Z, 6vpx:C, 5y14:C, 5y14:A, 5y14:B, 5yc0:B, 5yc0:C, 5yc0:F
12	6pwu:A	615	42	0.4222	0.0309	0.4524	3.64e-05	6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
13	1llm:C	87	26	0.3333	0.1724	0.5769	1.60e-04	1llm:D
14	2r2v:C	33	30	0.3333	0.4545	0.5000	1.71e-04	2r2v:D
15	3crp:B	34	30	0.3111	0.4118	0.4667	2.55e-04	2b1f:A, 2b1f:C, 3crp:C
16	6x5b:B	149	19	0.3333	0.1007	0.7895	2.83e-04	6x5b:E, 6x5b:K, 6x5c:B, 6x5c:G, 6x5c:F
17	6opn:B	124	16	0.3111	0.1129	0.8750	0.002	6opn:E, 6opn:H
18	4hjb:C	30	30	0.4444	0.6667	0.6667	0.002	4hjb:D
19	7ucf:B	137	19	0.3111	0.1022	0.7368	0.004	5t3x:B, 7t75:B, 7t9a:D, 7t9b:D, 7t9b:F
20	6ohy:B	120	14	0.2667	0.1000	0.8571	0.034	6ohy:E, 6ohy:F
21	3w8v:A	32	30	0.2667	0.3750	0.4000	0.18	3w8v:B, 3w92:A, 3w92:B, 3w92:C, 3w93:A, 3w93:B, 3w93:C
22	7pkt:O	584	19	0.2222	0.0171	0.5263	2.4
23	4ykn:A	1205	35	0.2222	0.0083	0.2857	4.9	4a55:A, 8am0:A, 8exl:A, 8exo:A, 8exu:A, 8exv:A, 5fi4:A, 8gub:A, 6gvf:A, 6gvg:A, 6gvi:A, 3hhm:A, 7jiu:A, 4jps:A, 4l23:A, 4l2y:A, 7mlk:A, 7myo:A, 4ovv:A, 8ow2:A, 7pg6:A, 6pys:A, 5sx9:A, 5sxj:A, 8tdu:A, 8tdu:C, 8tgd:A, 8tgd:C, 8ts9:A, 8tsa:A, 8tsb:A, 8tsc:A, 8tsd:A, 4tv3:A, 5uk8:A, 5ukj:A, 5ul1:A, 8v8h:A, 8v8h:C, 8v8i:A, 8v8i:C, 8v8j:A, 8v8j:C, 8v8v:A, 8v8v:C, 8w9a:A, 8w9b:A, 4waf:A, 5xgh:A, 5xgi:A, 3zim:A, 4zop:A
24	8ovw:L	241	21	0.2444	0.0456	0.5238	5.0
25	4r78:A	287	32	0.2444	0.0383	0.3438	5.2	4r7b:A, 4r7b:B
26	4oo8:A	1301	22	0.2222	0.0077	0.4545	6.5	4zt0:C
27	5kc1:F	61	27	0.2444	0.1803	0.4074	8.4	5kc1:D, 5kc1:B, 5kc1:L, 5kc1:J

[Back]