Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
RKPVSEKIMEIKLIKGPKGLGFSIAGGVGNQHIPGDNSIYVTKIIEGGAAHKDGKLQIGDKLLAVNNVCLEEVTHEEAVT
ALKNTSDFVYLKVAKPT

The query sequence (length=97) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7pc3:A 405 93 0.9588 0.2296 1.0000 1.32e-61 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
2 2ka9:A 189 97 0.8557 0.4392 0.8557 4.90e-56 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
3 2ka9:A 189 86 0.4845 0.2487 0.5465 9.54e-24 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
4 8bq8:C 93 90 0.5979 0.6237 0.6444 5.72e-35 8bq8:A, 8bq8:B
5 8cn1:H 101 89 0.4948 0.4752 0.5393 2.91e-25 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
6 8c1t:A 90 90 0.4227 0.4556 0.4556 2.68e-24 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
7 7p73:A 420 84 0.4124 0.0952 0.4762 8.55e-20 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
8 6xa7:B 96 80 0.3814 0.3854 0.4625 3.39e-19 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
9 2m0z:A 97 93 0.4021 0.4021 0.4194 2.59e-16 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
10 8b82:A 108 93 0.3505 0.3148 0.3656 4.34e-14 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
11 4xhv:A 94 89 0.3402 0.3511 0.3708 9.48e-14
12 4wyu:A 201 99 0.3814 0.1841 0.3737 2.96e-13 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
13 4wyu:A 201 78 0.2887 0.1393 0.3590 1.03e-08 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
14 3jxt:A 96 87 0.3505 0.3542 0.3908 9.70e-13 3jxt:B
15 5heb:A 119 77 0.3093 0.2521 0.3896 3.71e-11 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
16 2exg:A 101 84 0.3402 0.3267 0.3929 6.29e-11 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
17 8bv7:A 95 62 0.2784 0.2842 0.4355 1.53e-10 8buw:A, 8buw:B
18 2r4h:C 98 85 0.2784 0.2755 0.3176 2.94e-10
19 2l4t:A 124 108 0.3918 0.3065 0.3519 3.11e-10 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
20 5wou:A 95 87 0.3196 0.3263 0.3563 3.26e-10
21 2kaw:A 90 64 0.2784 0.3000 0.4219 3.70e-10 6lcb:A, 2mx6:A
22 2pdz:A 86 75 0.3505 0.3953 0.4533 4.15e-10
23 1n7t:A 103 95 0.3402 0.3204 0.3474 4.47e-10 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
24 1l6o:A 95 65 0.2680 0.2737 0.4000 1.12e-09 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
25 2koh:A 111 70 0.2887 0.2523 0.4000 1.50e-09 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
26 7weg:B 96 74 0.3093 0.3125 0.4054 2.02e-09 7weg:A
27 7qqm:A 413 85 0.3711 0.0872 0.4235 2.12e-09
28 7p70:A 407 75 0.3402 0.0811 0.4400 3.32e-09 7pc4:A, 7qql:A
29 3ch8:A 190 79 0.3196 0.1632 0.3924 5.76e-09 2qbw:A
30 6gbe:A 119 93 0.2990 0.2437 0.3118 8.10e-09
31 6x23:A 89 90 0.2887 0.3146 0.3111 8.83e-09
32 7pc5:A 405 77 0.2990 0.0716 0.3766 2.47e-08
33 6q0m:B 94 90 0.3093 0.3191 0.3333 5.86e-08
34 8bp4:A 93 66 0.2887 0.3011 0.4242 8.45e-08 8bp4:C, 8bp4:B
35 6zbq:A 89 51 0.2062 0.2247 0.3922 1.29e-07 6zc4:A
