Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
QTVAIKMGADNGMLAFEPSTIEIQAGDTVQWVNNKLAPHNVVVEGQPELSHKDLAFSPGETFEATFSEPGTYTYYCEPHR
GAGMVGKIVVQ

The query sequence (length=91) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1bxu:A 91 91 1.0000 1.0000 1.0000 1.45e-65 1bxv:A
2 1j5c:A 98 94 0.6484 0.6020 0.6277 3.89e-42 1j5d:A, 1jxd:A, 1jxf:A, 1pcs:A
3 4r0o:A 106 104 0.6154 0.5283 0.5385 1.47e-36 1baw:A, 1baw:B, 1baw:C, 3bqv:A, 3cvb:A, 3cvb:B, 3cvc:A, 3cvd:A, 3cvd:B, 3cvd:C, 2q5b:A, 2q5b:B, 2q5b:C, 4r0o:B, 4r0o:C, 4r0o:D, 2w88:A, 2w88:B, 2w88:C, 2w8c:A, 2w8c:B
4 2gim:A 106 103 0.5495 0.4717 0.4854 8.84e-31 2cj3:A, 2cj3:B, 1fa4:A, 2gim:C, 1nin:A, 1tu2:A
5 1b3i:A 97 96 0.5165 0.4845 0.4896 3.52e-29 2b3i:A, 2jxm:A
6 2plt:A 98 95 0.4835 0.4490 0.4632 1.46e-26 7zqe:M
7 4dp0:X 99 99 0.4615 0.4242 0.4242 4.82e-24 4dp1:X, 4dp2:X, 4dp4:X, 4dp5:X, 4dp6:X
8 1ag6:A 99 99 0.4396 0.4040 0.4040 3.49e-23 1oow:A, 2pcf:A, 1tef:A, 1tef:B, 1teg:A, 1teg:B, 1ylb:B
9 6yez:P 99 99 0.4396 0.4040 0.4040 1.43e-22 6zoo:P
10 1iuz:A 98 95 0.4505 0.4184 0.4316 2.33e-21
11 1pla:A 97 95 0.4066 0.3814 0.3895 2.91e-21 1plb:A
12 1jxg:A 100 99 0.4286 0.3900 0.3939 3.41e-21 4dp7:X, 4dp8:X, 4dp9:X, 4dpa:X, 4dpb:X, 4dpc:X, 1jxg:B, 3pcy:A, 4pcy:A, 5pcy:A, 6pcy:A, 1plc:A, 1pnc:A, 1pnd:A, 1tkw:A
13 7pcy:A 98 95 0.4066 0.3776 0.3895 9.01e-20
14 1byo:A 99 97 0.3956 0.3636 0.3711 3.91e-19 1byo:B, 1byp:A
15 9pcy:A 99 97 0.3846 0.3535 0.3608 3.20e-18
16 3tu6:A 127 82 0.3407 0.2441 0.3780 2.95e-13
17 2bz7:A 102 100 0.3516 0.3137 0.3200 3.01e-13 2bzc:A, 1kdi:A, 1kdj:A
18 1aac:A 105 84 0.3297 0.2857 0.3571 2.32e-11 1aan:A, 1bxa:A, 2gb2:A, 2gba:A, 2gc4:C, 2gc4:G, 2gc4:K, 2gc4:O, 2idq:A, 2ids:A, 2idt:A, 2idu:A, 3ie9:A, 3iea:A, 2j55:A, 2j55:B, 2j56:A, 2j56:B, 2j57:A, 2j57:B, 2j57:C, 2j57:D, 3l45:A, 1mda:A, 1mda:B, 1mg2:C, 1mg2:G, 1mg2:K, 1mg2:O, 1mg3:C, 1mg3:G, 1mg3:K, 1mg3:O, 2mta:A, 2ov0:A, 4p5r:A, 4p5s:A, 3ply:A, 3ply:B, 3ply:C, 3ply:D, 2qdv:A, 2qdw:A, 2rac:A, 3rym:A, 3rym:C, 3rym:B, 3rym:D, 1sf3:A, 1sf5:A, 1sfd:A, 1sfd:B, 1sfh:A, 1sfh:B, 1t5k:A, 1t5k:B, 1t5k:C, 1t5k:D
19 3c75:A 106 79 0.3187 0.2736 0.3671 2.14e-10 3c75:B, 1id2:A, 1id2:B, 1id2:C
20 6akn:A 124 81 0.3077 0.2258 0.3457 4.17e-10 6akn:B, 1bqk:A, 1bqr:A, 8hm9:A, 8hm9:B, 6ifp:A, 6ifp:C, 2jkw:A, 2jkw:B, 2ux6:A, 2ux7:A, 2uxf:A, 2uxg:A, 5wv4:A, 5wv4:B, 5xmo:A, 5y23:A, 5y23:B, 4yl4:A, 5ysg:A, 5ysg:B, 5ysg:C, 5ysg:D, 5yw3:A, 5yw3:B, 5yw3:C, 5yw3:D, 5z0x:A, 5z0x:B, 1zia:A, 1zib:A, 5ztd:A, 5ztd:B
