Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●D-I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●D-QUARK ●DRfold ●DRfold2 ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred ●TCRfinder

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●DeepMSA2 ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP Library
>protein
QSFLPPGWEMRIAPNGRPFFYDHNTKTTTWEDPRLKFPVH

The query sequence (length=40) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2laj:A 40 40 1.0000 1.0000 1.0000 1.37e-25
2 2m3o:W 43 39 0.8000 0.7442 0.8205 3.83e-19 2kpz:A, 2kq0:A, 2mpt:A, 4n7h:A
3 4lcd:A 419 32 0.5500 0.0525 0.6875 3.94e-11 4lcd:B
4 5dws:C 40 31 0.5000 0.5000 0.6452 3.70e-10
5 2ez5:W 46 31 0.5000 0.4348 0.6452 4.60e-10
6 1i5h:W 50 33 0.5000 0.4000 0.6061 5.46e-10
7 5cq2:A 76 31 0.5000 0.2632 0.6452 1.07e-09 5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
8 5cq2:A 76 31 0.4750 0.2500 0.6129 4.88e-08 5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
9 2jmf:A 43 35 0.5250 0.4884 0.6000 3.12e-09
10 2lb1:A 35 32 0.4750 0.5429 0.5938 4.89e-09 2ltx:A
11 2djy:A 42 33 0.4750 0.4524 0.5758 5.37e-09
12 2n8t:A 39 35 0.4500 0.4615 0.5143 5.54e-09
13 2kxq:A 90 33 0.4750 0.2111 0.5758 1.62e-08 2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
14 2kxq:A 90 32 0.3250 0.1444 0.4062 0.003 2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
15 6jjz:B 96 32 0.4750 0.1979 0.5938 4.55e-08 6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
16 6jjz:B 96 36 0.3000 0.1250 0.3333 2.4 6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
17 1jmq:A 46 31 0.4000 0.3478 0.5161 6.60e-07 1k5r:A, 1k9q:A, 1k9r:A, 2lax:A, 2lay:A, 2ltw:A
18 2ltv:A 36 32 0.3750 0.4167 0.4688 2.26e-06 2law:A
19 6jjy:A 128 33 0.4500 0.1406 0.5455 4.09e-06 6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
20 6jjy:A 128 34 0.3500 0.1094 0.4118 5.26e-05 6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
21 7lp3:A 37 32 0.3750 0.4054 0.4688 4.30e-06 7lp3:C
22 7lp2:E 37 30 0.3750 0.4054 0.5000 8.98e-06 2lb2:A, 7lp2:A, 7lp2:C, 2lty:A
23 1eg4:A 260 28 0.3000 0.0462 0.4286 2.00e-05
24 8sg2:A 163 31 0.3500 0.0859 0.4516 4.39e-05 6dun:A, 6dun:B, 7efj:A, 7efx:A, 7ekv:A, 7f0m:A, 7f0m:C, 7f0m:B, 7f0m:D, 1f8a:B, 4gwv:A, 3i6c:A, 3i6c:B, 1i8g:B, 1i8h:B, 3ikd:A, 3ikd:B, 3ikg:A, 3ikg:B, 9inr:A, 9inr:B, 2itk:A, 3jyj:A, 3jyj:B, 3kab:A, 3kac:A, 3kac:B, 3kad:A, 3kaf:A, 3kag:A, 3kah:A, 3kai:A, 3kce:A, 2lb3:A, 2n1o:A, 1nmw:A, 3ntp:A, 6o33:A, 6o34:A, 3odk:A, 3oob:A, 1pin:A, 2q5a:A, 3tc5:A, 3tcz:A, 3tdb:A, 4tns:A, 4tyo:A, 4tyo:B, 5uy9:A, 6vaj:A, 3wh0:A, 2xp3:A, 2xp4:A, 2xp5:A, 2xp6:A, 2xp7:A, 2xp8:A, 2xp9:A, 2xpa:A, 2xpb:A
25 2nc3:A 33 30 0.3250 0.3939 0.4333 9.63e-05 2nc4:A, 2nc5:A, 2nc6:A
26 8pxx:A 99 34 0.3500 0.1414 0.4118 0.003 2dyf:A
27 8pxx:A 99 27 0.2000 0.0808 0.2963 0.30 2dyf:A
28 2jup:W 37 27 0.2000 0.2162 0.2963 0.90 2rly:W, 2rm0:W
29 2oei:A 37 37 0.3500 0.3784 0.3784 1.1 2ho2:A
30 5exe:C 314 36 0.3000 0.0382 0.3333 1.8 5c4i:C, 5c4i:F, 5exd:C, 5exd:F, 5exd:I, 5exd:L, 5exe:F
31 8typ:A 310 31 0.2750 0.0355 0.3548 3.6 1elv:A, 8gmn:A, 8gmn:B, 8gmn:C, 8gmn:D
32 8b6j:E 245 32 0.3000 0.0490 0.3750 3.8 8b6j:e, 8bqs:E, 8bqs:e, 8gym:qE, 8gym:qe, 8gym:QE, 8gym:Qe, 8gzu:qE, 8gzu:qe, 8gzu:QE, 8gzu:Qe, 7tgh:3E
33 7vgb:A 681 25 0.2250 0.0132 0.3600 4.1 7vgb:B, 7vgc:A
34 2k78:A 126 14 0.2000 0.0635 0.5714 4.3 2o6p:A, 2o6p:B
35 7pog:A 2382 18 0.1750 0.0029 0.3889 4.9 4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
36 2w16:B 754 28 0.2250 0.0119 0.3214 5.1 2iah:A, 2w6t:B, 2w6u:B, 2w76:B, 2w77:B, 2w78:B, 1xkh:A, 1xkh:B, 1xkh:C
37 8b5q:B 365 27 0.2500 0.0274 0.3704 5.3 8b5q:A, 8b5s:A, 8b5s:B, 8b62:A, 8b62:B, 8b63:A, 8b63:B
38 7olc:SE 261 28 0.2000 0.0307 0.2857 6.0 7old:SE, 8oo0:SE, 5oql:m, 7r81:F2, 6rxu:Cb, 6rxv:Cb, 6rxx:Cb, 6rxz:Cb, 7z3n:SE, 7z3o:SE
39 8jhz:A 2615 18 0.1750 0.0027 0.3889 6.4
40 8jhz:A 2615 18 0.1750 0.0027 0.3889 8.1
41 4laj:A 343 19 0.2250 0.0262 0.4737 7.7 4dvr:G, 2i5y:G, 2i5y:P, 2i60:G, 2i60:P, 4jzw:G, 4jzw:A, 4jzz:A, 4k0a:A, 4ka2:A, 4laj:J, 4laj:F, 4laj:B, 4r4f:A, 1yyl:G, 1yyl:P, 1yym:G, 1yym:P
42 5hxm:A 1060 20 0.2250 0.0085 0.4500 8.9 5f7u:A, 5hpo:A, 5i0d:A, 5i0d:B, 4kmq:A, 4kwu:A
43 7kuy:E 338 9 0.1750 0.0207 0.7778 9.8 5bkf:E

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417