36 4e34:A 87 77 0.3093 0.3448 0.3896 3.18e-07 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
37 2qt5:A 194 74 0.2474 0.1237 0.3243 7.17e-07 2qt5:B
38 2qt5:A 194 78 0.2577 0.1289 0.3205 6.63e-06 2qt5:B
39 2kpl:A 129 78 0.2371 0.1783 0.2949 7.27e-07
40 2i0i:A 81 82 0.3093 0.3704 0.3659 1.13e-06 2i0i:B, 2i0i:C
41 5n7d:A 423 78 0.2371 0.0544 0.2949 2.16e-06 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
42 1n7f:A 86 87 0.2990 0.3372 0.3333 2.58e-06 1n7f:B
43 7qqn:C 414 76 0.2887 0.0676 0.3684 2.89e-06 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
44 7qct:A 90 93 0.2990 0.3222 0.3118 3.80e-06 7qct:B
45 7d6f:A 87 76 0.2268 0.2529 0.2895 1.50e-05
46 5zys:A 90 77 0.2577 0.2778 0.3247 1.61e-05
47 3tsz:A 341 74 0.2990 0.0850 0.3919 2.43e-05 3shw:A
48 2m0u:A 117 86 0.2784 0.2308 0.3140 3.00e-05
49 7pcb:A 415 80 0.2577 0.0602 0.3125 3.25e-05 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
50 2os6:A 89 61 0.2268 0.2472 0.3607 5.60e-05
51 2ejy:A 85 56 0.1856 0.2118 0.3214 6.22e-05
52 1b8q:A 127 65 0.2165 0.1654 0.3231 6.38e-05
53 7x2e:A 163 89 0.3196 0.1902 0.3483 9.74e-05 2kbs:A
54 6kz1:A 97 69 0.2371 0.2371 0.3333 7.63e-04 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
55 1u38:A 89 52 0.1856 0.2022 0.3462 0.001
56 6nid:B 88 58 0.1546 0.1705 0.2586 0.001 6nid:A, 6nid:C
57 3bpu:A 86 78 0.2268 0.2558 0.2821 0.001
58 4wsi:A 372 58 0.1753 0.0457 0.2931 0.002 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
59 1ihj:B 95 74 0.2371 0.2421 0.3108 0.006 1ihj:A
60 3vqg:A 85 57 0.1546 0.1765 0.2632 0.008
61 4xh7:A 110 66 0.2165 0.1909 0.3182 0.020
62 3cyy:B 81 47 0.1443 0.1728 0.2979 0.16 3cyy:A
63 6hks:B 94 69 0.2165 0.2234 0.3043 0.41 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
64 5f67:A 98 54 0.1753 0.1735 0.3148 0.45 5f67:B
65 6ar4:B 87 47 0.1546 0.1724 0.3191 0.62 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
66 3r0h:D 199 82 0.2165 0.1055 0.2561 1.1 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
67 3d8f:A 127 73 0.1856 0.1417 0.2466 1.4 3d8f:C
68 1zub:A 109 58 0.1959 0.1743 0.3276 1.6
69 3jqo:B 130 38 0.1340 0.1000 0.3421 2.0 3jqo:E, 3jqo:H, 3jqo:K, 3jqo:N, 3jqo:Q, 3jqo:T, 3jqo:W, 3jqo:Z, 3jqo:c, 3jqo:f, 3jqo:i, 3jqo:l, 3jqo:o, 2ofq:A, 3zbi:B, 3zbi:E, 3zbi:H, 3zbi:K, 3zbi:N, 3zbi:Q, 3zbi:T, 3zbi:W, 3zbi:Z, 3zbi:c, 3zbi:f, 3zbi:i, 3zbi:l, 3zbi:o
70 5ez0:D 95 69 0.1856 0.1895 0.2609 2.6 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
71 7pog:A 2382 38 0.1031 0.0042 0.2632 4.9 4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
72 2egn:A 83 53 0.1546 0.1807 0.2830 5.2
73 5h3h:B 269 47 0.1649 0.0595 0.3404 6.3 5h3h:A
74 2q5l:A 538 83 0.1959 0.0353 0.2289 8.9 2nxw:A, 2nxw:B, 2q5j:A, 2q5j:B, 2q5l:B, 2q5o:A, 2q5o:B, 2q5q:A, 2q5q:B
75 8xud:D 651 39 0.1134 0.0169 0.2821 9.8 6iqq:C, 6iqq:D, 5wql:D, 5wql:C, 8xud:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417