21 5fc9:A 95 67 0.2637 0.2526 0.3582 4.31e-08 5fc9:B, 5fc9:C, 5fc9:D
22 1adw:A 123 83 0.3077 0.2276 0.3373 1.43e-07 1adw:B, 4bwt:A, 4bwt:B, 4bwu:A, 4bwu:B, 4bxv:A, 4bxv:B, 3erx:A, 3erx:B
23 1pmy:A 123 91 0.2857 0.2114 0.2857 4.22e-07
24 8k9n:A 125 84 0.2747 0.2000 0.2976 1.62e-06 8k9p:A, 3nyk:A, 2p80:D, 1paz:A, 3paz:A, 4paz:A, 5paz:A, 6paz:A, 7paz:A, 8paz:A, 1py0:A, 1pza:A, 1pzb:A, 4rh4:A, 5x31:A, 5x31:B
25 5b1j:C 124 75 0.2967 0.2177 0.3600 1.90e-04 3ef4:A, 3ef4:B, 3ef4:C
26 6hbe:C 427 82 0.2857 0.0609 0.3171 2.17e-04 6hbe:A, 6hbe:B
27 6hbe:C 427 81 0.2637 0.0562 0.2963 0.18 6hbe:A, 6hbe:B
28 6vox:A 407 70 0.2308 0.0516 0.3000 0.021
29 1aoz:A 552 92 0.3407 0.0562 0.3370 0.026 1aoz:B, 1aso:A, 1aso:B, 1asp:A, 1asp:B, 1asq:A, 1asq:B
30 2aan:A 123 121 0.4066 0.3008 0.3058 0.027
31 8ajz:B 167 84 0.2857 0.1557 0.3095 0.032 3bvd:B, 2cua:A, 2cua:B, 1ehk:B, 3eh3:B, 3eh4:B, 3eh5:B, 4fa7:B, 4faa:B, 2fwl:B, 4g70:B, 4g71:B, 4g72:B, 4g7q:B, 4g7r:B, 4g7s:B, 4gp4:B, 4gp5:B, 4gp8:B, 8hua:B, 8k65:B, 8k6y:B, 4n4y:B, 5ndc:B, 3qjq:B, 3qjr:B, 3qjs:B, 3qjt:B, 3qju:B, 3qjv:B, 2qpd:B, 2qpe:B, 3s33:B, 3s38:B, 3s39:B, 3s3a:B, 3s3b:B, 3s3c:B, 3s3d:B, 3s8f:B, 3s8g:B, 5u7n:A, 5u7n:B, 5u7n:C, 5u7n:D, 5u7n:E, 5u7n:F, 5u7n:G, 5u7n:H, 1xme:B
32 5ue6:A 314 84 0.2967 0.0860 0.3214 0.40 1kbv:A, 1kbv:B, 1kbv:C, 1kbv:D, 1kbv:F, 1kbv:E, 1kbw:A, 1kbw:B, 1kbw:C, 1kbw:D, 1kbw:E, 1kbw:F, 5tb7:A, 5tb7:C, 5tb7:B, 5ue6:C, 5ue6:B, 5ue6:D, 5ue6:F, 5ue6:E, 5ue6:G, 5ue6:I, 5ue6:H
33 6vow:A 409 70 0.2198 0.0489 0.2857 0.44
34 4hpp:A 426 42 0.1648 0.0352 0.3571 0.57
35 3wi9:A 303 82 0.2308 0.0693 0.2561 0.63 6l46:A, 3wia:A, 3wia:B, 3wia:C, 3wia:D, 3wia:E, 3wia:F, 3wia:G, 3wia:H, 3wia:I, 3wkp:A, 3wkq:A, 3wni:A, 3wnj:A, 3x1e:A, 3x1f:A, 3x1g:A, 3x1n:A, 4ysa:A, 4ysd:A, 4yso:A, 4ysp:A, 4ysq:A, 4ysr:A, 4yss:A, 4yst:A, 4ysu:A, 5ytl:A, 5ytm:A, 5ytn:A, 4zk8:A
36 3gdc:A 288 60 0.1868 0.0590 0.2833 0.65 3gdc:B, 3gdc:C
37 4xqk:A 1517 49 0.1429 0.0086 0.2653 1.4 4xqk:B
38 4hcf:B 96 87 0.2747 0.2604 0.2874 1.7 4hcf:A, 4hcg:A, 4hcg:B
39 5akr:A 337 42 0.1648 0.0445 0.3571 2.2 2avf:A, 2avf:B, 2avf:C, 2avf:D, 2avf:E, 2avf:F, 2bw4:A, 2bw5:A, 2bwd:A, 2bwi:A, 6gb8:A, 6gbb:A, 6gby:A, 6gcg:A, 6gsq:A, 6gt0:A, 6gt2:A, 6gti:A, 6gtj:A, 6gtk:A, 6gtl:A, 6gtn:A, 5i6k:A, 5i6l:A, 5i6m:A, 5i6n:A, 5i6o:A, 5i6p:A, 1kcb:A, 6knf:A, 6knf:B, 6knf:C, 6kng:A, 6kng:B, 6kng:C, 5n8f:A, 5n8g:A, 5n8h:A, 5n8i:A, 1nia:A, 1nia:B, 1nia:C, 1nib:A, 1nib:B, 1nib:C, 1nic:A, 1nid:A, 1nie:A, 1nif:A, 2nrd:A, 5of5:A, 5of6:A, 5of7:A, 5of8:A, 5ofc:A, 5ofd:A, 5ofe:A, 5off:A, 5ofg:A, 5ofh:A, 5og2:A, 5og3:A, 5og4:A, 5og5:A, 5og6:A, 5ogf:A, 5ogg:A, 6qwg:A, 1rzp:A, 1rzp:B, 1rzp:C, 1rzq:A, 1rzq:B, 1rzq:C, 2y1a:A, 6zu6:A, 6zua:A, 6zub:A, 6zud:A, 6zut:A
40 8phi:F 453 46 0.1429 0.0287 0.2826 2.7 9bjm:A, 5ea3:F, 5ea4:F, 5ea5:F, 5ea6:F, 6eag:F, 6eah:C, 6eak:F, 8kg5:A, 8kg5:C, 8kg5:B, 3kpe:A, 7kqd:F, 5kww:F, 6ntx:B, 6vkc:F, 6vkd:F, 6vke:F
41 9f8x:A 572 25 0.1209 0.0192 0.4400 3.3 9f8x:B, 9f8x:C, 9f8x:D, 1qni:A, 1qni:B, 1qni:C, 1qni:D, 1qni:E, 1qni:F
42 8iag:B 223 40 0.1758 0.0717 0.4000 5.1 8iag:A
43 2eb6:A 267 49 0.1758 0.0599 0.3265 5.7 2eb5:A, 2eb5:B, 2eb5:C, 2eb5:D, 2eb5:E, 2eb6:B, 2eb6:C, 2eb6:D, 2eb6:E
44 8onu:A 133 48 0.1209 0.0827 0.2292 5.9
45 5d4h:B 341 45 0.1868 0.0499 0.3778 6.0 2afn:A, 2afn:B, 2afn:C, 1aq8:A, 1aq8:B, 1aq8:C, 1as6:A, 1as6:B, 1as6:C, 1as7:A, 1as7:B, 1as7:C, 1as8:A, 1as8:B, 1as8:C, 2b08:A, 2b08:B, 2b08:C, 5d4h:A, 5d4h:C, 5d4i:A, 5d4i:C, 5d4i:B, 5d4j:A, 5d4j:B, 5d4j:C, 2e86:A, 2e86:B, 2e86:C, 1et5:A, 1et7:A, 1et8:A, 5f7a:A, 5f7a:C, 5f7a:B, 5f7b:A, 5f7b:B, 5f7b:C, 2fjs:A, 2fjs:B, 2fjs:C, 3h4f:A, 3h4f:B, 3h4f:C, 3h4h:A, 3h4h:B, 3h4h:C, 3h56:A, 1j9q:A, 1j9q:B, 1j9q:C, 1j9r:A, 1j9r:B, 1j9r:C, 1j9s:A, 1j9s:B, 1j9s:C, 1j9t:A, 1j9t:B, 1j9t:C, 1l9o:A, 1l9o:B, 1l9o:C, 1l9p:A, 1l9p:B, 1l9p:C, 1l9q:A, 1l9q:C, 1l9q:B, 1l9r:A, 1l9r:B, 1l9r:C, 1l9s:A, 1l9s:B, 1l9s:C, 1l9t:A, 1l9t:C, 1l9t:B, 1npj:A, 1npj:B, 1npj:C, 1npn:A, 1npn:B, 1npn:C, 1ntd:A, 2p80:A, 2p80:B, 2p80:C, 2pp7:A, 2pp7:B, 2pp7:C, 2pp8:A, 2pp8:B, 2pp8:C, 2pp9:A, 2pp9:B, 2pp9:C, 2ppa:A, 2ppa:B, 2ppa:C, 2ppc:A, 2ppc:B, 2ppc:C, 2ppd:A, 2ppd:B, 2ppd:C, 2ppe:A, 2ppe:B, 2ppe:C, 2ppf:A, 2ppf:B, 2ppf:C, 1sjm:A, 1sjm:B, 1sjm:C, 1snr:A, 1snr:B, 1snr:C, 4ysc:A, 4ysc:B, 4ysc:C, 4yse:A, 4yse:B, 4yse:C, 1zdq:A, 1zdq:B, 1zdq:C, 1zds:A, 1zds:B, 1zds:C
46 6v4x:I 510 31 0.1319 0.0235 0.3871 8.3
47 6tv9:A 372 50 0.1648 0.0403 0.3000 8.4 6tv9:B, 6tv9:C, 6tv9:D, 6tv9:E, 6tv9:F, 6tv9:G, 6tv9:H
48 6kol:A 125 121 0.3297 0.2400 0.2479 9.0 6l9s:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417